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2个野扁桃自交不亲和S-RNase基因全长的克隆与序列分析
被引量：
3
1
作者
关鹏
曾斌
+5 位作者
李疆
罗淑萍
王建友
李伟阳
田嘉
李鹏
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期905-916,共12页
【目的】克隆新疆野扁桃(Amygdalus ledebouriana Schlecht.)自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因SRNase全长序列,为自交不亲和性的分子调控奠定基础。【方法】以新疆野扁桃花柱为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆S-RNase基因全长,采...
【目的】克隆新疆野扁桃(Amygdalus ledebouriana Schlecht.)自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因SRNase全长序列,为自交不亲和性的分子调控奠定基础。【方法】以新疆野扁桃花柱为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆S-RNase基因全长,采用BLAST和ORF Finder对核酸序列进行分析,利用CDD、Prot Param、Tmpred、Signal P、Target P、SOPMA、DANMAN、MEGA6和Prot Fun对推导的氨基酸序列进行分析。【结果】克隆到Pt S16-RNase基因和Pt S17-RNase基因,2者均属于RNase T2基因家族,与其他多种植物的S-RNase基因的序列相似度为83%~98%,序列均具有S-RNas蛋白典型结构。Pt S16-RNase基因ORF长690 bp,编码229个氨基酸,Pt S17-RNase基因ORF长678 bp,编码225个氨基酸。预测2个S-RNase蛋白均为亲水性、不稳定的分泌蛋白,二级结构均以α-螺旋、延伸链和无规卷曲为主,在蔷薇科李属植物中具有较高的系统进化一致性,可能的主要功能为水解酶和激素。【结论】获得2个新疆野扁桃自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因S-RNase全长序列。
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关键词
野扁桃
自交不亲和性
S-RNASE基因
生物信息学
RACE
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职称材料
题名
2个野扁桃自交不亲和S-RNase基因全长的克隆与序列分析
被引量：
3
1
作者
关鹏
曾斌
李疆
罗淑萍
王建友
李伟阳
田嘉
李鹏
机构
新疆农业大学
农
学
院
新疆农业大学林学与园艺学院.新疆农业大学果树学新疆特色果树研究中心
中国林业科
学
院
新疆
分
院
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期905-916,共12页
基金
国家自然科学基金(31260465)
国家林业公益性行业科研专项(201304701-1
+2 种基金
201304701-5)
新疆维吾尔自治区科技计划项目(201130102-1-5)
新疆维吾尔自治区果树学重点学科(201007)
文摘
【目的】克隆新疆野扁桃(Amygdalus ledebouriana Schlecht.)自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因SRNase全长序列,为自交不亲和性的分子调控奠定基础。【方法】以新疆野扁桃花柱为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆S-RNase基因全长,采用BLAST和ORF Finder对核酸序列进行分析,利用CDD、Prot Param、Tmpred、Signal P、Target P、SOPMA、DANMAN、MEGA6和Prot Fun对推导的氨基酸序列进行分析。【结果】克隆到Pt S16-RNase基因和Pt S17-RNase基因,2者均属于RNase T2基因家族,与其他多种植物的S-RNase基因的序列相似度为83%~98%,序列均具有S-RNas蛋白典型结构。Pt S16-RNase基因ORF长690 bp,编码229个氨基酸,Pt S17-RNase基因ORF长678 bp,编码225个氨基酸。预测2个S-RNase蛋白均为亲水性、不稳定的分泌蛋白,二级结构均以α-螺旋、延伸链和无规卷曲为主,在蔷薇科李属植物中具有较高的系统进化一致性,可能的主要功能为水解酶和激素。【结论】获得2个新疆野扁桃自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因S-RNase全长序列。
关键词
野扁桃
自交不亲和性
S-RNASE基因
生物信息学
RACE
Keywords
Amygdalus ledebouriana Schlecht.
Self-incompatibility
S-RNase gene
Bioinformatics
RACE
分类号
S662.9 [农业科学—果树学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
2个野扁桃自交不亲和S-RNase基因全长的克隆与序列分析
关鹏
曾斌
李疆
罗淑萍
王建友
李伟阳
田嘉
李鹏
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
3
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