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74-plex SNPs复合检测体系在中国人群中的族群推断研究
被引量：
4
1
作者
刘杨
孙昌春
+6 位作者
马咪
王玲
赵雯婷
马泉
季安全
刘京
李彩霞
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期296-308,共13页
使用一组祖源SNP可以分析某人群的遗传成分,推断某个体的族群来源。本课题组前期筛选出74个SNP位点实现了撒哈拉以南的非洲、北非、欧洲、美洲、大洋洲、南亚、西南亚、东亚、东北亚和东南亚等10个地理区域人群的推断,并基于Mass ARRAY...
使用一组祖源SNP可以分析某人群的遗传成分,推断某个体的族群来源。本课题组前期筛选出74个SNP位点实现了撒哈拉以南的非洲、北非、欧洲、美洲、大洋洲、南亚、西南亚、东亚、东北亚和东南亚等10个地理区域人群的推断,并基于Mass ARRAY质谱分析技术构建了74-plexSNPs复合检测体系。本研究利用该体系对14个中国人群1371份样本进行基因分型,验证评估该体系对中国人群的区分能力和法医学应用效能。首先,基于全球57个人群3628份个体构建参考人群分型库,采用Structure分析和等位基因频率热图等方法进行人群区分能力评估;然后,选取千人基因组计划中3个人群(不包含在参考人群分型库中)及本实验室检测的14个人群共计1654个体作为测试数据集,通过似然比和族群成分等统计分析,评估该体系对实际样本的族群来源推断能力。结果表明,DNA的量最低为1.5ng时,74个SNP均可正确判型,适用于微量检材的检测;该体系对全球10个地理区域人群有区分能力,针对测试人群中欧洲、美洲、南部非洲个体族群来源推断的准确率为95.4%、不排除率为1.06%,东亚个体推断的准确率为71.0%、不排除率为17.9%,东南亚个体推断的准确率66.4%、不排除率为33.3%。该方法可以为实际案件侦察提供线索。
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关键词
法医遗传学
祖源SNP
族群推断
中国人群
在线阅读
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职称材料
27重SNP复合扩增技术推断犯罪嫌疑人族群1例
被引量：
3
2
作者
马咪
刘京
+8 位作者
江丽
赵蕾
王博超
虎建华
张涛
周浩
冯保强
刘海渤
李彩霞
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2018年第6期730-732,共3页
1案例1.1简要案情某年1月,新疆生产建设兵团某师辖区内发生一起故意杀人案,嫌疑人作案手段凶残,死者被锐器刺穿颈动脉和气管,导致失血性休克死亡。
关键词
法医遗传学
多态性
单核苷酸
祖先信息标记
复合扩增
种族推断
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职称材料
题名
74-plex SNPs复合检测体系在中国人群中的族群推断研究
被引量：
4
1
作者
刘杨
孙昌春
马咪
王玲
赵雯婷
马泉
季安全
刘京
李彩霞
机构
山西医科大学
公安
部物证鉴定中心
新疆生产建设兵团第七师公安局
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期296-308,共13页
基金
国家自然科学基金项目(编号:81772027)
国家重点研发计划资(编号:2017YFC0803501),国家科技资源共享服务平台计划项目(编号:YCZYPT[2017]01-3)
中央公益类基本科研业务费专项资金项目(编号:2017JB025,2017JB026,2019JB011)资助。
文摘
使用一组祖源SNP可以分析某人群的遗传成分,推断某个体的族群来源。本课题组前期筛选出74个SNP位点实现了撒哈拉以南的非洲、北非、欧洲、美洲、大洋洲、南亚、西南亚、东亚、东北亚和东南亚等10个地理区域人群的推断,并基于Mass ARRAY质谱分析技术构建了74-plexSNPs复合检测体系。本研究利用该体系对14个中国人群1371份样本进行基因分型,验证评估该体系对中国人群的区分能力和法医学应用效能。首先,基于全球57个人群3628份个体构建参考人群分型库,采用Structure分析和等位基因频率热图等方法进行人群区分能力评估;然后,选取千人基因组计划中3个人群(不包含在参考人群分型库中)及本实验室检测的14个人群共计1654个体作为测试数据集,通过似然比和族群成分等统计分析,评估该体系对实际样本的族群来源推断能力。结果表明,DNA的量最低为1.5ng时,74个SNP均可正确判型,适用于微量检材的检测;该体系对全球10个地理区域人群有区分能力,针对测试人群中欧洲、美洲、南部非洲个体族群来源推断的准确率为95.4%、不排除率为1.06%,东亚个体推断的准确率为71.0%、不排除率为17.9%,东南亚个体推断的准确率66.4%、不排除率为33.3%。该方法可以为实际案件侦察提供线索。
关键词
法医遗传学
祖源SNP
族群推断
中国人群
Keywords
forensic genetics
AISNPs
ancestry inference
Chinese populations
分类号
D919 [医药卫生—法医学]
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职称材料
题名
27重SNP复合扩增技术推断犯罪嫌疑人族群1例
被引量：
3
2
作者
马咪
刘京
江丽
赵蕾
王博超
虎建华
张涛
周浩
冯保强
刘海渤
李彩霞
机构
公安
部物证鉴定中心法医遗传学
公安
部重点实验室北京市现场物证检验工程技术研究中心现场物证溯源技术国家工程实验室
新疆生产建设兵团第七师公安局
新疆生产建设兵团
公安局
出处
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2018年第6期730-732,共3页
基金
国家重点研发计划资助项目(2017YFC0803501)
国家科技资源共享服务平台计划资助项目(YCZYPT[2017] 01-3)
+2 种基金
公安科技成果推广引导计划资助项目(2016TGYDGAES14)
国家自然科学基金资助项目(81772027)
中央公益类基本科研业务费专项资金项目(2017JB025)
文摘
1案例1.1简要案情某年1月,新疆生产建设兵团某师辖区内发生一起故意杀人案,嫌疑人作案手段凶残,死者被锐器刺穿颈动脉和气管,导致失血性休克死亡。
关键词
法医遗传学
多态性
单核苷酸
祖先信息标记
复合扩增
种族推断
分类号
DF795.2 [医药卫生—法医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
74-plex SNPs复合检测体系在中国人群中的族群推断研究
刘杨
孙昌春
马咪
王玲
赵雯婷
马泉
季安全
刘京
李彩霞
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
27重SNP复合扩增技术推断犯罪嫌疑人族群1例
马咪
刘京
江丽
赵蕾
王博超
虎建华
张涛
周浩
冯保强
刘海渤
李彩霞
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2018
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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