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药用植物种质资源的超低温保存 被引量:8
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作者 李翠 陈东亮 +3 位作者 陈晓英 雷明 郭晓云 缪剑华 《中国现代中药》 CAS 2020年第6期966-970,共5页
药用植物种质资源是发展中医药的特有野生生物资源和战略生物资源,药用植物种质资源的保存至关重要。原位保存和离位保存是药用植物种质资源的主要保存方法,超低温保存是迄今为止最为安全、经济、有效的药用植物种质资源离位保存方法。... 药用植物种质资源是发展中医药的特有野生生物资源和战略生物资源,药用植物种质资源的保存至关重要。原位保存和离位保存是药用植物种质资源的主要保存方法,超低温保存是迄今为止最为安全、经济、有效的药用植物种质资源离位保存方法。本文从超低温保存的原理及优势、材料的选择和预处理、保护剂的使用、化冻方法及药用植物超低温保存现状进行总结综述和展望,提出药用植物超低温保存研究应以遗传稳定性为首要考察指标并逐步与生产实践相结合。 展开更多
关键词 药用植物 种质资源 超低温保存 原理
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药用植物4.0研究进展与展望 被引量:18
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作者 秦双双 韦坤华 +8 位作者 胡营 梁莹 韦范 宋志军 王硕 周小雷 乔柱 杨晓男 缪剑华 《中国现代中药》 CAS 2023年第7期1383-1395,共13页
药用植物4.0是信息技术、生物技术与药用植物高度融合的技术创新体系。基于药用植物跨组学生物学、药效学数据采集与挖掘,药用植物4.0搭建了药用植物跨组学大数据平台,通过跨组学大数据的集成与分析,解读药用植物形态、生态、组学与药效... 药用植物4.0是信息技术、生物技术与药用植物高度融合的技术创新体系。基于药用植物跨组学生物学、药效学数据采集与挖掘,药用植物4.0搭建了药用植物跨组学大数据平台,通过跨组学大数据的集成与分析,解读药用植物形态、生态、组学与药效,以及药效与疾病间的关系,推进自然资源到数字资源的转变,为人工智能(AI)式药物筛选等创新工具开发提供数据支撑,实现药用植物资源与新药的智慧创制。药用植物4.0未来将着眼于药用植物精准栽培、药效单体生物制药、健康产品及中药肽的智慧创制,以期实现药用植物资源保护与开发利用的协调发展,为大健康产业发展所需资源和产品研发提供支撑,为实施“健康中国”战略提供物质基础。 展开更多
关键词 药用植物4.0 跨组学 大数据 资源保护 开发利用
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广西肿节风种质资源调查及质量评价 被引量:7
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作者 黄宝优 蓝祖栽 +3 位作者 姚绍嫦 唐美琼 凌征柱 韦健 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期33-36,共4页
采用走访和实地调查相结合的方法,对广西大宗药材肿节风种质资源的地理分布及生境、生物学特性、群落特征和伴生植物等进行调查,并按照《中国药典》2010年版肿节风药材项下的质控标准对广西不同产地的肿节风药材进行质量评价.结果表明,... 采用走访和实地调查相结合的方法,对广西大宗药材肿节风种质资源的地理分布及生境、生物学特性、群落特征和伴生植物等进行调查,并按照《中国药典》2010年版肿节风药材项下的质控标准对广西不同产地的肿节风药材进行质量评价.结果表明,广西肿节风种质资源丰富,全区各地都有分布,尤以海拔60~1 306 m植被较好的沟谷或近水的阴湿林下最为丰富;肿节风喜温暖湿润的阴湿环境,对湿度要求较高,耐旱性较差,适应肥沃疏松的各种土壤;广西肿节风药材品质佳,质量好,有较好的开发利用价值;肿节风生境正不同程度地遭受人为破坏,资源量逐年减少,存在资源危机,亟待保护. 展开更多
关键词 肿节风 种质资源 质量评价 广西
