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题名一种新型β-葡萄糖苷酶基因的分析
被引量:1
- 1
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作者
蒋承建
李双喜
申佩弘
阎冰
武波
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机构
广西大学生命科学与技术学院广西大学微生物与植物遗传工程教育部重点实验室广西亚热带资源保护利用重点实验室
广西海洋生物技术重点实验室广西海洋研究所
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出处
《中国酿造》
CAS
北大核心
2009年第5期42-45,共4页
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基金
广西海洋生物技术重点实验室开放基金资助(GLMBT-0806)
广西大学科研基金资助(X081075)
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文摘
宏基因组文库技术已经成为开发未知功能基因及其编码产物的有效途径。本研究采用β-葡萄糖苷酶的活性筛选策略,对所构建的土壤宏基因组文库进行筛选,得到了一个表达β-葡萄糖苷酶活性的阳性克隆。生物信息学分析表明该克隆所包含的外源DNA片断编码一个由151个氨基酸编码组成的多肽。BLASTx软件分析可能的ORF和GenBank数据库中的基因在DNA水平上没有任何相似性;在氨基酸水平上与一种来自于糖基水解酶蛋白家族4的β-葡萄糖苷酶的相似性为56%,同源性为41%。初步的酶学数据表明目标ORF是一种编码β-葡萄糖苷酶的新型基因。本研究工作对于深入挖掘土壤未培养微生物的β-葡萄糖苷酶基因资源具有重要实践意义。
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关键词
宏基因组文库
Β-葡萄糖苷酶
多肽
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Keywords
metagenomic library
β-glucosidase
peptide
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分类号
Q78
[生物学—分子生物学]
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题名一种来自于土壤宏基因组文库的AprN基因的鉴定
被引量:1
- 2
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作者
蒋承建
阎冰
申佩弘
武波
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机构
广西海洋生物技术重点实验室广西海洋研究所
广西大学生命科学与技术学院广西大学微生物与植物遗传工程教育部重点实验室广西亚热带资源保护利用重点实验室
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出处
《生物学杂志》
CAS
CSCD
2010年第2期43-46,共4页
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基金
广西海洋生物技术重点实验室开放基金资助(编号:GLMBT-0806)
广西大学科研基金(编号:X081075)
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文摘
宏基因组文库技术的发展拓宽了酶学的研究范围,从而导致了一系列新型的生物催化剂被发现和鉴定。采用蛋白酶的活性筛选策略,从已构建的碱性污染土壤宏基因组文库分离得到了一个表达蛋白酶的阳性克隆。生物信息学分析表明该克隆所包含的外源DNA片断编码一个由381个氨基酸编码组成的多肽,该多肽大约为39kDa,等电点为8.91。BLAST软件分析该外源DNA片断包含一个完整的碱性蛋白酶基因(ap01),GC含量为46.3%。相关酶学数据表明该阳性克隆所分泌的碱性蛋白酶最适作用pH值为9.5,最佳作用温度为40℃。
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关键词
宏基因组文库
未培养微生物
碱性蛋白酶
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Keywords
metagenomic library
uncultured microorganism
AprN
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分类号
Q781
[生物学—分子生物学]
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