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喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNA D-loop区遗传多样性及系统发育分析
被引量：
21
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作者
李静
郭丽君
+4 位作者
王莉
胡平
肖逸
韩建林
王玉涛
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2020年第8期2481-2492,共12页
为明确喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛遗传多样性水平、遗传分化和系统进化地位,本研究选择mtDNA D-loop区序列作为分子标记,采用PCR直接测序和生物信息学方法分析喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNA D-loop区序列特征和遗传多样性,利用GenBank中...
为明确喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛遗传多样性水平、遗传分化和系统进化地位,本研究选择mtDNA D-loop区序列作为分子标记,采用PCR直接测序和生物信息学方法分析喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNA D-loop区序列特征和遗传多样性,利用GenBank中牦牛序列,采用最大似然法构建系统发育树和中介网络关系。结果显示,喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNA D-loop序列富含A、T碱基,AT含量为61.2%,存在63个多态位点,占核苷酸总数的7.04%,平均单倍型多样性(Hd)为0.806,平均核苷酸多样性(π)为0.01528,平均核苷酸差异数(K)为13.509,表明喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛遗传多样性丰富;系统发育分析显示,中国境内牦牛形成两大分支,细分为6个小进化支,存在两个母系起源,表明喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛拥有两个不同的母系起源;中介网络关系分析显示,喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛与其他品种牦牛单倍型共享较少,在分支C中喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛群体所占比例较大,且与野牦牛共享。喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛群体具有较独特的遗传背景,推测可能是从早期野牦牛驯化而来。建议加大该区域牦牛品种的认定和品种标准的制定,加强对该区域牦牛遗传资源的保护;根据群体现状,引入野血牦牛进行提纯复壮,防止品种退化和遗传多样性降低;减少外来牦牛品种的引进而无序杂交,以确保优质牦牛品种资源的本品种特性。
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关键词
喀喇昆仑-帕米尔地区
牦牛
mtDNA
D-loop
遗传多样性
系统发育
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题名
喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNA D-loop区遗传多样性及系统发育分析
被引量：
21
1
作者
李静
郭丽君
王莉
胡平
肖逸
韩建林
王玉涛
机构
喀什
大学生命与地理科学学院
新疆
帕米尔高原生物资源与生态重点实验室
新疆喀什第二中学
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2020年第8期2481-2492,共12页
基金
中国科学院“西部之光”项目(2018-XBQNXZ-A1-002)
喀什大学创新团队建设项目((17)2602)
喀什大学校内课题((17)2606)。
文摘
为明确喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛遗传多样性水平、遗传分化和系统进化地位,本研究选择mtDNA D-loop区序列作为分子标记,采用PCR直接测序和生物信息学方法分析喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNA D-loop区序列特征和遗传多样性,利用GenBank中牦牛序列,采用最大似然法构建系统发育树和中介网络关系。结果显示,喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNA D-loop序列富含A、T碱基,AT含量为61.2%,存在63个多态位点,占核苷酸总数的7.04%,平均单倍型多样性(Hd)为0.806,平均核苷酸多样性(π)为0.01528,平均核苷酸差异数(K)为13.509,表明喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛遗传多样性丰富;系统发育分析显示,中国境内牦牛形成两大分支,细分为6个小进化支,存在两个母系起源,表明喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛拥有两个不同的母系起源;中介网络关系分析显示,喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛与其他品种牦牛单倍型共享较少,在分支C中喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛群体所占比例较大,且与野牦牛共享。喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛群体具有较独特的遗传背景,推测可能是从早期野牦牛驯化而来。建议加大该区域牦牛品种的认定和品种标准的制定,加强对该区域牦牛遗传资源的保护;根据群体现状,引入野血牦牛进行提纯复壮,防止品种退化和遗传多样性降低;减少外来牦牛品种的引进而无序杂交,以确保优质牦牛品种资源的本品种特性。
关键词
喀喇昆仑-帕米尔地区
牦牛
mtDNA
D-loop
遗传多样性
系统发育
Keywords
Karakoram-Pamir area
yak
mtDNA D-loop
genetic diversity
phylogeny
分类号
S823.8 [农业科学—畜牧学]
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1
喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNA D-loop区遗传多样性及系统发育分析
李静
郭丽君
王莉
胡平
肖逸
韩建林
王玉涛
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2020
21
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