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基于WGS构建葡萄高密度遗传图谱及抗炭疽病QTL定位
1
作者 潘凤英 曲俊杰 +4 位作者 黄羽 韦荣福 郭泽西 尹玲 孙大运 《中外葡萄与葡萄酒》 北大核心 2024年第3期30-37,共8页
葡萄炭疽病是一种危害葡萄成熟果实的真菌病害,严重影响葡萄的产量和品质。美洲种葡萄具有适应南方湿热气候且高抗炭疽病的特点,因此构建美洲葡萄高密度分子遗传图谱,定位其抗炭疽病QTL,利用其中的抗病基因指导葡萄抗病育种具有重要意... 葡萄炭疽病是一种危害葡萄成熟果实的真菌病害,严重影响葡萄的产量和品质。美洲种葡萄具有适应南方湿热气候且高抗炭疽病的特点,因此构建美洲葡萄高密度分子遗传图谱,定位其抗炭疽病QTL,利用其中的抗病基因指导葡萄抗病育种具有重要意义。本研究以美洲葡萄‘C30-5-1’165株自交后代为作图群体,基于全基因组测序(WGS)开发SNP标记,构建遗传图谱,并对葡萄抗炭疽病QTL进行分析。构建的葡萄分子遗传图谱总遗传距离为3138.74 cM,相邻标记间平均遗传距离为0.98 cM,分布均匀。根据群体炭疽病抗性表型数据,在11号连锁群上检测到1个炭疽病抗性相关QTL,命名为Cgr2,可解释表型变异5.0%,是一个微效QTL。与葡萄参考基因组比对分析发现,该QTL区域包含2个候选抗性基因,分别编码UDP糖基转移酶和类黄酮3’-单加氧酶,它们可能对葡萄炭疽病抗性起重要作用。 展开更多
关键词 葡萄 遗传图谱 抗炭疽病 QTL定位
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基于GC-MS分析红皮龙眼和四季蜜龙眼果肉挥发性成分差异
2
作者 易晨歆 卿昊炜 +6 位作者 黎明 石雨雨 桂秋林 郭慧勤 彭宏祥 丁峰 张树伟 《中国南方果树》 北大核心 2025年第2期6-12,共7页
鉴定和分析红皮龙眼和四季蜜龙眼果肉挥发性成分可为龙眼育种、品质改良和产品开发提供参考。采用顶空固相微萃取—气相色谱质谱联用技术(HS-SPME-GC-MS),检测红皮龙眼和四季蜜龙眼果肉挥发性成分,并通过主成分分析、正交偏最小二乘法... 鉴定和分析红皮龙眼和四季蜜龙眼果肉挥发性成分可为龙眼育种、品质改良和产品开发提供参考。采用顶空固相微萃取—气相色谱质谱联用技术(HS-SPME-GC-MS),检测红皮龙眼和四季蜜龙眼果肉挥发性成分,并通过主成分分析、正交偏最小二乘法判别分析,以变量重要性投影(VIP)≥1,p<0.05,差异倍数≥2或≤0.5为基准,筛选差异代谢物,分析比较差异成分。结果表明,红皮龙眼和四季蜜龙眼共检测出挥发性成分76种,包括酯类27种、烷烃类13种、芳烃类10种,萜类8种,酮类5种,醛类3种,醇类、酚类、烯烃类和杂环化合物各2种,胺类和酸类各1种,其中红皮龙眼中检测出挥发性成分75种,四季蜜龙眼中检测出62种,选到差异成分44种;其中酮类中1-(2-羟基-5-甲基苯基)-乙酮仅在四季蜜龙眼中检测到,甲基丁香酚、丁酸甲酯、3-羟基丁酸乙酯、月桂酸乙酯、十四烷酸甲酯、十四烷酸乙酯、乙酸正丙酯、3,4-二甲基苯甲酸甲酯、十八酸乙酯、新松香二烯、3-羟基-3-甲基-丁酸、3-(4-异丙基苯基)-2-甲基丙醇、异榄香素、(E)-茴香脑等14种仅在红皮龙眼中检测到。红皮龙眼和四季蜜龙眼酯类挥发性成分种类最多,红皮龙眼的特有挥发性成分多达14种,四季蜜龙眼的特有挥发性种类仅1种,品种间差异较大。 展开更多
关键词 红皮龙眼 四季蜜龙眼 果肉 香气 气相色谱质谱联用技术(GC-MS)
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龙眼MYB14的生物信息学分析及其基因表达载体构建
3
作者 李浩然 丁峰 +9 位作者 张树伟 彭宏祥 潘介春 何新华 王颖 李琳 王金英 黄幸 谭春露 徐炯志 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期929-936,共8页
