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基于网络药理学与分子对接探讨虫草素治疗哮喘的作用机制
1
作者
蒋蔓灵
张雷
+2 位作者
刘瑶
李国平
黄锦伟
《中国药理学通报》
北大核心
2025年第11期2158-2166,共9页
目的 基于网络药理学、分子对接及体外细胞实验验证,拟探讨虫草素抗哮喘作用的潜在分子机制。方法 使用数据库检索并筛选得到虫草素靶点和哮喘靶点;取交集得到共同靶点,构建蛋白互作网络(protein-protein pnteraction networks,PPI)并...
目的 基于网络药理学、分子对接及体外细胞实验验证,拟探讨虫草素抗哮喘作用的潜在分子机制。方法 使用数据库检索并筛选得到虫草素靶点和哮喘靶点;取交集得到共同靶点,构建蛋白互作网络(protein-protein pnteraction networks,PPI)并基于拓扑分析得出核心靶点;对核心靶点进行京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和基因本体论(gene ontology,GO)富集分析,并构建药物-靶点-通路网络;将虫草素与核心靶点进行分子对接以及分子动力学模拟验证。后基于Beas-2B细胞体外模型,采用CCK-8法和RT-qPCR的方法验证虫草素的药效及机制。结果 通过数据库筛选获得虫草素靶点438个,与哮喘靶点取交集得到113个共同靶点,进一步通过拓扑分析获得22个核心靶点;KEGG富集得到TNF、HIF-1等165条通路;分子对接的结果显示,虫草素与其中某些核心靶点具有较高的亲和力,分子动力学模拟结果也印证了这一点;体外模拟哮喘细胞实验表明,虫草素能够抑制屋尘螨(house dust mite,HDM)刺激的Beas-2B细胞中MAPK1、HIF1A、MTOR、MYC、IL10以及JUN的mRNA水平上调,表现出了明显的药效。结论 虫草素可通过MAPK1等靶点发挥抗哮喘的作用,为更好地推进其开发应用提供了科学根据。
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关键词
虫草素
哮喘
网络药理学
分子对接
分子动力学
信号转导机制
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职称材料
铜绿假单胞菌对肺血管内皮细胞功能的影响及其机制
被引量：
1
2
作者
张雷
王俊轶
+3 位作者
何翔
吴敏
李国平
黄锦伟
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期1-10,共10页
目的探究铜绿假单胞菌(PA)感染对肺血管内皮细胞功能的影响,并探讨其加重小鼠肺部炎症反应的可能机制。方法PAO1菌株感染人肺微血管内皮细胞HULEC-5a 2 h后,采用逆转录实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测自噬相关基因5(ATG5)、6-磷酸果糖-2-...
目的探究铜绿假单胞菌(PA)感染对肺血管内皮细胞功能的影响,并探讨其加重小鼠肺部炎症反应的可能机制。方法PAO1菌株感染人肺微血管内皮细胞HULEC-5a 2 h后,采用逆转录实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测自噬相关基因5(ATG5)、6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶3(PFKFB3)和钙黏蛋白5(CDH5)的mRNA表达,免疫荧光检测ATG5、PFKFB3和血管内皮钙黏蛋白(VE-cadherin)的蛋白表达。采用小干扰RNA(siRNA)分别敲减ATG5、PFKFB3后,RT-qPCR检测ATG5、PFKFB3和CDH5的mRNA表达,免疫荧光检测PFKFB3和VE-cadherin的蛋白表达,并采用乳酸测定试剂盒检测细胞内乳酸的水平。采用PAO1菌株感染小鼠后,肺组织切片病理染色观察小鼠肺部炎症,激光共聚焦显微镜观察并分析荧光标记的内皮细胞PFKFB3和VE-cadherin的表达量。结果与对照组比较,PAO1感染HULEC-5a细胞后,PFKFB3 mRNA和蛋白表达均增加(P均<0.05),CDH5 mRNA表达减少(P=0.023),VE-cadherin蛋白表达减少(P<0.001),且连续性被破坏,乳酸含量升高(P=0.017)。