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基于线粒体D-loop区和Cyt b基因分析广西禾花鲤三个群体遗传结构 被引量：12
1
作者 程磊 何苹萍 +3 位作者 韦嫔媛 鲁翠云 吴铁军 彭金霞 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期54-59,共6页
研究基于线粒体D-loop区和Cyt b基因部分序列,分析了广西全州、融水、环江三地禾花鲤(Cyprinus carpio)的遗传结构。在3个群体中共鉴定到19种D-loop与Cyt b序列的组合单倍型,总的单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.916±0.... 研究基于线粒体D-loop区和Cyt b基因部分序列,分析了广西全州、融水、环江三地禾花鲤(Cyprinus carpio)的遗传结构。在3个群体中共鉴定到19种D-loop与Cyt b序列的组合单倍型,总的单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.916±0.010和0.008±0.004,禾花鲤线粒体DNA具有单倍型多样性高和核苷酸多样性低的特点。环江群体单倍型多样性最低,但是核苷酸多样性却最高,反映了环江群体存在最明显的谱系混杂。分子方差分析(AMOVA)显示遗传变异主要来源于群体内部(71.54%),禾花鲤三个群体间有显著的遗传分化(Fst=0.285;P<0.01)。系统发育分析表明,多数样本的线粒体单倍型属于华南鲤(C.carpio rubrefusus)类型,同时三地禾花鲤中均检测到一定频率的西鲤(C.carpio carpio)或远东鲤(C.carpio haematopterus)类型的线粒体单倍型,提示禾花鲤可能受到鲤养殖品种的杂交渐渗。研究初步揭示了广西禾花鲤的种质资源现状,为禾花鲤这一地方特色“稻鱼共作”品种的选育和苗种管理提供了必要的依据。 展开更多
关键词 禾花鲤 遗传结构 线粒体DNA 渐渗
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广西不同地区克氏原螯虾群体遗传多样性微卫星分析 被引量：14
2
作者 黄小芳 唐章生 +6 位作者 刘俊丹 张宏燕 钟一治 卢智发 侯树鉴 王大鹏 陆专灵 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期437-444,共8页
【目的】了解当前广西克氏原螯虾(Procambarus clarkii)群体的遗传背景,为其人工养殖及种质资源保护提供参考依据。【方法】选取广西5个地区(南宁、大塘、融水、柳州和来宾)的克氏原螯虾群体作为研究对象,利用8对微卫星引物对各克氏原... 【目的】了解当前广西克氏原螯虾(Procambarus clarkii)群体的遗传背景,为其人工养殖及种质资源保护提供参考依据。【方法】选取广西5个地区(南宁、大塘、融水、柳州和来宾)的克氏原螯虾群体作为研究对象,利用8对微卫星引物对各克氏原螯虾群体基因组DNA进行PCR检测,然后通过PopGene32和NTSYSpc 2.1等在线软件分析广西克氏原螯虾群体的遗传多样性。【结果】南宁(NN)、大塘(DT)、融水(RS)、柳州(LZ)和来宾(LB)5个克氏原螯虾群体的平均有效等位基因数(Ne)为2.5142~3.0574,平均期望杂合度(He)为0.5708~0.6489,平均多态信息含量(PIC)为0.4899~0.5843,存在中度至高度的遗传多样性,其中南宁群体和大塘群体的遗传多样性略低于融水群体、柳州群体和来宾群体。5个克氏原螯虾群体的平衡偏离指数(D)均为负值,且发生一定程度的Hardy-Weinberg平衡偏离,杂合子缺失现象普遍存在。5个克氏原螯虾群体间的基因流(Nm)为2.3898~6.0284,遗传分化指数(Fst)为0.0398~0.0947,表明各群体间存在广泛的基因交流,仅存在低度至中度的遗传分化;各克氏原螯虾群体间的遗传相似系数和遗传距离分别为0.6861~0.8583和0.1528~0.3768,其中,遗传距离趋势与Fst趋势一致,而遗传相似系数与Nm趋势一致,均表明柳州群体与来宾群体具有高度的相似性,遗传距离较近。UPGMA聚类分析结果也显示,南宁群体和大塘群体聚类为一支,而柳州群体先与来宾群体聚类再与融水群体聚类成另一支。【结论】广西不同地区克氏原螯虾群体具有一定的遗传多样性,但其杂合子缺失现象普遍存在,应通过适当引种及加强不同地区群体间的遗传交流,保护好克氏原螯虾的优良种质资源。 展开更多
关键词 克氏原螯虾 遗传多样性 微卫星位点 杂合子缺失 广西
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广西北部湾珍稀动物现状调查与研究 被引量：3
3
