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改进NSGA-Ⅱ在板式定制家具多目标柔性作业车间调度中的应用
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作者 唐雪梅 杨兵 +1 位作者 唐思怡 黄成 《森林防火》 2025年第2期125-133,共9页
在板式定制家具生产中,多目标柔性作业车间调度问题(Multi-Objective Flexible Job Shop Scheduling Problem,MOFJSP)严重制约生产效率与资源配置。以最小化最大完工时间、机器总负载和最大机器负载为求解目标,引入改进的非支配精英策... 在板式定制家具生产中,多目标柔性作业车间调度问题(Multi-Objective Flexible Job Shop Scheduling Problem,MOFJSP)严重制约生产效率与资源配置。以最小化最大完工时间、机器总负载和最大机器负载为求解目标,引入改进的非支配精英策略遗传算法(non-dominated sorting genetic algorithm II,NSGA-II)来解决该问题。对NSGA-II进行创新改良,构建扩展工序编码体系,设计主动调度解码机制,开发高效的初始解生成策略及交叉、变异优化操作,提升算法搜索与寻优能力。针对传统算法在非支配排序和精英保留策略的不足,提出改进的精英策略,引导搜索靠近真实Pareto曲面,实现更优解集均匀分布,增强算法性能。通过结合真实生产数据验证,结果显示改进后的NSGA-II在实际生产中可行性与有效性良好,能显著优化生产过程。 展开更多
关键词 NSGA-Ⅱ 板式家具 家具生产 车间调度 多目标优化
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治疗性抗体可开发性评估研究进展 被引量:3
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作者 Anthony Mackitz DZISOO 任丽萍 +2 位作者 谢诗扬 周雨薇 黄健 《电子科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第3期476-480,共5页
抗体在疾病诊防治中起着关键作用。其中,治疗性抗体已形成千亿美元的市场,适应症涵盖肿瘤、自身免疫及感染性疾病等,但也存在研发成本高、成功率低的困境。如何全面、合理、快速地对海量候选抗体进行可开发性评估,降低研发后期失败率,... 抗体在疾病诊防治中起着关键作用。其中,治疗性抗体已形成千亿美元的市场,适应症涵盖肿瘤、自身免疫及感染性疾病等,但也存在研发成本高、成功率低的困境。如何全面、合理、快速地对海量候选抗体进行可开发性评估,降低研发后期失败率,是治疗性抗体开发领域亟待解决的关键科技问题。该文综述了抗体可开发性评估实验研究及相关生物信息学研究的进展,总结了现有研究存在的问题,有助于相关领域学者未来研究的开展。 展开更多
关键词 生物信息学 可开发性 机器学习 治疗性抗体
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CISI2.0:更好的抗体交叉或自身相互作用预测工具 被引量:1
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作者 周雨薇 岳鹏 黄健 《电子科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第5期659-666,共8页
抗体广泛用于各类疾病的预防、诊断与治疗。然而,治疗性抗体研发的成功率还不尽人意。不少抗体因为稳定性差,溶解度低,存在交叉或自身相互作用等可开发性缺陷而最终开发失败。候选单克隆抗体能否开发成功,与其理化性质息息相关。虽然已... 抗体广泛用于各类疾病的预防、诊断与治疗。然而,治疗性抗体研发的成功率还不尽人意。不少抗体因为稳定性差,溶解度低,存在交叉或自身相互作用等可开发性缺陷而最终开发失败。候选单克隆抗体能否开发成功,与其理化性质息息相关。虽然已有多种实验方法测定抗体交叉或自身相互作用相关的多种理化特性,但实验测试费力费时费钱。现有的抗体可开发性计算方法,或者依赖于结构,速度慢,通量低;或者未提供可用的软件或在线服务;或者提供的计算服务或软件费用过高;或者预测器的性能与健壮性有待提高。该文仅基于抗体序列,采用二肽期望均值偏差为特征,构建预测抗体交叉或自身相互作用的支持向量机模型。评估结果显示,该集成模型敏感性为100%,准确率为96.18%,可望用于抗体交叉或自身相互作用的高通量评估,加速治疗性抗体研发进程,降低研发成本。 展开更多