【目的】克隆龙眼MYB-related基因家族中MYB14基因,并对其进行生物信息学分析和基因表达载体的构建,为进一步研究该基因的生物学功能提供基础数据。【方法】通过转录组测序及生物信息学分析得到龙眼MYB14基因全长序列,进一步设计特异引... 【目的】克隆龙眼MYB-related基因家族中MYB14基因,并对其进行生物信息学分析和基因表达载体的构建,为进一步研究该基因的生物学功能提供基础数据。【方法】通过转录组测序及生物信息学分析得到龙眼MYB14基因全长序列,进一步设计特异引物对其开放阅读框(ORF)全长序列进行克隆和生物信息学分析,同时构建超表达载体。【结果】MYB14基因属于MYB-related家族的TBP-like亚家族,ORF长度831 bp,编码276个氨基酸,有一个MYB结合位点。该蛋白属于非跨膜亲水蛋白,亚细胞定位预测定位于细胞质,存在57个氨基酸磷酸化位点。其二级结构主要由无规则卷曲以及α-螺旋构成,二级结构与三级结构预测结果高度一致,同源基因进化树分析表明该基因与大麻亲缘关系最近,同时成功构建了植物超表达载体pBI121-MYB14。【结论】本研究克隆得到了龙眼MYB14基因,成功构建表达载体pBI121-MYB14,为该基因功能的研究奠定了坚实的基础。 展开更多
关键词 龙眼 MYB-related 基因克隆 表达载体构建
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荔枝、龙眼育种研究进展 被引量：4
4
作者 卿昊炜 黎明 +4 位作者 易晨歆 张树伟 郭慧勤 彭宏祥 丁峰 《中国南方果树》 北大核心 2024年第3期1-6,15,共7页
我国是荔枝、龙眼原产国,荔枝、龙眼栽培历史悠久,野生荔枝、龙眼资源丰富.随着社会的发展,原有的荔枝、龙眼品种难以满足市场需求,选育符合市场需求的优良品种是荔枝、龙眼产业发展的迫切要求.本文综述了不同育种方法,即常规实生育种... 我国是荔枝、龙眼原产国,荔枝、龙眼栽培历史悠久,野生荔枝、龙眼资源丰富.随着社会的发展,原有的荔枝、龙眼品种难以满足市场需求,选育符合市场需求的优良品种是荔枝、龙眼产业发展的迫切要求.本文综述了不同育种方法,即常规实生育种、杂交育种、分子标记辅助育种和生物技术育种运用于荔枝、龙眼的情况,并对今后荔枝、龙眼的育种发展进行了展望. 展开更多
关键词 荔枝 龙眼 常规育种 杂交育种 分子标记辅助育种 生物技术育种
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荔枝转录因子LcZAT 12的克隆与表达分析
5
作者 卿昊炜 张树伟 +9 位作者 莫啸 易晨歆 郭慧勤 韦金菊 吴子昂 徐炯志 贾海锋 邱海吉 张艳青 丁峰 《中国南方果树》 北大核心 2024年第6期1-11,共11页
为探究LcZAT12在荔枝果实发育成熟中的作用,以禾荔及禾荔晚熟芽变突变株MS1、MS2作为试材,克隆出LcZAT12全长序列,并对其进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量技术分析LcZAT12在荔枝不同组织及在果实不同发育时期中果皮和种子中的表... 为探究LcZAT12在荔枝果实发育成熟中的作用,以禾荔及禾荔晚熟芽变突变株MS1、MS2作为试材,克隆出LcZAT12全长序列,并对其进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量技术分析LcZAT12在荔枝不同组织及在果实不同发育时期中果皮和种子中的表达模式。结果表明,LcZAT12全长429 bp,编码氨基酸142个;利用在线网站对LcZAT12的蛋白性质进行预测显示,该蛋白位于细胞核,磷酸化以丝氨酸为主,无信号肽与跨膜结构域,蛋白质二级结构以α螺旋和不规则卷曲为主。氨基酸同源序列比对结果显示,LcZAT蛋白含有两个高度保守的结构域;系统进化树分析发现,LcZAT12蛋白与糖槭和漾濞槭的同源蛋白亲缘关系最近;时空表达模式表明,LcZAT12蛋白可能在荔枝果实发育期起关键作用。 展开更多
关键词 荔枝 LcZAT12转录因子 生物信息学 表达量 果实发育
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一种高效荔枝杂交育种隔离授粉方法及应用 被引量：1
6
作者 丁峰 张树伟 +5 位作者 卢江 彭宏祥 秦献泉 李鸿莉 朱建华 彭浩绵 《中国热带农业》 2017年第2期66-69,共4页
在荔枝品种的选育方法中,人工杂交育种方法非常重要。然而传统的荔枝杂交育种授粉方法工作量大,费工费时,缺点多。本研究根据荔枝雌雄异花同株和同一株树雌雄花不同时间分批开放以及主要靠虫媒授粉的特点,设计了荔枝杂交育种花粉隔离防... 在荔枝品种的选育方法中,人工杂交育种方法非常重要。然而传统的荔枝杂交育种授粉方法工作量大,费工费时,缺点多。本研究根据荔枝雌雄异花同株和同一株树雌雄花不同时间分批开放以及主要靠虫媒授粉的特点,设计了荔枝杂交育种花粉隔离防护网罩取代人工套袋隔离花粉的方法,可显著节省人力物力,大大提高荔枝杂交授粉工作效率,同时还具有防病虫害的作用。 展开更多
关键词 荔枝 杂交育种 授粉 花粉隔离防护网罩
