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新德里金属β-酰胺酶基因特征
1
作者
王国戗
牛菊霞
邢善霞
《郑州大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2012年第4期545-547,共3页
目的:研究新德里金属β-酰胺酶(NDM-1)基因的特征,分析其可能的来源。方法:在美国生物信息中心(NCBI)检索NDM-1基因,使用Blast生物学软件对检索到的基因与GenBank进行比对。使用ClustalW2.0生物学软件,对5条NDM-1基因和30条各亚型β-内...
目的:研究新德里金属β-酰胺酶(NDM-1)基因的特征,分析其可能的来源。方法:在美国生物信息中心(NCBI)检索NDM-1基因,使用Blast生物学软件对检索到的基因与GenBank进行比对。使用ClustalW2.0生物学软件,对5条NDM-1基因和30条各亚型β-内酰胺酶基因进行多序列比较。结果:在NCBI中检索到3条NDM-1基因,与GenBank比较后共发现9条基因序列与NDM-1基因同源性较高,其中2条为两株海洋细菌的部分基因序列(同源性达69%和70%)。选择5条NDM-1基因与30条β-内酰胺酶基因进行多序列比较,同源性均很低,在基因进化树上NDM-1基因与β-内酰胺酶基因位于不同分枝。结论:NDM-1基因并非来源于β-内酰胺酶基因,NDM-1基因可能与两株海洋细菌有一定的亲缘关系。
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关键词
新德里金属β-酰胺酶
超级细菌
基因进化
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题名
新德里金属β-酰胺酶基因特征
1
作者
王国戗
牛菊霞
邢善霞
机构
新乡
医学院第一附属
医院
检验
科
新乡市传染病医院药剂科
出处
《郑州大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2012年第4期545-547,共3页
文摘
目的:研究新德里金属β-酰胺酶(NDM-1)基因的特征,分析其可能的来源。方法:在美国生物信息中心(NCBI)检索NDM-1基因,使用Blast生物学软件对检索到的基因与GenBank进行比对。使用ClustalW2.0生物学软件,对5条NDM-1基因和30条各亚型β-内酰胺酶基因进行多序列比较。结果:在NCBI中检索到3条NDM-1基因,与GenBank比较后共发现9条基因序列与NDM-1基因同源性较高,其中2条为两株海洋细菌的部分基因序列(同源性达69%和70%)。选择5条NDM-1基因与30条β-内酰胺酶基因进行多序列比较,同源性均很低,在基因进化树上NDM-1基因与β-内酰胺酶基因位于不同分枝。结论:NDM-1基因并非来源于β-内酰胺酶基因,NDM-1基因可能与两株海洋细菌有一定的亲缘关系。
关键词
新德里金属β-酰胺酶
超级细菌
基因进化
Keywords
NDM-1
superbug
gene evolution
分类号
R372 [医药卫生—病原生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
新德里金属β-酰胺酶基因特征
王国戗
牛菊霞
邢善霞
《郑州大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2012
0
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