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新型冠状病毒ORF 1ab/S/M蛋白遗传进化分析及mRNA疫苗抗原表位序列筛选 被引量：4
1
作者 常凯 刘晨霞 +5 位作者 朱紫衣 许宏宣 王艳艳 熊杰 曲远青 江忠勇 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1131-1137,共7页
目的分析新型冠状病毒(SARS-CoV-2)ORF 1ab/S/M蛋白的遗传进化特性并筛选mRNA疫苗的抗原表位序列。方法收集全球SARS-CoV-2的全基因组序列,比较ORF 1ab/S/M蛋白及核酸遗传差异并构建进化树,绘制遗传差异全球分布图。基于严重急性呼吸综... 目的分析新型冠状病毒(SARS-CoV-2)ORF 1ab/S/M蛋白的遗传进化特性并筛选mRNA疫苗的抗原表位序列。方法收集全球SARS-CoV-2的全基因组序列,比较ORF 1ab/S/M蛋白及核酸遗传差异并构建进化树,绘制遗传差异全球分布图。基于严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)的研究基础,结合SARS-CoV-2的遗传差异,预测并筛选mRNA疫苗抗原表位候选序列。结果全球新型冠状病毒肺炎(COVID-19)暴发地区SARS-CoV-2的ORF 1ab核酸序列相似性为100.0%,同源性为99.3%;S蛋白核酸序列相似性为100.0%,同源性为97.5%;M蛋白核酸序列相似性为100.0%,同源性为99.9%。三种蛋白遗传变异的全球分布显示,美洲地区与亚欧地区暴发的SARS-CoV-2存在明显差异。SARS-CoV-2 ORF 1ab蛋白区段筛选出11条B细胞和13条T细胞mRNA疫苗候选目标序列,S蛋白区段筛选出6条B细胞和4条T细胞mRNA疫苗候选目标序列,M蛋白区段筛选出3条B细胞和7条T细胞mRNA疫苗候选目标序列。结论在美洲地区与亚欧地区暴发的SARS-CoV-2存在明显的遗传差异,通过构建新的线性抗原表位mRNA筛选策略,筛选出ORF 1ab/S/M编码区中多条引起免疫细胞响应的抗原表位序列,可为mRNA疫苗(串联抗原表位序列)研发、抗体制备及免疫机制研究提供参考。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 遗传进化 刺突蛋白 膜蛋白 抗原表位 mRNA疫苗
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