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安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达影响的初步研究
被引量：
12
1
作者
钟国才
李强
+7 位作者
柯尊洪
吕莹丽
郝晓峰
李崇前
杨达
王海敏
王栋
郭政
《中国神经精神疾病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期82-87,共6页
目的研究安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达的影响。方法分析抑郁症大鼠模型组和安佳欣胶囊组各8例样本的基因表达谱数据,筛选差异表达基因。利用基因功能分类体系Gene Ontology中的生物学过程子树和细胞组分子树,寻找和分析显...
目的研究安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达的影响。方法分析抑郁症大鼠模型组和安佳欣胶囊组各8例样本的基因表达谱数据,筛选差异表达基因。利用基因功能分类体系Gene Ontology中的生物学过程子树和细胞组分子树,寻找和分析显著聚集差异表达基因的复合功能类,从分子水平和基因功能模块水平探索安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因表达谱的影响。结果筛选出330个差异表达基因,并进一步识别了8个差异表达基因功能模块,主要涉及糖代谢、蛋白转运、谷氨酰胺代谢、凋亡诱导和神经发生。通过文献证实进一步发现了差异功能模块中7个可能与抑郁症发病相关的基因(Pfkm、Gpx1、Stx1a、Ninj2、Plp、Evl、Nrn1)在两组动物中差异表达。结论安佳欣胶囊可能增加抑郁症模型大鼠的单胺递质合成和释放,改善神经保护和神经发生功能,这些改变可能与安佳欣胶囊的抗抑郁作用有关。
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关键词
安佳欣胶囊
抑郁症
基因表达谱
GENE
ONTOLOGY
基因功能
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职称材料
根据基因表达谱与基因功能模块研究大鼠抑郁症发病的分子机制
2
作者
杨达
钟国才
+7 位作者
李崇前
吕莹丽
张敏
王栋
王海敏
李强
郝晓峰
郭政
《高技术通讯》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期529-534,共6页
用Willner法构造大鼠抑郁症模型,由基因芯片检测8例模型和8例正常大鼠的基因表达谱,识别差异表达基因,寻找差异表达基因功能模块并构建基因表达相关网络,研究大鼠抑郁症模型的分子病理机制。在基因本体（GO）功能体系中寻找显著富集差...
用Willner法构造大鼠抑郁症模型,由基因芯片检测8例模型和8例正常大鼠的基因表达谱,识别差异表达基因,寻找差异表达基因功能模块并构建基因表达相关网络,研究大鼠抑郁症模型的分子病理机制。在基因本体（GO）功能体系中寻找显著富集差异表达基因的疾病相关功能模块,提取疾病相关功能模块中的基因构造表达相关网络,从中选择显著多地与其它基因共表达的基因定义为HUB基因,并进一步研究其与疾病的关系。筛选得到207个差异表达基因及13个差异表达基因功能模块,主要涉及神经肽激素活性、信号传导通路、核糖体生成以及蛋白质转运与降解。在共表达相关网络中进一步识别了4个差异表达的HUB基因。利用基因功能模块和表达相关网络研究疾病机制的结果显示,抑郁症的发病可能涉及单胺递质的释放、信号传导以及神经肽激素调节等通路协同作用。
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关键词
抑郁症
基因本体
基因表达谱
功能模块
表达相关网络
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职称材料
题名
安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达影响的初步研究
被引量：
12
1
作者
钟国才
李强
柯尊洪
吕莹丽
郝晓峰
李崇前
杨达
王海敏
王栋
郭政
机构
哈尔滨医科大学生物信息学系
成都康弘集团博士后工作站
出处
《中国神经精神疾病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期82-87,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(编号:30170515
30370388
+8 种基金
30370798
30570424
30571034)
国家863计划资助项目(编号:2003AA2Z2051
2002AA2Z2052)
黑龙江科技攻关重点资助项目(编号:GB03C602-4)
哈尔滨市科技攻关资助项目(编号:2003AA3CS113)
黑龙江自然科学基金资助项目(编号:F0177)
哈医大211工程"十五"建设项目资助
文摘
目的研究安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达的影响。方法分析抑郁症大鼠模型组和安佳欣胶囊组各8例样本的基因表达谱数据,筛选差异表达基因。利用基因功能分类体系Gene Ontology中的生物学过程子树和细胞组分子树,寻找和分析显著聚集差异表达基因的复合功能类,从分子水平和基因功能模块水平探索安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因表达谱的影响。结果筛选出330个差异表达基因,并进一步识别了8个差异表达基因功能模块,主要涉及糖代谢、蛋白转运、谷氨酰胺代谢、凋亡诱导和神经发生。通过文献证实进一步发现了差异功能模块中7个可能与抑郁症发病相关的基因(Pfkm、Gpx1、Stx1a、Ninj2、Plp、Evl、Nrn1)在两组动物中差异表达。结论安佳欣胶囊可能增加抑郁症模型大鼠的单胺递质合成和释放,改善神经保护和神经发生功能,这些改变可能与安佳欣胶囊的抗抑郁作用有关。
关键词
安佳欣胶囊
抑郁症
基因表达谱
GENE
ONTOLOGY
基因功能
Keywords
ANJIAXIN capsule
depression
gene expression profile
Gene Ontology
gene function
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
根据基因表达谱与基因功能模块研究大鼠抑郁症发病的分子机制
2
作者
杨达
钟国才
李崇前
吕莹丽
张敏
王栋
王海敏
李强
郝晓峰
郭政
机构
哈尔滨医科大学生物信息学系
成都康弘集团博士后工作站
同济大学生命科学与技术学院
出处
《高技术通讯》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期529-534,共6页
基金
国家自然科学基金（30370388.30670539）.863计划（2002AA-222052）和哈医大211工程“十五”建设项目资助.
文摘
用Willner法构造大鼠抑郁症模型,由基因芯片检测8例模型和8例正常大鼠的基因表达谱,识别差异表达基因,寻找差异表达基因功能模块并构建基因表达相关网络,研究大鼠抑郁症模型的分子病理机制。在基因本体（GO）功能体系中寻找显著富集差异表达基因的疾病相关功能模块,提取疾病相关功能模块中的基因构造表达相关网络,从中选择显著多地与其它基因共表达的基因定义为HUB基因,并进一步研究其与疾病的关系。筛选得到207个差异表达基因及13个差异表达基因功能模块,主要涉及神经肽激素活性、信号传导通路、核糖体生成以及蛋白质转运与降解。在共表达相关网络中进一步识别了4个差异表达的HUB基因。利用基因功能模块和表达相关网络研究疾病机制的结果显示,抑郁症的发病可能涉及单胺递质的释放、信号传导以及神经肽激素调节等通路协同作用。
关键词
抑郁症
基因本体
基因表达谱
功能模块
表达相关网络
Keywords
depression, gene ontology, gene expression profile, functional module, co-expression network
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达影响的初步研究
钟国才
李强
柯尊洪
吕莹丽
郝晓峰
李崇前
杨达
王海敏
王栋
郭政
《中国神经精神疾病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2007
12
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
根据基因表达谱与基因功能模块研究大鼠抑郁症发病的分子机制
杨达
钟国才
李崇前
吕莹丽
张敏
王栋
王海敏
李强
郝晓峰
郭政
《高技术通讯》
CAS
CSCD
北大核心
2007
0
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