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BUB1基因在胃癌组织中高表达:基于Oncomine数据库及生物信息学方法 被引量:11
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作者 李小燕 何杰 +2 位作者 余觅 张维 孙建 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期683-692,共10页
目的探讨细胞周期有丝分裂纺锤体检测点丝/苏氨酸激酶(BUB1)基因在胃癌(STAD)中的表达及临床价值。方法分别运用Oncomine、GEPIA、BioGPS和Kaplan-Meier Plotter等数据库分析BUB1基因在胃癌组织和正常胃组织的表达差异,并且分析BUB1表... 目的探讨细胞周期有丝分裂纺锤体检测点丝/苏氨酸激酶(BUB1)基因在胃癌(STAD)中的表达及临床价值。方法分别运用Oncomine、GEPIA、BioGPS和Kaplan-Meier Plotter等数据库分析BUB1基因在胃癌组织和正常胃组织的表达差异,并且分析BUB1表达水平与胃癌患者生存预后之间的关系;利用癌症细胞系全科百科全书(CCLE)分析BUB1分别在胃癌组织T细胞和B细胞中的表达,利用String数据库绘制BUB1相关蛋白网络图及基因本体(GO)功能注释,并对京都基因和基因组百科全书(KEGG)相关通路进行分析。采用肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析BUB1在免疫浸润物中的表达及对胃癌患者生存预后的影响。为进一步验证Oncomine数据库基因芯片的结果,我们选择成都医学院第一附属医院2018年3月~2019年7月收治的胃癌患者30例,经外科手术获得胃腺癌组织30份,同时获取的癌旁正常组织30份作为对照组,通过PCR和免疫组化技术对Oncomine数据库中BUB1基因表达的数据进行验证。结果Oncomine、GEPIA、BioGPS分析显示:与正常胃组织相比,BUB1在胃癌组织中呈现高表达(P<0.05)。通过Kaplan-Meier生存分析发现,BUB1基因高表达的胃癌患者无进展生存期(HR=0.52,95%CI=0.41~0.67,P<0.05)、总生存期(HR=0.67,95%CI=0.55~0.82,P<0.05)均有所延长。通过string数据收集到与BUB1相关蛋白主要富集于13类细胞学组分、4类分子功能和12类生物学过程,并参与了4条信号通路。TIMER数据库分析显示在免疫微环境中高表达BUB1 mRNA的CD4+T细胞和巨噬细胞对胃癌患者5年生存预后较好。实时定量PCR结果提示胃癌组织样本BUB1的表达水平(4.345±0.421)明显高于配对的癌旁正常胃粘膜组织(1.583±0.122)(t=34.63,P<0.05);免疫组化结果提示胃癌组织BUB1染色成阳性。结论胃癌组织中BUB1基因呈现高表达,BUB1可能具有减少肿瘤免疫抑制作用可协助评估胃癌患者的预后情况。 展开更多
关键词 BUB1基因 胃癌 生存期 生物信息学
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载脂蛋白A-Ⅰ模拟肽对非酒精性脂肪肝病大鼠糖脂代谢的影响 被引量:6
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作者 杨青 周陈红 +1 位作者 黎瑶 杜飞 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期651-654,660,共5页
目的:探讨载脂蛋白A-Ⅰ(apoA-Ⅰ)模拟肽对非酒精性脂肪肝病(NAFLD)大鼠糖脂代谢的影响及其可能的机制。方法:50只清洁级健康雄性SD大鼠随机分为空白组(n=13)和造模组(n=37),空白组大鼠给予普通饲料饲养,造模组大鼠给予高脂饲料喂养,连... 目的:探讨载脂蛋白A-Ⅰ(apoA-Ⅰ)模拟肽对非酒精性脂肪肝病(NAFLD)大鼠糖脂代谢的影响及其可能的机制。方法:50只清洁级健康雄性SD大鼠随机分为空白组(n=13)和造模组(n=37),空白组大鼠给予普通饲料饲养,造模组大鼠给予高脂饲料喂养,连续喂养12周,每组随机取1只大鼠评估NAFLD模型是否成功。造模组剩余的36只大鼠随机分为模型组、阳性药物组和apoA-Ⅰ模拟肽组,每组12只,apoA-Ⅰ模拟肽组大鼠腹腔注射apoA-Ⅰ模拟肽,阳性药物组腹腔注射阿托伐他汀,模型组和空白组腹腔注射等量的生理盐水,1次/d,连续8周。检测大鼠肝功能、血糖和血脂水平,HE染色观察大鼠肝脏组织形态,ELISA法检测肝脏组织中SOD、GSH-Px、MDA、IL-1β、IL-6和TNF-α水平。结果:与空白组比较,模型组、阳性药物组和apoA-Ⅰ模拟肽组大鼠血清ALT、AST、FBG、TC、TG和LDL-C水平升高(P<0.05),而HDL-C水平降低(P<0.05),肝脏组织中SOD和GSH-Px水平降低(P<0.05),而MDA、IL-1β、IL-6和TNF-α水平升高(P<0.05);与模型组比较,阳性药物组和apoA-Ⅰ模拟肽组大鼠血清ALT、AST、FBG、TC、TG和LDL-C水平降低(P<0.05),而HDL-C水平升高(P<0.05),肝脏组织中SOD和GSH-Px水平升高(P<0.05),而MDA、IL-1β、IL-6和TNF-α水平降低(P<0.05)。结论:apoA-Ⅰ模拟肽可减轻NAFLD模型大鼠肝损伤,改善糖脂代谢,其机制可能与减轻肝脏氧化应激和炎症反应有关。 展开更多
