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滇牡丹花瓣色斑形成的分子机制研究
1
作者
李海清
杜春
+1 位作者
王娟
张怀璧
《广西植物》
北大核心
2025年第4期628-640,共13页
为探究滇牡丹花瓣色斑形成的分子机制,该研究以滇牡丹有色斑和无色斑的黄色花瓣为试验材料,利用Illumina平台进行转录组测序和UPLC系统进行代谢组分析,筛选影响滇牡丹色斑生成的关键差异表达基因和转录因子。结果表明:(1)转录组测序共获...
为探究滇牡丹花瓣色斑形成的分子机制,该研究以滇牡丹有色斑和无色斑的黄色花瓣为试验材料,利用Illumina平台进行转录组测序和UPLC系统进行代谢组分析,筛选影响滇牡丹色斑生成的关键差异表达基因和转录因子。结果表明:(1)转录组测序共获得63981条Unigenes,平均长度为805 bp,注释到的Unigenes占比68.24%。筛选到19496个差异表达基因,其中有41个差异表达基因参与类黄酮生物合成,筛选出差异显著的DFR、CHS和CHI 3条结构基因。在得到的37个MYB转录因子中,筛选到1个R2R3-MYB转录因子PdMYB 30在促进色斑生成中发挥了重要作用。(2)通过UPLC-MS/MS平台靶向测定检测到44种花青素化合物。(3)通过验证RNA-seq中差异表达基因的表达变化趋势与qRT-PCR结果一致。综上表明,滇牡丹色斑的形成主要受花青素的影响,转录因子PdMYB 30与结构基因CHS、CHI和DFR在红色斑黄花硬蕾期(B-S1)因相似的高表达而呈正相关,预测PdMYB 30可能是在类黄酮生物合成中促进色斑形成的正调节因子,可以提高类黄酮生物合成通路中结构基因的表达量,从而促进植物中花青素的积累。该研究为制定高效的滇牡丹育种技术提供了科学依据。
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关键词
滇牡丹
色斑形成
转录组
代谢组
差异表达基因
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职称材料
棉花竹FsMyb1基因的生物信息学研究
被引量：
3
2
作者
彭桂莎
杨宇明
+2 位作者
孙浩
张怀璧
王娟
《西部林业科学》
CAS
2011年第4期5-11,共7页
以项目组已克隆并在GenBank中登记的棉花竹的FsMyb1基因(GU390881)序列为基础,利用生物信息学分析方法,对其编码的FsMyb1蛋白进行理化性质、分子结构、生物功能预测和分析。结果显示,棉花竹FsMyb1基因编码是一种亲水性蛋白质;无信号肽,...
以项目组已克隆并在GenBank中登记的棉花竹的FsMyb1基因(GU390881)序列为基础,利用生物信息学分析方法,对其编码的FsMyb1蛋白进行理化性质、分子结构、生物功能预测和分析。结果显示,棉花竹FsMyb1基因编码是一种亲水性蛋白质;无信号肽,无导肽,无跨膜结构域;亚细胞定位为细胞核;共有2个糖基化位点和21个磷酸化位点。二级结构包括无规则卷曲、α-螺旋、延伸链;三级结构的构象为α-helix/loop混合型构象,是典型的R2R3-Myb转录因子。同源比对和进化分析结果显示,FsMyb1蛋白与OsMyb等蛋白有很高的同源性。初步推测,FsMyb1蛋白可能是一类调节苯丙氨酸代谢,尤其是一种与调节次生细胞壁增厚和花青素生物合成功能相关的转录调节因子。
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关键词
MYB基因
生物信息学分析
棉花竹
苯丙氨酸代谢
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职称材料
滇牡丹PdANS的克隆、表达及与花青素含量的相关性
被引量：
4
3
作者
平怀磊
郭雪
+4 位作者
余潇
宋静
杜春
王娟
张怀璧
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期206-217,共12页
花色是观赏植物最重要的品质性状之一,在植物生长发育过程中发挥着重要作用。探明滇牡丹的花色调控机理,为提高观赏价值奠定理论基础。以花瓣为材料,克隆获得PdANS,生物信息学分析其特征,结合实时荧光定量PCR、HPLC等技术探究不同组织...
