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高粱全基因组生长素原初响应基因Aux/IAA的序列特征分析
被引量：
20
1
作者
王益军
吕燕萍
+2 位作者
谢秦
邓德祥
卞云龙
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期688-694,共7页
生长素在生物体的生长、发育与分化过程中发挥着重要作用。Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的三大基因家族之一。采用生物信息学的方法,对高粱全基因组Aux/IAA基因进行序列特征分析表明,高粱基因组中共有25...
生长素在生物体的生长、发育与分化过程中发挥着重要作用。Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的三大基因家族之一。采用生物信息学的方法,对高粱全基因组Aux/IAA基因进行序列特征分析表明,高粱基因组中共有25个Aux/IAA基因,分布于高粱9对染色体,在高粱第6号染色体上未发现Aux/IAA基因。序列比对与系统发生分析表明,22个(88%)高粱Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域,19对高粱/玉米Aux/IAA蛋白、2对高粱/水稻Aux/IAA蛋白处于系统进化树的同一分支。该研究结果不仅有助于生长素信号转导通路的解析,而且可以为其他作物基因家族的研究提供参考。
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关键词
高粱
生长素
Aux/IAA基因家族
比较基因组学
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职称材料
大豆生物量与产量组分间的相关及关联分析
被引量：
20
2
作者
晁毛妮
郝德荣
+6 位作者
印志同
张晋玉
宋海娜
张怀仁
褚姗姗
张国正
喻德跃
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期7-16,共10页
生物量与后期的籽粒产量存在紧密联系,是决定作物经济产量的主要因素之一。本研究利用自然群体中的1142 SNP在2年环境下通过全基因组关联分析检测大豆基因组中与生物量及产量组分显著关联的SNP。结果表明:(1)生物量、百粒重和单株籽粒...
生物量与后期的籽粒产量存在紧密联系,是决定作物经济产量的主要因素之一。本研究利用自然群体中的1142 SNP在2年环境下通过全基因组关联分析检测大豆基因组中与生物量及产量组分显著关联的SNP。结果表明:(1)生物量、百粒重和单株籽粒产量在自然群体中存在广泛的表型及遗传变异,并存在极显著的正相关,其中生物量与单株籽粒产量之间的相关略高于与百粒重;(2)两年环境下共检测到41、56和29个SNP分别与生物量、百粒重和单株籽粒产量显著关联,其中仅有6、19和1个SNP在2个环境中都被检测到;(3)共检测到15个SNP同时控制2个或2个以上性状,其中位于第19染色体上的BARC-029051-06057位点被检测到同时与生物量、百粒重和单株籽粒产量3个性状显著关联,表明有共同的遗传基础,同时也解释了性状间相关的遗传原因;(4)鉴定到的多个SNP与先前我们对叶绿素荧光参数及多个环境下产量相关性状的定位结果共位。这些显著关联SNP位点的鉴定,有助于理解生物量及产量相关性状的遗传机制,从而促进利用分子标记辅助选择聚合有利基因,实现未来大豆高产育种计划。
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关键词
单核苷酸位点多态性(SNP)
光合作用
产量
大豆
自然群体
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职称材料
题名
高粱全基因组生长素原初响应基因Aux/IAA的序列特征分析
被引量：
20
1
作者
王益军
吕燕萍
谢秦
邓德祥
卞云龙
机构
扬州大学农学院/作物遗传生理江苏省重点实验室/植物功能基因组学教育部重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期688-694,共7页
基金
江苏省高校自然科学研究项目(09KJB180010)
扬州大学高层次人才科研基金项目(nxy5286)资助
文摘
生长素在生物体的生长、发育与分化过程中发挥着重要作用。Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的三大基因家族之一。采用生物信息学的方法,对高粱全基因组Aux/IAA基因进行序列特征分析表明,高粱基因组中共有25个Aux/IAA基因,分布于高粱9对染色体,在高粱第6号染色体上未发现Aux/IAA基因。序列比对与系统发生分析表明,22个(88%)高粱Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域,19对高粱/玉米Aux/IAA蛋白、2对高粱/水稻Aux/IAA蛋白处于系统进化树的同一分支。该研究结果不仅有助于生长素信号转导通路的解析,而且可以为其他作物基因家族的研究提供参考。
关键词
高粱
生长素
Aux/IAA基因家族
比较基因组学
Keywords
Sorghum Auxin Aux/IAA gene family Comparative genomics
分类号
S514 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
大豆生物量与产量组分间的相关及关联分析
被引量：
20
2
作者
晁毛妮
郝德荣
印志同
张晋玉
宋海娜
张怀仁
褚姗姗
张国正
喻德跃
机构
南京农业
大学
国家大豆改良中心
/作物
遗传
与种质创新国家
重点
实验室
江苏
沿江地区农业科
学
研究所
扬州大学农学院/作物遗传生理江苏省重点实验室/植物功能基因组学教育部重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期7-16,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31171573
31201230
+3 种基金
31271749)
江苏科技支撑计划项目(BE2012328
BK2012768
BE2012747)资助
文摘
生物量与后期的籽粒产量存在紧密联系,是决定作物经济产量的主要因素之一。本研究利用自然群体中的1142 SNP在2年环境下通过全基因组关联分析检测大豆基因组中与生物量及产量组分显著关联的SNP。结果表明:(1)生物量、百粒重和单株籽粒产量在自然群体中存在广泛的表型及遗传变异,并存在极显著的正相关,其中生物量与单株籽粒产量之间的相关略高于与百粒重;(2)两年环境下共检测到41、56和29个SNP分别与生物量、百粒重和单株籽粒产量显著关联,其中仅有6、19和1个SNP在2个环境中都被检测到;(3)共检测到15个SNP同时控制2个或2个以上性状,其中位于第19染色体上的BARC-029051-06057位点被检测到同时与生物量、百粒重和单株籽粒产量3个性状显著关联,表明有共同的遗传基础,同时也解释了性状间相关的遗传原因;(4)鉴定到的多个SNP与先前我们对叶绿素荧光参数及多个环境下产量相关性状的定位结果共位。这些显著关联SNP位点的鉴定,有助于理解生物量及产量相关性状的遗传机制,从而促进利用分子标记辅助选择聚合有利基因,实现未来大豆高产育种计划。
关键词
单核苷酸位点多态性(SNP)
光合作用
产量
大豆
自然群体
Keywords
Single nucleotide polymorphisms（SNP）
Photosynthesis
Yield
Soybean
Natural population
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高粱全基因组生长素原初响应基因Aux/IAA的序列特征分析
王益军
吕燕萍
谢秦
邓德祥
卞云龙
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
20
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下载PDF
职称材料
2
大豆生物量与产量组分间的相关及关联分析
晁毛妮
郝德荣
印志同
张晋玉
宋海娜
张怀仁
褚姗姗
张国正
喻德跃
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
20
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