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全基因组预测枯草芽孢杆菌BEST195的分泌蛋白
被引量:
8
1
作者
任文来
韩长志
+1 位作者
刘通
夏秀芹
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2016年第6期106-111,共6页
枯草芽孢杆菌BEST195作为纳豆菌的一种,是纳豆生产的重要菌株之一。利用Signal P、Prot Comp、TMHMM、Phobius、Lipo P、Tat P等预测程序对该菌中4 456条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻,同时,对上述分泌蛋白的氨基酸分布、信号肽长度大小...
枯草芽孢杆菌BEST195作为纳豆菌的一种,是纳豆生产的重要菌株之一。利用Signal P、Prot Comp、TMHMM、Phobius、Lipo P、Tat P等预测程序对该菌中4 456条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻,同时,对上述分泌蛋白的氨基酸分布、信号肽长度大小、信号肽切割位点等性质进行分析。结果表明:枯草芽孢杆菌含有分泌蛋白102个,其氨基酸长度、信号肽长度与植物病原菌不同;信号肽切割位点属于A-X-A类型,与其他已经报道的植物病原真菌、细菌以及卵菌中分泌蛋白信号肽切割位点一致。通过上述生物信息学分析方法有效地实现了枯草芽孢杆菌BEST195分泌蛋白的预测,分泌蛋白的信号肽切割位点具有物种保守型特点。
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关键词
枯草芽孢杆菌
分泌蛋白
信号肽
预测
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职称材料
禾谷炭疽菌GPCR蛋白生物信息学分析
被引量:
8
2
作者
韩长志
任文来
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2016年第4期82-87,共6页
基于酿酒酵母中已经报道的3个典型GPCR序列,利用Blastp以及关键词对炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,通过SMART保守结构域及遗传关系分析。结果表明:发现该菌存在4个典型的GPCR;4个GPCR在蛋白质二级结构上均含有典型的7跨膜结构域以...
基于酿酒酵母中已经报道的3个典型GPCR序列,利用Blastp以及关键词对炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,通过SMART保守结构域及遗传关系分析。结果表明:发现该菌存在4个典型的GPCR;4个GPCR在蛋白质二级结构上均含有典型的7跨膜结构域以及较高比例的α螺旋结构,均不含有明显的信号肽序列;在定位方面,4个GPCR均定位在质膜上;该菌中的GPCR与C.higginsianum、C.fioriniae等炭疽菌属中的病菌具有较高的同源序列以及较近的亲缘关系。
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关键词
禾谷炭疽菌
G蛋白偶联受体
信号肽
二级结构
生物信息学
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职称材料
扶桑绵粉蚧对河北省棉花的入侵风险及预防建议
被引量:
1
3
作者
葛朝红
刘彦霞
+2 位作者
周永萍
邓素花
师树新
《天津农林科技》
2018年第4期32-33,共2页
本文对扶桑绵粉蚧的形态特征、发生规律和为害症状结合河北省的地理位置、气候条件和外在因素进行分析,认为扶桑绵粉蚧对河北省存在较大的潜在入侵风险,并从虫态的普及、源头控制、调运等方面提出预防建议。
关键词
扶桑绵粉蚧
形态特征
危害条件
预防建议
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职称材料
芦笋无公害栽培技术
4
作者
贾莉
任文来
《现代农村科技》
2009年第9期16-16,共1页
芦笋又称石刁柏,属多年生草本植物,一次栽培可连续采收8~10年。芦笋以丰富的营养价值和药用价值被赋予“蔬菜之王”的美称。近年来,河北省芦笋产业迅速崛起,随着栽培面积的不断扩大,生产上也出现了栽培技术不规范、产品质量低等...
