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分枝杆菌三种检测方法的比较及结果不一致的原因分析
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作者 陈保羽 张东英 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第4期549-552,555,共5页
目的探讨抗酸染色、RT-PCR法及荧光PCR熔解曲线法对分枝杆菌的阳性检出率,评估三者的准确性及灵敏度。方法选择病理诊断为上皮样肉芽肿病变的石蜡组织样本93例,分别使用抗酸染色检测分枝杆菌、RT-PCR检测组织中结核分枝杆菌复合群(RT-PC... 目的探讨抗酸染色、RT-PCR法及荧光PCR熔解曲线法对分枝杆菌的阳性检出率,评估三者的准确性及灵敏度。方法选择病理诊断为上皮样肉芽肿病变的石蜡组织样本93例,分别使用抗酸染色检测分枝杆菌、RT-PCR检测组织中结核分枝杆菌复合群(RT-PCR法)及荧光PCR熔解曲线法检测分枝杆菌。比较三种方法的检测结果,并分析三种方法结果不一致的原因。结果93例样本中,共有13例(14.0%)样本抗酸染色呈阳性;20例(21.5%)样本组织结核分枝杆菌复合群(RT-PCR法)检测为阳性;共有57例(61.3%)样本通过荧光PCR熔解曲线法检测为阳性,其中10例为结核分枝杆菌复合群阳性。结论对于组织结核分枝杆菌检测RT-PCR法的灵敏度最高。而荧光PCR熔解曲线法可以检出更多的分枝杆菌感染病例。非结核分枝杆菌感染(分枝杆菌属阳性)是导致抗酸染色阳性而结核分枝杆菌复合群检测(RT-PCR法)阴性的原因。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 非结核分枝杆菌 抗酸染色 RT-PCR 荧光PCR熔解曲线法
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微滴式数字PCR在检测胃腺癌和结直肠腺癌NTRK基因融合中的应用
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作者 刘彬彬 濮晓红 +1 位作者 付尧 张东英 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第10期1052-1058,共7页
目的评估微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)应用于NTRK基因融合检测的可行性。方法回顾性分析830例原发性结直肠腺癌和560例胃腺癌样本,分别运用免疫组织化学(IHC)和荧光原位杂交(FISH)技术检测石蜡包埋肿瘤组织中pan-TRK蛋白... 目的评估微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)应用于NTRK基因融合检测的可行性。方法回顾性分析830例原发性结直肠腺癌和560例胃腺癌样本,分别运用免疫组织化学(IHC)和荧光原位杂交(FISH)技术检测石蜡包埋肿瘤组织中pan-TRK蛋白表达情况以及NTRK1/2/3基因断裂情况。FISH及IHC阳性样本进一步行二代测序(NGS)检测及ddPCR检测。结果所有石蜡包埋肿瘤样本均成功进行IHC和FISH检测。FISH或IHC阳性样本合计26例,其中FISH阳性21例,IHC阳性18例。26例阳性样本进一步行RNA Seq NGS、DNA Seq NGS及ddPCR检测。DNA Seq NGS合计检测到14例NTRK基因融合,2例扩增。RNA Seq NGS合计检测到3例NTRK基因融合,ddPCR检测结果与RNA Seq NGS完全一致。结论ddPCR可有效区分FISH和DNA Seq NGS检测为NTRK非典型融合的结直肠腺癌和胃腺癌病例,可以作为除FISH之外NTRK基因初筛方法的补充。 展开更多
关键词 胃肠道腺癌 NTRK基因融合 微滴式数字PCR 荧光原位杂交 免疫组织化学 二代测序
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