作者 何安尤 王大鹏 +3 位作者 程胜龙 施军 韩耀全 陈晓汉 《安徽农业科学》 CAS 2013年第34期13258-13261,共4页
通过资料搜集和对广西北部湾沿岸进行渔访的方式,统计了广西北部湾海域的珍稀动物及主要分布区域,并从分布区、资源量变化、环境压力等方面对中华白海豚等珍稀动物的保护现状进行了分析。指出海洋环境污染、栖息地丧失和人类捕捞对珍稀... 通过资料搜集和对广西北部湾沿岸进行渔访的方式,统计了广西北部湾海域的珍稀动物及主要分布区域,并从分布区、资源量变化、环境压力等方面对中华白海豚等珍稀动物的保护现状进行了分析。指出海洋环境污染、栖息地丧失和人类捕捞对珍稀动物危害最大,须进行针对性的保护。 展开更多
关键词 珍稀动物 北部湾 广西
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基于线粒体Cytb基因序列的西江流域广西境内卷口鱼遗传多样性分析 被引量：11
4
作者 彭敏 韩耀全 +5 位作者 王大鹏 施军 吴伟军 李育森 雷建军 何安尤 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期10-18,共9页
为了解西江流域广西境内卷口鱼(Ptychidio jordani)种群遗传结构及分化程度,采用线粒体Cytb基因序列对西江流域广西境内6个江段的139尾野生卷口鱼的遗传多样性进行了分析。结果显示,线粒体Cytb基因长度为1053 bp,碱基T、C、A、G的平均... 为了解西江流域广西境内卷口鱼(Ptychidio jordani)种群遗传结构及分化程度,采用线粒体Cytb基因序列对西江流域广西境内6个江段的139尾野生卷口鱼的遗传多样性进行了分析。结果显示,线粒体Cytb基因长度为1053 bp,碱基T、C、A、G的平均含量分别为29.1%、27.7%、29.3%、13.9%,其中A+T(58.4%)高于C+G(41.6%)。共定义20个单倍型,并聚为2个分支,未观察到明显的地理聚群。6个卷口鱼群体的平均单倍型多样性和平均核苷酸多样性分别为0.7682、0.0023,其中红水河群体(单倍型多样性h=0.7487,核苷酸多样性π=0.0033)遗传多样性最高,柳江群体(h=0.2744,π=0.0004)和左江群体(h=0.3747,π=0.0003)的遗传多样性相对较低。卷口鱼总体的遗传分化指数(FST)为0.4614(P<0.01),表现出较大的遗传分化。两两群体间遗传分化结果显示,左江和柳江种群之间的遗传分化程度最大,而柳江和西江之间最小。AMOVA分析表明西江流域的卷口鱼群体遗传变异一半来自群体内(53.86%),一半来自群体间(46.14%)。中性检验(Tajima's D=−1.0828,P>0.05;Fu's Fs=−6.5725,0.01<P<0.05)与碱基错配分布分析表明西江流域卷口鱼种群大约在0.07~0.187 Ma经历了种群扩张。综上,西江流域广西境内的卷口鱼柳江群体和左江群体遗传多样性较低,总群体分化程度较大,但仍属于一个种群,其中空间距离与地理阻隔对卷口鱼的遗传分化具有一定的促进作用。 展开更多
关键词 卷口鱼 遗传分化 遗传多样性 CYTB基因 西江流域
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广西岩滩水库不同养殖类型区域沉积物磷分布特征分析 被引量：2
5
作者 雷建军 王大鹏 +2 位作者 肖俊军 何安尤 李育森 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期2288-2294,共7页
【目的】评价广西岩滩水库不同养殖类型区域在不同季节的沉积物磷分布特征和释放潜力,为科学发展库区养殖业提供参考依据。【方法】在广西岩滩库区选择非养殖区(T0)、投饵网箱养殖区(T1)、生态网箱养殖区(T2)和围栏养殖区(T3)各3个站位,... 【目的】评价广西岩滩水库不同养殖类型区域在不同季节的沉积物磷分布特征和释放潜力,为科学发展库区养殖业提供参考依据。【方法】在广西岩滩库区选择非养殖区(T0)、投饵网箱养殖区(T1)、生态网箱养殖区(T2)和围栏养殖区(T3)各3个站位,于2016年3月(春季)、6月(夏季)、9月(秋季)和12月(冬季)分别采集12个站位的表层沉积物,以淡水沉积物磷形态的标准测试法(SMT)测定各种形态磷含量。【结果】不同养殖类型区域表层沉积物磷含量差别明显,整体上表现为T1/T2>T3>T0,T1和T2的沉积物磷含量差异仅表现在投饵季节(夏季和秋季)。不同养殖类型区域沉积物中的铁铝磷(Fe/Al-P)和钙磷(Ca-P)比例差异明显,且二者通常呈反比关系;无机磷(IP)的比例虽然最高,但各养殖区域间差异不显著(P>0.05)。T0只有Fe/Al-P比例存在明显的季节差异,T1各形态磷比例均具有明显的季节差异,T2的Ca-P比例无季节差异,但冬季的Fe/Al-P比例显著高于其他季节(P<0.05),而T3只有Ca-P比例表现出季节差异,其他形态磷均不存在季节差异。各形态磷与总磷(TP)的相关性分析结果表明,IP与TP的相关性最高,相关系数(R2)达0.9632;而有机磷(OP)与TP的相关性最低,对应的相关系数为0.5785。【结论】各种养殖类型均可提高库区沉积物中的磷含量和释放潜力,尤其生态网箱养殖在冬季对磷的释放潜力提升作用最明显。在库区开展水产养殖时即使采用生态养殖模式,也要注意在不同区域实施轮养,避免局部水域因营养盐累积而造成底质恶化。 展开更多
