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miR-146a-5p靶向IRAK1、TRAF6抑制小细胞肺癌耐药
被引量：
4
1
作者
梁雪
吕磊
+2 位作者
钱立庭
李明
韩丹丹
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2020年第3期333-339,共7页
目的初步探讨miR-146a-5p在小细胞肺癌(SCLC)耐药机制中的作用。方法通过qRT-PCR检验SCLC耐药细胞株(H69-AR)和敏感细胞株(H69)中miR-146a-5p表达水平,探究miR-146a-5p与SCLC耐药的相关性;分别通过慢病毒载体以稳定转染miR-146a-5p mimi...
目的初步探讨miR-146a-5p在小细胞肺癌(SCLC)耐药机制中的作用。方法通过qRT-PCR检验SCLC耐药细胞株(H69-AR)和敏感细胞株(H69)中miR-146a-5p表达水平,探究miR-146a-5p与SCLC耐药的相关性;分别通过慢病毒载体以稳定转染miR-146a-5p mimic或miR-146a-5p inhibitor使其细胞中的miR-146a-5p上调或抑制,再利用CCK-8法和划痕实验验证miR-146a-5p对SCLC细胞株的生物学影响;查阅相关文献以及应用目前生物学最权威软件预测miR-146a-5p的靶基因,应用Western blot、qRT-PCR检测miR-146a-5p与预测靶基因两者之间的关系。结果H69-AR相对H69细胞株的miR-146a-5p表达水平为(1∶22.70),差异有统计学意义(P<0.05);生物学信息数据库预测miR-146a-5p可能靶基因为白介1受体相关激酶1(IRAK1)和肿瘤坏死因子受体相关因子6(TRAF6);H69-AR相对H69细胞株中mIRAK1、mTRAF6的表达水平差异分别为(4.92∶1.00)、(2.76∶1.00),差异有统计学意义(P<0.05);H69-AR细胞株转染miR-146a-5p mimic后,与对照组比较,细胞抑制率上升,迁移速度减缓,同时mIRAK1、mTRAF6表达水平分别减少为(1.00∶14.55)、(1∶3.20),并且IRAK1、TRAF6蛋白表达也分别减少为(0.24∶1.00)、(0.31∶1.00),差异有统计学意义(P<0.05);H69细胞株转染miR-146a-5p inhibitor后,与对照组相比,细胞抑制率下降,迁移速度增快,同时mIRAK1、mTRAF6表达水平分别增加为(10.86∶1.00)、(4.64∶1.00),IRAK1、TRAF6蛋白表达也分别增加为(4.76∶1.00)、(3.96∶1.00),差异有统计学意义(P<0.05)。结论miR-146a-5p通过靶向IRAK1和TRAF6基因抑制SCLC耐药。
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关键词
miR-146a-5p
白介1受体相关激酶1
肿瘤坏死因子受体相关因子6
小细胞肺癌
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职称材料
基于miRNA-mRNA调控网络的鼻咽癌相关分子机制研究
被引量：
4
2
作者
郭伟茜
高劲
+4 位作者
花蕾
郑先斌
张洋洋
孙斌
陶振超
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2021年第8期1205-1212,共8页
目的通过构建鼻咽癌微小核糖核酸(miRNA)调控网络筛选与鼻咽癌发病相关的分子标志物。方法从基因表达数据库(GEO)数据库下载鼻咽癌miRNA芯片数据GSE70970和基因芯片数据GSE12452,利用R软件筛选出差异表达miRNA和mRNA,并对其进行功能富...
目的通过构建鼻咽癌微小核糖核酸(miRNA)调控网络筛选与鼻咽癌发病相关的分子标志物。方法从基因表达数据库(GEO)数据库下载鼻咽癌miRNA芯片数据GSE70970和基因芯片数据GSE12452,利用R软件筛选出差异表达miRNA和mRNA,并对其进行功能富集分析。应用FunRich软件预测差异miRNA的转录因子及靶基因,将靶基因与差异基因取交集获得核心基因,并通过Cytoscape软件构建miRNA-mRNA调控网络。通过Kaplan-Meier plotter数据库对核心基因进行生存分析。结果一共筛选出47个差异表达miRNA、797个差异表达基因。功能富集分析表明差异表达的miRNA主要参与信号转导、转录调控等过程,差异表达基因主要参与细胞因子受体相互作用、细胞周期、小细胞肺癌等信号通路。靶基因与差异表达基因取交集后筛选出23个核心基因,构建miRNA-mRNA调控网络。生存分析显示其中4个核心基因对鼻咽癌患者的预后有影响,包括多聚磷酸肌醇磷酸酶1(MINPP1)、锌指环指蛋白3(ZNRF3)、纤毛顶结构蛋白(SNTN)、β微管蛋白2A(TUBB2A),其相对应的miRNA分别为hsa-miR-199b-5p、hsa-miR-520e、hsa-miR-107、hsa-miR-421。结论通过构建miRNA-mRNA调控网络同时结合生存分析,筛选鼻咽癌相关的分子标志物,为鼻咽癌诊断、治疗提供潜在的分子靶点。
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关键词
鼻咽癌
微小核糖核酸
差异表达基因
调控网络
生物信息学
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职称材料
题名
miR-146a-5p靶向IRAK1、TRAF6抑制小细胞肺癌耐药
被引量：
4
1
作者
梁雪
吕磊
钱立庭
李明
韩丹丹
机构
新乡
医学院
新乡医学院附属安徽省肿瘤医院
安徽省肿瘤医院
表观实验室
中国科学技术大学第一
附属
医院
西区放疗科
中国科学技术大学第一
附属
医院
西区检验科
出处
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2020年第3期333-339,共7页
