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利用SSCP技术分析棉花纤维差异表达的基因
被引量:
2
1
作者
谢晓兵
于霁雯
+7 位作者
吴嫚
翟红红
范术丽
宋美珍
庞朝友
李兴丽
张金发
喻树迅
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2011年第4期306-310,共5页
单链构象多态性(Single strand conformation polymorphism,SSCP)技术是一种简便、灵敏的多态性检测方法,可以检测出在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中因构象差异而导致的单链DNA片段迁移率的不同。本研究根据棉花基因芯片筛选的纤维发育中...
单链构象多态性(Single strand conformation polymorphism,SSCP)技术是一种简便、灵敏的多态性检测方法,可以检测出在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中因构象差异而导致的单链DNA片段迁移率的不同。本研究根据棉花基因芯片筛选的纤维发育中差异表达基因设计了162对引物,利用SSCP技术在4个陆地棉品种、4个海岛棉品种中进行多态性检测。结果表明,在162对引物中,146对引物经PCR扩增后在1.5%的琼脂糖凝胶电泳中检测出现清晰、明亮的带。经过SSCP分析,54对引物在陆地棉之间产生多态性,共出现116个多态性位点;45对引物在海岛棉之间产生多态性,共出现111个多态性位点;79对引物在陆地棉和海岛棉之间产生多态性,共出现260个多态性位点;36对引物在陆地棉之间、海岛棉之间同时出现多态性。进一步聚类分析后表明,海岛棉和陆地棉分别聚在了一起。
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关键词
陆地棉
海岛棉
单链构象多态性(SSCP)
多态性
聚类分析
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职称材料
题名
利用SSCP技术分析棉花纤维差异表达的基因
被引量:
2
1
作者
谢晓兵
于霁雯
吴嫚
翟红红
范术丽
宋美珍
庞朝友
李兴丽
张金发
喻树迅
机构
西北农林科技
大学
农
学院
中国农业
科学院
棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室
新墨西哥州立大学作物与环境科学院
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2011年第4期306-310,共5页
基金
国家十一五"973"计划(2010CB126006)
转基因重大专项(2009ZX08009-118B)
文摘
单链构象多态性(Single strand conformation polymorphism,SSCP)技术是一种简便、灵敏的多态性检测方法,可以检测出在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中因构象差异而导致的单链DNA片段迁移率的不同。本研究根据棉花基因芯片筛选的纤维发育中差异表达基因设计了162对引物,利用SSCP技术在4个陆地棉品种、4个海岛棉品种中进行多态性检测。结果表明,在162对引物中,146对引物经PCR扩增后在1.5%的琼脂糖凝胶电泳中检测出现清晰、明亮的带。经过SSCP分析,54对引物在陆地棉之间产生多态性,共出现116个多态性位点;45对引物在海岛棉之间产生多态性,共出现111个多态性位点;79对引物在陆地棉和海岛棉之间产生多态性,共出现260个多态性位点;36对引物在陆地棉之间、海岛棉之间同时出现多态性。进一步聚类分析后表明,海岛棉和陆地棉分别聚在了一起。
关键词
陆地棉
海岛棉
单链构象多态性(SSCP)
多态性
聚类分析
Keywords
G.hirsutum L.
G.barbadense L.
single strand conformation polymorphism(SSCP)
polymorphism
cluster analysis
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用SSCP技术分析棉花纤维差异表达的基因
谢晓兵
于霁雯
吴嫚
翟红红
范术丽
宋美珍
庞朝友
李兴丽
张金发
喻树迅
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2011
2
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