关键词 养殖类型 沉积物 磷 分布特征 广西岩滩水库
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广西地区罗非鱼寄生车轮虫形态分类的研究 被引量：3
6
作者 余艳玲 林勇 +2 位作者 张永德 高桂多 曾兰 《水产学杂志》 CAS 2013年第6期48-53,共6页
采用银染色方法对广西地区奥尼罗非鱼鱼苗体表寄生的车轮虫进行抽样检测,运用国际通用的方法"统一定位法"和"齿体定位描述法"对检测的车轮虫进行形态学描述,发现寄生于广西奥尼罗非鱼幼鱼体表的车轮虫有两种:异齿... 采用银染色方法对广西地区奥尼罗非鱼鱼苗体表寄生的车轮虫进行抽样检测,运用国际通用的方法"统一定位法"和"齿体定位描述法"对检测的车轮虫进行形态学描述,发现寄生于广西奥尼罗非鱼幼鱼体表的车轮虫有两种:异齿车轮虫(Trichodina heterodentata Duncan 1977)与紧密车轮虫(Trichodina compacta Van As&Basson,1989),其中紧密车轮虫为国内首次报道,而罗非鱼是国内发现异齿车轮虫的新寄主。 展开更多
关键词 车轮虫 分类学 罗非鱼
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陆基圆池养殖大口黑鲈结节病病原菌的分离鉴定及其毒力基因分析
7
作者 高雪梅 谭红连 +5 位作者 苏三婷 童桂香 苏美珍 陈静 陈谊 韦信贤 《西南农业学报》 北大核心 2025年第8期1767-1775,共9页
【目的】明确广西陆基圆池养殖大口黑鲈(Micropterus salmoides)结节病的病原菌种类及其特性,为科学防治陆基圆池养殖大口黑鲈结节病提供科学依据。【方法】采集患结节病的大口黑鲈肝脏组织,以常规细菌分离方法分离病原菌,结合形态学观... 【目的】明确广西陆基圆池养殖大口黑鲈(Micropterus salmoides)结节病的病原菌种类及其特性,为科学防治陆基圆池养殖大口黑鲈结节病提供科学依据。【方法】采集患结节病的大口黑鲈肝脏组织,以常规细菌分离方法分离病原菌,结合形态学观察、生理生化鉴定及16S rRNA序列分析等进行鉴定;通过人工回归感染试验验证其致病性,利用PCR检测其毒力基因,并以药敏试验筛选敏感抗菌药物用于治疗。【结果】从患结节病的大口黑鲈肝脏中分离出3株优势菌株,分别命名为NN202301、HZ202306和DH202310;经形态学观察、生理生化鉴定及16S rRNA序列分析,确认3株菌株均为鰤鱼诺卡氏菌(Nocardia seriolae)。人工回归感染试验表明,菌株NN202301、HZ202306和DH202310的半数致死剂量(LD_(50))分别为1.12×10^(6)、8.89×10^(5)和1.26×10^(6)CFU/mL;毒力基因PCR扩增结果显示,3株菌株均携带有gapA、ibeA、mce1A和pup 4种毒力基因,即具有较高的致病性,且其毒力在一定浓度范围内呈剂量依赖性;药敏试验结果发现,3株菌株对头孢哌酮、头孢吡肟、特治星、舒普深和多西环素5种抗菌药敏感,而对链霉素和万古霉素已产生完全耐药性。【结论】陆基圆池养殖模式下大口黑鲈结节病的主要病原菌为鰤鱼诺卡氏菌,该菌具有较强的致病性,携带多种毒力基因,且存在多重耐药性,生产中可选用多西环素作为治疗大口黑鲈结节病的潜在药物。 展开更多
关键词 大口黑鲈 陆基圆池养殖模式 结节病 分离鉴定 毒力基因
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碱度环境对克氏原螯虾室内高密度养殖的影响
8
作者 李旻 王大鹏 +3 位作者 杨艳 袁畅 梁正 黄玉英 《渔业信息与战略》 2025年第2期135-142,共8页
研究不同碱度环境对克氏原螯虾(Procambarus clarkii)室内高密度养殖的水质及养殖性状的影响,探索达到水质和养殖性状最优的碱度条件。在帆布池中进行克氏原螯虾高密度养殖,并泼洒不同浓度的碳酸氢钠(NaHCO_(3))以调节碱度环境。在贵港... 研究不同碱度环境对克氏原螯虾(Procambarus clarkii)室内高密度养殖的水质及养殖性状的影响,探索达到水质和养殖性状最优的碱度条件。在帆布池中进行克氏原螯虾高密度养殖,并泼洒不同浓度的碳酸氢钠(NaHCO_(3))以调节碱度环境。在贵港市桂平石咀镇设置对照组和低(70 mg·L^(-1))、中(100 mg·L^(-1))、高(130 mg·L^(-1))3个碱度[以碳酸钙(CaCO_(3))计]处理组。