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巴马香猪产活仔数性状全基因组关联分析
被引量:
5
1
作者
莫家远
高九昱
+9 位作者
奉玲丽
李月月
田威龙
刘笑笑
程锋
梁靓
雷树桥
文蔚
梁晶
兰干球
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2020年第12期3965-3975,共11页
为寻找与巴马香猪产活仔数相关的分子标记,试验利用全基因组关联分析(GWAS)定位并筛选了影响产活仔数性状的候选基因,采集297头具有多胎产仔记录的巴马香猪耳组织样品,提取DNA并利用猪50K SNP芯片进行基因分型,分型结果经质控与基因型...
为寻找与巴马香猪产活仔数相关的分子标记,试验利用全基因组关联分析(GWAS)定位并筛选了影响产活仔数性状的候选基因,采集297头具有多胎产仔记录的巴马香猪耳组织样品,提取DNA并利用猪50K SNP芯片进行基因分型,分型结果经质控与基因型填充后,使用Tassel软件对巴马香猪产活仔数性状进行全基因组关联分析。结果显示,巴马香猪平均窝产活仔数在1~9胎内随着胎次增加逐渐升高;经质控过滤后共获得32816个SNPs位点,利用全基因组关联分析共筛选到8个与巴马香猪产活仔数相关的SNPs位点,分别在基因组或染色体水平达到显著;对关联显著SNP位点上下游500 kb内的编码基因进行富集分析,并依据猪繁殖性状相关QTL区域及基因功能,最终筛选到4个基因(CAPZB、MSH3、CITED2和HSD17B7)作为影响巴马香猪产活仔数的候选基因。
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关键词
巴马香猪
产活仔数
全基因组关联分析(GWAS)
候选基因
芯片
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职称材料
金百麦环境净化剂Genbiom对猪流行性腹泻病毒的杀灭效果研究
2
作者
白云华
王立贤
+8 位作者
陈华林
麻柱
杨超
路永强
王楚端
黄全奎
邢凯
王朝军
薛振华
《广西畜牧兽医》
2022年第4期159-162,共4页
猪流行性腹泻病毒是引起猪腹泻的主要病原之一,可导致猪呕吐、水样腹泻和严重脱水等症状,给世界养猪业造成了巨大的经济损失。Genbiom主要成分是二氧化钛,在催化过程中具有较强的抑菌杀毒作用。本研究以PEDV作为指示病毒,通过检测Genbio...
猪流行性腹泻病毒是引起猪腹泻的主要病原之一,可导致猪呕吐、水样腹泻和严重脱水等症状,给世界养猪业造成了巨大的经济损失。Genbiom主要成分是二氧化钛,在催化过程中具有较强的抑菌杀毒作用。本研究以PEDV作为指示病毒,通过检测Genbiom对PEDV的杀灭效果,来验证Genbiom对PEDV的最低使用量和最短作用时间。结果表明:Genbiom对PEDV具有良好的杀灭作用,使用25mg最低量,与病毒作用10min即可完全杀灭病毒,本试验为PEDV感染的预防和控制措施提供重要的依据。
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关键词
金百麦
环境净化剂
猪流行性腹泻病毒
杀灭效果
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职称材料
转录组测序技术在猪上的研究进展
被引量:
1
3
作者
黄全奎
周松峰
+1 位作者
邢凯
白云华
《猪业科学》
2020年第4期104-107,共4页
转录组(Transcriptome)是指特定细胞或组织中的全部转录产物,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA以及非编码RNA。转录组测序技术的快速发展,为转录组的研究提供了可靠的平台。转录组测序技术能够全面分析某一组织或细胞在不同物种、品种...