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中国南方喀斯特地貌药用植物保育策略 被引量:9
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作者 梁莹 韦坤华 +5 位作者 张占江 肖冬 乔柱 李明杰 张重义 缪剑华 《中国现代中药》 CAS 2017年第2期226-231,共6页
中国南方喀斯特地貌作为重要的世界自然遗产组成部分,孕育着丰富的药用植物资源。然而石漠化和人为过度掠夺加剧了对药用植物的危害,特别是濒危野生药用植物种质资源多样性受到威胁。本文通过分析药用植物对喀斯特地貌独特环境的响应特... 中国南方喀斯特地貌作为重要的世界自然遗产组成部分,孕育着丰富的药用植物资源。然而石漠化和人为过度掠夺加剧了对药用植物的危害,特别是濒危野生药用植物种质资源多样性受到威胁。本文通过分析药用植物对喀斯特地貌独特环境的响应特点,结合药用植物资源生态学特征,以保护与恢复中国南方喀斯特地貌药用植物物种和药效为目标,探讨药用植物资源保护、物种信息提取以及复育技术和方法,为促进中国南方喀斯特退化生态系统的恢复重建,推动药用资源的可持续开发利用提供参考。 展开更多
关键词 药用植物保育学 喀斯特地貌 石漠化 濒危灭绝 保育策略
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药用植物保育学研究进展与展望 被引量:2
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作者 梁莹 秦双双 +6 位作者 韦坤华 汤丹峰 乔柱 郭晓云 韦范 朱艳霞 缪剑华 《中国现代中药》 CAS 2022年第3期387-394,共8页
药用植物保育学是在大量药用植物引种、驯化与保护的实践经验和理论研究的基础上,经过归纳总结构建的重点学科。通过开展药用植物发源中心、遗传保育、生态保育、驯化保育、繁育、复育及保育策略与评价研究,为珍稀濒危药用植物原种保存... 药用植物保育学是在大量药用植物引种、驯化与保护的实践经验和理论研究的基础上,经过归纳总结构建的重点学科。通过开展药用植物发源中心、遗传保育、生态保育、驯化保育、繁育、复育及保育策略与评价研究,为珍稀濒危药用植物原种保存、生境保护、繁育与复育提供理论依据和技术指导。未来将着眼于药材品质形成的遗传机制、生态机制、驯化机制研究,应用药用植物精准栽培技术,推动药用植物保育学学科发展,实现药用植物资源的可持续利用。 展开更多
关键词 药用植物保育学 药用植物发源中心 物种保存 可持续利用
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药用植物短蕊万寿竹的组织培养研究 被引量:2
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作者 王一诺 秦双双 +3 位作者 黄宝优 韦莹 李翠 韦坤华 《中国现代中药》 CAS 2017年第2期239-242,共4页
目的:更好的开发利用短蕊万寿竹。方法:以短蕊万寿竹的幼嫩茎段为外植体,MS为基本培养基,采用正交设计研究外源激素的种类和配比对诱导丛生芽和生根的影响。结果:最适的启动培养基为MS+6-BA 1.0 mg·L^(-1)+NAA 0.2 mg·L^(-1)+... 目的:更好的开发利用短蕊万寿竹。方法:以短蕊万寿竹的幼嫩茎段为外植体,MS为基本培养基,采用正交设计研究外源激素的种类和配比对诱导丛生芽和生根的影响。结果:最适的启动培养基为MS+6-BA 1.0 mg·L^(-1)+NAA 0.2 mg·L^(-1)+IBA 0.5 mg·L^(-1),诱导丛生芽的最佳培养基为MS+6-BA 1.5 mg·L^(-1)+NAA 0.2 mg·L^(-1)+KT 1.0 mg·L^(-1),丛生芽的增殖系数达到6.88,最佳的生根培养基为MS+6-BA 0.5 mg·L^(-1)+NAA 2.0 mg·L^(-1)+AC 2.0 g·L^(-1),生根率达到96%以上。结论:建立短蕊万寿竹的组织培养繁殖体系,为人工种植提供大量种苗。 展开更多
关键词 短蕊万寿竹 组织培养 丛生芽 生根培养
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药用植物青葙全长转录组测序分析 被引量:3
