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lncRNA FKBP15作为绝经后骨质疏松症肾虚血瘀证潜在生物标志物的可行性
1
作者
朱弈桦
孙海涛
+5 位作者
彭晨健
杨浩淼
储旭东
郭杨
马勇
王礼宁
《中国骨质疏松杂志》
北大核心
2025年第4期518-525,548,共9页
目的探讨人外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中差异表达的长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)作为绝经后骨质疏松症肾虚血瘀证(PMOP-SXXY)潜在生物标志物的可行性和临床应用价值。方法采用病例对照研究...
目的探讨人外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中差异表达的长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)作为绝经后骨质疏松症肾虚血瘀证(PMOP-SXXY)潜在生物标志物的可行性和临床应用价值。方法采用病例对照研究,初期纳入PMOP-SXXY和骨量正常女性患者共10例,采用密度梯度离心法获取PBMC,使用Trizol法进行RNA提取并进行文库构建,后利用RNA测序技术得到lncRNA和mRNA表达谱,筛选差异表达的lncRNAs(differential expressed lncRNA,DElncRNAs)和mRNAs(differential expressed mRNA,DEmRNAs)(筛选标准为表达倍数变化FC≥2,P<0.05);根据差异表达基因进行GO、KEGG富集分析,同时选择显著差异表达的10个lncRNAs与20个mRNAs进行lncRNA-mRNA相关性分析,筛选出潜在可作为生物诊断标志物的lncRNAs;采用ROC曲线分析,评估各潜在lncRNAs作为PMOP-SXXY诊断标志物的诊断价值;后再次纳入PMOP-SXXY和骨量正常女性患者共30例,行实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR),对筛选结果进行外部验证。结果①与骨量正常组相比,PMOP-SXXY组中共2599个DElncRNAs和751个DEmRNAs。②GO富集分析中发现差异基因功能主要富集在蛋白结合上以及膜、质膜、胞外基质等细胞组分上;KEGG分析则显示差异表达的主要富集在细胞外基质受体相互作用(ECM-receptor interaction)、PI3K-Akt信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)、焦点粘连(Focal adhesion)、癌症通路(Pathways in cancer)和蛋白质消化与吸收(Protein digestion and absorption)等信号通路中;lncRNA-mRNA相关性网络显示,lncRNA FKBP15具有最多的节点数,共15个,其次为lncRNA HMGCR、lncRNA SLC25A37和lncRNA IQGAP1等。③利用ROC曲线分析筛选出对PMOP-SXXY诊断具有较好预测价值的lncRNAs:lncRNA FKBP15:其AUC为1.000,95%CI:1.000~1.000;lncRNA SLC25A37:其AUC为0.900,95%CI:0.690~1.000;lncRNA HMGCR:其AUC为1.000,95%CI:1.000~1.000;lncRNA IQGAP1:其AUC为0.960,95%CI:0.843~1.000,其中lncRNA FKBP15和lncRNA HMGC的诊断价值最高。④qPCR结果显示,lncRNA FKBP15、lncRNA HMGCR、lncRNA SLC25A37和lncRNA IQGAP1与PMOP-SXXY的发生均有显著相关性(P<0.05),而lncRNA FKBP15在PMOP-SXXY组和正常组中具有更明显的差异性表达。结论lncRNA FKBP15在PMOP-SXXY患者外周血中高表达,与绝经后骨质疏松症的发生密切相关,可作为PMOP-SXXY的临床诊断的潜在生物标志物。
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关键词
绝经后骨质疏松症
肾虚血瘀证
lncRNA
潜在生物标志物
RNA测序
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职称材料
CircRNA作为骨质疏松症生物标志物的研究进展
被引量：
2
2
作者
彭晨健
孙海涛
+7 位作者
王军
魏伟
刘岸龙
储旭东
钱卫庆
马勇
郭杨
王礼宁
《中国骨质疏松杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期1632-1637,1674,共7页
骨质疏松症作为一种慢性代谢性骨病,其具有病情进展隐匿的特点,往往会导致疾病诊断相对滞后。因此,有关骨质疏松症的早期筛查已成为一项重大的公共卫生挑战。目前最新研究表明,circRNA广泛参了与骨代谢的调控,与骨质疏松症的发生发展密...
