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新疆地区牛冠状病毒的分子流行病学调查 被引量：7
1
作者 王梦娇 蒋倩 +6 位作者 马学军 夏瑞阳 郭雪萍 孙磊 钟旗 马雪连 姚刚 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期5125-5133,共9页
牛冠状病毒(bovine coronavirus,BCoV)是造成犊牛腹泻的主要病原之一。新疆养牛业发展迅速,国内外引入品种数量日益增多,BCoV感染呈上升态势,但对其流行现状与规律缺乏全面了解。本研究于2020—2022年对新疆南、北疆养牛业主产区BCoV感... 牛冠状病毒(bovine coronavirus,BCoV)是造成犊牛腹泻的主要病原之一。新疆养牛业发展迅速,国内外引入品种数量日益增多,BCoV感染呈上升态势,但对其流行现状与规律缺乏全面了解。本研究于2020—2022年对新疆南、北疆养牛业主产区BCoV感染的流行情况进行了两年跟踪调查,共采集犊牛腹泻粪样本652份,采用RT-PCR方法进行了BCoV检测。对分离鉴定到的毒株进行了遗传进化分析。结果发现,BCoV总阳性率23.93%(156/652)。BCoV感染呈季节性变化,冬季为主要感染季节,检出率高达50.85%。南疆地区BCoV发病率高于北疆地区。与奶用犊牛相比,肉用犊牛更易感染。遗传进化分析表明:本试验分离到的BCoV毒株暂命名为BCoV/China/XJ-CJ/2022,该毒株的S基因与2018年毒株MN982199.1进化关系最近,N基因与2018年毒株MK095169.1BCOV-China/SWUN/LN4/2018进化关系最近,M基因与2017年毒株MK095148.1 China/SWUN/SC1/2017进化关系最近,HE基因与2017年毒株MK095136.1 BCOV-China/SWUN/SC2/2017进化关系最近。使用软件分析BCoV/China/XJ-CJ/2022与其它国家出现的BCoV毒株之间未出现基因重组现象。经5个结构蛋白的核苷酸和氨基酸相似性分析,发现其基因依然与中国国内本土毒株FJ938064.1_E-AH187-TC相似度最高,分别最低达到91.50%和96.70%。调查结果表明,BCoV在新疆规模化牛场呈现出的季节、地域和品种间的感染差异性可为精准防控策略的制定提供数据支撑。 展开更多
关键词 牛冠状病毒 分子流行病学 遗传进化分析
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新疆喀什地区安格斯犊牛腹泻主要病毒性病原调查及牛诺如病毒全基因序列分析 被引量：4
2
作者 吴静 史晋成 +7 位作者 萨妮耶·库尔班 纳曼·阿卜杜拉 孙磊 姚刚 钟旗 骆梁涛 赵红琼 马雪连 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第11期4420-4428,共9页
【目的】调查新疆喀什地区安格斯犊牛腹泻主要病毒性病原流行情况及牛诺如病毒(Bovine norovirus,BNoV)全基因组遗传关系。【方法】采用RT-PCR技术分别对2021年不同季节在喀什4个牛场采集的363份犊牛腹泻粪便样品进行牛轮状病毒(Bovine ... 【目的】调查新疆喀什地区安格斯犊牛腹泻主要病毒性病原流行情况及牛诺如病毒(Bovine norovirus,BNoV)全基因组遗传关系。【方法】采用RT-PCR技术分别对2021年不同季节在喀什4个牛场采集的363份犊牛腹泻粪便样品进行牛轮状病毒(Bovine rotavirus,BRV)、牛冠状病毒(Bovine coronavirus,BCoV)、牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)和BNoV 4种病毒性病原检测,并对扩增获得的BNoV全基因序列进行分析。【结果】BCoV和BNoV检出率较高,分别为36.09%(131/363)和25.07%(91/363),混合感染中BCoV+BNoV检出数量最多,阳性率为44.00%(22/50)。对喀什地区4个场区进行检测,其中A场主要检测出BCoV和BNoV,检出率分别为43.52%(47/108)和32.41%(35/108);B场主要检测到BCoV,检出率为52.21%(71/136);C、D场病原检出率普遍较低。秋、冬季检出量最多的病毒分别为BNoV和BCoV,检出率分别为66.67%(50/75)和77.59%(90/116)。