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作者 朱艳霞 姜建萍 +2 位作者 郭晓云 韦坤华 缪剑华 《中国现代中药》 CAS 2023年第7期1463-1472,共10页
目的:构建药用植物青葙全长转录组,旨在为青葙功能基因组学研究提供遗传信息。方法:基于PacBio Sequel平台对青葙的根、茎、叶、花、果5个部位的混合样本进行高通量测序,对原始数据进行校正、筛选、聚类、去冗余、过滤、功能注释和结构... 目的:构建药用植物青葙全长转录组,旨在为青葙功能基因组学研究提供遗传信息。方法:基于PacBio Sequel平台对青葙的根、茎、叶、花、果5个部位的混合样本进行高通量测序,对原始数据进行校正、筛选、聚类、去冗余、过滤、功能注释和结构分析,获得青葙全长转录组数据。结果:经质量控制后获得高质量测序reads数据量为13.46 Gb,拼接去冗余后获得155300条循环一致性序列(CCS),研究共获得521928个高质量isoforms和210189个转录本。利用非冗余蛋白(NR)、核苷酸序列(NT)、SwissProt、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、真核生物相邻类的聚簇(KOG)、蛋白家族(Pfam)、基因本体(GO)7个数据库进行全长序列的功能注释,结果显示共有158562个转录本被成功注释。GO注释结果显示,转录本共富集在包含生物学过程、细胞组成和分子功能三大类的47个条目中。KEGG分析显示,转录本注释到代谢通路中的基因较多,其次是基因信息过程。基因结构分析结显示,共得到8350条蛋白质编码序列(CDS)、88574条lncRNA、45535个简单序列重复(SSRs),其中单核苷酸重复的占比最大,为52.94%,此外预测得到57类转录因子,如常见的MADS、WRKY、AP2-EREBP、bHLH等类型。结论:获得了青葙的全长转录组数据,为该植物后续分子功能研究提供了遗传信息和基础数据。 展开更多
关键词 青葙 全长转录组 功能注释 结构分析
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钙离子对药用植物生长和次生代谢产物积累作用的研究进展 被引量:5
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作者 范沾涛 刘寒 +6 位作者 黄媛 马梅冰 李林轩 韦范 梁莹 陆恒 韦坤华 《中国现代中药》 CAS 2023年第8期1789-1798,共10页
钙是植物生长发育必需的营养元素,也是细胞信号转导的第二信使。其不仅可以满足植物正常生长发育需求,还可以调控植物代谢。钙可以通过稳定细胞壁和细胞膜、提高离子吸收、参与信号转导等方式直接参与植物抗寒、抗热、抗旱、抗重金属毒... 钙是植物生长发育必需的营养元素,也是细胞信号转导的第二信使。其不仅可以满足植物正常生长发育需求,还可以调控植物代谢。钙可以通过稳定细胞壁和细胞膜、提高离子吸收、参与信号转导等方式直接参与植物抗寒、抗热、抗旱、抗重金属毒害和抗盐胁迫等。但是,每种植物对钙的敏感程度不同,缺钙会影响植物的正常生长,适宜浓度的钙能促进植物生长,而钙浓度过高会对植物形成胁迫,抑制植物的生长发育、降低作物的产量。因此,保持植物体内钙离子含量的平衡对植物的正常生长发育具有重要意义。对钙离子对药用植物生长发育、生理生化特性和次生代谢产物积累影响的研究进行总结,探究药用植物与钙离子之间的关系,为药用植物资源开发提供参考。 展开更多
关键词 钙离子 药用植物 生长发育 生理生化特性 次生代谢产物
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濒危药用植物八角莲保育研究 被引量:2
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作者 陈东亮 钟楚 +3 位作者 简少芬 李林轩 韦坤华 缪剑华 《中国现代中药》 CAS 2022年第3期395-402,共8页
