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多拷贝基因座DYF399S1在河南汉族群体中的遗传多态性分析 被引量:2
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作者 张晶 王磊 +5 位作者 黄艳梅 马亚磊 尚万兵 张银珂 郭栋 黄书琴 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2015年第1期33-36,共4页
目的:研究Y染色体上1个新的多拷贝短串联重复序列基因座DYF399S1在河南汉族群体中的遗传多态性。方法:采集248名河南汉族无关男性个体的血标本,提取基因组DNA,PCR法扩增,用中性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离PCR产物并测序,采用ABI 3130基因自... 目的:研究Y染色体上1个新的多拷贝短串联重复序列基因座DYF399S1在河南汉族群体中的遗传多态性。方法:采集248名河南汉族无关男性个体的血标本,提取基因组DNA,PCR法扩增,用中性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离PCR产物并测序,采用ABI 3130基因自动分析仪和Gene Mapper ID v3.5软件分析结果。结果:DYF399S1基因座为3拷贝,在河南汉族群体继续表现为(GAAA)3N7(GAAA)12-22其模块结构包括1个重复数目变异的核心序列和1个固定的重复序列结构。按其变异模块命名等位基因,共发现11个等位基因。在248名河南汉族无关男性个体中,3个拷贝组成的单体型有94种,其中出现最多的单体型是18/18/18,频率是0.080 6,仅出现1次的单体型有49种,频率是0.004 0;单体型辨别能力(DC)是0.372 5,单体型多样性(HD)和个体识别力(DP)分别为0.865 5和0.862 1。结论:DYF399S1基因座具有高度的多态性,适用于法医学实践和人类进化的研究。 展开更多
关键词 DYF399S1基因座 Y染色体短串联重复序列 遗传多态性 法医学
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通路抑制剂对Tax诱导的Bcl-3的影响及其在NF-κB激活中作用的研究
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作者 黄艳梅 张莉莉 +3 位作者 王金恒 吕壮伟 张新宁 王辉 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期291-294,共4页
目的:通过研究不同通路的抑制剂在TaxP细胞(稳定表达Tax的Jurkat亚细胞系)中对Bcl-3(Human B-cellleukemia protein 3)表达的影响和shRNA Bcl-3对NF-κB转录激活作用的影响,探讨Tax阳性细胞中调控Bcl-3的通路及Bcl-3在NF-κB通路中的作... 目的:通过研究不同通路的抑制剂在TaxP细胞(稳定表达Tax的Jurkat亚细胞系)中对Bcl-3(Human B-cellleukemia protein 3)表达的影响和shRNA Bcl-3对NF-κB转录激活作用的影响,探讨Tax阳性细胞中调控Bcl-3的通路及Bcl-3在NF-κB通路中的作用。方法:将TaxP细胞分别用NF-κB(Nuclear factor-κB)抑制剂、GSK(Glycogen synthase kinase)抑制剂和蛋白酶抑制剂处理后,Western blot检测Bcl-3蛋白的表达情况;将Bcl-3的shRNA质粒转入TaxP细胞中,RT-PCR检测Bcl-3mRNA的表达抑制情况;共转染Bcl-3的shRNA和pNF-κB-luc质粒至Jurkat和TaxP细胞中,检测抑制Bcl-3表达后对NF-κB转录活性的影响。结果:Bcl-3的表达不受GSK抑制剂的影响,但在蛋白酶抑制后有明显的升高;RT-PCR的结果表明,在转染Bcl-3 shRNA质粒后,Bcl-3的mRNA表达有明显的下降,荧光素酶活性结果显示Bcl-3在Jurkat和TaxP细胞中被抑制后NF-κB的转录活性明显下降(P<0.05)。结论:Tax诱导的Bcl-3表达不依赖于GSK通路,而NF-κB通路参与了Bcl-3的调控,说明Bcl-3在NF-κB的激活中发挥着促进作用。 展开更多
关键词 TAX Bcl-3 NF-κB转录活性 抑制剂
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常染色体显性遗传Alport综合征一家系COL4A3及COL4A4的基因突变 被引量:6
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作者 束双双 张连云 +3 位作者 黄艳梅 张晶 杨保胜 咸韦 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2014年第5期723-726,共4页
