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临床分离金黄色葡萄球菌ST22克隆毒力及耐药基因分析
被引量：
5
1
作者
詹铀超
陈凯锐
+3 位作者
江雁琼
张艳玲
刘正祥
袁文常
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2019年第7期1146-1150,共5页
目的了解金黄色葡萄球菌ST22克隆临床分离株的毒力及耐药特征,为防控其感染提供依据。方法收集临床分离的经鉴定为ST22克隆的104株金黄色葡萄球菌,以及1株病房空气中分离到ST22菌株,应用SCCmec分型、spa分型等分子分型方法对菌株进行分...
目的了解金黄色葡萄球菌ST22克隆临床分离株的毒力及耐药特征,为防控其感染提供依据。方法收集临床分离的经鉴定为ST22克隆的104株金黄色葡萄球菌,以及1株病房空气中分离到ST22菌株,应用SCCmec分型、spa分型等分子分型方法对菌株进行分子分型,检测pvl等18种毒力基因的携带率,检测erm基因的携带率,检测菌株对苯唑西林、红霉素、四环素等13种临床常用抗生素的耐药性,分析菌株的耐药情况。结果 104株ST22菌株中,76株为CA-SA,28株为HA-SA;其中6株为MRSA,98株为MSSA。6株MRSA均为ST22-MRSA-IV-t309。98株MSSA分为12种spa型,主要型别为t309型(87.8%,86/98)。ST22克隆的pvl毒力基因检出率为79.8%(83/104),ST22主要携带有seg,sei,sem,sen及seo 5种肠毒素基因,75%(78/104)的ST22菌株携带有这5种基因。药敏结果显示ST22主要对青霉素耐药,对红霉素也有较高的耐药率,erm耐药基因检出率较低。结论乌鲁木齐地区流行的ST22克隆能够引起社区及医院内感染,携带有较多的致病基因,并且有MRSA菌株的出现。
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关键词
金黄色葡萄球菌
分子分型
毒力基因
杀白细胞毒素
耐药基因
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职称材料
长链非编码RNA XIST在系统性红斑狼疮患者外周血CD4+T细胞表达降低并与疾病活动度负相关
被引量：
4
2
作者
白文栋
许琴
+4 位作者
赵咏梅
席文锦
晁亚妮
何江
邹红云
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期821-825,共5页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)X连锁X染色体特异性失活转录本(XIST)在系统性红斑狼疮(SLE)患者外周血CD4+细胞亚群中的表达,并分析其临床意义。方法募集50例SLE患者和30例健康人,比较SLE组和健康对照组CD4+T细胞中XIST表达情况。根据...
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)X连锁X染色体特异性失活转录本(XIST)在系统性红斑狼疮(SLE)患者外周血CD4+细胞亚群中的表达,并分析其临床意义。方法募集50例SLE患者和30例健康人,比较SLE组和健康对照组CD4+T细胞中XIST表达情况。根据系统性红斑狼疮疾病活动度指数(SLEDAI)评分情况将50例SLE患者分为稳定期SLE组(SLEDAI评分<5分,n=19)和活动期SLE组(SLEDAI评分≥5分,n=31)。比较稳定期SLE组和活动期SLE组CD4+T细胞中XIST表达情况。分析活动期SLE患者CD4+T细胞中XIST表达水平与SLEDAI的相关性。根据是否合并狼疮肾炎,将31例活动期SLE患者分为无合并狼疮肾炎组(n=17)和合并狼疮肾炎组(n=14),比较两组CD4+T细胞中XIST表达情况。绘制CD4+T细胞中XIST诊断SLE和合并狼疮肾炎的受试者工作特征(ROC)曲线。结果与健康对照组相比,SLE组CD4+T细胞XIST表达显著降低。与稳定期SLE组相比,活动期SLE组CD4+T细胞中XIST表达显著降低。相关性分析显示,活动期SLE患者CD4+T细胞中XIST表达水平与SLEDAI评分呈负相关。活动期SLE患者中,与无合并狼疮肾炎组相比,合并狼疮肾炎组CD4+T细胞中XIST表达显著降低。ROC曲线结果显示,CD4+T细胞中XIST在诊断SLE及是否合并狼疮肾炎中具有良好效能。结论SLE患者CD4+T细胞中XIST表达显著降低,其表达水平与疾病活动度密切相关,而且在诊断SLE及SLE合并狼疮肾炎方面具有良好效能。
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关键词
长链非编码RNA(lncRNA)
X连锁X染色体特异性失活转录本(XIST)
系统性红斑狼疮
疾病活动度
狼疮肾炎
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职称材料
激素性股骨头坏死mRNA与非编码RNA差异表达谱及竞争性内源RNA调控网络分析
被引量：
2
3
作者
李嘉程
杨曦
+3 位作者
梁学振
阎博昭
许波
李刚
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期1230-1237,共8页
目的探讨激素性股骨头坏死(SONFH)的发病机制。方法检索SRA数据库中SONFH相关去核糖体转录组测序数据集SRP091890,利用R语言分析得到差异长链非编码RNA(lncRNAs)和mRNAs。检索GEO数据库中SONFH相关芯片数据集GSE89587,利用R语言分析得...