对BNoV全基因序列分析显示,本试验检测到的新疆喀什地区BNoV Bo/XJ-KS/01/CHN株(登录号:ON076888)属于GⅢ.2型BNoV,与中国CN/HB-SJZ和CH/HB/BD/2019毒株在进化树中处于同一分支,且与CN/HB-SJZ-2毒株核苷酸相似性最高,为93.70%;与英国分离到的Jena/1999/UK毒株核苷酸相似性最低,为72.49%。进一步对3个开放阅读框(ORF)比对分析发现,测得的BNoV全基因组序列与国内参考株CN/HB-SJZ-2的核苷酸和氨基酸相似性主要是在ORF1区域最高,分别为94.24%和98.69%;与国外参考株Jena/1999/UK的核苷酸和氨基酸相似性主要是在ORF3区域最低,分别为63.59%和64.57%。与国内外毒株比对结果显示,未出现基因重组现象。【结论】南疆地区犊牛腹泻流行情况因季节、场区不同有一定的差异。病毒性病原主要在秋、冬季感染率较高,以单一BCoV、BRV和BNoV感染为主。本研究测定分析的BNoV GⅢ.2型Bo/XJ-KS/01/CHN全基因序列与中国CN/HB-SJZ-2参考株亲缘关系最近,与国内外全基因组参考序列比对未出现基因重组现象。 展开更多
关键词 犊牛腹泻 病毒性病原 流行病学调查 遗传进化分析
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基于网络药理学和试验验证分析小檗碱治疗鸡沙门菌感染的作用机制 被引量：4
3
作者 张旭梅 魏玉荣 +4 位作者 许丞惠 杨彤 史慧君 付强 杨莉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期3557-3570,共14页
采用网络药理学、分子对接、分子动力学模拟等方法,结合沙门菌攻毒试验初步验证小檗碱(berberine,BBR)干预肉鸡肠炎的潜在靶点及作用机制。首先利用PharMapper数据库和Swisstargets数据库预测药物靶点;通过GeneCards数据库收集疾病靶点... 采用网络药理学、分子对接、分子动力学模拟等方法,结合沙门菌攻毒试验初步验证小檗碱(berberine,BBR)干预肉鸡肠炎的潜在靶点及作用机制。首先利用PharMapper数据库和Swisstargets数据库预测药物靶点;通过GeneCards数据库收集疾病靶点,并筛选出药物和疾病靶点的交集,将得到的交集靶点构建蛋白质互作网络及GO与KEGG富集分析;对筛选出的核心靶点进行分子对接验证和动力学模拟;后续建立肉鸡肠道炎症模型,观察其肠道组织形态变化,并利用RT-qPCR验证BBR对靶点蛋白mRNA表达量的影响。结果显示:最终筛选得到BBR潜在靶点374个,与肠炎交集174个;GO与KEGG富集分析分别得到197条目和73条目,主要涉及信号转导、蛋白磷酸化过程及PI3K-Akt、趋化因子及Ras等信号通路;分子对接和动力学模拟结果显示,BBR与核心靶点之间均能较好地结合,主要通过疏水作用力、氢键结合;组织切片结果发现,BBR可显著缓解肠道组织损伤;RT-qPCR结果显示,给药后仔鸡盲肠组织中HSP90AA1表达量显著下降(P<0.001),PIK3CA表达量显著上升(P<0.01)。通过网络药理学和试验验证发现,BBR可能通过调节HSP90AA1和PIK3CA表达量来调控肠道炎症的发生发展,可能涉及PI3K-Akt、cAMP、AMPK等信号通路,为深入进行BBR治疗肠炎的作用机制研究提供新思路与新方法。 展开更多
关键词 网络药理学 小檗碱 肠炎 分子对接 作用机制
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基于网络药理学及分子对接探究益母草碱治疗肠道炎症的分子机制 被引量：2
4
作者 许丞惠 张旭梅 +5 位作者 杨彤 李嘉蕙 孙亚伟 史慧君 付强 杨莉 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期2103-2113,共11页
【目的】运用网络药理学、分子对接和动力学模拟技术研究益母草碱治疗肠道炎症的分子机制。【方法】采用Pubchem、PharmMapper和SwissTargetPrediction数据库收集益母草碱与肠道炎症的潜在靶点,利用Venny 2.1在线作图工具平台系统获取... 【目的】运用网络药理学、分子对接和动力学模拟技术研究益母草碱治疗肠道炎症的分子机制。【方法】采用Pubchem、PharmMapper和SwissTargetPrediction数据库收集益母草碱与肠道炎症的潜在靶点,利用Venny 2.1在线作图工具平台系统获取益母草碱治疗肠道炎症的交集靶点;通过STRING与DAVID数据库获取蛋白-蛋白相互作用(PPI)关系并绘制交集靶点的PPI网络图,对交集靶点进行GO功能与KEGG通路富集分析,运用Cytoscape 3.8.2软件筛选得到核心靶点蛋白,应用分子对接技术与分子动力学模拟对核心靶点进行验证。