花色是观赏植物最重要的品质性状之一,在植物生长发育过程中发挥着重要作用。探明滇牡丹的花色调控机理,为提高观赏价值奠定理论基础。以花瓣为材料,克隆获得PdANS,生物信息学分析其特征,结合实时荧光定量PCR、HPLC等技术探究不同组织、不同发育时期中PdANS的表达情况与各组织花青素含量的相关性。结果表明,PdANS全长1 121 bp,包含一个1 064bp的开放阅读框(ORF),编码354个氨基酸,相对分子质量40.41 kD,理论等电点(pI)5.48,分子式为C_(1819)H_(2876)N_(474)O_(540)S_(12),脂肪指数为88.64,不稳定指数(Ⅱ)为55.32,亲水平均数为-0.435,推测为不稳定的亲水蛋白。且无信号肽序列及跨膜螺旋区,是没有分泌功能的非跨膜蛋白。系统进化分析显示,滇牡丹PdANS与牡丹、芍药等植物的ANS蛋白亲缘关系最近。RT-qPCR结果显示,PdANS在花瓣、花药、萼片、苞片和花梗中均有表达,以花瓣中的表达量最高。HPLC结果表明,在不同组织提取液中,分别检测出Cy3G5G、Pn3G5G、Cy3G和Pn3G四种花青素,且花青素含量花瓣>花药>萼片>花梗>苞片。相关性分析表明,花青素含量与PdANS表达量呈极显著相关性。推测PdANS在滇牡丹花色的形成中扮演着重要角色,参与花青素物质的生物合成。
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关键词
滇牡丹
ANS基因
花青素
生物信息学分析
HPLC
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职称材料
题名
滇牡丹花瓣色斑形成的分子机制研究
1
作者
李海清
杜春
王娟
张怀璧
机构
西南林业大学园林园艺学院
西南林业大学林学院
新西兰皇家植物与食品研究所
出处
《广西植物》
北大核心
2025年第4期628-640,共13页
基金
云南省重大基础专项生物资源数字化开发应用项目(202002AA100007)
国家自然科学基金(32060089)
云南省万人计划“云岭产业技术领军人才”专项资助项目(云发改[2018]212号)。
文摘
为探究滇牡丹花瓣色斑形成的分子机制,该研究以滇牡丹有色斑和无色斑的黄色花瓣为试验材料,利用Illumina平台进行转录组测序和UPLC系统进行代谢组分析,筛选影响滇牡丹色斑生成的关键差异表达基因和转录因子。结果表明:(1)转录组测序共获得63981条Unigenes,平均长度为805 bp,注释到的Unigenes占比68.24%。筛选到19496个差异表达基因,其中有41个差异表达基因参与类黄酮生物合成,筛选出差异显著的DFR、CHS和CHI 3条结构基因。在得到的37个MYB转录因子中,筛选到1个R2R3-MYB转录因子PdMYB 30在促进色斑生成中发挥了重要作用。(2)通过UPLC-MS/MS平台靶向测定检测到44种花青素化合物。(3)通过验证RNA-seq中差异表达基因的表达变化趋势与qRT-PCR结果一致。综上表明,滇牡丹色斑的形成主要受花青素的影响,转录因子PdMYB 30与结构基因CHS、CHI和DFR在红色斑黄花硬蕾期(B-S1)因相似的高表达而呈正相关,预测PdMYB 30可能是在类黄酮生物合成中促进色斑形成的正调节因子,可以提高类黄酮生物合成通路中结构基因的表达量,从而促进植物中花青素的积累。该研究为制定高效的滇牡丹育种技术提供了科学依据。
关键词
滇牡丹
色斑形成
转录组
代谢组
差异表达基因
Keywords
Paeonia delavayi
colour spot formation
transcriptome
metabolome
differentially expressed genes(DEGs)
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
棉花竹FsMyb1基因的生物信息学研究
被引量：
3
2
作者
彭桂莎
杨宇明
孙浩
张怀璧
王娟
机构
西南林业大学国家林业局西南地区生物多样性保育重点实验室
云南省林业科学院
新西兰皇家植物与食品研究所
出处
《西部林业科学》
CAS
2011年第4期5-11,共7页
基金
国家林业局948项目(2008-4-30)"竹子重要性状的基因工程研究技术引进"
云南省科技计划项目2009CD073
云南省中青年学术技术带头人后备人才培养项目(2010CI016)共同资助研究
