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抗苗勒氏管激素(AMH)的生物学作用及其在马属动物中的应用
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作者 于雪 卢丽婷 +2 位作者 郝金娟 吕延飞 夏冬 《山东畜牧兽医》 2021年第10期62-65,共4页
抗苗勒氏管激素(AMH)在睾丸间质细胞、卵母细胞发育方面具有重要的生物学作用。在临床应用上,作为马属动物隐睾、卵母细胞和胚胎质量的可靠内分泌标记物,可用于评估成年马生殖寿命和卵巢卵泡储备的情况,以及在对马属动物纳入胚胎生产计... 抗苗勒氏管激素(AMH)在睾丸间质细胞、卵母细胞发育方面具有重要的生物学作用。在临床应用上,作为马属动物隐睾、卵母细胞和胚胎质量的可靠内分泌标记物,可用于评估成年马生殖寿命和卵巢卵泡储备的情况,以及在对马属动物纳入胚胎生产计划之前作为可靠的标记之一来选择优秀的供体,这些方面的应用将对马属动物的生产将产生较大的应用价值。 展开更多
关键词 抗苗勒氏管激素 隐睾 卵巢储备 颗粒细胞
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基于图编码与改进流注意力的编码sORFs预测方法DeepsORF
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作者 谢冬梅 边昕烨 +4 位作者 于连飞 刘文博 王子灵 曲志坚 于家峰 《计算机应用》 北大核心 2025年第2期546-555,共10页
小开放阅读框(sORFs)在多种生物学过程中发挥着关键作用,且准确识别编码sORFs和非编码sORFs是基因组学中一项重要且有挑战性的任务。针对目前大多数编码sORFs预测算法严重依赖基于先验生物知识的手工特征且缺乏通用性的问题以及原始sORF... 小开放阅读框(sORFs)在多种生物学过程中发挥着关键作用,且准确识别编码sORFs和非编码sORFs是基因组学中一项重要且有挑战性的任务。针对目前大多数编码sORFs预测算法严重依赖基于先验生物知识的手工特征且缺乏通用性的问题以及原始sORFs的序列长度长短不一而无法直接输入预测模型的问题,提出一种基于sORF-Graph图编码方式的端到端的深度学习框架DeepsORF预测编码sORFs。首先,通过sORF-Graph将所有sORFs序列编码成对应的图,并将序列信息编码成图元素特征,从而对输入序列进行标准化处理;其次,引入基于卷积与残差的流注意力机制捕获sORFs中碱基远距离之间的相互作用,以更有效地表达sORFs的特征,并提高模型的预测精度。实验结果证明,DeepsORF框架在6个独立测试集上的性能均得到提升,与csORF-finder方法相比,DeepsORF在D.melanogaster nonCDS-sORFs测试集上的准确率、马修斯相关系数(MCC)以及精确率分别提升了9.97、19.49与13.07个百分点,验证了DeepsORF模型在识别编码sORFs和非编码sORFs任务中的有效性以及良好泛化能力。 展开更多
关键词 小开放阅读框 编码sORFs 端到端 图编码 流注意力
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添加共试剂改善聚酰胺复合反渗透膜的性能 被引量:2
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作者 闫婷婷 张娜 +7 位作者 李强 李振华 李春辉 李雪 于茹 王瑞 王吉华 曹赞霞 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2021年第6期2008-2014,共7页
将N,N′-二甲基乙酰胺(DMAc)作为共试剂添加在间苯二胺水溶液中参与界面聚合反应,以改善聚酰胺复合反渗透膜(PA-RO-x,x代表添加DMAc的质量分数)的性能.X射线光电子能谱(XPS)和衰减全反射傅里叶红外光谱(ATR-FTIR)分析表明,随着DMAc含量... 将N,N′-二甲基乙酰胺(DMAc)作为共试剂添加在间苯二胺水溶液中参与界面聚合反应,以改善聚酰胺复合反渗透膜(PA-RO-x,x代表添加DMAc的质量分数)的性能.X射线光电子能谱(XPS)和衰减全反射傅里叶红外光谱(ATR-FTIR)分析表明,随着DMAc含量的增加,复合膜结构中交联聚酰胺含量相对于线性羧基部分有所增加;场发射扫描电子显微镜(FE-SEM)和原子力显微镜(AFM)表征结果显示,随着DMAc含量的增加,膜表面的粗糙程度逐渐增大;静态水接触角测试结果表明,添加DMAc后,膜的亲水性增强.结合上述测试结果发现,添加DMAc可以有效降低水油两相的不相溶性,提高水相中间苯二胺向正己烷中扩散的速率,这有助于加快间苯二胺与均苯三甲酰氯反应;同时,聚酰胺结构中交联酰胺含量的增加可以提供更多的氢键位点,有助于水分子快速渗透通过复合膜而不损失截盐率;膜表面的粗糙程度变大,有助于提高水通量.在2 g/L的氯化钠溶液和1.6 MPa测试压力条件下,PA-RO-5.2(DMAc添加质量分数为5.2%)的渗透通量和截盐率分别为66.1L/(m^(2)·h)和98.7%,与未添加DMAc的聚酰胺复合反渗透膜相比,通量增加115%,截盐率仅下降0.9%. 展开更多
关键词 聚酰胺复合反渗透膜 共试剂 N N′-二甲基乙酰胺 渗透通量 截盐率