基金
国家自然科学基金青年项目(编号:81602230)
安徽省重点研究与开发计划项目(编号:1704a0802157)。
文摘
目的初步探讨miR-146a-5p在小细胞肺癌(SCLC)耐药机制中的作用。方法通过qRT-PCR检验SCLC耐药细胞株(H69-AR)和敏感细胞株(H69)中miR-146a-5p表达水平,探究miR-146a-5p与SCLC耐药的相关性;分别通过慢病毒载体以稳定转染miR-146a-5p mimic或miR-146a-5p inhibitor使其细胞中的miR-146a-5p上调或抑制,再利用CCK-8法和划痕实验验证miR-146a-5p对SCLC细胞株的生物学影响;查阅相关文献以及应用目前生物学最权威软件预测miR-146a-5p的靶基因,应用Western blot、qRT-PCR检测miR-146a-5p与预测靶基因两者之间的关系。结果H69-AR相对H69细胞株的miR-146a-5p表达水平为(1∶22.70),差异有统计学意义(P<0.05);生物学信息数据库预测miR-146a-5p可能靶基因为白介1受体相关激酶1(IRAK1)和肿瘤坏死因子受体相关因子6(TRAF6);H69-AR相对H69细胞株中mIRAK1、mTRAF6的表达水平差异分别为(4.92∶1.00)、(2.76∶1.00),差异有统计学意义(P<0.05);H69-AR细胞株转染miR-146a-5p mimic后,与对照组比较,细胞抑制率上升,迁移速度减缓,同时mIRAK1、mTRAF6表达水平分别减少为(1.00∶14.55)、(1∶3.20),并且IRAK1、TRAF6蛋白表达也分别减少为(0.24∶1.00)、(0.31∶1.00),差异有统计学意义(P<0.05);H69细胞株转染miR-146a-5p inhibitor后,与对照组相比,细胞抑制率下降,迁移速度增快,同时mIRAK1、mTRAF6表达水平分别增加为(10.86∶1.00)、(4.64∶1.00),IRAK1、TRAF6蛋白表达也分别增加为(4.76∶1.00)、(3.96∶1.00),差异有统计学意义(P<0.05)。结论miR-146a-5p通过靶向IRAK1和TRAF6基因抑制SCLC耐药。
关键词
miR-146a-5p
白介1受体相关激酶1
肿瘤坏死因子受体相关因子6
小细胞肺癌
Keywords
miR-146a-5p
interleukin-1 receptor-related kinase 1
tumor necrosis factor receptor-related factor 6
small cell lung cancer
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
基于miRNA-mRNA调控网络的鼻咽癌相关分子机制研究
被引量：
4
2
作者
郭伟茜
高劲
花蕾
郑先斌
张洋洋
孙斌
陶振超
机构
安徽
医科大学
附属
省立
医院
放射治疗科
中国科学技术大学
附属
第一
医院
西区放射治疗科
新乡医学院附属安徽省肿瘤医院
出处
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2021年第8期1205-1212,共8页
基金
安徽省自然科学基金(编号:1408085MH189)
国家癌症中心攀登基金(编号:NCC201812B037)。
文摘
目的通过构建鼻咽癌微小核糖核酸(miRNA)调控网络筛选与鼻咽癌发病相关的分子标志物。方法从基因表达数据库(GEO)数据库下载鼻咽癌miRNA芯片数据GSE70970和基因芯片数据GSE12452,利用R软件筛选出差异表达miRNA和mRNA,并对其进行功能富集分析。应用FunRich软件预测差异miRNA的转录因子及靶基因,将靶基因与差异基因取交集获得核心基因,并通过Cytoscape软件构建miRNA-mRNA调控网络。通过Kaplan-Meier plotter数据库对核心基因进行生存分析。结果一共筛选出47个差异表达miRNA、797个差异表达基因。功能富集分析表明差异表达的miRNA主要参与信号转导、转录调控等过程,差异表达基因主要参与细胞因子受体相互作用、细胞周期、小细胞肺癌等信号通路。靶基因与差异表达基因取交集后筛选出23个核心基因,构建miRNA-mRNA调控网络。生存分析显示其中4个核心基因对鼻咽癌患者的预后有影响,包括多聚磷酸肌醇磷酸酶1(MINPP1)、锌指环指蛋白3(ZNRF3)、纤毛顶结构蛋白(SNTN)、β微管蛋白2A(TUBB2A),其相对应的miRNA分别为hsa-miR-199b-5p、hsa-miR-520e、hsa-miR-107、hsa-miR-421。结论通过构建miRNA-mRNA调控网络同时结合生存分析,筛选鼻咽癌相关的分子标志物,为鼻咽癌诊断、治疗提供潜在的分子靶点。
关键词
鼻咽癌
微小核糖核酸
差异表达基因
调控网络
生物信息学
Keywords
nasopharyngeal carcinoma
microRNA
differentially expressed gene
regulatory network
bioinformatics
分类号
R739.6 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
miR-146a-5p靶向IRAK1、TRAF6抑制小细胞肺癌耐药
梁雪
吕磊
钱立庭
李明
韩丹丹
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2020
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于miRNA-mRNA调控网络的鼻咽癌相关分子机制研究
郭伟茜
高劲
花蕾
郑先斌
张洋洋
孙斌
陶振超
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2021
4
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