八角莲以根茎入药,能够清热解毒、祛瘀消肿、化痰散结,具有极高的药用价值。近年来,各种内部和外部致濒因子的共同作用加重了八角莲的濒危程度,须通过人工保育实现其资源的可持续利用。在分析八角莲资源现状、濒危成因、就地保护和迁地... 八角莲以根茎入药,能够清热解毒、祛瘀消肿、化痰散结,具有极高的药用价值。近年来,各种内部和外部致濒因子的共同作用加重了八角莲的濒危程度,须通过人工保育实现其资源的可持续利用。在分析八角莲资源现状、濒危成因、就地保护和迁地保护现状的基础上,根据其生长发育规律、野生原种适生环境及濒危原因提出八角莲回归保育策略,旨在为其回归保育实践、资源开发及可持续利用提供参考。 展开更多
关键词 八角莲 种质资源 就地保育 迁地保育 回归保育
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广西肿节风药材有效成分含量与土壤因子关系研究 被引量:2
10
作者 姚绍嫦 蓝祖栽 +1 位作者 唐美琼 凌征柱 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第21期76-79,共4页
研究测定了广西区内18个肿节风主要分布区的土壤因子中化学性状和矿质元素含量与相应肿节风药材中的有效成分含量,并对之进行相关性分析,探讨了土壤因子对肿节风有效成分的影响,筛选出主导因子。结果显示,异嗪皮啶与有机质呈极显著正相... 研究测定了广西区内18个肿节风主要分布区的土壤因子中化学性状和矿质元素含量与相应肿节风药材中的有效成分含量,并对之进行相关性分析,探讨了土壤因子对肿节风有效成分的影响,筛选出主导因子。结果显示,异嗪皮啶与有机质呈极显著正相关,与速效磷和速效钾呈显著正相关;迷迭香酸与速效磷呈显著正相关,速效氮、Ca对异嗪皮啶和迷迭香酸均呈显著负相关。研究表明土壤中丰富的有机质、速效磷和速效钾供应有利于提高药材中的有效成分含量。 展开更多
关键词 肿节风 有效成分 土壤因子 相关分析
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基于非靶向代谢组学的苍耳不同药用部位代谢产物特征分析 被引量:1
11
作者 唐美琼 蓝祖栽 +7 位作者 胡营 韦筱媚 韦桂丽 梁莹 韦范 杨晓男 秦双双 缪剑华 《中国现代中药》 CAS 2023年第7期1529-1534,共6页
目的:分析苍耳不同药用部位之间代谢产物的差异。方法:采用超高效液相色谱-电喷雾离子源-质谱法(UPLC-ESI-MS)对苍耳根、茎和叶进行测定;用主成分分析(PCA)和偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)进行数据处理;通过对代谢物精确相对分子质量... 目的:分析苍耳不同药用部位之间代谢产物的差异。方法:采用超高效液相色谱-电喷雾离子源-质谱法(UPLC-ESI-MS)对苍耳根、茎和叶进行测定;用主成分分析(PCA)和偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)进行数据处理;通过对代谢物精确相对分子质量及碎片信息的确认,结合软件数据库搜索鉴定代谢物;对差异代谢物进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:苍耳的根、茎和叶的化学组成得到有效区分,从3个部位中共鉴定出5902个代谢物,筛选出64个差异代谢物,主要富集在植物次生代谢物质的生物合成,癌症中的中央碳代谢,鸟氨酸、赖氨酸和烟酸生物合成生物碱等通路。结论:从苍耳根、茎和叶代谢产物差异的角度揭示不同部位药性、药效差异的物质基础,为苍耳类中药资源的最大化综合利用提供参考。 展开更多
关键词 苍耳草 非靶向代谢组学 药用部位 化学成分 代谢通路
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广西莪术全长转录组测序及生物信息学分析 被引量:1
12
作者 胡营 彭玉德 +4 位作者 雷明 唐美琼 梁莹 韦筱媚 缪剑华 《中国现代中药》 CAS 2023年第7期1417-1427,共11页