目的探讨激素性股骨头坏死(SONFH)的发病机制。方法检索SRA数据库中SONFH相关去核糖体转录组测序数据集SRP091890,利用R语言分析得到差异长链非编码RNA(lncRNAs)和mRNAs。检索GEO数据库中SONFH相关芯片数据集GSE89587,利用R语言分析得到差异miRNAs。利用miRDB、miRTarbase和TargetScan数据库分别预测SONFH相关miRNAs的靶向mRNAs,构建miRNA-mRNA调控网络。采用clusterProfiler包对上述调控网络中的mRNAs进行功能富集分析,利用Starbase数据库预测其lncRNAs,构建lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络。结果共筛选出422个显著差异mRNAs、22个显著差异miRNAs和416个显著差异lncRNAs。通过miRDB、miRTarbase和TargetScan数据库预测的靶向mRNAs与上述差异mRNAs交叉映射,确定46个mRNAs参与SONFH相关miRNA-mRNA调控网络的构建;GO功能富集分析显示,miRNA-mRNA网络可能参与细胞增殖和细胞周期等生物学过程。通过Starbase数据库预测的靶向lncRNAs与上述差异lncRNAs交叉映射,确定3个lncRNAs参与SONFH相关lncRNA-miRNA调控网络的构建,最终构建VASH1-AS1相关的ceRNA调控网络,SLC5A6、NQO2和THAP6可能通过has-let-7d-5p或hsa-mir-3194-3p间接被VASH1-AS1调控。结论VASH1-AS1可能通过has-let-7d-5p或hsa-mir-3194-3p间接调控SLC5A6、NQO2和THAP6,而VASH1-AS1、has-let-7d-5p和NQO2可能作为调控因子,通过调控网络参与调节“血管新生-骨形成耦联”机制,在SONFH发病过程中起关键作用。
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关键词
激素性股骨头坏死
生物信息学
竞争性RNA
调控网络
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职称材料
题名
临床分离金黄色葡萄球菌ST22克隆毒力及耐药基因分析
被引量：
5
1
作者
詹铀超
陈凯锐
江雁琼
张艳玲
刘正祥
袁文常
机构
广州医
科
大学附属第五
医院
检验
科
广州
军区
广州
总
医院
检验
科
新疆军区总医院检验科
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2019年第7期1146-1150,共5页
基金
国家自然科学基金(编号:81401703)
文摘
目的了解金黄色葡萄球菌ST22克隆临床分离株的毒力及耐药特征,为防控其感染提供依据。方法收集临床分离的经鉴定为ST22克隆的104株金黄色葡萄球菌,以及1株病房空气中分离到ST22菌株,应用SCCmec分型、spa分型等分子分型方法对菌株进行分子分型,检测pvl等18种毒力基因的携带率,检测erm基因的携带率,检测菌株对苯唑西林、红霉素、四环素等13种临床常用抗生素的耐药性,分析菌株的耐药情况。结果 104株ST22菌株中,76株为CA-SA,28株为HA-SA;其中6株为MRSA,98株为MSSA。6株MRSA均为ST22-MRSA-IV-t309。98株MSSA分为12种spa型,主要型别为t309型(87.8%,86/98)。ST22克隆的pvl毒力基因检出率为79.8%(83/104),ST22主要携带有seg,sei,sem,sen及seo 5种肠毒素基因,75%(78/104)的ST22菌株携带有这5种基因。药敏结果显示ST22主要对青霉素耐药,对红霉素也有较高的耐药率,erm耐药基因检出率较低。结论乌鲁木齐地区流行的ST22克隆能够引起社区及医院内感染,携带有较多的致病基因,并且有MRSA菌株的出现。
关键词
金黄色葡萄球菌
分子分型
毒力基因
杀白细胞毒素
耐药基因
Keywords
Staphylococcus aureus
molecular characterization
virulence gene
panton valentine leukocidin
resistance gene
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
长链非编码RNA XIST在系统性红斑狼疮患者外周血CD4+T细胞表达降低并与疾病活动度负相关
被引量：
4
2
作者
白文栋
许琴
赵咏梅
席文锦
晁亚妮
何江
邹红云
机构
新疆军区总医院检验科
新疆
特殊环境医学重点实验室
新疆军区
总
医院
血液
科
空军军医大学基础医学院免疫学教研室
出处
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期821-825,共5页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金(2016D01C394)。
文摘