克氏原螯虾养殖密度为100尾·m^(-2)。50 d养殖试验结果表明:碱度对养殖水体的水温和溶解氧的影响差异不显著(P>0.05),而对pH、悬浮物、氨氮、亚硝酸盐、硝酸盐、磷酸盐和溶解二氧化碳影响显著(P<0.05)。中碱度和高碱度处理的克氏原螯虾的养殖性状参数:存活率、体质量增长量、每周增长质量、最终生物量显著优于对照组(P<0.05)。高碱度处理的克氏原螯虾的最终体质量平均值显著优于对照组和低碱度处理(P<0.05),且饵料转化率显著低于中碱度处理组(P<0.05)。碱度环境有利于保持水质稳定,可有效提升克氏原螯虾养殖成活率及其生长速度(如体质量增长量和每周增长质量等)。当碱度维持在130 mg·L^(-1)时,效果最佳,但继续提高碱度是否能达到更好的效果,需要进一步研究。 展开更多
关键词 克氏原螯虾 碱度调节 水质 生长性状
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IHHNV PCR检测方法改进及广西流行株基因型分析 被引量：4
9
作者 杨慧赞 童桂香 +5 位作者 郑晓聪 谭红连 黄国秋 廖永志 韦信贤 胡庭俊 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1127-1132,共6页
[目的]建立并优化传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)检测及其基因分型的套式PCR,并确定IHH-NV在广西流行的基因型,为有效防控广西对虾传染性皮下及造血组织坏死病(IHHN)提供参考依据。[方法]在以PCR检测IHHNV现有标准的基础上,于389... [目的]建立并优化传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)检测及其基因分型的套式PCR,并确定IHH-NV在广西流行的基因型,为有效防控广西对虾传染性皮下及造血组织坏死病(IHHN)提供参考依据。[方法]在以PCR检测IHHNV现有标准的基础上,于389F/R和309F/R两对引物扩增片段之外的绝对保守区域设计外引物IHHNV-WF/WR,优化退火温度和引物浓度后建立IHHNV检测及基因分型的套式PCR,并通过与一步法PCR对比以验证其优越性;采用建立的套式PCR对546株2010 2018年收集的IHHNV广西流行株进行基因型分析,确定IHHNV在广西流行的基因型。[结果]优化后的第一轮PCR反应体系20.0 L:2×F8 FastLong PCR MasterMix 10.0 μL,上、下游引物(20 μmol/L)各0.8 μL,DNA模板2.0 μL,无核菌酶灭菌水补足至20.0 μL。扩增程序:94.0 ℃预变性3 min;94.0 ℃ 10 s,59.0 ℃ 15 s,72.0 ℃ 15 s,进行35个循环;72.0 ℃延伸5 min。套式PCR检测IHHNV的灵敏度较一步法PCR提高100倍;对100份IHHNV阳性临床样品的检测结果与一步法PCR的检测结果一致,符合率达100%。从546株IHHNV广西流行株中均能扩增获得309 bp的目的条带,全部为感染型(基因1型和基因2型)。[结论]在PCR检测IHHNV现有标准基础上建立的IHHNV检测及基因分型套式PCR,其灵敏度较一步法PCR提高100倍,尤其适用于检测IHHNV含量低的样品,可为疫病监测及进出口检疫提供更敏感的技术手段。当前广西流行的IHHNV均为感染型(基因1型和基因2型)。 展开更多
关键词 对虾 传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV) 套式PCR 基因型
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两个罗氏沼虾种群的遗传多样性研究 被引量：5
10
作者 钟丹丹 林勇 +5 位作者 宾石玉 余艳玲 陈忠 曾兰 杜雪松 张永德 《广东农业科学》 CAS 2015年第24期140-145,共6页
为了解罗氏沼虾广东种群和广西种群的遗传多样性,指导罗氏沼虾的遗传育种工作,利用12个微卫星标记对罗氏沼虾广西和广东2个种群的遗传多样性进行了分析。结果表明,12个微卫星位点在2个罗氏沼虾种群中的扩增产物均具有多态性,共获得71个... 为了解罗氏沼虾广东种群和广西种群的遗传多样性,指导罗氏沼虾的遗传育种工作,利用12个微卫星标记对罗氏沼虾广西和广东2个种群的遗传多样性进行了分析。结果表明,12个微卫星位点在2个罗氏沼虾种群中的扩增产物均具有多态性,共获得71个等位基因,每个位点平均等位基因数为5.92个。广西种群的平均有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、平均多态信息含量分别为3.9183、0.9505、0.7376、0.6558,广东种群的平均有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、平均多态信息含量分别为4.4374、0.9413、0.7609、0.6834,高于广西种群。结果表明,两个罗氏沼虾种群均具有较高的遗传多样性,具有较大的育种潜力。 展开更多