芦笋又称石刁柏,属多年生草本植物,一次栽培可连续采收8~10年。芦笋以丰富的营养价值和药用价值被赋予“蔬菜之王”的美称。近年来,河北省芦笋产业迅速崛起,随着栽培面积的不断扩大,生产上也出现了栽培技术不规范、产品质量低等问题。因此,建立规范的栽培技术体系尤为重要。现将芦笋无公害栽培技术介绍如下:
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关键词
无公害栽培技术
芦笋
多年生草本植物
栽培技术体系
药用价值
营养价值
栽培面积
产品质量
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职称材料
题名
全基因组预测枯草芽孢杆菌BEST195的分泌蛋白
被引量:
8
1
作者
任文来
韩长志
刘通
夏秀芹
机构
廊坊市文安县农业局
西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室
出处
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2016年第6期106-111,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31560211)资助
云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目(ZK150004)资助
+2 种基金
云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设项目(50097505)资助
云南省高校林下生物资源保护及利用科技创新团队(2014015)资助
云南省教育厅科学研究基金项目(2014Y330)资助
文摘
枯草芽孢杆菌BEST195作为纳豆菌的一种,是纳豆生产的重要菌株之一。利用Signal P、Prot Comp、TMHMM、Phobius、Lipo P、Tat P等预测程序对该菌中4 456条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻,同时,对上述分泌蛋白的氨基酸分布、信号肽长度大小、信号肽切割位点等性质进行分析。结果表明:枯草芽孢杆菌含有分泌蛋白102个,其氨基酸长度、信号肽长度与植物病原菌不同;信号肽切割位点属于A-X-A类型,与其他已经报道的植物病原真菌、细菌以及卵菌中分泌蛋白信号肽切割位点一致。通过上述生物信息学分析方法有效地实现了枯草芽孢杆菌BEST195分泌蛋白的预测,分泌蛋白的信号肽切割位点具有物种保守型特点。
关键词
枯草芽孢杆菌
分泌蛋白
信号肽
预测
Keywords
Bacillus subtilis subsp. natto
secreted protein
signal peptide
prediction
分类号
S759.81 [农业科学—森林经理学]
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职称材料
题名
禾谷炭疽菌GPCR蛋白生物信息学分析
被引量:
8
2
作者
韩长志
任文来
机构
西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室
廊坊市文安县农业局
出处
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2016年第4期82-87,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31560211)资助
云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目(ZK150004)资助
+2 种基金
云南省教育厅科学研究基金项目(2014Y330)资助
云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设项目(50097505)资助
云南省高校林下生物资源保护及利用科技创新团队(2014015)资助
文摘
基于酿酒酵母中已经报道的3个典型GPCR序列,利用Blastp以及关键词对炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,通过SMART保守结构域及遗传关系分析。结果表明:发现该菌存在4个典型的GPCR;4个GPCR在蛋白质二级结构上均含有典型的7跨膜结构域以及较高比例的α螺旋结构,均不含有明显的信号肽序列;在定位方面,4个GPCR均定位在质膜上;该菌中的GPCR与C.higginsianum、C.fioriniae等炭疽菌属中的病菌具有较高的同源序列以及较近的亲缘关系。
关键词
禾谷炭疽菌
G蛋白偶联受体
信号肽
二级结构
生物信息学
Keywords
Colletotrichum graminicola
GPCR
signal peptide
secondary structure
Colletotrichum spp.
分类号
S763.1 [农业科学—森林保护学]
S435.1 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
扶桑绵粉蚧对河北省棉花的入侵风险及预防建议
被引量:
1
3
作者
葛朝红
刘彦霞
周永萍
邓素花
师树新
机构
河北省农林科学院棉花研究所
廊坊市文安县农业局
出处
《天津农林科技》
2018年第4期32-33,共2页
基金
河北省科技支撑计划项目(17226302D)
文摘
本文对扶桑绵粉蚧的形态特征、发生规律和为害症状结合河北省的地理位置、气候条件和外在因素进行分析,认为扶桑绵粉蚧对河北省存在较大的潜在入侵风险,并从虫态的普及、源头控制、调运等方面提出预防建议。
关键词
扶桑绵粉蚧
形态特征
危害条件
预防建议
分类号
S435.62 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
在线阅读
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职称材料
题名
芦笋无公害栽培技术
4
作者
贾莉
任文来
机构
河北省
廊坊市文安县农业局
出处
《现代农村科技》
2009年第9期16-16,共1页
文摘
芦笋又称石刁柏,属多年生草本植物,一次栽培可连续采收8~10年。芦笋以丰富的营养价值和药用价值被赋予“蔬菜之王”的美称。近年来,河北省芦笋产业迅速崛起,随着栽培面积的不断扩大,生产上也出现了栽培技术不规范、产品质量低等问题。因此,建立规范的栽培技术体系尤为重要。现将芦笋无公害栽培技术介绍如下:
关键词
无公害栽培技术
芦笋
多年生草本植物
栽培技术体系
药用价值
营养价值
栽培面积
产品质量
分类号
S644.6 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
全基因组预测枯草芽孢杆菌BEST195的分泌蛋白
任文来
韩长志
刘通
夏秀芹
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2016
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
禾谷炭疽菌GPCR蛋白生物信息学分析
韩长志
任文来
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2016
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
扶桑绵粉蚧对河北省棉花的入侵风险及预防建议
葛朝红
刘彦霞
周永萍
邓素花
师树新
《天津农林科技》
2018
1
在线阅读
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职称材料
4
芦笋无公害栽培技术
贾莉
任文来
《现代农村科技》
2009
0
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