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)X连锁X染色体特异性失活转录本(XIST)在系统性红斑狼疮(SLE)患者外周血CD4+细胞亚群中的表达,并分析其临床意义。方法募集50例SLE患者和30例健康人,比较SLE组和健康对照组CD4+T细胞中XIST表达情况。根据系统性红斑狼疮疾病活动度指数(SLEDAI)评分情况将50例SLE患者分为稳定期SLE组(SLEDAI评分<5分,n=19)和活动期SLE组(SLEDAI评分≥5分,n=31)。比较稳定期SLE组和活动期SLE组CD4+T细胞中XIST表达情况。分析活动期SLE患者CD4+T细胞中XIST表达水平与SLEDAI的相关性。根据是否合并狼疮肾炎,将31例活动期SLE患者分为无合并狼疮肾炎组(n=17)和合并狼疮肾炎组(n=14),比较两组CD4+T细胞中XIST表达情况。绘制CD4+T细胞中XIST诊断SLE和合并狼疮肾炎的受试者工作特征(ROC)曲线。结果与健康对照组相比,SLE组CD4+T细胞XIST表达显著降低。与稳定期SLE组相比,活动期SLE组CD4+T细胞中XIST表达显著降低。相关性分析显示,活动期SLE患者CD4+T细胞中XIST表达水平与SLEDAI评分呈负相关。活动期SLE患者中,与无合并狼疮肾炎组相比,合并狼疮肾炎组CD4+T细胞中XIST表达显著降低。ROC曲线结果显示,CD4+T细胞中XIST在诊断SLE及是否合并狼疮肾炎中具有良好效能。结论SLE患者CD4+T细胞中XIST表达显著降低,其表达水平与疾病活动度密切相关,而且在诊断SLE及SLE合并狼疮肾炎方面具有良好效能。
关键词
长链非编码RNA(lncRNA)
X连锁X染色体特异性失活转录本(XIST)
系统性红斑狼疮
疾病活动度
狼疮肾炎
分类号
R593.24+1 [医药卫生—内科学]
R593.24+2 [医药卫生—内科学]
在线阅读
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职称材料
题名
激素性股骨头坏死mRNA与非编码RNA差异表达谱及竞争性内源RNA调控网络分析
被引量：
2
3
作者
李嘉程
杨曦
梁学振
阎博昭
许波
李刚
机构
山东中医药大学第一临床医学院
新疆军区总医院检验科
山东中医药大学附属
医院
骨
科
出处
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期1230-1237,共8页
基金
国家自然科学基金(82074453)
山东省医药卫生科技发展计划(2019WS577)。
文摘
目的探讨激素性股骨头坏死(SONFH)的发病机制。方法检索SRA数据库中SONFH相关去核糖体转录组测序数据集SRP091890,利用R语言分析得到差异长链非编码RNA(lncRNAs)和mRNAs。检索GEO数据库中SONFH相关芯片数据集GSE89587,利用R语言分析得到差异miRNAs。利用miRDB、miRTarbase和TargetScan数据库分别预测SONFH相关miRNAs的靶向mRNAs,构建miRNA-mRNA调控网络。采用clusterProfiler包对上述调控网络中的mRNAs进行功能富集分析,利用Starbase数据库预测其lncRNAs,构建lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络。结果共筛选出422个显著差异mRNAs、22个显著差异miRNAs和416个显著差异lncRNAs。通过miRDB、miRTarbase和TargetScan数据库预测的靶向mRNAs与上述差异mRNAs交叉映射,确定46个mRNAs参与SONFH相关miRNA-mRNA调控网络的构建;GO功能富集分析显示,miRNA-mRNA网络可能参与细胞增殖和细胞周期等生物学过程。通过Starbase数据库预测的靶向lncRNAs与上述差异lncRNAs交叉映射,确定3个lncRNAs参与SONFH相关lncRNA-miRNA调控网络的构建,最终构建VASH1-AS1相关的ceRNA调控网络,SLC5A6、NQO2和THAP6可能通过has-let-7d-5p或hsa-mir-3194-3p间接被VASH1-AS1调控。结论VASH1-AS1可能通过has-let-7d-5p或hsa-mir-3194-3p间接调控SLC5A6、NQO2和THAP6,而VASH1-AS1、has-let-7d-5p和NQO2可能作为调控因子,通过调控网络参与调节“血管新生-骨形成耦联”机制,在SONFH发病过程中起关键作用。
关键词
激素性股骨头坏死
生物信息学
竞争性RNA
调控网络
Keywords
steroid-induced osteonecrosis of the femoral head
bioinformatics
competitive RNA
regulatory network
分类号
R681.8 [医药卫生—骨科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
临床分离金黄色葡萄球菌ST22克隆毒力及耐药基因分析
詹铀超
陈凯锐
江雁琼
张艳玲
刘正祥
袁文常
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2019
5
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职称材料
2
长链非编码RNA XIST在系统性红斑狼疮患者外周血CD4+T细胞表达降低并与疾病活动度负相关
白文栋
许琴
赵咏梅
席文锦
晁亚妮
何江
邹红云
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
4
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职称材料
3
激素性股骨头坏死mRNA与非编码RNA差异表达谱及竞争性内源RNA调控网络分析
李嘉程
杨曦
梁学振
阎博昭
许波
李刚
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
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职称材料
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