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巨桉脱水素基因EgrDHN家族鉴定及表达模式分析
被引量:
1
1
作者
苏国芬
李大华
+8 位作者
王潘
周料
胡浩
邓海群
陈鑫
冯名开
耿显宸
王翊
徐增富
《中南林业科技大学学报》
CSCD
北大核心
2024年第12期166-177,共12页
【目的】深入挖掘巨桉Eucalyptus grandis脱水素基因EgrDHN家族成员并探讨其应对逆境胁迫的表达模式,从中筛选具有抗逆功能的EgrDHN基因对于培育桉树抗逆新品种具有重要意义。【方法】以巨桉全基因组数据为参考,利用生物信息学筛选鉴定...
【目的】深入挖掘巨桉Eucalyptus grandis脱水素基因EgrDHN家族成员并探讨其应对逆境胁迫的表达模式,从中筛选具有抗逆功能的EgrDHN基因对于培育桉树抗逆新品种具有重要意义。【方法】以巨桉全基因组数据为参考,利用生物信息学筛选鉴定得到巨桉EgrDHN基因家族成员,对其进行生物信息学分析,具体包括进化树分析、蛋白序列比对、启动子序列中顺式作用元件预测等;并基于生物信息学分析结果,采用RT-qPCR测定方法,对EgrDHN基因家族成员在低温、高盐和ABA胁迫处理下的表达模式及其组织表达特异性进行了分析。【结果】从巨桉基因组中共鉴定出EgrDHN家族9个成员,将其命名为EgrDHN1~EgrDHN9,分布于5条染色体上,根据蛋白质保守序列的特点可分为K_(n)S、SK_(n)和Y_(n)SK_(n) 3种类型。系统进化树显示植物DHN家族成员可分为4个进化枝,其中第Ⅳ进化枝包含巨桉EgrDHN7、EgrDHN8、EgrDHN9,但不包含任何毛果杨Populus trichocarpa DHN同源基因(PtrDHNs),两者存在明显差异。启动子元件预测分析发现巨桉EgrDHN启动子中含有低温响应(Low-temperature response,LTR)元件,MYB、MYC等与抗逆性相关以及植物激素响应类顺式作用元件。组织特异性表达分析发现EgrDHN家族成员在根、成熟叶片、子叶中表达量较高,其中EgrDHN2在成熟叶片中表达量最高。非生物逆境胁迫下经RT-qPCR检测发现EgrDHN家族成员中,EgrDHN1在高盐胁迫下表达量下调,在低温和ABA胁迫时上调,而其他成员在低温、高盐、ABA胁迫下均表现为上调,其中低温条件下以EgrDHN2、EgrDHN3、EgrDHN4响应最为明显。【结论】大部分EgrDHNs基因参与逆境胁迫响应,且除EgrDHN1在盐胁迫下的表达量下降外其他成员在逆境胁迫下的表达量均上升。
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关键词
巨桉
脱水素
非生物胁迫
表达分析
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职称材料
人工林种植模式对天门冬生物量、养分含量及品质的影响
被引量:
1
2
作者
王家妍
蒋丰璟
+3 位作者
李青春
杨梅
徐圆圆
莫雅芳
《经济林研究》
北大核心
2024年第4期145-154,共10页
【目的】为天门冬Asparagus cochinchinensis林下栽培模式的选择提供参考。【方法】采用化学计量分析和主成分分析的方法对广西国有高峰林场27年生杉木Cunninghamia lanceolata纯林、27年生杉木/13年生马尾松Pinus massoniana混交林、2...
【目的】为天门冬Asparagus cochinchinensis林下栽培模式的选择提供参考。【方法】采用化学计量分析和主成分分析的方法对广西国有高峰林场27年生杉木Cunninghamia lanceolata纯林、27年生杉木/13年生马尾松Pinus massoniana混交林、27年生杉木/13年生桉树Eucalyptus robusta混交林和27年生木荷Schima superba纯林模式下种植的1年生天门冬生物量、含水量、养分及药用成分含量进行测定和分析。【结果】杉木混交桉树能提高天门冬地下部分的生物量,木荷纯林模式下其生物量表现最佳。杉木纯林模式下天门冬块根的碳(C)、氮(N)、钾(K)积累表现最佳,但养分利用效率较低且生长受磷(P)元素限制;杉木混交林模式能提高天门冬的养分利用效率并缓解P元素限制,且混交桉树模式下天门冬的养分表现较混交马尾松模式下更佳;木荷纯林模式下天门冬生长受到N元素限制。杉木纯林模式能促进天门冬块根总氨基酸的积累,杉木混交林和木荷纯林更利于块根中总皂苷、总多糖的积累。相关性和主成分分析结果表明,C、N、P、K的积累之间具有协同性,N、K会抑制天门冬生长,P对天门冬的生长有益;一定程度的养分胁迫能提高天门冬块根的总氨基酸含量,而适宜的养分分配更利于块根中总皂苷、总多糖的积累。【结论】阔叶树林下种植可促进天门冬生长、提高其药用成分含量并缓解养分限制,提高天门冬的综合品质。杉木/桉树混交林模式下天门冬的品质较杉木纯林模式下更高,木荷纯林模式下天门冬的综合品质最佳。
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关键词
天门冬
林下种植模式
生物量
化学计量特征
主成分分析
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职称材料
题名
巨桉脱水素基因EgrDHN家族鉴定及表达模式分析
被引量:
1
1
作者
苏国芬
李大华
王潘
周料
胡浩
邓海群
陈鑫
冯名开
耿显宸
王翊
徐增富
机构
广西大学
林学院
广西大学中南速生材繁育国家林业和草原局重点实验室
广西
壮族自治区国有东门林场
出处
《中南林业科技大学学报》
CSCD
北大核心
2024年第12期166-177,共12页
基金
广西重点研发计划揭榜制科技项目(桂科JB22035001)