关键词 载脂蛋白A-Ⅰ模拟肽 酒精性脂肪肝病 糖脂代谢 氧化应激 炎症反应 大鼠
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低氧条件下人成骨细胞长链非编码RNA5'aHIF-1α的表达 被引量:2
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作者 张学翠 金小岚 +5 位作者 郎红梅 万勇 郭鑫 杨云 李薇 刘东方 《中华骨质疏松和骨矿盐疾病杂志》 2013年第3期246-250,共5页
目的观察低氧条件下人成骨细胞HIF-1α反义转录物5'aHIF-1α的表达变化,探讨低氧对人成骨细胞分化影响的调控机制。方法采用人成骨肉瘤细胞系(MG63),随机分为4组,分别在不同氧体积分数(10%、6%、3%和1%O2)条件下培养72 h。用Trizol... 目的观察低氧条件下人成骨细胞HIF-1α反义转录物5'aHIF-1α的表达变化,探讨低氧对人成骨细胞分化影响的调控机制。方法采用人成骨肉瘤细胞系(MG63),随机分为4组,分别在不同氧体积分数(10%、6%、3%和1%O2)条件下培养72 h。用Trizol法提取总RNA,用实时荧光定量PCR法检测5'aHIF-1α表达;用Western blot法检测HIF-1α蛋白表达。结果 10%O2组MG63细胞5'aHIF-1α表达水平是对照组(6%O2)的2.06±0.07倍,3%和1%O2组MG63细胞5'aHIF-1α表达水平分别是对照组的0.63±0.08和0.43±0.03倍。10%O2组5'a HIF-1α蛋白表达水平明显降低,3%和1%O2组HIF-1α蛋白表达水平随氧体积分数降低而逐渐升高。结论低氧条件下,长链非编码RNA-5'aHIF-1α可能在转录或转录后水平抑制MG63细胞HIF-1α的表达,但随着氧体积分数的降低,其抑制作用逐渐减弱。 展开更多
关键词 低氧 成骨细胞 长链非编码RNAs 低氧诱导因子1Α
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垂体腺瘤中Wnt通路抑制因子作用的研究进展
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作者 杨惠岚 安振梅 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期663-667,共5页
Wnt信号通路与多种肿瘤的发生相关,研究表明Wnt通路抑制因子的异常甲基化可使Wnt信号通路异常激活,从而诱导肿瘤的形成。垂体腺瘤作为颅内常见的肿瘤之一,临床症状主要由垂体激素过度分泌(或)缺乏和(或)肿瘤占位效应引起,其发病机制至... Wnt信号通路与多种肿瘤的发生相关,研究表明Wnt通路抑制因子的异常甲基化可使Wnt信号通路异常激活,从而诱导肿瘤的形成。垂体腺瘤作为颅内常见的肿瘤之一,临床症状主要由垂体激素过度分泌(或)缺乏和(或)肿瘤占位效应引起,其发病机制至今不完全清楚,部分研究表明垂体腺瘤的发生与Wnt通路抑制因子的异常甲基化相关。本文对垂体腺瘤中Wnt通路抑制因子作用的研究进行综述,为垂体腺瘤中去甲基化治疗提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 Wnt通路抑制因子 DNA甲基化 垂体腺瘤 s FRP DKKs
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兔椎体软骨终板内血管三维影像结构研究 被引量:5
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作者 徐鸿明 胡斐 +3 位作者 王雍立 金海明 陶周善 王向阳 《中国脊柱脊髓杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1013-1017,共5页
目的:研究兔椎体软骨终板内血管的三维影像结构。方法:选取6月龄日本大耳白兔(2.5~3kg)5只,使用Micro-CT对通过腹主动脉注射硫酸钡造影剂后的兔L4、L5椎体及其终板进行10mm与5mm范围扫描,将扫描结果导入Mimics软件进行血管三维结构... 目的:研究兔椎体软骨终板内血管的三维影像结构。方法:选取6月龄日本大耳白兔(2.5~3kg)5只,使用Micro-CT对通过腹主动脉注射硫酸钡造影剂后的兔L4、L5椎体及其终板进行10mm与5mm范围扫描,将扫描结果导入Mimics软件进行血管三维结构重建,观察椎体终板内血管的三维结构。10mm与5mm范围扫描结果分别为10mm组和5mm组,从两组血管三维图中随机选取5个血管末端并测量其直径大小。结果:Mimics软件重建的椎体终板内血管三维结构清晰可见。10mm组终板内血管俯视图可见血管在终板内接触髓核部分的中心区域分布密集,管径粗,并向四周的接触纤维环部分的终板呈放射状辐射;矢状面上可见终板将椎体部分与椎间盘内纤维环及髓核部分明显分隔开,其内血管从椎体后方发出,沿终板后方向前方辐射长入。5mm组图像可见终板内接触髓核部分的中心区域的血管与接触纤维环部分的外周区域的血管结构不同,接触纤维环部分的外周区域的血管形状为单一襻样结构,而终板内接触髓核部分的中心区域的血管是一种复杂的完全缠绕在一起的血管襻结构。5mm组血管末端直径明显小于10mm组血管末端直径(P〈0.001)。结论:注射硫酸钡造影剂后用Micro-CT扫描建立终板内血管三维结构的方法可以清楚地显示兔终板内血管的三维结构,为进一步研究终板血管变化提供新的技术手段。 展开更多
