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基于生物信息学构建宫颈癌预后相关ceRNA网络
被引量:
1
1
作者
任敬秦
周常慧
+3 位作者
刘成清
娜孜拉·赛提尼亚孜
杨楠
李榕
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2024年第5期385-391,共7页
目的分析宫颈癌中环状RNA(circRNA)-长链非编码RNA(lncRNA)-微RNA(miRNA)-mRNA网络并构建预后模型。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库的数据,通过生物信息学分析差异基因及关键基因。基于TCGA数据库采用单变量、L...
目的分析宫颈癌中环状RNA(circRNA)-长链非编码RNA(lncRNA)-微RNA(miRNA)-mRNA网络并构建预后模型。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库的数据,通过生物信息学分析差异基因及关键基因。基于TCGA数据库采用单变量、LASSO和多变量Cox回归分析建立预后mRNA模型,并使用GEO数据库进行验证。利用R包及Cystoscape软件构建Nomogram模型及宫颈癌circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络。结果通过单变量、LASSO和多变量Cox回归分析,构建了包含5个mRNA的预后模型,该模型的1、2、3年受试者操作特征曲线下面积分别为0.71、0.71、0.70。同时,在GSE44001中验证预测结果,该预后模型的Nomogram模型C-index为0.707。本研究共构建了包含39个circRNA、27个lncRNA、12个miRNA和5个mRNA的ceRNA网络。结论本研究揭示的网络有助于探讨宫颈癌ceRNA的机制,构建预后模型及Nomogram模型可以预测患者预后。
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关键词
竞争性内源RNA
环状RNA
长链非编码RNA
宫颈癌
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职称材料
磁共振扩散加权成像表观扩散系数与肿块型浸润性乳腺癌分子亚型的相关性
被引量:
10
2
作者
尚柳彤
杨家斐
+6 位作者
卢晶
王婷婷
周颖
邢新博
王鑫坤
杨淑辉
胡明艳
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期1410-1414,共5页
目的探讨磁共振扩散加权成像表观扩散系数(ADC)与肿块型浸润性乳腺癌5种分子亚型及其生物学预后因子相关性。方法回顾分析64例经手术或活检病理证实为浸润性乳腺癌患者(69个肿块型病灶)的磁共振影像学资料,比较不同分子亚型间平均ADC值...
目的探讨磁共振扩散加权成像表观扩散系数(ADC)与肿块型浸润性乳腺癌5种分子亚型及其生物学预后因子相关性。方法回顾分析64例经手术或活检病理证实为浸润性乳腺癌患者(69个肿块型病灶)的磁共振影像学资料,比较不同分子亚型间平均ADC值及其与乳腺癌生物学预后因子雌激素受体、孕激素受体、人类表皮生长因子受体-2、Ki-67的表达的关系。结果浸润性乳腺癌5种分子亚型间ADC值无显著差异(P>0.05);雌激素受体、孕激素受体、人类表皮生长因子受体-2阳性、阴性组ADC值差异均无统计学意义(P>0.05);但HER2阳性组平均ADC值高于阴性组;Ki-67阳性、阴性组ADC值差异有统计学意义(P=0.023)。阴性组ADC值明显高于阳性组,ADC值与Ki-67的表达呈负相关(r=-0.249)。结论 ADC不能鉴别肿块型浸润性乳腺癌5种分子亚型,但与浸润性乳腺癌预后因子Ki-67的表达存在相关性,对指导治疗和判断预后有一定意义。
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关键词
乳腺肿瘤
磁共振成像
表观扩散系数
预后因子
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职称材料
题名
基于生物信息学构建宫颈癌预后相关ceRNA网络
被引量:
1
1
作者
任敬秦
周常慧
刘成清
娜孜拉·赛提尼亚孜
杨楠
李榕
机构
新疆医科大学公共卫生学院儿少卫生与妇幼保健学教研室
新疆
特殊环境与健康研究重点实验室
中亚高发病成因与防治国家重点实验室
出处