广西科技基地和人才专项(桂科AD23026337)。
文摘
【目的】深入挖掘巨桉Eucalyptus grandis脱水素基因EgrDHN家族成员并探讨其应对逆境胁迫的表达模式,从中筛选具有抗逆功能的EgrDHN基因对于培育桉树抗逆新品种具有重要意义。【方法】以巨桉全基因组数据为参考,利用生物信息学筛选鉴定得到巨桉EgrDHN基因家族成员,对其进行生物信息学分析,具体包括进化树分析、蛋白序列比对、启动子序列中顺式作用元件预测等;并基于生物信息学分析结果,采用RT-qPCR测定方法,对EgrDHN基因家族成员在低温、高盐和ABA胁迫处理下的表达模式及其组织表达特异性进行了分析。【结果】从巨桉基因组中共鉴定出EgrDHN家族9个成员,将其命名为EgrDHN1~EgrDHN9,分布于5条染色体上,根据蛋白质保守序列的特点可分为K_(n)S、SK_(n)和Y_(n)SK_(n) 3种类型。系统进化树显示植物DHN家族成员可分为4个进化枝,其中第Ⅳ进化枝包含巨桉EgrDHN7、EgrDHN8、EgrDHN9,但不包含任何毛果杨Populus trichocarpa DHN同源基因(PtrDHNs),两者存在明显差异。启动子元件预测分析发现巨桉EgrDHN启动子中含有低温响应(Low-temperature response,LTR)元件,MYB、MYC等与抗逆性相关以及植物激素响应类顺式作用元件。组织特异性表达分析发现EgrDHN家族成员在根、成熟叶片、子叶中表达量较高,其中EgrDHN2在成熟叶片中表达量最高。非生物逆境胁迫下经RT-qPCR检测发现EgrDHN家族成员中,EgrDHN1在高盐胁迫下表达量下调,在低温和ABA胁迫时上调,而其他成员在低温、高盐、ABA胁迫下均表现为上调,其中低温条件下以EgrDHN2、EgrDHN3、EgrDHN4响应最为明显。【结论】大部分EgrDHNs基因参与逆境胁迫响应,且除EgrDHN1在盐胁迫下的表达量下降外其他成员在逆境胁迫下的表达量均上升。
关键词
巨桉
脱水素
非生物胁迫
表达分析
Keywords
Eucalyptus grandis
dehydrin
abiotic stress
expression analysis
分类号
S718.43 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
人工林种植模式对天门冬生物量、养分含量及品质的影响
被引量:
1
2
作者
王家妍
蒋丰璟
李青春
杨梅
徐圆圆
莫雅芳
机构
广西
国有高峰林场
广西大学
林学院
广西大学
广西
森林生态与保育
重点
实验室
广西大学中南速生材繁育国家林业和草原局重点实验室
出处
《经济林研究》
北大核心
2024年第4期145-154,共10页
基金
广西自筹经费林业科技项目(桂林科研〔2022ZC〕第34号)
广西重点研发计划项目(桂科AB21238014)
国家自然科学基金面上项目(32371856)。
文摘
【目的】为天门冬Asparagus cochinchinensis林下栽培模式的选择提供参考。【方法】采用化学计量分析和主成分分析的方法对广西国有高峰林场27年生杉木Cunninghamia lanceolata纯林、27年生杉木/13年生马尾松Pinus massoniana混交林、27年生杉木/13年生桉树Eucalyptus robusta混交林和27年生木荷Schima superba纯林模式下种植的1年生天门冬生物量、含水量、养分及药用成分含量进行测定和分析。【结果】杉木混交桉树能提高天门冬地下部分的生物量,木荷纯林模式下其生物量表现最佳。杉木纯林模式下天门冬块根的碳(C)、氮(N)、钾(K)积累表现最佳,但养分利用效率较低且生长受磷(P)元素限制;杉木混交林模式能提高天门冬的养分利用效率并缓解P元素限制,且混交桉树模式下天门冬的养分表现较混交马尾松模式下更佳;木荷纯林模式下天门冬生长受到N元素限制。杉木纯林模式能促进天门冬块根总氨基酸的积累,杉木混交林和木荷纯林更利于块根中总皂苷、总多糖的积累。相关性和主成分分析结果表明,C、N、P、K的积累之间具有协同性,N、K会抑制天门冬生长,P对天门冬的生长有益;一定程度的养分胁迫能提高天门冬块根的总氨基酸含量,而适宜的养分分配更利于块根中总皂苷、总多糖的积累。【结论】阔叶树林下种植可促进天门冬生长、提高其药用成分含量并缓解养分限制,提高天门冬的综合品质。杉木/桉树混交林模式下天门冬的品质较杉木纯林模式下更高,木荷纯林模式下天门冬的综合品质最佳。
关键词
天门冬
林下种植模式
生物量
化学计量特征
主成分分析
Keywords
Asparagus cochinchinensis
understory intercropping mode
biomass
stoichiometric characteristics
principal component analysis
分类号
S604.5 [农业科学—园艺学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
巨桉脱水素基因EgrDHN家族鉴定及表达模式分析
苏国芬
李大华
王潘
周料
胡浩
邓海群
陈鑫
冯名开
耿显宸
王翊
徐增富
《中南林业科技大学学报》
CSCD
北大核心
2024
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
人工林种植模式对天门冬生物量、养分含量及品质的影响
王家妍
蒋丰璟
李青春
杨梅
徐圆圆
莫雅芳
《经济林研究》
北大核心
2024
1
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职称材料
已选择
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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