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基于T2T基因组鉴定大豆R2R3-MYB基因家族及干旱和盐胁迫下的表达分析
1
作者
李志强
罗正乾
+4 位作者
徐琳黎
周国慧
屈丝雨
刘恩良
顼东婷
《生物技术通报》
北大核心
2025年第5期141-152,共12页
【目的】R2R3-MYB转录因子在植物响应逆境胁迫过程中发挥着重要作用,旨在对大豆R2R3-MYB转录因子进行完整鉴定以及研究大豆R2R3-MYB基因在逆境胁迫中的作用。【方法】利用大豆无gap端粒到端粒(T2T)基因组对大豆R2R3-MYB家族基因进行系...
【目的】R2R3-MYB转录因子在植物响应逆境胁迫过程中发挥着重要作用,旨在对大豆R2R3-MYB转录因子进行完整鉴定以及研究大豆R2R3-MYB基因在逆境胁迫中的作用。【方法】利用大豆无gap端粒到端粒(T2T)基因组对大豆R2R3-MYB家族基因进行系统鉴定和进化分析,并使用RT-qPCR对该家族的基因在干旱和盐胁迫下进行表达分析。【结果】大豆基因组中包含324个R2R3-MYB基因,新鉴定到77个,分布在20条染色体上。进化分析结果显示大豆R2R3-MYB家族基因可分为4个亚组,共线性基因对在进化树的分支上距离更近。通过启动子分析发现,与ABA和抗旱相关的顺式作用元件最多。通过表达分析,推测10个基因参与了大豆耐盐过程,其中GmMYB19和GmMYB76已被报道,GmMYB89和GmMYB214是首次鉴定并发现可能与大豆抗旱耐盐性有关。【结论】在大豆中鉴定到321个R2R3-MYB家族基因,通过干旱和盐胁迫诱导的表达模式分析确定了10个抗旱耐盐的候选基因。
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关键词
大豆
R2R3-MYB基因家族
生物信息学分析
干旱和盐胁迫
表达分析
T2T
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题名
基于T2T基因组鉴定大豆R2R3-MYB基因家族及干旱和盐胁迫下的表达分析
1
作者
李志强
罗正乾
徐琳黎
周国慧
屈丝雨
刘恩良
顼东婷
机构
新疆艾德森生物科技有限公司
新疆
农业科学院综合试验场站
新疆
农业科学院粮食作物研究所
山西省
科技
情报与战略研究中心
出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第5期141-152,共12页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金资助项目(2023D01B17)。
文摘
【目的】R2R3-MYB转录因子在植物响应逆境胁迫过程中发挥着重要作用,旨在对大豆R2R3-MYB转录因子进行完整鉴定以及研究大豆R2R3-MYB基因在逆境胁迫中的作用。【方法】利用大豆无gap端粒到端粒(T2T)基因组对大豆R2R3-MYB家族基因进行系统鉴定和进化分析,并使用RT-qPCR对该家族的基因在干旱和盐胁迫下进行表达分析。【结果】大豆基因组中包含324个R2R3-MYB基因,新鉴定到77个,分布在20条染色体上。进化分析结果显示大豆R2R3-MYB家族基因可分为4个亚组,共线性基因对在进化树的分支上距离更近。通过启动子分析发现,与ABA和抗旱相关的顺式作用元件最多。通过表达分析,推测10个基因参与了大豆耐盐过程,其中GmMYB19和GmMYB76已被报道,GmMYB89和GmMYB214是首次鉴定并发现可能与大豆抗旱耐盐性有关。【结论】在大豆中鉴定到321个R2R3-MYB家族基因,通过干旱和盐胁迫诱导的表达模式分析确定了10个抗旱耐盐的候选基因。
关键词
大豆
R2R3-MYB基因家族
生物信息学分析
干旱和盐胁迫
表达分析
T2T
Keywords
Glycine max
R2R3-MYB gene family
bioinformatics analysis
drought and salt stress
expression analysis
T2T
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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1
基于T2T基因组鉴定大豆R2R3-MYB基因家族及干旱和盐胁迫下的表达分析
李志强
罗正乾
徐琳黎
周国慧
屈丝雨
刘恩良
顼东婷
《生物技术通报》
北大核心
2025
0
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