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20个物种同义密码子偏性的比较分析
被引量：
37
1
作者
刘庆坡
冯英
董辉
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2004年第7期67-71,共5页
对6种双子叶植物、4种单子叶植物、7种多细胞真核动物、2种单细胞真核生物及1种原核生物(大肠杆菌)的编码序列(CodingDNASequence,CDS)进行了比较研究。结果发现,各供试物种密码子的用法存在明显的位置依赖,编码区域不同区段对密码子...
对6种双子叶植物、4种单子叶植物、7种多细胞真核动物、2种单细胞真核生物及1种原核生物(大肠杆菌)的编码序列(CodingDNASequence,CDS)进行了比较研究。结果发现,各供试物种密码子的用法存在明显的位置依赖,编码区域不同区段对密码子选择使用的程度差异很大,表明基因的同义密码子偏性与其编码区不同区域的碱基环境密切相关;基因组差异是造成密码子使用偏性的首要因素。对"翻译起始区"和"翻译终止区"的特征分析发现,大部分供试物种编码序列中的"翻译起始区"碱基偏置强烈,"翻译终止区"相对较弱,暗示"翻译起始区"的密码子使用对提高蛋白翻译的效率和精确性更为重要。不同物种中G+C含量对其同义密码子偏性的贡献率差异很大,但并非是影响同义密码子使用偏性的唯一因素。可以认为,基因编码区域密码子偏性的研究能为搜寻物种进化的分子机理提供线索。
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关键词
密码子使用偏性
位置依赖
G+C含量
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职称材料
题名
20个物种同义密码子偏性的比较分析
被引量：
37
1
作者
刘庆坡
冯英
董辉
机构
浙江大学农业与生物技术学院农学系
新疆克拉玛依市独山子区晟通热力有限公司
出处
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2004年第7期67-71,共5页
文摘
对6种双子叶植物、4种单子叶植物、7种多细胞真核动物、2种单细胞真核生物及1种原核生物(大肠杆菌)的编码序列(CodingDNASequence,CDS)进行了比较研究。结果发现,各供试物种密码子的用法存在明显的位置依赖,编码区域不同区段对密码子选择使用的程度差异很大,表明基因的同义密码子偏性与其编码区不同区域的碱基环境密切相关;基因组差异是造成密码子使用偏性的首要因素。对"翻译起始区"和"翻译终止区"的特征分析发现,大部分供试物种编码序列中的"翻译起始区"碱基偏置强烈,"翻译终止区"相对较弱,暗示"翻译起始区"的密码子使用对提高蛋白翻译的效率和精确性更为重要。不同物种中G+C含量对其同义密码子偏性的贡献率差异很大,但并非是影响同义密码子使用偏性的唯一因素。可以认为,基因编码区域密码子偏性的研究能为搜寻物种进化的分子机理提供线索。
关键词
密码子使用偏性
位置依赖
G+C含量
Keywords
codon usage bias
position-dependence
G+C content
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
20个物种同义密码子偏性的比较分析
刘庆坡
冯英
董辉
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2004
37
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