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植物非特异性磷脂酶C的研究进展 被引量：3
7
作者 帅良 孙健 +4 位作者 段振华 李丽 何雪梅 李昌宝 廖玲燕 《江苏农业科学》 2019年第18期30-37,共8页
非特异性磷脂酶C(non-specific PLC,NPC)能够水解磷脂酸胆碱和磷脂酰乙醇胺生成二酰基甘油(diacylglycerol,DAG),虽然非特异性磷脂酶C没有PLC家族基因的C2、X、Y、EF等结构域,但它仍含有1个磷酸酯酶结构域,能够水解磷脂。近年来研究发现... 非特异性磷脂酶C(non-specific PLC,NPC)能够水解磷脂酸胆碱和磷脂酰乙醇胺生成二酰基甘油(diacylglycerol,DAG),虽然非特异性磷脂酶C没有PLC家族基因的C2、X、Y、EF等结构域,但它仍含有1个磷酸酯酶结构域,能够水解磷脂。近年来研究发现,非特异性磷脂酶C在植物逆境胁迫和信号转导的过程中起着重要的调节作用。因此本文对非特异性磷脂酶C的结构、生理功能及其作用机制进行概述,并对其研究前景进行了展望。 展开更多
关键词 非特异性磷脂酶C 二酰基甘油 逆境胁迫 信号转导
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特早熟龙眼新品种“桂丰早”选育及区域引种试验 被引量：2
8
作者 谭春露 丁峰 +9 位作者 邓英毅 张树伟 刘一 陈贞洁 石雨雨 盘玉璐 潘介春 卢美英 徐炯志 彭宏祥 《中国南方果树》 北大核心 2023年第1期57-63,共7页
对新发现的特早熟龙眼实生变异单株“桂丰早”,采用主栽品种“石硖”“储良”作为对照品种进行SCoT分子标记鉴定,并在广西南宁、大新、龙州、钦州和广东茂名、湛江等不同产区布置开展区域引种试验。通过连续4年多点种植观察和分析测试,... 对新发现的特早熟龙眼实生变异单株“桂丰早”,采用主栽品种“石硖”“储良”作为对照品种进行SCoT分子标记鉴定,并在广西南宁、大新、龙州、钦州和广东茂名、湛江等不同产区布置开展区域引种试验。通过连续4年多点种植观察和分析测试,结果表明:“桂丰早”龙眼与“石硖”“储良”对比,在植物学性状、生长结果习性、SCoT分子标记不同引物扩增带均具有明显的差异;“桂丰早”龙眼适应性强,在各地均表现特早熟性状稳定,不同年份不同产区均比同一果园的“石硖”早熟7~15 d,且早结性、丰产性强,果大质优,综合性状优良,认为“桂丰早”适合我国龙眼主产区推广种植,以期缓解目前我国龙眼品种结构不合理、熟期过于集中、效益不好等严重制约产业发展的瓶颈问题。“桂丰早”于2021年12月30日获植物新品种授权命名。 展开更多
关键词 龙眼 桂丰早 特早熟 区试 SCoT分子标记
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龙眼DlTRF2-like的克隆及表达模式分析
9
作者 李浩然 张树伟 +8 位作者 王金英 黄小雄 彭宏祥 徐炯志 潘介春 朱建华 谭春露 李平 丁峰 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第12期3471-3476,共6页
以龙眼成熟叶片为材料,克隆龙眼MYB-related基因家族TRF2-like基因,命名为DlTRF2-like,并对其进行生物信息学和表达模式分析。DlTRF2-like基因属于MYB-related家族的TRF-like亚家族,ORF长度是909 bp,编码含有302个氨基酸残基的蛋白,预... 以龙眼成熟叶片为材料,克隆龙眼MYB-related基因家族TRF2-like基因,命名为DlTRF2-like,并对其进行生物信息学和表达模式分析。DlTRF2-like基因属于MYB-related家族的TRF-like亚家族,ORF长度是909 bp,编码含有302个氨基酸残基的蛋白,预测该基因定位于细胞核,同源基因进化分析表明龙眼DlTRF2-like与阿月浑子PvTRF2-like亲缘关系最近。利用实时荧光定量PCR检测DlTRF2-like基因在‘四季蜜’龙眼不同组织及乙烯利和多效唑处理后不同时间的相对表达量。结果表明:DlTRF2-like在龙眼不同组织中均有表达,在花芽中表达量最高;乙烯利和多效唑处理后,DlTRF2-like基因的表达量明显高于对照,推测DlTRF2-like响应乙烯利和多效唑信号促进龙眼成花。 展开更多
关键词 龙眼 MYB-related 龙眼成花 TRF-like亚家族 表达模式分析
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