关键词 交叉相互作用 可开发性 自身相互作用 支持向量机 治疗性抗体
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利用计算生物学方法识别原核启动子的研究进展 被引量:1
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作者 苏伟 孙自杰 +1 位作者 岳鹏 林昊 《电子科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第5期667-675,共9页
原核启动子作为DNA中的一个关键区域,含有RNA聚合酶特异性结合和基因转录起始所需的保守序列,在转录调控中发挥着重要作用。然而,由于实验方法在实验周期和实验耗材上的限制,对启动子序列进行批量准确的鉴定仍然是分子生物学领域一项艰... 原核启动子作为DNA中的一个关键区域,含有RNA聚合酶特异性结合和基因转录起始所需的保守序列,在转录调控中发挥着重要作用。然而,由于实验方法在实验周期和实验耗材上的限制,对启动子序列进行批量准确的鉴定仍然是分子生物学领域一项艰巨的任务。随着计算机技术的发展,出现了多个基于计算生物学的原核启动子预测方法,这些方法在数据质量、数据集大小、提取的特征、特征选择技术、分类算法以及评估策略方面表现出高度的多样性。该文系统地比较并总结这些方法,以便改进和进一步发展原核启动子识别技术。 展开更多
关键词 生物信息 机器学习 预测器 原核启动子
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肿瘤免疫微环境中免疫细胞间通讯景观探究 被引量:2
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作者 任丽萍 宁琳 +1 位作者 谢雷 张杨 《电子科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第2期177-183,共7页
肿瘤免疫微环境(TIME)内细胞间通讯为肿瘤发生发展提供了重要的微环境,但目前单细胞相关研究多关注免疫细胞与肿瘤之间的通讯,对不同免疫细胞间的信号交流研究较少。由此收集11套CD45+细胞的单细胞测序数据,推测出TIME中不同免疫细胞间... 肿瘤免疫微环境(TIME)内细胞间通讯为肿瘤发生发展提供了重要的微环境,但目前单细胞相关研究多关注免疫细胞与肿瘤之间的通讯,对不同免疫细胞间的信号交流研究较少。由此收集11套CD45+细胞的单细胞测序数据,推测出TIME中不同免疫细胞间的信号通讯网络。结果发现,肿瘤样本中免疫细胞间的交流更加频繁与密切,进一步分析得到12条与肿瘤相关的差异信号通讯关系,主要包括各种趋化因子−趋化因子受体信号、白介素−白介素受体信号以及Notch通路信号。这些通讯信号关系及其下游转录因子与肿瘤发生发展密切相关。此外,发现部分关键转录因子与各种肿瘤的预后显著相关。最后,通过构建TIME中不同免疫细胞间存在的细胞间通讯全局景观,挖掘出肿瘤中特异及缺失的免疫细胞间通讯关系,为理解TIME中免疫系统调控及肿瘤发展机制提供了线索,也为肿瘤的临床诊疗研究提供了新的设计思路。 展开更多
关键词 免疫细胞 细胞间通讯 单细胞测序 肿瘤免疫微环境
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细胞间通信预测方法研究进展
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作者 任丽萍 潘贤润 +3 位作者 刘天元 杨煜 宁琳 张杨 《电子科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第5期667-674,共8页
基于配体-受体(L-R)互作的细胞间通信是细胞相互协同完成复杂生命活动的重要方式。随着单细胞测序技术的快速发展,在单细胞水平上系统地解析细胞间通信网络及功能迅速成为细胞生物学研究的热点。生物信息学家已开发了大量细胞间信号通... 基于配体-受体(L-R)互作的细胞间通信是细胞相互协同完成复杂生命活动的重要方式。随着单细胞测序技术的快速发展,在单细胞水平上系统地解析细胞间通信网络及功能迅速成为细胞生物学研究的热点。生物信息学家已开发了大量细胞间信号通信预测的方法及平台,为细胞间信号通信研究提供了重要技术支撑。该文简要阐述了细胞间通信的基本生物学过程;并系统比较了目前较具代表性的细胞间通信预测相关数据库、算法以及评测分析研究;最后系统总结了细胞间通信预测方法的发展趋势,并展望了其未来的研究方向。 展开更多
关键词 数据库 细胞间通信 配体 受体 单细胞测序 空间转录组
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