【结果】共收集到379个与益母草碱相关的潜在靶点蛋白,15464个与肠道炎症相关的潜在靶点,获得170个益母草碱治疗肠道炎症的潜在交集靶点,筛选出丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、抑癌基因TP 53、前列腺素氧化环化酶2(PTGS2)、雷帕霉素靶蛋白(mTOR)、多聚ADP核糖聚合酶1(PARP1)等16个核心靶点。GO功能及KEGG通路富集分析结果显示,益母草碱通过调控蛋白质磷酸化、细胞增殖、凋亡过程负调控、蛋白水解、炎症反应等144个生物过程和Fc epsilon RI信号通路、Fcγ-R介导的吞噬作用、MAPK信号通路、mTOR信号通路等55条信号通路治疗肠道炎症。分子对接结果表明,益母草碱与核心靶点中PTGS2、mTOR、PARP1对接结果良好,有较强的结合活性,分子动力学模拟发现益母草碱与3个蛋白之间主要以氢键和疏水键相结合。【结论】益母草碱通过mTOR、PARP1、PTGS2等多个靶点,多个信号通路、多途径发挥其对肠道炎症的治疗效果。本研究结果为益母草碱在临床中的应用奠定基础。 展开更多
关键词 益母草碱 肠道炎症 网络药理学 分子对接 分子动力学模拟 作用机制
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牛传染性鼻气管炎病毒诱导MDBK细胞线粒体损伤模型的建立 被引量：1
5
作者 郭雪萍 马英才 +7 位作者 李泽龙 王添姿 高函雅 徐李依娜 吴煜锋 钟旗 姚刚 马雪连 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期3132-3139,共8页
为探讨牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)诱导MDBK细胞线粒体损伤的最适时间和浓度,本试验用0.5、1.0、1.5、2.0感染复数(multiplicity of infection, MOI) IBRV感染MDBK细胞6、12、24、36、48 h,采用透射电镜、流式细胞术等技术检测MMP和MPT... 为探讨牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)诱导MDBK细胞线粒体损伤的最适时间和浓度,本试验用0.5、1.0、1.5、2.0感染复数(multiplicity of infection, MOI) IBRV感染MDBK细胞6、12、24、36、48 h,采用透射电镜、流式细胞术等技术检测MMP和MPTP异常开放情况。结果显示,用不同MOI IBRV感染MDBK细胞12 h,感染组与对照组相比,MPTP均显著降低,且除2.0 MOI外均随接毒剂量的增加而降低;MMP在1.5 MOI后开始极显著降低;用1.5 MOI IBRV分别感染MDBK细胞6、12、24、36 h,感染组与对照组相比MPTP及MMP从6 h起均显著降低,且随着病毒感染时间的不断延长而降低。透射电镜结果显示,IBRV感染MDBK细胞6 h就可引起细胞线粒体损伤,出现部分空泡化,24 h线粒体完全空泡化,并且在线粒体周围可以看见病毒粒子。结果表明,IBRV感染可以诱导MDBK细胞线粒体损伤,且用1.5 MOI感染MDBK细胞6~24 h是诱导细胞线粒体损伤的最佳时间和浓度。该时间和浓度可用于IBRV相关药物研究,为进一步研究线粒体损伤提供理论依据。 展开更多
关键词 IBRV 线粒体损伤 MMP MPTP
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高校兽医病理生理实验课线上线下混合式新型教育课堂的建设 被引量：1
6
作者 马雪连 李泽龙 +3 位作者 王添姿 高函雅 徐李依娜 吴煜锋 《中国畜禽种业》 2023年第2期114-117,共4页
该文主要从传统兽医病理生理学实验课的弊端、兽医病理生理实验混合式教学建设的意义及现状分析、兽医病理生理实验混合式教学的理念及模式、医病理生理实验混合式教学的建设几个方面阐述了兽医病理生理实验课线上线下混合式新型教育课... 该文主要从传统兽医病理生理学实验课的弊端、兽医病理生理实验混合式教学建设的意义及现状分析、兽医病理生理实验混合式教学的理念及模式、医病理生理实验混合式教学的建设几个方面阐述了兽医病理生理实验课线上线下混合式新型教育课堂建设的必要性。 展开更多
关键词 兽医病理生理实验 线上线下混合式 多媒体教学
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