与PAO1感染HULEC-5a细胞比较,PAO1感染敲减PFKFB3的HULEC-5a细胞后,CDH5 mRNA表达增加(P=0.043),VE-cadherin荧光连续性得到恢复,乳酸含量降低(P=0.047);PAO1感染敲减ATG5的HULEC-5a细胞后,PFKFB3 mRNA(P=0.013)和蛋白表达(P=0.003)均增加,CDH5 mRNA(P=0.020)和VE-cadherin蛋白表达(P=0.001)均减少,乳酸含量升高(P=0.015)。PAO1感染小鼠后,病理HE染色结果显示,肺泡内明显的红细胞渗漏,炎症细胞浸润,肺泡间隔增宽和部分血管内皮细胞脱落。免疫荧光染色结果显示,与正常小鼠比较,PAO1感染小鼠内皮细胞PFKFB3表达增加,VE-cadherin荧光减弱,且不连续。结论PA可能通过AGT5调控PFKFB3通路,破坏肺血管内皮细胞功能,进而加重小鼠肺部炎症反应。
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关键词
铜绿假单胞菌
肺血管内皮细胞
6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2
6-二磷酸酶3
自噬相关基因5
感染
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职称材料
题名
基于网络药理学与分子对接探讨虫草素治疗哮喘的作用机制
1
作者
蒋蔓灵
张雷
刘瑶
李国平
黄锦伟
机构
澳门科技大学中医药学院
成都市第三人民医院呼吸健康研究所过敏与精准医学实验室
出处
《中国药理学通报》
北大核心
2025年第11期2158-2166,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(No82370022,82300088)
四川省自然科学基金(No23NSFSC1736,2024NSFSC1524)
+2 种基金
成都市医学科研课题项目(No2024028)
成都市高水平临床重点专科建设项目(NoZX20201202020)
澳门科学技术发展基金(No0124/2022/A)。
文摘
目的 基于网络药理学、分子对接及体外细胞实验验证,拟探讨虫草素抗哮喘作用的潜在分子机制。方法 使用数据库检索并筛选得到虫草素靶点和哮喘靶点;取交集得到共同靶点,构建蛋白互作网络(protein-protein pnteraction networks,PPI)并基于拓扑分析得出核心靶点;对核心靶点进行京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和基因本体论(gene ontology,GO)富集分析,并构建药物-靶点-通路网络;将虫草素与核心靶点进行分子对接以及分子动力学模拟验证。后基于Beas-2B细胞体外模型,采用CCK-8法和RT-qPCR的方法验证虫草素的药效及机制。结果 通过数据库筛选获得虫草素靶点438个,与哮喘靶点取交集得到113个共同靶点,进一步通过拓扑分析获得22个核心靶点;KEGG富集得到TNF、HIF-1等165条通路;分子对接的结果显示,虫草素与其中某些核心靶点具有较高的亲和力,分子动力学模拟结果也印证了这一点;体外模拟哮喘细胞实验表明,虫草素能够抑制屋尘螨(house dust mite,HDM)刺激的Beas-2B细胞中MAPK1、HIF1A、MTOR、MYC、IL10以及JUN的mRNA水平上调,表现出了明显的药效。结论 虫草素可通过MAPK1等靶点发挥抗哮喘的作用,为更好地推进其开发应用提供了科学根据。
关键词
虫草素
哮喘
网络药理学
分子对接
分子动力学
信号转导机制
Keywords
cordycepin
asthma
network pharmacology
molecular docking
molecular dynamics
signaling transduction mechanisms
分类号
R284.1 [医药卫生—中药学]
R319 [医药卫生—基础医学]
R562.25 [医药卫生—呼吸系统]
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职称材料
题名
铜绿假单胞菌对肺血管内皮细胞功能的影响及其机制
被引量：
1
2
作者
张雷
王俊轶
何翔
吴敏
李国平
黄锦伟
机构
澳门科技大学中药质量