骨质疏松症作为一种慢性代谢性骨病,其具有病情进展隐匿的特点,往往会导致疾病诊断相对滞后。因此,有关骨质疏松症的早期筛查已成为一项重大的公共卫生挑战。目前最新研究表明,circRNA广泛参了与骨代谢的调控,与骨质疏松症的发生发展密切相关,基于其高度的序列保守性和稳定性,其具备了成为新型临床生物标志物的潜力。生物标志物研究一般取材于体液样本或相邻组织样本,其中血液是最常用的,其具体可分为血清、血浆、外周血单核细胞和血浆外泌体等来源。因此,本文拟就circRNA作为骨质疏松症生物标志物的研究情况进行综述。
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关键词
骨质疏松症
生物标志物
circRNA
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职称材料
题名
lncRNA FKBP15作为绝经后骨质疏松症肾虚血瘀证潜在生物标志物的可行性
1
作者
朱弈桦
孙海涛
彭晨健
杨浩淼
储旭东
郭杨
马勇
王礼宁
机构
南京中医药大学骨伤修复与重建新技术实验室
南通大学杏林学院附属
惠山
医院
南京中医药大学附属南京中
医院
南京中医药大学
无锡
附属
医院
南京中医药大学中西医结合学院
南京中医药大学附属盐城中
医院
出处
《中国骨质疏松杂志》
北大核心
2025年第4期518-525,548,共9页
基金
国家自然科学基金面上项目(82074458)
江苏省自然科学基金青年项目(BK20220470)
+4 种基金
江苏省高等学校自然科学研究面上项目(22KJB360012)
江苏省中医退行性骨关节病临床医学创新中心资助项目(苏中医科教〔2021〕4号)
江苏省卫生健康委员会科研基金项目(Z2022059)
无锡市卫生健康委员会中青年拔尖人才支持计划(HB2023121)
无锡市中医药管理局科技项目计划立项项目(ZYYB03)。
文摘
目的探讨人外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中差异表达的长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)作为绝经后骨质疏松症肾虚血瘀证(PMOP-SXXY)潜在生物标志物的可行性和临床应用价值。方法采用病例对照研究,初期纳入PMOP-SXXY和骨量正常女性患者共10例,采用密度梯度离心法获取PBMC,使用Trizol法进行RNA提取并进行文库构建,后利用RNA测序技术得到lncRNA和mRNA表达谱,筛选差异表达的lncRNAs(differential expressed lncRNA,DElncRNAs)和mRNAs(differential expressed mRNA,DEmRNAs)(筛选标准为表达倍数变化FC≥2,P<0.05);根据差异表达基因进行GO、KEGG富集分析,同时选择显著差异表达的10个lncRNAs与20个mRNAs进行lncRNA-mRNA相关性分析,筛选出潜在可作为生物诊断标志物的lncRNAs;采用ROC曲线分析,评估各潜在lncRNAs作为PMOP-SXXY诊断标志物的诊断价值;后再次纳入PMOP-SXXY和骨量正常女性患者共30例,行实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR),对筛选结果进行外部验证。结果①与骨量正常组相比,PMOP-SXXY组中共2599个DElncRNAs和751个DEmRNAs。②GO富集分析中发现差异基因功能主要富集在蛋白结合上以及膜、质膜、胞外基质等细胞组分上;KEGG分析则显示差异表达的主要富集在细胞外基质受体相互作用(ECM-receptor interaction)、PI3K-Akt信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)、焦点粘连(Focal adhesion)、癌症通路(Pathways in cancer)和蛋白质消化与吸收(Protein digestion and absorption)等信号通路中;lncRNA-mRNA相关性网络显示,lncRNA FKBP15具有最多的节点数,共15个,其次为lncRNA HMGCR、lncRNA SLC25A37和lncRNA IQGAP1等。