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荒漠植物内生菌多样性及其增强农作物抗旱和耐盐性的研究进展
被引量：
9
1
作者
伊帕热·帕尔哈提
祖力胡玛尔·肉孜
+3 位作者
田永芝
朱艳蕾
李远婷
马晓林
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第12期88-99,共12页
与内生菌共生是荒漠植物应对极端环境的重要策略。内生菌可促进宿主植物抗旱和耐盐生长,且荒漠植物内生菌可以相似方式促进非宿主农作物的抗逆生长,有望解决极端环境下粮食减产问题。本文综述了近年来荒漠植物来源的内生菌种类及其宿主...
与内生菌共生是荒漠植物应对极端环境的重要策略。内生菌可促进宿主植物抗旱和耐盐生长,且荒漠植物内生菌可以相似方式促进非宿主农作物的抗逆生长,有望解决极端环境下粮食减产问题。本文综述了近年来荒漠植物来源的内生菌种类及其宿主植物多样性,并从植物-微生物共生互作的生理(激素、代谢物、抗氧化物及渗透势调节)到分子(酶和基因)水平,系统分析了内生菌对宿主及非宿主农作物发挥协同抗旱和耐盐的作用机制。结合本课题组多年从事荒漠植物内生菌的研究进展,在获得大量具有促生抗逆功能的菌株并探明其作用方式的基础上,为荒漠生态植被恢复及农业可持续发展探索备选方案。
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关键词
荒漠植物
内生菌
农作物
抗旱耐盐
抗逆响应基因
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职称材料
基于转录组测序筛选疆南绒山羊次级毛囊周期发育相关的circRNA
被引量：
1
2
作者
陆庆伟
唐森
+6 位作者
李彬
秦崇凯
刘文娜
蒲雪
王亚倩
吴翠玲
付雪峰
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1793-1806,共14页
【目的】探讨疆南绒山羊皮肤毛囊的生长发育机制,加深对次级毛囊发育相关候选基因遗传调控和功能的认识,为指导疆南绒山羊后期培育,改善其绒产量提供参考。【方法】利用高通量测序技术对疆南绒山羊次级毛囊生长期、退行期和休止期皮肤...
【目的】探讨疆南绒山羊皮肤毛囊的生长发育机制,加深对次级毛囊发育相关候选基因遗传调控和功能的认识,为指导疆南绒山羊后期培育,改善其绒产量提供参考。【方法】利用高通量测序技术对疆南绒山羊次级毛囊生长期、退行期和休止期皮肤组织中环状RNA(circRNA)进行分析,筛选出不同比较组的差异表达circRNA(DE circRNA),对其宿主基因进行GO功能、KEGG通路及蛋白互作(PPI)分析,并联合前期转录组数据构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络。【结果】在9个疆南绒山羊皮肤组织中共鉴定到2482个circRNAs。其中包含138个DE circRNAs,退行期和生长期、退行期和休止期、休止期和生长期比较组中分别存在54、74、65个DEcircRNAs。GO功能和KEGG通路分析揭示,DEcircRNA宿主基因主要富集在细胞黏附、整合素介导信号通路、细胞整合素复合物等功能通路,以及一些与毛囊生理过程有关的信号通路,如MAPK、TGF-beta、Hedgehog等。结合PPI网络推测14个circRNAs可能参与调控疆南绒山羊皮肤次级毛囊生长发育。通过6个DEcircRNAs、20个DE miRNAs、3个DEmRNAs和2个DElncRNAs构建了疆南绒山羊ceRNA网络。【结论】本研究通过转录组测序筛选出与疆南绒山羊次级毛囊周期发育相关的关键circRNAs,包括novel-gene5238-2、novel-gene7855-1、novel-gene4455-1等。研究结果为circRNA在绒山羊次级毛囊发育中的生物学功能和调控特性提供理论依据,也为疆南绒山羊育种提供了新的方向。
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关键词
疆南绒山羊
转录组测序
环状RNA(circRNA)
次级毛囊周期
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职称材料
题名
荒漠植物内生菌多样性及其增强农作物抗旱和耐盐性的研究进展
被引量：
9
1
作者
伊帕热·帕尔哈提
祖力胡玛尔·肉孜
田永芝
朱艳蕾
李远婷
马晓林
机构
新疆师范大学生命科学学院新疆特殊环境物种保护与调控生物学实验室新疆特殊环境物种多样性应用与调控重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第12期88-99,共12页
基金
国家自然科学基金项目(31860129)
新疆维吾尔自治区高校科研计划(XJEDU2021Y036)。
文摘