关键词 罗氏沼虾 微卫星标记 遗传多样性 分子标记
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尼罗罗非鱼选育家系的遗传多样性研究 被引量：7
11
作者 张永德 曾兰 +5 位作者 宾石玉 杜雪松 杨慧赞 陈忠 余艳玲 林勇 《广西师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2014年第3期94-101,共8页
近年来,微卫星标记技术因其引物通用性强、检测快速、多态信息含量高等优点发展并成为各种物种基因组作图的首选标记。本文利用11个微卫星标记分析14个尼罗罗非鱼家系的遗传多样性,研究尼罗罗非鱼群体的遗传多样性和家系间的遗传关系。... 近年来,微卫星标记技术因其引物通用性强、检测快速、多态信息含量高等优点发展并成为各种物种基因组作图的首选标记。本文利用11个微卫星标记分析14个尼罗罗非鱼家系的遗传多样性,研究尼罗罗非鱼群体的遗传多样性和家系间的遗传关系。结果表明,11个微卫星位点扩增产物具有多态性,每个位点平均等位基因数为8.36;14个尼罗罗非鱼家系的平均多态信息含量、平均杂合度、平均有效等位基因数分别为0.499 3、0.558 3、2.608 0,表现为较高的遗传多态性。对14个尼罗罗非鱼家系间的遗传距离分析发现,家系NT207与NT213遗传距离最小,为0.204 4;家系NT208与NT210遗传距离最大,为0.760 9。14个尼罗罗非鱼家系间的平均遗传相似性指数为0.649 6,平均遗传距离为0.440 2。UPGMA系统树分析结果表明,家系NT215、NT218、NT210与NT211构成一个分支;家系NT214、NT203、NT206、NT207、NT213、NT217、NT209与NT216构成另一个分支;而家系NT208、NT201与其他家系的遗传距离则较远,分别构成独立的分支。 展开更多
关键词 罗非鱼 微卫星标记 遗传多样性 亲缘关系
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克氏原螯虾养殖群体的SLAF测序及遗传多样性分析 被引量：3
12
作者 刘亚楠 刘洁 +5 位作者 魏上 李亚琳 李明 肖俊 邱高峰 陆颖 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期3265-3273,共9页
【目的】探究克氏原螯虾养殖群体内和群体间的遗传多样性,为引种和群体间杂交以改善养殖群体种质提供参考依据。【方法】以湖北、江西、安徽、浙江和江苏5省克氏原螯虾主产地14个养殖群体的120个个体为研究对象,采用简化基因组测序技术... 【目的】探究克氏原螯虾养殖群体内和群体间的遗传多样性,为引种和群体间杂交以改善养殖群体种质提供参考依据。【方法】以湖北、江西、安徽、浙江和江苏5省克氏原螯虾主产地14个养殖群体的120个个体为研究对象,采用简化基因组测序技术——特定区点扩增片段测序技术(SLAF-seq)进行基因组测序,获得基因组SNP基因型数据,构建群体系统发育进化树,并进行群体结构、主成分和遗传多样性分析。【结果】共鉴定出741147个单核苷酸多态性(SNP)位点,群体系统进化分析表明,14个群体的种源主要来自浙江金华和江苏宿迁,然后再向各地引种迁徙。群体结构分析结果与系统进化分析结果相吻合。主成分分析结果揭示了安徽长丰和滁州群体、湖北荆州龙口及和平2个群体,以及浙江东阳群体等5个群体与其他群体间存在相对较远的亲缘关系,是杂交引种的潜在种源。群体遗传多样性分析显示,14个群体的Ho介于0.2171~0.2801,平均值为0.2476,He介于0.3424~0.3598,平均值为0.3534,PIC介于0.2750~0.2878,群体间相差不大,接近0.25,各群体均接近遗传多样性中等水平的下限。【结论】14个克氏原螯虾养殖群体内的遗传多样性较低,群体间的亲缘关系较接近,品种单一、长期内交迹象明显。通过群体的基因组重测序,能以较低的成本实现对养殖群体遗传多样性的定期监测。 展开更多
关键词 克氏原螯虾 SLAF-seq SNP 遗传多样性 群体遗传学
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凡纳滨对虾微卫星分子标记的开发及不同养殖家系遗传多态性分析 被引量：13
13
作者 李强勇 李旻 +7 位作者 曾地刚 朱威霖 彭敏 杨春玲 刘青云 赵永贞 陈秀荔 陈晓汉 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期429-436,共8页
