背景与目的肺癌是我国最常见的恶性肿瘤,肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)是肺癌的主要类型,严重威胁着人民的生命健康,目前关于血清分泌型蛋白1(Dikkopf 1,DKK1)在LUAD中的作用研究较少,本研究旨在通过生物信息学方法探究DKK1在LUAD...背景与目的肺癌是我国最常见的恶性肿瘤,肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)是肺癌的主要类型,严重威胁着人民的生命健康,目前关于血清分泌型蛋白1(Dikkopf 1,DKK1)在LUAD中的作用研究较少,本研究旨在通过生物信息学方法探究DKK1在LUAD发生发展中的作用及潜在的预后价值。方法应用基因型组织表达(genotype-tissue expression,GTEx)、癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库和肿瘤与免疫系统交互网站(tumor-immune system interactions database,TISIDB)等多个数据库,对DKK1在LUAD中的表达、临床病理特征、免疫细胞浸润、预后和甲基化等进行分析,同时应用LinkedOmics数据库分析DKK1的共表达基因及其功能富集。收集2016年至2017年于新疆医科大学附属肿瘤医院行手术治疗的59例石蜡包埋的LUAD患者病理样本,通过免疫组织化学试验(immunohistochemistry,IHC)进行表达预后验证。结果生信分析结果显示DKK1在LUAD组织的表达水平高于正常组织,晚期癌症中的表达高于早期阶段,实验验证后发现59例LUAD中阴性表达15例(25.4%),弱阳性表达18例(30.5%),强阳性表达26例(44.1%)。DKK1的不同表达情况与甲基化、预后以及多种免疫细胞的活动相关。功能富集显示DKK1可能参与表皮发育、细胞-基质连接等过程,京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析表明DKK1与ABC转运蛋白相关。生物信息学分析及临床病例标本显示DKK1高表达与LUAD患者较差的预后有关。结论DKK1在LUAD中高表达,与患者预后不良有关,并且DKK1与肿瘤免疫细胞浸润和通路密切相关。DKK1可能是LUAD潜在的预后标志物和免疫治疗新靶点。展开更多
文摘背景与目的肺癌是我国最常见的恶性肿瘤,肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)是肺癌的主要类型,严重威胁着人民的生命健康,目前关于血清分泌型蛋白1(Dikkopf 1,DKK1)在LUAD中的作用研究较少,本研究旨在通过生物信息学方法探究DKK1在LUAD发生发展中的作用及潜在的预后价值。方法应用基因型组织表达(genotype-tissue expression,GTEx)、癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库和肿瘤与免疫系统交互网站(tumor-immune system interactions database,TISIDB)等多个数据库,对DKK1在LUAD中的表达、临床病理特征、免疫细胞浸润、预后和甲基化等进行分析,同时应用LinkedOmics数据库分析DKK1的共表达基因及其功能富集。收集2016年至2017年于新疆医科大学附属肿瘤医院行手术治疗的59例石蜡包埋的LUAD患者病理样本,通过免疫组织化学试验(immunohistochemistry,IHC)进行表达预后验证。结果生信分析结果显示DKK1在LUAD组织的表达水平高于正常组织,晚期癌症中的表达高于早期阶段,实验验证后发现59例LUAD中阴性表达15例(25.4%),弱阳性表达18例(30.5%),强阳性表达26例(44.1%)。DKK1的不同表达情况与甲基化、预后以及多种免疫细胞的活动相关。功能富集显示DKK1可能参与表皮发育、细胞-基质连接等过程,京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析表明DKK1与ABC转运蛋白相关。生物信息学分析及临床病例标本显示DKK1高表达与LUAD患者较差的预后有关。结论DKK1在LUAD中高表达,与患者预后不良有关,并且DKK1与肿瘤免疫细胞浸润和通路密切相关。DKK1可能是LUAD潜在的预后标志物和免疫治疗新靶点。