目的:获取广西莪术的全长转录组信息,了解其转录组的整体水平,挖掘姜黄素类生物合成通路基因。方法:利用Pacbio Sequel测序平台对广西莪术根、茎、叶、花4个部位的混合样品进行全长转录组测序,结合生物信息学等方法进行功能注释、代谢... 目的:获取广西莪术的全长转录组信息,了解其转录组的整体水平,挖掘姜黄素类生物合成通路基因。方法:利用Pacbio Sequel测序平台对广西莪术根、茎、叶、花4个部位的混合样品进行全长转录组测序,结合生物信息学等方法进行功能注释、代谢通路分析、简单序列重复(SSR)分析。结果:共获得原始数据14.47 Gb,经纠错、过滤、去冗余得到高质量一致性序列151218条。对所有转录本在非冗余蛋白(NR)、核苷酸序列(NT)、基因本体(GO)、真核生物相邻类的聚簇(KOG)、蛋白家族(Pfam)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)和SwissProt七大功能数据库进行注释及分类,结果有128414个基因被注释,占比84.92%。共有325个基因参与姜黄素的生物合成,编码4-香豆酸-辅酶A连接酶、苯丙氨酸解氨酶、姜黄素合成酶、二酮-辅酶A合成酶、肉桂酸-4-羟化酶和咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶6个关键酶。MISA分析共发现32459个SSR位点,以单核苷酸重复数量最多,占全部重复类型的38.63%;1~3个核苷酸重复序列占主导位置,占总SSR位点的93.58%。结论:在高通量全长转录组水平对广西莪术进行研究,对姜黄素合成相关基因进行了挖掘,为后续阐明广西莪术姜黄素生物合成分子机制提供依据,为进一步研究广西莪术的分子标记和优良基因挖掘提供数据基础。 展开更多
关键词 广西莪术 全长转录组 功能注释 简单序列重复
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广西仙草保育关键技术及问题分析 被引量:4
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作者 汤丹峰 韦范 +3 位作者 谢锦祥 朱艳霞 韦坤华 缪剑华 《中国现代中药》 CAS 2022年第3期407-411,共5页
仙草是我国南方地区重要的药食同源植物,含有多糖、黄酮类化合物、三萜类化合物、矿物质、氨基酸、维生素等成分,是天然、安全、营养食品的理想原料。近年来,随着国家政策的支持和社会的发展,仙草产业发展规模有序扩大,逐渐成为研究热... 仙草是我国南方地区重要的药食同源植物,含有多糖、黄酮类化合物、三萜类化合物、矿物质、氨基酸、维生素等成分,是天然、安全、营养食品的理想原料。近年来,随着国家政策的支持和社会的发展,仙草产业发展规模有序扩大,逐渐成为研究热点。介绍其形态、分布和生长习性;针对广西地理气候条件,结合广西仙草生产种植经验,对其保育关键技术进行总结。广西已形成了较为完善的品种选择-种苗繁育-生产种植-采收储藏-种苗种子保育生产模式,做到了“在利用中保护、在保护中利用”的良性循环。对仙草保育过程存在的问题进行了分析,以期为仙草保育学研究和广西仙草产业发展提供参考。 展开更多
关键词 仙草 保育关键技术 存在问题
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白及的保育研究 被引量:10
14
作者 韦坤华 梁莹 +4 位作者 林杨 李林轩 胡营 缪剑华 高文远 《中国现代中药》 CAS 2019年第5期689-693,共5页
白及是我国珍稀名贵药用资源与工业原料,用途广泛,市场需求量大,野生资源稀缺,需要通过人工保育实现其资源的可持续利用。本文在对白及资源现状分析的基础上,探讨白及的迁地保育与回归保育的方案,制定白及的迁地保育与回归保育策略,促... 白及是我国珍稀名贵药用资源与工业原料,用途广泛,市场需求量大,野生资源稀缺,需要通过人工保育实现其资源的可持续利用。本文在对白及资源现状分析的基础上,探讨白及的迁地保育与回归保育的方案,制定白及的迁地保育与回归保育策略,促进白及产业的健康发展,也为其它珍稀濒危药用植物的保育研究提供实践参考。 展开更多
关键词 白及 种质资源 迁地保育 回归保育
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密花豆的保育学研究进展 被引量:3
15
作者 朱艳霞 林杨 +2 位作者 黄燕芬 秦双双 韦坤华 《中国现代中药》 CAS 2021年第9期1644-1648,共5页
