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海拔高度与藏族人群肠道菌群的宏基因组学关联分析
被引量:
9
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作者
梁田
马利锋
+8 位作者
张致英
刘丽军
刘芳
董文学
李靖
张寒
蒋雅琼
白骕
康龙丽
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2021年第2期36-43,共8页
为了探究海拔高度对人类肠道菌群的影响,选取海拔3650~4500 m地区的67名藏族人,对其肠道菌群进行16S rRNA基因V3~V4区测序.对测序数据进行物种组成、alpha多样性、beta多样性、Pearson相关性、LEfSe、微生物网络、基因功能预测和肠型等...
为了探究海拔高度对人类肠道菌群的影响,选取海拔3650~4500 m地区的67名藏族人,对其肠道菌群进行16S rRNA基因V3~V4区测序.对测序数据进行物种组成、alpha多样性、beta多样性、Pearson相关性、LEfSe、微生物网络、基因功能预测和肠型等生物信息学分析.研究结果表明:藏族人群肠道菌群的alpha多样性随海拔高度增加而降低,而beta多样性却与海拔高度的相关性较低,不同海拔高度人群的肠道菌群结构相似.LEfSe分析证明海拔3650 m藏族人群肠道菌群的biomarker为脱硫弧菌属;而海拔4000 m藏族人群肠道菌群的biomarker为梭菌属.Pearson相关性分析发现广古菌门、脱硫弧菌属、甲烷杆菌属、艰难杆菌属的丰度随着海拔高度的增加而显著下降.随着海拔高度的增加,藏族人群的肠道菌群微生物网络更加脆弱.总之,海拔高度是影响藏族人群肠道菌群alpha多样性的重要因素,不同海拔高度人群的肠道菌群差异显著.
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关键词
肠道菌群
海拔
alpha多样性
beta多样性
微生物网络
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题名
海拔高度与藏族人群肠道菌群的宏基因组学关联分析
被引量:
9
1
作者
梁田
马利锋
张致英
刘丽军
刘芳
董文学
李靖
张寒
蒋雅琼
白骕
康龙丽
机构
西藏民族大学高原病分子机制与干预研究省级重点实验室
西藏民族大学环境与疾病相关基因研究高校重点实验室
拉萨市城关区扎细社区卫生服务中心
出处
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2021年第2期36-43,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(31660307)
西藏自治区科技厅项目(XZ201801-GB-03)
西藏自治区自然科学基金资助项目(XZ2018ZRG-75(Z),XZ2019ZRG-133).
文摘
为了探究海拔高度对人类肠道菌群的影响,选取海拔3650~4500 m地区的67名藏族人,对其肠道菌群进行16S rRNA基因V3~V4区测序.对测序数据进行物种组成、alpha多样性、beta多样性、Pearson相关性、LEfSe、微生物网络、基因功能预测和肠型等生物信息学分析.研究结果表明:藏族人群肠道菌群的alpha多样性随海拔高度增加而降低,而beta多样性却与海拔高度的相关性较低,不同海拔高度人群的肠道菌群结构相似.LEfSe分析证明海拔3650 m藏族人群肠道菌群的biomarker为脱硫弧菌属;而海拔4000 m藏族人群肠道菌群的biomarker为梭菌属.Pearson相关性分析发现广古菌门、脱硫弧菌属、甲烷杆菌属、艰难杆菌属的丰度随着海拔高度的增加而显著下降.随着海拔高度的增加,藏族人群的肠道菌群微生物网络更加脆弱.总之,海拔高度是影响藏族人群肠道菌群alpha多样性的重要因素,不同海拔高度人群的肠道菌群差异显著.
关键词
肠道菌群
海拔
alpha多样性
beta多样性
微生物网络
Keywords
intestinal microbiota
altitude
alpha diversity
beta diversity
microbial network
分类号
Q988 [生物学—生态学]
R57 [医药卫生—消化系统]
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1
海拔高度与藏族人群肠道菌群的宏基因组学关联分析
梁田
马利锋
张致英
刘丽军
刘芳
董文学
李靖
张寒
蒋雅琼
白骕
康龙丽
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2021
9
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