【目的】基于第三代高通量测序技术--单分子实时(SMRT)测序开发凡纳滨对虾微卫星分子标记,为凡纳滨对虾的遗传育种研究提供基础资料。【方法】采用SMRT测序对凡纳滨对虾转录组进行测序,经Illumina测序纠错后利用MISA对获得的转录组数据... 【目的】基于第三代高通量测序技术--单分子实时(SMRT)测序开发凡纳滨对虾微卫星分子标记,为凡纳滨对虾的遗传育种研究提供基础资料。【方法】采用SMRT测序对凡纳滨对虾转录组进行测序,经Illumina测序纠错后利用MISA对获得的转录组数据进行分析;以Primer 3.0设计微卫星引物,随机挑选40对微卫星引物进行PCR扩增验证,并选用扩增成功且具有多态性的微卫星引物用于不同养殖家系凡纳滨对虾遗传多态性分析。【结果】凡纳滨对虾转录组SMRT测序共获得51367条非冗余全长转录本序列,鉴定出39674条微卫星序列;微卫星的分布密度为0.232SSR/kb;以二核苷酸重复微卫星序列分布最多,共有22223条(占56.01%)。随机选取的40对微卫星引物中有26对微卫星引物能成功扩增出特异性条带;微卫星荧光分型结果显示,有16个微卫星位点具有多态性,共获得67个等位基因,平均等位基因数(Na)为4.2个,计算获得的平均观测杂合度(Ho)为0.511,平均期望杂合度(He)为0.451,平均多态性信息含量(PIC)为0.489。在16个微卫星位点中,有2个微卫星位点为低度多态性(PIC<0.25),6个微卫星位点为中度多态性(0.25<PIC<0.50),其余8个微卫星位点为高度多态性(PIC>0.50);有4个微卫星位点偏移Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),其余12个微卫星位点均未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。【结论】采用SMRT测序开发凡纳滨对虾微卫星分子标记是一种简单而高效的途径,有助于开展凡纳滨对虾的遗传育种研究工作。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 单分子实时(SMRT)测序 微卫星分子标记 多态性分析
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池塘循环水槽养殖模式研究进展 被引量：9
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作者 阴晴朗 罗永巨 +4 位作者 郭忠宝 肖俊 周毅 王婧杰 唐瞻杨 《水产学杂志》 CAS 北大核心 2019年第5期76-82,共7页
池塘循环水槽养殖将传统池塘"开放式散养"模式创新为新型的高效池塘循环流水"圈养"模式。在池塘的中建设占据池塘面积1%~3%的养殖单元,配备推水增氧设备和吸污设施,剩余的97%池塘大水面净化养殖尾水。以池塘内小面... 池塘循环水槽养殖将传统池塘"开放式散养"模式创新为新型的高效池塘循环流水"圈养"模式。在池塘的中建设占据池塘面积1%~3%的养殖单元,配备推水增氧设备和吸污设施,剩余的97%池塘大水面净化养殖尾水。以池塘内小面积高密度养殖和大面积净化水质为核心,具有高产、节水、环保等优点,符合绿色循环经济、节能减排的需求。本文通过总结和探讨池塘循环流水养殖模式发展的历史、系统的特点、技术关键等,以期为今后更好地建立适用于我国国情的池塘循环水槽养殖模式提供参考。 展开更多
关键词 池塘循环水槽 发展历程 系统特点 技术关键 研究展望
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广西罗非鱼和卵形鲳鲹海豚链球菌的生化特性及基因多态性分析 被引量：6
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作者 黄婷 李莉萍 +8 位作者 王瑞 梁万文 罗洪林 陈福艳 张彬 杨传萍 罗永巨 陈明 甘西 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期459-462,共4页
对2006—2011年从广西养殖的罗非鱼Oreochromis niloticus和卵形鲳鲹Trachinotus ovatus中分离的链球菌菌株进行生理生化和二重PCR鉴定,并利用随机扩增多态性DNA标记(RAPD)对经鉴定为海豚链球菌Streptococcus iniae的临床菌株进行生化... 对2006—2011年从广西养殖的罗非鱼Oreochromis niloticus和卵形鲳鲹Trachinotus ovatus中分离的链球菌菌株进行生理生化和二重PCR鉴定,并利用随机扩增多态性DNA标记(RAPD)对经鉴定为海豚链球菌Streptococcus iniae的临床菌株进行生化特性及基因多态性分析。结果表明:经鉴定共有22株临床分离菌株为海豚链球菌;RAPD分析发现,所有菌株的电泳结果均在750 bp处出现特异性条带,且带型相同;结合Bachrach的研究结果,推测本试验中所分离的22株海豚链球菌的血清型均为Ⅰ型。本研究结果可为防治鱼类海豚链球菌病提供科学依据。 展开更多