关键词 椎体终板 血管 血管造影 硫酸钡 MICRO-CT
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REG1A通过调控Wnt/β-catenin信号通路对肺腺癌细胞增殖和迁移的促进作用 被引量:2
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作者 李小燕 张维 何杰 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期444-453,共10页
目的:探讨再生基因1A(REG1A)对肺腺癌细胞增殖和迁移的促进作用及其对Wnt/β-catenin信号通路的调控,并阐明可能的作用机制。方法:利用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库下载符合本研究要求的515例肺腺癌组织和59例癌旁正常组织的基因表达谱,... 目的:探讨再生基因1A(REG1A)对肺腺癌细胞增殖和迁移的促进作用及其对Wnt/β-catenin信号通路的调控,并阐明可能的作用机制。方法:利用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库下载符合本研究要求的515例肺腺癌组织和59例癌旁正常组织的基因表达谱,根据REG1A表达水平的中位值,分为低和高表达REG1A组,采用R 3.6.1软件对2组基因进行差异基因分析,根据差异基因进行基因本体(GO)功能注释,采用GSEA 4.1.0软件筛查差异基因富集的京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路。筛查出得分最高的信号通路[无翅型MMTV整合位点(Wnt)信号通路],采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)及Western blotting法检测人正常肺上皮细胞(BEAS-2B)和肺腺癌细胞A549、LC-2、HCC515和PC14中REG1A mRNA及蛋白表达水平。采用脂质体转染法将shREG1A和shNC质粒转染A549细胞,将REG1A敲减后的细胞,采用氯化锂(LiCl)处理,将细胞分为shNC组、shREG1A组、shREG1A+PBS组和shREG1A+LiCl组,采用细胞计数试剂盒(CCK-8)检测各组细胞增殖活性,采用Transwell实验检测各组细胞的迁移情况,RT-qPCR和Western blotting法检测各组细胞中无翅型MMTV整合位点家族成员3a(Wnt-3a)、β-连环素(β-catenin)和原癌基因(c-Myc)mRNA及蛋白表达水平。结果:生物信息学分析,低和高表达REG1A组共有78个差异基因,其中上调的基因50个,下调的基因28个,上述基因主要富集在脂质转运体活性、内切核糖核酸酶活性和胃肠道上皮结构稳态的维持等生物学过程和分子功能上,富集的通路有Wnt信号通路、Janus激酶-信号转导与转录激活因子(JAK-STAT)信号通路和癌症信号通路,其中Wnt信号通路富集得分最高。RT-qPCR法和Western blotting检测,肺腺癌A549、LC-2、HCC515和PC14细胞中REG1A mRNA及蛋白表达水平均明显高于BEAS-2B细胞(P<0.05)。脂质体转染法敲减REG1A后,与shNC组比较,shREG1A组A549细胞中REG1A mRNA和蛋白表达水平明显降低(P<0.05);shNC组、shREG1A组、shREG1A+PBS组和shREG1A+LiCl组细胞增殖活性及迁移细胞数差异有统计学意义(P<0.05),shREG1A组细胞增殖活性低于shNC组和shREG1A+LiCl组(P<0.05),shREG1A组迁移细胞数少于shNC组和shREG1A+LiCl组(P<0.05),shREG1A组与shREG1A+PBS组细胞增殖活性和迁移细胞数比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论:REG1A在肺腺癌细胞中呈现高表达,可以通过调控Wnt/β-catenin信号通路,促进A549细胞的增殖和迁移;敲减REG1A后,A549细胞增殖和迁移能力也受到抑制。 展开更多
关键词 肺腺癌 再生基因1A 细胞增殖 细胞迁移 生物信息学
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