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高等植物氨基酸吸收与转运及生物学功能的研究进展
被引量:
63
1
作者
宋奇超
曹凤秋
+3 位作者
巩元勇
程晓园
毕昕媛
刘来华
《植物营养与肥料学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期1507-1517,共11页
氨基酸不仅是细胞中蛋白质生物合成的必需底物,而且也参与植物体内的氮代谢途径以及碳氮平衡的调节。近年来,氨基酸的转运与吸收机制及其生物学功能已成为植物分子生物学特别关注和研究的热点之一。最近,学术界亦发现某些氨基酸可能作...
氨基酸不仅是细胞中蛋白质生物合成的必需底物,而且也参与植物体内的氮代谢途径以及碳氮平衡的调节。近年来,氨基酸的转运与吸收机制及其生物学功能已成为植物分子生物学特别关注和研究的热点之一。最近,学术界亦发现某些氨基酸可能作为信号分子对植物生长发育具有特殊的生物学意义。本文就氨基酸吸收与转运的分子生理机理及其在植物生长发育中的重要功能(如调控生长、适应各种环境胁迫等)的研究进展进行了较详细地综述。
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关键词
氨基酸
吸收和转运
氮素营养
信号分子
胁迫响应
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职称材料
大豆GmGLRs基因全基因组鉴定与表达分析
被引量:
3
2
作者
崔晓霞
赵硕
+5 位作者
郭书巧
束红梅
何晓兰
倪万潮
巩元勇
刘来华
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2019年第6期1-8,共8页
为明确大豆GmGLRs基因家族的结构特征以及不同组织的表达模式,利用生物信息学的方法,从全基因组水平鉴定了大豆GmGLRs基因家族,并对其染色体定位、系统进化关系、基因结构、跨膜结构域及组织表达模式进行分析。结果表明,在大豆基因组(Wm...
为明确大豆GmGLRs基因家族的结构特征以及不同组织的表达模式,利用生物信息学的方法,从全基因组水平鉴定了大豆GmGLRs基因家族,并对其染色体定位、系统进化关系、基因结构、跨膜结构域及组织表达模式进行分析。结果表明,在大豆基因组(Wm82.a2.v1)全基因组信息中共鉴定出17个GmGLRs基因。基因定位显示,这些基因不均匀的分布在10条染色体上,有5条染色体各分布1个GmGLRs基因,有3条染色体各分布2个GmGLRs基因,有2条染色体各分布3个GmGLRs基因。系统进化树分析将这些基因分为2个亚族,有2个GmGLRs基因在一个亚族,其他15个GmGLRs基因在另一个亚族,这些基因在系统进化关系上成对出现,表现出很高的同源性。基因结构分析表明,这些基因基本上都具有6个外显子,只有1个基因有7个外显子。此外,大豆GmGLRs基因的CDS序列长度差异不大,最长的CDS长度是2 844 bp,最短的CDS长度是2 409 bp,平均长度为2 748 bp。跨膜结构域预测结果表明,10个GmGLRs蛋白有3个跨膜结构域,4个GmGLRs蛋白有4个跨膜结构域,2个GmGLRs蛋白有5个跨膜结构域,1个GmGLR蛋白有2个跨膜结构域。组织表达模式研究显示,这些基因没有表现出组织特异性的差异,但是在表达丰度上存在显著差异,高、中、低丰度表达基因数分别为8,5,4个。结果为大豆GmGLRs基因的克隆和功能研究提供了理论基础。
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关键词
大豆
大豆基因组
GmGLRs基因
生物信息学
表达分析
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职称材料
棉花DUR3基因的鉴定及进化分析
3
作者
巩元勇
赵丽华
+3 位作者
闫飞
孙伊辰
王慧
刘来华
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期283-292,共10页
植物DUR3同源蛋白属于钠离子/溶质共运蛋白家族的尿素高亲和力运输蛋白,在植物体对外源尿素的主动吸收及内源尿素的再分配过程中具有重要作用。为明确棉花DUR3基因的结构和进化情况,基于生物信息学的方法,从全基因组水平鉴定陆地棉和雷...