关键词 海豚链球菌 基因多态性 随机扩增多态性DNA标记
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无乳链球菌感染吉富品系尼罗罗非鱼的病理学研究 被引量：4
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作者 罗伟 甘西 +4 位作者 朱佳杰 敖秋桅 谭芸 陈明 罗永巨 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期375-382,共8页
【目的】确定无乳链球菌侵染吉富品系尼罗罗非鱼的途径及靶器官,为罗非鱼抗病育种及无乳链球菌病疫苗的研发提供理论依据。【方法】分别采用腹腔注射、经口灌胃及体外浸泡3种方式对吉富品系尼罗罗非鱼进行无乳链球菌感染,然后采集感染... 【目的】确定无乳链球菌侵染吉富品系尼罗罗非鱼的途径及靶器官,为罗非鱼抗病育种及无乳链球菌病疫苗的研发提供理论依据。【方法】分别采用腹腔注射、经口灌胃及体外浸泡3种方式对吉富品系尼罗罗非鱼进行无乳链球菌感染,然后采集感染罗非鱼的鳃、脾脏、肝脏和小肠组织进行病理形态学观察,并利用家兔抗无乳链球菌血清进行免疫组织化学定位,明确不同感染途径下无乳链球菌在鱼体内各组织中的分布规律及其浸染的靶器官。【结果】3种人工感染方式均能促使吉富品系尼罗罗非鱼感染无乳链球菌,其中,腹腔注射和经口灌胃在感染2 h后即出现病理变化,而体外浸泡感染方式出现病理变化的时间约在感染5 h后,且病变程度较腹腔注射和经口灌胃的感染方式轻。免疫组织化学定位发现,腹腔注射组吉富品系尼罗罗非鱼的病原菌信号出现顺序为脾脏→肝脏和鳃→小肠,经口灌胃组的病原菌信号出现顺序为小肠→鳃和脾脏→肝脏,体外浸泡组的病原菌信号出现顺序为鳃→脾脏→肝脏和小肠。【结论】采用腹腔注射、经口灌胃及体外浸泡3种方式均能促使吉富品系尼罗罗非鱼感染无乳链球菌,其对应的病原菌信号分别优先在脾脏、肠道和鳃组织出现。因此,自然养殖条件下防止养殖水体和食源被无乳链球菌污染是防控罗非鱼无乳链球菌病暴发的有效措施。 展开更多
关键词 吉富品系尼罗罗非鱼 无乳链球菌 致病途径 靶器官 免疫组织化学
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盐度、温度和光照对广西沿海牟氏角毛藻生长的影响 被引量：5
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作者 朱昔恩 林原有 +4 位作者 项桂德 熊建华 陈田聪 陈晓汉 张彬 《广东农业科学》 CAS 2022年第1期136-141,共6页
【目的】结合广西防城港海区的水质和环境条件,探讨影响牟氏角毛藻生长的主要理化因子,筛选最佳理化参数,为规模化扩培生产提供技术数据。【方法】采用单因子变量方法研究盐度、温度、光照强度对牟氏角毛藻生长的影响,其中盐度设置0‰、... 【目的】结合广西防城港海区的水质和环境条件,探讨影响牟氏角毛藻生长的主要理化因子,筛选最佳理化参数,为规模化扩培生产提供技术数据。【方法】采用单因子变量方法研究盐度、温度、光照强度对牟氏角毛藻生长的影响,其中盐度设置0‰、5‰、10‰、20‰、30‰、35‰、40‰共7个梯度,温度设置25、28、31、34℃共4个梯度,光照强度设置1000、4000、7000 lx共3个梯度。【结果】牟氏角毛藻在盐度5‰~40‰条件下均能正常生长,20‰盐度为牟氏角毛藻的最适盐度;高温培养条件下,31℃时牟氏角毛藻达到最大藻细胞浓度;温度越低,生长速度越慢,稳定期越长;温度越高,生长速度越快,稳定期越短;4000 lx为牟氏角毛藻的最适生长光照强度,光照强度越高,稳定期越长。【结论】20‰盐度、31℃水温和4000 lx光照强度是广西防城港海区牟氏角毛藻的最佳生长条件,生长速度和藻细胞密度均达最高值;过高或过低的盐度、温度、光照强度均会抑制牟氏角毛藻的生长。 展开更多
关键词 牟氏角毛藻 盐度 温度 光照 藻细胞密度 生长速率
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广西地区克氏原螯虾繁育技术及展望 被引量：3
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作者 袁畅 陆专灵 +2 位作者 黄彬胜 王大鹏 李文红 《渔业信息与战略》 2021年第4期267-274,共8页
传统的“放种虾”模式,既不利于良种选育和养殖技术的标准化,也无法满足反季节养殖等新模式的苗种需求,需改变育苗模式,提高苗种中培成活率,解决克氏原螯虾产业发展苗种供应的瓶颈问题。综述了克氏原螯虾的繁殖生物学现状、亲虾选择、... 传统的“放种虾”模式,既不利于良种选育和养殖技术的标准化,也无法满足反季节养殖等新模式的苗种需求,需改变育苗模式,提高苗种中培成活率,解决克氏原螯虾产业发展苗种供应的瓶颈问题。综述了克氏原螯虾的繁殖生物学现状、亲虾选择、繁育影响因素、广西育苗模式与技术,对广西地区的苗种繁育技术发展趋势进行了展望。研究认为提高广西地区克氏原螯虾苗种繁育技术,需发挥广西地区秋冬季反季节养殖和一年多造养殖优势,推广庭院内小规模工厂化育苗,研究小规格苗种中培技术,调查各地克氏原螯虾繁殖高峰,做好繁育场布局规划,以解决广西地区由于冬闲田养殖兴起导致的克氏原螯虾苗种供应不足问题。 展开更多