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基于随机序列的固有无序蛋白预测算法比较分析 被引量:2
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作者 董晴晴 赵亚伟 +3 位作者 袁增 于家峰 王芳华 唐胡成 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期46-49,共4页
固有无序蛋白质(IDPs)是一种普遍存在且缺乏稳定空间结构的重要功能蛋白,为传统的蛋白质序列-结构-功能研究模式提出了挑战,成为当前蛋白质科学研究的热点领域。由于其特殊的柔性结构特征,IDPs的实验研究难度大,通过计算方法来预测IDPs... 固有无序蛋白质(IDPs)是一种普遍存在且缺乏稳定空间结构的重要功能蛋白,为传统的蛋白质序列-结构-功能研究模式提出了挑战,成为当前蛋白质科学研究的热点领域。由于其特殊的柔性结构特征,IDPs的实验研究难度大,通过计算方法来预测IDPs成为IDPs研究的重要手段。然而由于被实验证实的IDPs还很少,对IDPs预测算法的有效评价还缺少可靠的数据集,因而通过人工设计随机蛋白序列并提出分析数理模型,从无序区残基分布、组成等多角度对两种代表性IDPs预测算法的预测结果进行了深入对比研究。结果表明各随机序列中不同IDPs预测算法得到的预测结果具有不同程度的差别,预测得到的无序区与天然蛋白中无序区序列特征一致,因此对IDPs的研究应充分考虑不同预测算法差异特征,提高研究结果的可靠性。 展开更多
关键词 蛋白质 固有无序蛋白 序列分析
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成猪INHBA基因相关长非编码RNA的筛选 被引量:1
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作者 芦春雪 卢丽婷 +9 位作者 李希冉 殷淑洁 冯静 刘欢 马兆谦 周百灵 任景 沈丛丛 黄平平 于雪 《山东畜牧兽医》 2023年第2期7-10,13,共5页
抑制素以一种反馈抑制的方式在卵母细胞增殖、卵泡发育中,发挥重要作用,尽管之前的研究已经证实了抑制素对哺乳动物繁殖性能的相关作用,但关于其相互作用长非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)的数据有限。lncRNA过去一直被忽视,被... 抑制素以一种反馈抑制的方式在卵母细胞增殖、卵泡发育中,发挥重要作用,尽管之前的研究已经证实了抑制素对哺乳动物繁殖性能的相关作用,但关于其相互作用长非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)的数据有限。lncRNA过去一直被忽视,被认为是转录噪音,现在的研究逐渐表明,lncRNA在很多生理过程中充当着不可或缺的角色,尤其是在转录、转录后多个水平参与调控,但其对生殖生理的调控作用研究相对较少。本研究拟利用生物信息学方法,综合分析筛选INHBA相关lncRNAs,再经分子生物学方法在细胞水平进行功能验证,在挖掘、利用繁殖相关分子标志物等方面具有重要的科学意义。 展开更多
关键词 抑制素 lncRNA 生物信息学 RT-QPCR
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仔猪生长发育关键基因筛选和功能分析
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作者 宋阳 芦春雪 +8 位作者 殷淑洁 冯静 刘欢 苏辰 周百灵 沈丛丛 陈清帅 黄平平 于雪 《山东畜牧兽医》 2023年第1期1-4,7,共5页
为揭示对仔猪背最长肌和皮下脂肪组织生长发育过程起关键作用的基因,从GEO数据库下载背最长肌和皮下脂肪组织各18个转录组测序数据,采用Ensembl release 104版本的猪基因组和注释文件,进行生物信息学分析。结果显示,在所有样本中共获得7... 为揭示对仔猪背最长肌和皮下脂肪组织生长发育过程起关键作用的基因,从GEO数据库下载背最长肌和皮下脂肪组织各18个转录组测序数据,采用Ensembl release 104版本的猪基因组和注释文件,进行生物信息学分析。结果显示,在所有样本中共获得79 800个转录本,其中包括29 118个mRNA、2 105个已知长链非编码RNA (lncRNA)和47 142个新的转录本。两种组织中共获得34 873个差异表达的转录本,包括12 536个差异表达的mRNA。对差异表达的mRNA进行KEGG和GO功能富集分析显示,肌节组织(sarcomere organization)、肌动蛋白细胞骨架组织(actin cytoskeleton organization)等通路与背最长肌发育性能相关,关键基因包括MYPN、TNNT1和PDLIM3等;脂肪细胞因子信号通路(Adipocytokine signaling pathway)、鞘脂信号通路(Sphingolipid signaling pathway)、脂肪酸代谢(Fatty acid metabolism)等通路与脂肪组织发育相关,关键基因包括SCD5、PCK1和FASN等。本研究详细分析了可能影响断奶仔猪生长性能的基因及通路,为断奶仔猪生长发育相关分子生物学的研究提供理论支撑。 展开更多
关键词 仔猪 背最长肌 生长发育 转录组测序 生物信息学分析
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