目的:对一常染色体显性遗传Alport综合征(AS)家系COL4A3/COL4A4基因突变进行分析,寻找其致病突变位点。方法:采用PCR技术和直接测序法分析该家系先证者COL4A3/COL4A4基因全部外显子序列,并与该家系成员、50名健康个体及GenBank序列进行... 目的:对一常染色体显性遗传Alport综合征(AS)家系COL4A3/COL4A4基因突变进行分析,寻找其致病突变位点。方法:采用PCR技术和直接测序法分析该家系先证者COL4A3/COL4A4基因全部外显子序列,并与该家系成员、50名健康个体及GenBank序列进行比较分析,筛选有意义突变。结果:在该家系COL4A3/COL4A4基因中共发现8个突变位点,其中包括1个错义突变、1个内含子突变和6个序列变异。COL4A4基因第44外显子上一个新的错义突变c.4195 A>T导致M1399L,该家系成员中患者均出现了此突变且均表现为杂合子。1个内含子突变为c.4127+11 C>T。其余6个序列变异分别为COL4A3基因上的c.1195 C>T,c.1223 G>A;以及COL4A4基因上的c.3011 C>T,c.4207 T>C,c.4548 A>G,c.4932 C>T。结论:常染色体显性遗传AS COL4A4基因c.4195 A>T和c.4127+11 C>T突变可能与其发病有关。 展开更多
关键词 Alport 综合征 常染色体显性遗传 COL4A3基因 COL4A4基因
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中国汉族、日本、欧裔和非裔人群SNP始祖多态位点的鉴定 被引量:6
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作者 赵美乐 齐守文 +5 位作者 刘良 曾昭书 王菡 黄艳梅 吴少军 黄代新 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2007年第3期540-542,共3页
目的应用全基因组单核苷酸多态性(SNP)基因分型数据及始祖多态位点(AIMs)推断区分人亚群。方法从国际公共数据库中选取中国汉族、日本人、欧裔和非裔4个人群270个样本4396943个SNP位点的基因分型结果。用Perl语言编写数据提取程序,从中... 目的应用全基因组单核苷酸多态性(SNP)基因分型数据及始祖多态位点(AIMs)推断区分人亚群。方法从国际公共数据库中选取中国汉族、日本人、欧裔和非裔4个人群270个样本4396943个SNP位点的基因分型结果。用Perl语言编写数据提取程序,从中得到1136个群体间等位基因频率差值大于0.3的SNP位点。根据每一个位点在不同人群之间多态性的差异,最终鉴定出44个始祖多态位点。结果这44个位点联合应用,可以区分其归属于欧裔、非裔、中国汉族或日本人群,并可高度可信地区分中国汉族和日本人群。结论这一套始祖构成位点的鉴定和应用,为中国人群的疾病关联分析研究、个体医疗、群体遗传学和法庭科学研究等相关科学提供了帮助。 展开更多
关键词 法医学 单核苷酸多态性 基因分型 始祖多态位点 种族
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河南汉族人群DYS464和DYS527基因座单体型遗传多态性检测 被引量:5
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作者 胡灏 赵美乐 +2 位作者 齐守文 黄艳梅 陈琼 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2010年第6期965-968,共4页
目的:检测河南地区汉族人群中Y染色体两个多拷贝短串联重复序列(STR)基因座DYS464和DYS527单体型的遗传多态性。方法:对110例河南汉族男性无关个体血样本基因组DNA采用荧光标记引物进行PCR扩增,PCR产物在ABI3100遗传分析仪上毛细管电泳... 目的:检测河南地区汉族人群中Y染色体两个多拷贝短串联重复序列(STR)基因座DYS464和DYS527单体型的遗传多态性。方法:对110例河南汉族男性无关个体血样本基因组DNA采用荧光标记引物进行PCR扩增,PCR产物在ABI3100遗传分析仪上毛细管电泳分析,并对不同重复序列分别测序。结果:DYS464基因座为四拷贝,核心序列重复数目变异在11~18次;DYS527基因座为双拷贝,核心序列重复数目变异在17~25次。110例河南汉族男性无关个体中,两个基因座所组成的单体型有104种,其中99种单体型仅出现1次,频率为0.0091,单体型基因多样性为0.9988,个体识别力为0.9897。结论:DY464和DYS527基因座具有高度多态性,适用于法医学实践和人类进化的研究。 展开更多
关键词 DYS464 DYS527 短串联重复序列 遗传多态性 法医学 河南汉族
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