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2024年第5期385-391,共7页
基金
国家自然科学基金(82060468)
中亚高发病成因与防治国家重点实验室(SKL-HIDCA-2022-GJ2)
新疆维吾尔自治区“十四五”高等学校特色学科-公共卫生与预防医学。
文摘
目的分析宫颈癌中环状RNA(circRNA)-长链非编码RNA(lncRNA)-微RNA(miRNA)-mRNA网络并构建预后模型。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库的数据,通过生物信息学分析差异基因及关键基因。基于TCGA数据库采用单变量、LASSO和多变量Cox回归分析建立预后mRNA模型,并使用GEO数据库进行验证。利用R包及Cystoscape软件构建Nomogram模型及宫颈癌circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络。结果通过单变量、LASSO和多变量Cox回归分析,构建了包含5个mRNA的预后模型,该模型的1、2、3年受试者操作特征曲线下面积分别为0.71、0.71、0.70。同时,在GSE44001中验证预测结果,该预后模型的Nomogram模型C-index为0.707。本研究共构建了包含39个circRNA、27个lncRNA、12个miRNA和5个mRNA的ceRNA网络。结论本研究揭示的网络有助于探讨宫颈癌ceRNA的机制,构建预后模型及Nomogram模型可以预测患者预后。
关键词
竞争性内源RNA
环状RNA
长链非编码RNA
宫颈癌
Keywords
ceRNA
circular RNA
long non-coding RNA
cervical cancer
分类号
R737.33 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
磁共振扩散加权成像表观扩散系数与肿块型浸润性乳腺癌分子亚型的相关性
被引量:
10
2
作者
尚柳彤
杨家斐
卢晶
王婷婷
周颖
邢新博
王鑫坤
杨淑辉
胡明艳
机构
解放军总医院第一附属医院放射科
新疆医科大学公共卫生学院儿少卫生与妇幼保健学教研室
解放军总医院第一附属医院病理科
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期1410-1414,共5页
文摘
目的探讨磁共振扩散加权成像表观扩散系数(ADC)与肿块型浸润性乳腺癌5种分子亚型及其生物学预后因子相关性。方法回顾分析64例经手术或活检病理证实为浸润性乳腺癌患者(69个肿块型病灶)的磁共振影像学资料,比较不同分子亚型间平均ADC值及其与乳腺癌生物学预后因子雌激素受体、孕激素受体、人类表皮生长因子受体-2、Ki-67的表达的关系。结果浸润性乳腺癌5种分子亚型间ADC值无显著差异(P>0.05);雌激素受体、孕激素受体、人类表皮生长因子受体-2阳性、阴性组ADC值差异均无统计学意义(P>0.05);但HER2阳性组平均ADC值高于阴性组;Ki-67阳性、阴性组ADC值差异有统计学意义(P=0.023)。阴性组ADC值明显高于阳性组,ADC值与Ki-67的表达呈负相关(r=-0.249)。结论 ADC不能鉴别肿块型浸润性乳腺癌5种分子亚型,但与浸润性乳腺癌预后因子Ki-67的表达存在相关性,对指导治疗和判断预后有一定意义。
关键词
乳腺肿瘤
磁共振成像
表观扩散系数
预后因子
Keywords
breast neoplasms
magnetic resonance imaging
diffusion-weighted imaging
prognostic factors
分类号
R445.2 [医药卫生—影像医学与核医学]
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学构建宫颈癌预后相关ceRNA网络
任敬秦
周常慧
刘成清
娜孜拉·赛提尼亚孜
杨楠
李榕
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2024
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
磁共振扩散加权成像表观扩散系数与肿块型浸润性乳腺癌分子亚型的相关性
尚柳彤
杨家斐
卢晶
王婷婷
周颖
邢新博
王鑫坤
杨淑辉
胡明艳
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
10
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