与内生菌共生是荒漠植物应对极端环境的重要策略。内生菌可促进宿主植物抗旱和耐盐生长,且荒漠植物内生菌可以相似方式促进非宿主农作物的抗逆生长,有望解决极端环境下粮食减产问题。本文综述了近年来荒漠植物来源的内生菌种类及其宿主植物多样性,并从植物-微生物共生互作的生理(激素、代谢物、抗氧化物及渗透势调节)到分子(酶和基因)水平,系统分析了内生菌对宿主及非宿主农作物发挥协同抗旱和耐盐的作用机制。结合本课题组多年从事荒漠植物内生菌的研究进展,在获得大量具有促生抗逆功能的菌株并探明其作用方式的基础上,为荒漠生态植被恢复及农业可持续发展探索备选方案。
关键词
荒漠植物
内生菌
农作物
抗旱耐盐
抗逆响应基因
Keywords
desert plant
endophyte
crops
drought and salt tolerance
genes associated with stress
分类号
S182 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
基于转录组测序筛选疆南绒山羊次级毛囊周期发育相关的circRNA
被引量：
1
2
作者
陆庆伟
唐森
李彬
秦崇凯
刘文娜
蒲雪
王亚倩
吴翠玲
付雪峰
机构
新疆
农业
大学
动物
科学
学院
新疆
畜牧
科学
院畜牧研究所
新疆
畜牧
科学
院
生物
技术研究所
阿克苏地区畜牧技术推广中心
新疆师范大学
生命科学
学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1793-1806,共14页
基金
国家重点研发计划(2021YFD1200902)
国家自然科学基金(32360814)
+2 种基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金(2022D01B107)
新疆维吾尔自治区“天池英才”
新疆维吾尔自治区创新环境建设专项(2021D04008)
文摘
【目的】探讨疆南绒山羊皮肤毛囊的生长发育机制,加深对次级毛囊发育相关候选基因遗传调控和功能的认识,为指导疆南绒山羊后期培育,改善其绒产量提供参考。【方法】利用高通量测序技术对疆南绒山羊次级毛囊生长期、退行期和休止期皮肤组织中环状RNA(circRNA)进行分析,筛选出不同比较组的差异表达circRNA(DE circRNA),对其宿主基因进行GO功能、KEGG通路及蛋白互作(PPI)分析,并联合前期转录组数据构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络。【结果】在9个疆南绒山羊皮肤组织中共鉴定到2482个circRNAs。其中包含138个DE circRNAs,退行期和生长期、退行期和休止期、休止期和生长期比较组中分别存在54、74、65个DEcircRNAs。GO功能和KEGG通路分析揭示,DEcircRNA宿主基因主要富集在细胞黏附、整合素介导信号通路、细胞整合素复合物等功能通路,以及一些与毛囊生理过程有关的信号通路,如MAPK、TGF-beta、Hedgehog等。结合PPI网络推测14个circRNAs可能参与调控疆南绒山羊皮肤次级毛囊生长发育。通过6个DEcircRNAs、20个DE miRNAs、3个DEmRNAs和2个DElncRNAs构建了疆南绒山羊ceRNA网络。【结论】本研究通过转录组测序筛选出与疆南绒山羊次级毛囊周期发育相关的关键circRNAs,包括novel-gene5238-2、novel-gene7855-1、novel-gene4455-1等。研究结果为circRNA在绒山羊次级毛囊发育中的生物学功能和调控特性提供理论依据,也为疆南绒山羊育种提供了新的方向。
关键词
疆南绒山羊
转录组测序
环状RNA(circRNA)
次级毛囊周期
Keywords
Jiangnan cashmere goats
transcriptome sequencing
circular RNA(circRNA)
secondary hair follicle cycle
分类号
S827 [农业科学—畜牧学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
荒漠植物内生菌多样性及其增强农作物抗旱和耐盐性的研究进展
伊帕热·帕尔哈提
祖力胡玛尔·肉孜
田永芝
朱艳蕾
李远婷
马晓林
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
9
在线阅读
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职称材料
2
基于转录组测序筛选疆南绒山羊次级毛囊周期发育相关的circRNA
陆庆伟
唐森
李彬
秦崇凯
刘文娜
蒲雪
王亚倩
吴翠玲
付雪峰
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
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