植物DUR3同源蛋白属于钠离子/溶质共运蛋白家族的尿素高亲和力运输蛋白,在植物体对外源尿素的主动吸收及内源尿素的再分配过程中具有重要作用。为明确棉花DUR3基因的结构和进化情况,基于生物信息学的方法,从全基因组水平鉴定陆地棉和雷蒙德氏棉的DUR3基因,并对基因结构、跨膜结构域、基序分布、进化关系等进行分析。结果表明:(1)从陆地棉A亚组和D亚组染色体各鉴定出1个DUR3基因,从雷蒙德氏棉基因组鉴定出1个DUR3基因。这3个棉花DUR3同源蛋白同其他植物DUR3同源蛋白一样,具有15个跨膜结构域,具有3个位置一致、高度保守的基序。(2)基因结构分析表明,双子叶植物DUR3基因的外显子个数明显多于单子叶植物,这3个棉花DUR3基因的外显子个数亦是如此。(3)根据物种间种属亲缘关系,对不同物种DUR3氨基酸序列构建的进化树显示,棉花的同双子叶植物的聚在一起。(4)DUR3直系同源基因和旁系同源基因的K a/K s比值普遍均大于1,说明这些基因在进化过程中主要受到正向选择的作用。该研究结果为深入研究棉花DUR3同源蛋白提供了理论基础。
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关键词
陆地棉
雷蒙德氏棉
DUR3
基因
生物信息
进化
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职称材料
题名
高等植物氨基酸吸收与转运及生物学功能的研究进展
被引量:
63
1
作者
宋奇超
曹凤秋
巩元勇
程晓园
毕昕媛
刘来华
机构
教育部植物与土壤互作重点实验室
中国科学院上海生命科学研究院
植物
生理及生态研究所
出处
《植物营养与肥料学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期1507-1517,共11页
基金
国家自然科学基金(31070223
31270881)
自然科学基金创新群体基金(31121062)资助
文摘
氨基酸不仅是细胞中蛋白质生物合成的必需底物,而且也参与植物体内的氮代谢途径以及碳氮平衡的调节。近年来,氨基酸的转运与吸收机制及其生物学功能已成为植物分子生物学特别关注和研究的热点之一。最近,学术界亦发现某些氨基酸可能作为信号分子对植物生长发育具有特殊的生物学意义。本文就氨基酸吸收与转运的分子生理机理及其在植物生长发育中的重要功能(如调控生长、适应各种环境胁迫等)的研究进展进行了较详细地综述。
关键词
氨基酸
吸收和转运
氮素营养
信号分子
胁迫响应
Keywords
amino acid
uptake and transport
nitrogen nutrition
signal molecule
stress response
分类号
Q945 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
大豆GmGLRs基因全基因组鉴定与表达分析
被引量:
3
2
作者
崔晓霞
赵硕
郭书巧
束红梅
何晓兰
倪万潮
巩元勇
刘来华
机构
江苏省农业科学院经济
作
物研究所
教育部植物与土壤互作重点实验室
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2019年第6期1-8,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31301682)
文摘
为明确大豆GmGLRs基因家族的结构特征以及不同组织的表达模式,利用生物信息学的方法,从全基因组水平鉴定了大豆GmGLRs基因家族,并对其染色体定位、系统进化关系、基因结构、跨膜结构域及组织表达模式进行分析。结果表明,在大豆基因组(Wm82.a2.v1)全基因组信息中共鉴定出17个GmGLRs基因。基因定位显示,这些基因不均匀的分布在10条染色体上,有5条染色体各分布1个GmGLRs基因,有3条染色体各分布2个GmGLRs基因,有2条染色体各分布3个GmGLRs基因。系统进化树分析将这些基因分为2个亚族,有2个GmGLRs基因在一个亚族,其他15个GmGLRs基因在另一个亚族,这些基因在系统进化关系上成对出现,表现出很高的同源性。基因结构分析表明,这些基因基本上都具有6个外显子,只有1个基因有7个外显子。此外,大豆GmGLRs基因的CDS序列长度差异不大,最长的CDS长度是2 844 bp,最短的CDS长度是2 409 bp,平均长度为2 748 bp。跨膜结构域预测结果表明,10个GmGLRs蛋白有3个跨膜结构域,4个GmGLRs蛋白有4个跨膜结构域,2个GmGLRs蛋白有5个跨膜结构域,1个GmGLR蛋白有2个跨膜结构域。组织表达模式研究显示,这些基因没有表现出组织特异性的差异,但是在表达丰度上存在显著差异,高、中、低丰度表达基因数分别为8,5,4个。结果为大豆GmGLRs基因的克隆和功能研究提供了理论基础。
关键词
大豆
大豆基因组
GmGLRs基因
生物信息学
表达分析
Keywords
Glycine max
Genome of soybean
GmGLRs gene
Bioinformatics
Expression analysis
分类号
S562.03 [农业科学—作物学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
棉花DUR3基因的鉴定及进化分析
3
作者
巩元勇
赵丽华
闫飞
孙伊辰
王慧
刘来华
机构
攀枝花学院生物与化学工程学院
教育部植物与土壤互作重点实验室
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期283-292,共10页
基金
国家自然科学基金(31301682)
金沙江干热河谷生态修复与治理创新研究团队专项经费(035200179)。
文摘
植物DUR3同源蛋白属于钠离子/溶质共运蛋白家族的尿素高亲和力运输蛋白,在植物体对外源尿素的主动吸收及内源尿素的再分配过程中具有重要作用。为明确棉花DUR3基因的结构和进化情况,基于生物信息学的方法,从全基因组水平鉴定陆地棉和雷蒙德氏棉的DUR3基因,并对基因结构、跨膜结构域、基序分布、进化关系等进行分析。结果表明:(1)从陆地棉A亚组和D亚组染色体各鉴定出1个DUR3基因,从雷蒙德氏棉基因组鉴定出1个DUR3基因。这3个棉花DUR3同源蛋白同其他植物DUR3同源蛋白一样,具有15个跨膜结构域,具有3个位置一致、高度保守的基序。(2)基因结构分析表明,双子叶植物DUR3基因的外显子个数明显多于单子叶植物,这3个棉花DUR3基因的外显子个数亦是如此。(3)根据物种间种属亲缘关系,对不同物种DUR3氨基酸序列构建的进化树显示,棉花的同双子叶植物的聚在一起。(4)DUR3直系同源基因和旁系同源基因的K a/K s比值普遍均大于1,说明这些基因在进化过程中主要受到正向选择的作用。该研究结果为深入研究棉花DUR3同源蛋白提供了理论基础。
关键词
陆地棉
雷蒙德氏棉
DUR3
基因
生物信息
进化
Keywords
Gossypium hirsutum
G.raimondii
DUR3 gene
bioinformatics
evolution
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高等植物氨基酸吸收与转运及生物学功能的研究进展
宋奇超
曹凤秋
巩元勇
程晓园
毕昕媛
刘来华
《植物营养与肥料学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
63
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
大豆GmGLRs基因全基因组鉴定与表达分析
崔晓霞
赵硕
郭书巧
束红梅
何晓兰
倪万潮
巩元勇
刘来华
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2019
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
棉花DUR3基因的鉴定及进化分析
巩元勇
赵丽华
闫飞
孙伊辰
王慧
刘来华
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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职称材料
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