鸡血藤为妇科要药,具有极高的药用价值,市场需求量大,野生资源稀缺。在对鸡血藤药材基原植物密花豆资源现状进行分析的基础上,综述了近年来其迁地保育和回归保育的方法,旨在促进鸡血藤产业健康发展并为其他珍稀濒危药用植物保育研究及... 鸡血藤为妇科要药,具有极高的药用价值,市场需求量大,野生资源稀缺。在对鸡血藤药材基原植物密花豆资源现状进行分析的基础上,综述了近年来其迁地保育和回归保育的方法,旨在促进鸡血藤产业健康发展并为其他珍稀濒危药用植物保育研究及实践提供参考。 展开更多
关键词 鸡血藤 种质资源 迁地保育 引种驯化 种苗繁育
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猫豆炭疽病病原分离与鉴定 被引量:2
16
作者 叶云峰 付岗 +3 位作者 刘威 蒋妮 刘丽辉 胡凤云 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期97-99,103,共4页
猫豆炭疽病主要危害猫豆的叶片、茎蔓和豆荚,导致猫豆品质和产量降低。本研究对猫豆炭疽病的病原进行分离和致病性测定,并通过形态学特征和ITS rDNA序列分析将该病原鉴定为胶孢炭疽菌[Colletotrichum gloeosporioides(Penz.)],该病原菌... 猫豆炭疽病主要危害猫豆的叶片、茎蔓和豆荚,导致猫豆品质和产量降低。本研究对猫豆炭疽病的病原进行分离和致病性测定,并通过形态学特征和ITS rDNA序列分析将该病原鉴定为胶孢炭疽菌[Colletotrichum gloeosporioides(Penz.)],该病原菌危害猫豆在国内为首次报道。 展开更多
关键词 猫豆 炭疽病 胶孢炭疽菌 病原鉴定
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菝葜全长转录组测序及分析 被引量:3
17
作者 秦双双 周鹏程 +6 位作者 胡营 杨晓男 梁莹 韦范 林杨 韦坤华 缪剑华 《中国现代中药》 CAS 2023年第7期1451-1462,共12页
目的:获得菝葜Smilax china L.全长转录组数据,深入挖掘其功能基因。方法:采用PacBio Sequel测序平台,分别提取菝葜根、茎、叶3个部位的RNA,将样品等量混合后进行全长转录组测序及分析。结果:共获得转录本122324个,N50长度为1400 nt,鸟... 目的:获得菝葜Smilax china L.全长转录组数据,深入挖掘其功能基因。方法:采用PacBio Sequel测序平台,分别提取菝葜根、茎、叶3个部位的RNA,将样品等量混合后进行全长转录组测序及分析。结果:共获得转录本122324个,N50长度为1400 nt,鸟嘌呤和胞嘧啶(GC)占比为45.32%,其中92878个(75.93%)转录本在七大数据库中注释。非冗余蛋白(NR)注释中,与菝葜最相近的物种是海枣Phoenix dactylifera L.,匹配程度达17.39%;真核生物相邻类的聚簇(KOG)数据库注释中,比对到一般功能预测的转录本最多,有17875个;基因本体(GO)数据库注释中,66001个转录本分布于生物学过程、细胞组成和分子功能三大类的45个功能组;京都基因与基因组百科全书(KEGG)注释中,参与菝葜生物合成和其他次生代谢转录本4286个,其中参与黄酮类化合物生物合成的转录本1478个、参与皂苷生物合成的转录本162个、参与芪类化合物生物合成的转录本4个、参与其他有机化合物合成的转录本2642个。在基因结构分析中,共得到64612个编码序列、2003个转录因子。此外,简单序列重复(SSR)分析表明,33118个SSR中最多的优势重复单元为腺嘌呤(A)G/C胸腺嘧啶(T),同时还预测到44580个长链非编码RNA和28229个mRNA。结论:获得了菝葜全长转录组数据,可为深入研究菝葜生长发育、相关代谢途径、胁迫响应及生物遗传多样性提供数据支持。 展开更多
关键词 菝葜 全长转录组 基因注释 基因结构
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木芙蓉的保育研究 被引量:2
18
作者 李林轩 范沾涛 +6 位作者 韦利月 杨立坚 梁莹 韦范 郭晓云 韦坤华 缪剑华 《中国现代中药》 CAS 2022年第3期412-418,共7页
