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基于RAD-seq简化基因组测序评价鹿苑鸡不同保种群保种现状
被引量：
8
1
作者
王洪志
李国辉
+7 位作者
张贤
张一平
张会永
殷建玫
苏一军
王克华
韩威
邹剑敏
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期818-825,共8页
本研究旨在评价基因库与保种场两个鹿苑鸡保种群的保种现状。利用RAD-seq简化基因组测序鉴定基因库与保种场两个鹿苑鸡群体的SNP标记,通过计算遗传统计量,比较分析两个群体的遗传差异。结果,经过两步数据质控,在基因库与保种场两个鹿苑...
本研究旨在评价基因库与保种场两个鹿苑鸡保种群的保种现状。利用RAD-seq简化基因组测序鉴定基因库与保种场两个鹿苑鸡群体的SNP标记,通过计算遗传统计量,比较分析两个群体的遗传差异。结果,经过两步数据质控,在基因库与保种场两个鹿苑鸡群体中分别鉴定出SNPs标记395 021个和428 314个,两个群体的平均杂合度Ho分别为0.211 1和0.206 8,群体间的遗传分化系数Fst为0.005 6;在Structure模型聚类分析中两个群体始终聚为一类,没有个体分离出来,表明两个鹿苑鸡群体未发生显著遗传分化(P>0.05)。两个群体的近交系数Fis分别为0.178 8和0.193 5,相对较高的近交水平可能是由于起始基础群规模较小(抢救性保护)所导致的。进一步的选择信号分析发现,两个鹿苑鸡群体在1、2、5、Z等染色体区域(位点)上存在一定分化,通过F_(st)和θ_π检验鉴定出58个受选择区域,筛选到96个受选择候选基因。GO和KEGG分析表明,这些差异基因主要富集在能量代谢、信号传递、应激免疫反应等调控通路。利用全基因组SNP标记信息可以更全面地评价保种现状,研究结果为进一步优化鹿苑鸡保种技术方案提供了依据。
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关键词
鹿苑鸡
简化基因组测序
遗传多样性
保种现状
在线阅读
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职称材料
影响肉鸡色素沉积的因素
被引量：
5
2
作者
张茂华
蒋建明
陆金元
《中国家禽》
北大核心
2006年第7期56-57,共2页
关键词
色素沉积
天然类胡萝卜素
肉鸡
日粮因素
饲料原料
玉米黄质
沉积效率
吸收过程
着色剂
叶黄素
在线阅读
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职称材料
鸭黄曲霉素中毒一例
被引量：
1
3
作者
王联芳
张一平
+1 位作者
蒋建明
尹震东
《中国家禽》
北大核心
2006年第24期34-34,共1页
张家港市某养鸭户饲养了1520只康贝尔鸭。饲养到65日龄，为了节约成本饲喂了霉变瘪谷，10天后鸭群出现食欲不振、消瘦、脱毛、下痢、贫血、弓背，有的出现跛行。
关键词
康贝尔鸭
黄曲霉素中毒
张家港市
节约成本
食欲不振
饲养
养鸭
日龄
在线阅读
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职称材料
题名
基于RAD-seq简化基因组测序评价鹿苑鸡不同保种群保种现状
被引量：
8
1
作者
王洪志
李国辉
张贤
张一平
张会永
殷建玫
苏一军
王克华
韩威
邹剑敏
机构
江苏省家禽科学研究所国家级地方鸡种基因库
张家港市畜禽有限公司
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期818-825,共8页
基金
扬州市自然科学基金项目(YZ2016134)
扬州市高效农业项目(YZ2016051)
文摘
本研究旨在评价基因库与保种场两个鹿苑鸡保种群的保种现状。利用RAD-seq简化基因组测序鉴定基因库与保种场两个鹿苑鸡群体的SNP标记,通过计算遗传统计量,比较分析两个群体的遗传差异。结果,经过两步数据质控,在基因库与保种场两个鹿苑鸡群体中分别鉴定出SNPs标记395 021个和428 314个,两个群体的平均杂合度Ho分别为0.211 1和0.206 8,群体间的遗传分化系数Fst为0.005 6;在Structure模型聚类分析中两个群体始终聚为一类,没有个体分离出来,表明两个鹿苑鸡群体未发生显著遗传分化(P>0.05)。两个群体的近交系数Fis分别为0.178 8和0.193 5,相对较高的近交水平可能是由于起始基础群规模较小(抢救性保护)所导致的。进一步的选择信号分析发现,两个鹿苑鸡群体在1、2、5、Z等染色体区域(位点)上存在一定分化,通过F_(st)和θ_π检验鉴定出58个受选择区域,筛选到96个受选择候选基因。GO和KEGG分析表明,这些差异基因主要富集在能量代谢、信号传递、应激免疫反应等调控通路。利用全基因组SNP标记信息可以更全面地评价保种现状,研究结果为进一步优化鹿苑鸡保种技术方案提供了依据。
关键词
鹿苑鸡
简化基因组测序
遗传多样性
保种现状
Keywords
Luyuan chicken
simplified genome sequencing
genetic diversity
conservation status
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
在线阅读
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职称材料
题名
影响肉鸡色素沉积的因素
被引量：
5
2
作者
张茂华
蒋建明
陆金元
机构
江苏省无锡市中盛饲料
有限公司
张家港市畜禽有限公司
出处
《中国家禽》
北大核心
2006年第7期56-57,共2页
关键词
色素沉积
天然类胡萝卜素
肉鸡
日粮因素
饲料原料
玉米黄质
沉积效率
吸收过程
着色剂
叶黄素
分类号
S831 [农业科学—畜牧学]
TQ466.1 [化学工程—制药化工]
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职称材料
题名
鸭黄曲霉素中毒一例
被引量：
1
3
作者
王联芳
张一平
蒋建明
尹震东
机构
张家港市
锦丰镇兽医卫生监督所
张家港市畜禽有限公司
出处
《中国家禽》
北大核心
2006年第24期34-34,共1页
文摘
张家港市某养鸭户饲养了1520只康贝尔鸭。饲养到65日龄，为了节约成本饲喂了霉变瘪谷，10天后鸭群出现食欲不振、消瘦、脱毛、下痢、贫血、弓背，有的出现跛行。
关键词
康贝尔鸭
黄曲霉素中毒
张家港市
节约成本
食欲不振
饲养
养鸭
日龄
分类号
S834.89 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于RAD-seq简化基因组测序评价鹿苑鸡不同保种群保种现状
王洪志
李国辉
张贤
张一平
张会永
殷建玫
苏一军
王克华
韩威
邹剑敏
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
影响肉鸡色素沉积的因素
张茂华
蒋建明
陆金元
《中国家禽》
北大核心
2006
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
鸭黄曲霉素中毒一例
王联芳
张一平
蒋建明
尹震东
《中国家禽》
北大核心
2006
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
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