研究
国家重点
实验室
成都市第三人民医院呼吸健康研究所过敏与精准医学实验室
北达科他大学
医学
与
健康
科学院生物
医学
科学系
中国科学院大学温州
研究
院
出处
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期1-10,共10页
基金
国家自然科学基金(81970026、82000029、82200079)
四川省自然科学基金(2022NSFSC1324)
+1 种基金
成都市高水平临床重点专科建设项目(ZX20201202020)
澳门科学技术发展基金(0124/2022/A)。
文摘
目的探究铜绿假单胞菌(PA)感染对肺血管内皮细胞功能的影响,并探讨其加重小鼠肺部炎症反应的可能机制。方法PAO1菌株感染人肺微血管内皮细胞HULEC-5a 2 h后,采用逆转录实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测自噬相关基因5(ATG5)、6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶3(PFKFB3)和钙黏蛋白5(CDH5)的mRNA表达,免疫荧光检测ATG5、PFKFB3和血管内皮钙黏蛋白(VE-cadherin)的蛋白表达。采用小干扰RNA(siRNA)分别敲减ATG5、PFKFB3后,RT-qPCR检测ATG5、PFKFB3和CDH5的mRNA表达,免疫荧光检测PFKFB3和VE-cadherin的蛋白表达,并采用乳酸测定试剂盒检测细胞内乳酸的水平。采用PAO1菌株感染小鼠后,肺组织切片病理染色观察小鼠肺部炎症,激光共聚焦显微镜观察并分析荧光标记的内皮细胞PFKFB3和VE-cadherin的表达量。结果与对照组比较,PAO1感染HULEC-5a细胞后,PFKFB3 mRNA和蛋白表达均增加(P均<0.05),CDH5 mRNA表达减少(P=0.023),VE-cadherin蛋白表达减少(P<0.001),且连续性被破坏,乳酸含量升高(P=0.017)。与PAO1感染HULEC-5a细胞比较,PAO1感染敲减PFKFB3的HULEC-5a细胞后,CDH5 mRNA表达增加(P=0.043),VE-cadherin荧光连续性得到恢复,乳酸含量降低(P=0.047);PAO1感染敲减ATG5的HULEC-5a细胞后,PFKFB3 mRNA(P=0.013)和蛋白表达(P=0.003)均增加,CDH5 mRNA(P=0.020)和VE-cadherin蛋白表达(P=0.001)均减少,乳酸含量升高(P=0.015)。PAO1感染小鼠后,病理HE染色结果显示,肺泡内明显的红细胞渗漏,炎症细胞浸润,肺泡间隔增宽和部分血管内皮细胞脱落。免疫荧光染色结果显示,与正常小鼠比较,PAO1感染小鼠内皮细胞PFKFB3表达增加,VE-cadherin荧光减弱,且不连续。结论PA可能通过AGT5调控PFKFB3通路,破坏肺血管内皮细胞功能,进而加重小鼠肺部炎症反应。
关键词
铜绿假单胞菌
肺血管内皮细胞
6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2
6-二磷酸酶3
自噬相关基因5
感染
Keywords
Pseudomonas aeruginosa
pulmonary vascular endothelial cell
6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 3
autophagy-related gene 5
infection
分类号
R378.991 [医药卫生—病原生物学]
R563.1*9 [医药卫生—呼吸系统]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学与分子对接探讨虫草素治疗哮喘的作用机制
蒋蔓灵
张雷
刘瑶
李国平
黄锦伟
《中国药理学通报》
北大核心
2025
0
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下载PDF
职称材料
2
铜绿假单胞菌对肺血管内皮细胞功能的影响及其机制
张雷
王俊轶
何翔
吴敏
李国平
黄锦伟
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
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