③利用ROC曲线分析筛选出对PMOP-SXXY诊断具有较好预测价值的lncRNAs:lncRNA FKBP15:其AUC为1.000,95%CI:1.000~1.000;lncRNA SLC25A37:其AUC为0.900,95%CI:0.690~1.000;lncRNA HMGCR:其AUC为1.000,95%CI:1.000~1.000;lncRNA IQGAP1:其AUC为0.960,95%CI:0.843~1.000,其中lncRNA FKBP15和lncRNA HMGC的诊断价值最高。④qPCR结果显示,lncRNA FKBP15、lncRNA HMGCR、lncRNA SLC25A37和lncRNA IQGAP1与PMOP-SXXY的发生均有显著相关性(P<0.05),而lncRNA FKBP15在PMOP-SXXY组和正常组中具有更明显的差异性表达。结论lncRNA FKBP15在PMOP-SXXY患者外周血中高表达,与绝经后骨质疏松症的发生密切相关,可作为PMOP-SXXY的临床诊断的潜在生物标志物。
关键词
绝经后骨质疏松症
肾虚血瘀证
lncRNA
潜在生物标志物
RNA测序
Keywords
postmenopausal osteoporosis
renal deficiency and blood stasis
lncRNA
potential biomarker
RNA sequencing
分类号
R589.5 [医药卫生—内分泌]
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职称材料
题名
CircRNA作为骨质疏松症生物标志物的研究进展
被引量：
2
2
作者
彭晨健
孙海涛
王军
魏伟
刘岸龙
储旭东
钱卫庆
马勇
郭杨
王礼宁
机构
南京中医药大学附属南京中
医院
骨伤科
无锡市惠山区人民医院骨科
南京中医药大学附属
医院
骨伤科
南京中医药大学骨伤修复与重建新技术实验室
南京中医药大学中医学院·中西医结合学院
出处
《中国骨质疏松杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期1632-1637,1674,共7页
基金
国家自然科学基金面上项目(82074458,82174411)
江苏省自然科学基金面上项目(BK20221351)
+2 种基金
江苏省自然科学基金青年项目(BK20220470)
江苏省高等学校自然科学研究面上项目(22KJB360012)
无锡市科技发展资金项目(Y20212043)。
文摘
骨质疏松症作为一种慢性代谢性骨病,其具有病情进展隐匿的特点,往往会导致疾病诊断相对滞后。因此,有关骨质疏松症的早期筛查已成为一项重大的公共卫生挑战。目前最新研究表明,circRNA广泛参了与骨代谢的调控,与骨质疏松症的发生发展密切相关,基于其高度的序列保守性和稳定性,其具备了成为新型临床生物标志物的潜力。生物标志物研究一般取材于体液样本或相邻组织样本,其中血液是最常用的,其具体可分为血清、血浆、外周血单核细胞和血浆外泌体等来源。因此,本文拟就circRNA作为骨质疏松症生物标志物的研究情况进行综述。
关键词
骨质疏松症
生物标志物
circRNA
Keywords
osteoporosis
biomarkers
circRNA
分类号
R446 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
lncRNA FKBP15作为绝经后骨质疏松症肾虚血瘀证潜在生物标志物的可行性
朱弈桦
孙海涛
彭晨健
杨浩淼
储旭东
郭杨
马勇
王礼宁
《中国骨质疏松杂志》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
CircRNA作为骨质疏松症生物标志物的研究进展
彭晨健
孙海涛
王军
魏伟
刘岸龙
储旭东
钱卫庆
马勇
郭杨
王礼宁
《中国骨质疏松杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
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