木芙蓉为锦葵科木槿属落叶灌木或小乔木,是我国传统名花,栽培历史十分悠久,具有较高的观赏、药用价值。在对木芙蓉种质资源现状和生物学特性研究的基础上,探讨其迁地保育、回归保育及推广应用,旨在为木芙蓉保育实践及种质资源开发利用... 木芙蓉为锦葵科木槿属落叶灌木或小乔木,是我国传统名花,栽培历史十分悠久,具有较高的观赏、药用价值。在对木芙蓉种质资源现状和生物学特性研究的基础上,探讨其迁地保育、回归保育及推广应用,旨在为木芙蓉保育实践及种质资源开发利用提供参考。 展开更多
关键词 木芙蓉 种质资源 迁地保育 回归保育
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岗梅全长转录组测序及其三萜皂苷生物合成相关基因的挖掘 被引量:2
19
作者 韦筱媚 廖振锋 +4 位作者 胡营 唐美琼 梁莹 韦坤华 缪剑华 《中国现代中药》 CAS 2023年第7期1515-1528,共14页
目的:获得岗梅全长转录组数据库,为深入挖掘岗梅功能基因奠定基础。方法:采用基于PacBio Sequel平台的单分子实时测序技术获取岗梅的根、茎、叶样品的转录组数据,并利用非冗余蛋白(NR)、核苷酸序列(NT)、SwissProt蛋白序列数据库、京都... 目的:获得岗梅全长转录组数据库,为深入挖掘岗梅功能基因奠定基础。方法:采用基于PacBio Sequel平台的单分子实时测序技术获取岗梅的根、茎、叶样品的转录组数据,并利用非冗余蛋白(NR)、核苷酸序列(NT)、SwissProt蛋白序列数据库、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、真核生物相邻类的聚簇(KOG)、蛋白家族(Pfam)、基因本体(GO)进行注释,分析并鉴定编码三萜皂苷生物合成的关键酶的转录本。结果:全长转录组共获得89629个转录本,其中81313个在公共数据库进行了注释。KEEG代谢通路富集分析表明,623个转录本参与岗梅中三萜皂苷合成相关的3条代谢通路,其中263个转录本编码了三萜皂苷生物合成途径的21个关键酶。此外,还预测了2471个转录因子、40421个简单重复序列位点、22119个长链非编码RNA(lncRNA)和29131个mRNA。结论:丰富了岗梅的转录组数据,并为鉴定参与三萜皂苷和其他次生代谢物生物合成的候选基因提供参考,促进其分子生物学和基因组学的研究。 展开更多
关键词 岗梅 全长转录组 测序分析 功能注释 三萜皂苷生物合成
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基于非靶向代谢组学的蜘蛛香不同部位差异代谢物分析 被引量:2
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作者 胡营 俞巧玲 +3 位作者 郭晓云 韦筱媚 韦坤华 缪剑华 《中国现代中药》 CAS 2023年第7期1619-1626,共8页
目的:研究蜘蛛香不同部位的代谢物差异,促进蜘蛛香资源的综合利用。方法:利用非靶向代谢组学技术,对蜘蛛香的根茎、根和叶3个部位的代谢物进行差异性比较分析。结果:从蜘蛛香的根茎、根和叶中共鉴定出491个代谢物,主要代谢物有挥发油、... 目的:研究蜘蛛香不同部位的代谢物差异,促进蜘蛛香资源的综合利用。方法:利用非靶向代谢组学技术,对蜘蛛香的根茎、根和叶3个部位的代谢物进行差异性比较分析。结果:从蜘蛛香的根茎、根和叶中共鉴定出491个代谢物,主要代谢物有挥发油、多糖、氨基酸等。蜘蛛香根茎、根和叶中的代谢物差异显著,根与叶、根茎与叶、根与根茎之间的差异代谢物分别为145、109、122个,根茎和叶中含莪术烯醇、4-羟基肉桂酸、芥子酸胆碱、5-羟基-1-四氢萘酮、4-乙基苯甲醛、松脂醇4-O-β-D-吡喃葡萄糖苷和5-胸苷酸二钠盐较少,而根中较多;根和根茎中含茶碱、芹菜素和阿尔泊酚酸较少,而叶中较多。根茎、根和叶的差异代谢物主要富集在类苯丙酸生物合成通路,氨酰tRNA生物合成通路和丙氨酸、天冬氨酸与谷氨酸代谢通路。结论:蜘蛛香的根茎、根和叶中含有挥发油、多糖、氨基酸等大量的差异代谢物,研究结果可为蜘蛛香不同部位关键代谢物的挖掘和充分利用提供参考。 展开更多
关键词 蜘蛛香 非靶向代谢组学 差异代谢物 通路分析
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