文摘
以项目组已克隆并在GenBank中登记的棉花竹的FsMyb1基因(GU390881)序列为基础,利用生物信息学分析方法,对其编码的FsMyb1蛋白进行理化性质、分子结构、生物功能预测和分析。结果显示,棉花竹FsMyb1基因编码是一种亲水性蛋白质;无信号肽,无导肽,无跨膜结构域;亚细胞定位为细胞核;共有2个糖基化位点和21个磷酸化位点。二级结构包括无规则卷曲、α-螺旋、延伸链;三级结构的构象为α-helix/loop混合型构象,是典型的R2R3-Myb转录因子。同源比对和进化分析结果显示,FsMyb1蛋白与OsMyb等蛋白有很高的同源性。初步推测,FsMyb1蛋白可能是一类调节苯丙氨酸代谢,尤其是一种与调节次生细胞壁增厚和花青素生物合成功能相关的转录调节因子。
关键词
MYB基因
生物信息学分析
棉花竹
苯丙氨酸代谢
Keywords
Myb gene
bioinformatics analysis
Fargesia fungosa
phenylalanine metabolism
分类号
S795 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
滇牡丹PdANS的克隆、表达及与花青素含量的相关性
被引量：
4
3
作者
平怀磊
郭雪
余潇
宋静
杜春
王娟
张怀璧
机构
西南林业大学林学院
西南林业大学园林园艺学院
西南林业大学绿色发展
研究
院
新西兰皇家植物与食品研究所
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期206-217,共12页
基金
云南省重大基础专项生物资源数字化开发应用项目(202002AA100007)
国家自然科学基金项目(32060089)
云南省万人计划“云岭产业技术领军人才”专项(云发改[2018]212号)
文摘
花色是观赏植物最重要的品质性状之一,在植物生长发育过程中发挥着重要作用。探明滇牡丹的花色调控机理,为提高观赏价值奠定理论基础。以花瓣为材料,克隆获得PdANS,生物信息学分析其特征,结合实时荧光定量PCR、HPLC等技术探究不同组织、不同发育时期中PdANS的表达情况与各组织花青素含量的相关性。结果表明,PdANS全长1 121 bp,包含一个1 064bp的开放阅读框(ORF),编码354个氨基酸,相对分子质量40.41 kD,理论等电点(pI)5.48,分子式为C_(1819)H_(2876)N_(474)O_(540)S_(12),脂肪指数为88.64,不稳定指数(Ⅱ)为55.32,亲水平均数为-0.435,推测为不稳定的亲水蛋白。且无信号肽序列及跨膜螺旋区,是没有分泌功能的非跨膜蛋白。系统进化分析显示,滇牡丹PdANS与牡丹、芍药等植物的ANS蛋白亲缘关系最近。RT-qPCR结果显示,PdANS在花瓣、花药、萼片、苞片和花梗中均有表达,以花瓣中的表达量最高。HPLC结果表明,在不同组织提取液中,分别检测出Cy3G5G、Pn3G5G、Cy3G和Pn3G四种花青素,且花青素含量花瓣>花药>萼片>花梗>苞片。相关性分析表明,花青素含量与PdANS表达量呈极显著相关性。推测PdANS在滇牡丹花色的形成中扮演着重要角色,参与花青素物质的生物合成。
关键词
滇牡丹
ANS基因
花青素
生物信息学分析
HPLC
Keywords
Paeonia delavayi
ANS gene
anthocyanin
bioinformatics analysis
HPLC
分类号
S685.11 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
滇牡丹花瓣色斑形成的分子机制研究
李海清
杜春
王娟
张怀璧
《广西植物》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
棉花竹FsMyb1基因的生物信息学研究
彭桂莎
杨宇明
孙浩
张怀璧
王娟
《西部林业科学》
CAS
2011
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
滇牡丹PdANS的克隆、表达及与花青素含量的相关性
平怀磊
郭雪
余潇
宋静
杜春
王娟
张怀璧
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
4
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