转录组(Transcriptome)是指特定细胞或组织中的全部转录产物,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA以及非编码RNA。转录组测序技术的快速发展,为转录组的研究提供了可靠的平台。转录组测序技术能够全面分析某一组织或细胞在不同物种、品种、发育阶段以及不同的处理条件下,全部转录产物的类别、结构以及表达水平的变化,揭示特定生物学过程的分子调控机制。近年来,研究人员广泛利用该技术筛选猪优良经济性状的基因,为功能基因的鉴定研究提供重要信息。文章综述了在不同试验设计下,基于转录组测序技术比较不同表型、不同处理条件、不同时期及不同组织间的转录组,筛选差异表达基因的研究,以期为今后猪育种的研究提供有用的信息。
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关键词
猪
转录组
高通量测序
试验设计
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职称材料
题名
巴马香猪产活仔数性状全基因组关联分析
被引量:
5
1
作者
莫家远
高九昱
奉玲丽
李月月
田威龙
刘笑笑
程锋
梁靓
雷树桥
文蔚
梁晶
兰干球
机构
广西
大学动物科学技术学院
广西里建桂宁种猪有限公司
巴马原种香猪农牧实业
有限公司
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2020年第12期3965-3975,共11页
基金
国家现代农业产业技术体系(nycytxgxcxtd-15-01)
广西创新驱动发展专项(桂科AA17204029)
广西科技重大专项(桂科AA17292002)。
文摘
为寻找与巴马香猪产活仔数相关的分子标记,试验利用全基因组关联分析(GWAS)定位并筛选了影响产活仔数性状的候选基因,采集297头具有多胎产仔记录的巴马香猪耳组织样品,提取DNA并利用猪50K SNP芯片进行基因分型,分型结果经质控与基因型填充后,使用Tassel软件对巴马香猪产活仔数性状进行全基因组关联分析。结果显示,巴马香猪平均窝产活仔数在1~9胎内随着胎次增加逐渐升高;经质控过滤后共获得32816个SNPs位点,利用全基因组关联分析共筛选到8个与巴马香猪产活仔数相关的SNPs位点,分别在基因组或染色体水平达到显著;对关联显著SNP位点上下游500 kb内的编码基因进行富集分析,并依据猪繁殖性状相关QTL区域及基因功能,最终筛选到4个基因(CAPZB、MSH3、CITED2和HSD17B7)作为影响巴马香猪产活仔数的候选基因。
关键词
巴马香猪
产活仔数
全基因组关联分析(GWAS)
候选基因
芯片
Keywords
Bama Xiang pigs
alive litter size
genome-wide association study(GWAS)
candidate gene
chip
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
金百麦环境净化剂Genbiom对猪流行性腹泻病毒的杀灭效果研究
2
作者
白云华
王立贤
陈华林
麻柱
杨超
路永强
王楚端
黄全奎
邢凯
王朝军
薛振华
机构
北京奶牛中心
中国农业科学院畜牧研究所
北京畜牧总站
中国农业大学
广西里建桂宁种猪有限公司
北京农学院
北京中育
种猪
有限
责任
公司
出处
《广西畜牧兽医》
2022年第4期159-162,共4页
文摘
猪流行性腹泻病毒是引起猪腹泻的主要病原之一,可导致猪呕吐、水样腹泻和严重脱水等症状,给世界养猪业造成了巨大的经济损失。Genbiom主要成分是二氧化钛,在催化过程中具有较强的抑菌杀毒作用。本研究以PEDV作为指示病毒,通过检测Genbiom对PEDV的杀灭效果,来验证Genbiom对PEDV的最低使用量和最短作用时间。结果表明:Genbiom对PEDV具有良好的杀灭作用,使用25mg最低量,与病毒作用10min即可完全杀灭病毒,本试验为PEDV感染的预防和控制措施提供重要的依据。
关键词
金百麦
环境净化剂
猪流行性腹泻病毒
杀灭效果
分类号
S858.28 [农业科学—临床兽医学]
在线阅读
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职称材料
题名
转录组测序技术在猪上的研究进展
被引量:
1
3
作者
黄全奎
周松峰
邢凯
白云华
机构
广西里建桂宁种猪有限公司
北京农学院动物科学技术学院
北京百净保科技发展
有限公司
出处
《猪业科学》
2020年第4期104-107,共4页
基金
广西创新驱动发展专项“畜禽微生态制剂和饲料的研发与应用”(桂科AA18118051)。
文摘
转录组(Transcriptome)是指特定细胞或组织中的全部转录产物,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA以及非编码RNA。转录组测序技术的快速发展,为转录组的研究提供了可靠的平台。转录组测序技术能够全面分析某一组织或细胞在不同物种、品种、发育阶段以及不同的处理条件下,全部转录产物的类别、结构以及表达水平的变化,揭示特定生物学过程的分子调控机制。近年来,研究人员广泛利用该技术筛选猪优良经济性状的基因,为功能基因的鉴定研究提供重要信息。文章综述了在不同试验设计下,基于转录组测序技术比较不同表型、不同处理条件、不同时期及不同组织间的转录组,筛选差异表达基因的研究,以期为今后猪育种的研究提供有用的信息。
关键词
猪
转录组
高通量测序
试验设计
Keywords
Pig
Transcriptome
High-throughout sequencing
Experiment design
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
巴马香猪产活仔数性状全基因组关联分析
莫家远
高九昱
奉玲丽
李月月
田威龙
刘笑笑
程锋
梁靓
雷树桥
文蔚
梁晶
兰干球
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2020
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
金百麦环境净化剂Genbiom对猪流行性腹泻病毒的杀灭效果研究
白云华
王立贤
陈华林
麻柱
杨超
路永强
王楚端
黄全奎
邢凯
王朝军
薛振华
《广西畜牧兽医》
2022
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
转录组测序技术在猪上的研究进展
黄全奎
周松峰
邢凯
白云华
《猪业科学》
2020
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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