关键词 广西 克氏原螯虾 育苗模式与技术 展望
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广西冬闲稻田繁育小龙虾苗种技术 被引量：2
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作者 余艳玲 王大鹏 +3 位作者 李青 卢智发 曾华忠 唐章生 《科学养鱼》 2019年第10期10-11,共2页
目前,小龙虾养殖最集中的区域仍是湖北、安徽、江苏三省,受气候限制,每年11月至次年3月是小龙虾供应的空白期,市场缺货严重,4-5月产量也较低,价格较高,一直到6月才进入供应高峰期,随之小龙虾价格急剧降低,整个市场价格波动较大。而广西... 目前,小龙虾养殖最集中的区域仍是湖北、安徽、江苏三省,受气候限制,每年11月至次年3月是小龙虾供应的空白期,市场缺货严重,4-5月产量也较低,价格较高,一直到6月才进入供应高峰期,随之小龙虾价格急剧降低,整个市场价格波动较大。而广西北半部属中亚热带、亚热带气候,南半部属南亚热带气候,降水充沛、日照充足、雨热同季,小龙虾越冬期短,可以实现反季节养殖,即8月交配后,次年3月可达大规格成虾,恰好可弥补小龙虾产业发展这一短板。现将广西冬闲稻田繁育小龙虾苗种技术总结如下。 展开更多
关键词 南亚热带气候 小龙虾 市场价格波动 越冬期 空白期
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广西内陆水域主要增殖放流鱼类生长生物学特征及变化 被引量：1
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作者 韩耀全 施军 +2 位作者 吴伟军 雷建军 孔彬 《江苏农业科学》 北大核心 2017年第16期155-160,共6页
生物的生长和生态学参数不仅能反映其生长及生存状况,也能在一定程度上反映其生活环境的质量及生活史情况。利用2013—2014年度开展渔业资源调查采集的鱼类生物学数据,分析广西主要增殖放流鱼类的生长生物学特性,为增殖放流、增殖效果... 生物的生长和生态学参数不仅能反映其生长及生存状况,也能在一定程度上反映其生活环境的质量及生活史情况。利用2013—2014年度开展渔业资源调查采集的鱼类生物学数据,分析广西主要增殖放流鱼类的生长生物学特性,为增殖放流、增殖效果评估及水域生态环境修复提供方法依据。通过体长和体质量关系数据估算鱼类生长参数和种群生态学参数。结果表明,主要增殖放流鱼类青鱼(Mylopharyngodon piceus)、草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、鲢鱼(Hypophthalmichthys molitrix)和鳙鱼(Aristichthys nobilis)的生长生物学特征参数分别为,青鱼a=2.766 0×10^(-2)、b=2.965 9、L∞=117.97 cm、m∞=38 593.97 g、k=0.146 0年-1、t0=-1.339 4年、trp=6.11年、mrp=11 594.5 g,草鱼a=6.062 8×10^(-2)、b=2.691 9、L∞=112.06 cm、m∞=19 933.8 g、k=0.198 5年-1、t0=-0.987 6年、trp=4.00年、mrp=6 692.2 g,鲢鱼a=1.631 3×10-4、b=2.652 3、L∞=99.25 cm、m∞=14 479.8 g、k=0.100年-1、t0=-1.104 0年、trp=8.65年、mrp=4 939.8 g,鳙鱼a=1.851 7×10^(-4)、b=2.656 3、L∞=96.6 cm、m∞=15 724.1 g、k=0.160年-1、t0=-0.682 9年、trp=5.42年、mrp=5 355.7 g。与历史数据及其他水域相关研究数据相比,青鱼样本的渐近体长和渐近体质量值均小于历史数据,但相对体质量更大,有小型化、低龄化的趋向。草鱼的参数相差较小,生长速度参数略有上升。鲢鱼的生长速度及体质量相对较低,鳙鱼的体质量增长速度相对较低。增殖放流鱼类生长基本正常。青鱼和草鱼的最佳起捕体质量为10、6 kg;鲢鱼和鳙鱼约为5 kg。调查研究水域应开展生态环境优化修复工作,通过持续增殖放流、调整增殖放流鱼类数量措施,保持水域草鱼现存资源量,适当增加青鱼、鲢鱼和鳙鱼的资源量。 展开更多
关键词 广西 内陆水域 增殖放流 鱼类 生物学特征
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