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广西不同地区克氏原螯虾群体遗传多样性微卫星分析
被引量：
14
1
作者
黄小芳
唐章生
+6 位作者
刘俊丹
张宏燕
钟一治
卢智发
侯树鉴
王大鹏
陆专灵
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期437-444,共8页
【目的】了解当前广西克氏原螯虾(Procambarus clarkii)群体的遗传背景,为其人工养殖及种质资源保护提供参考依据。【方法】选取广西5个地区(南宁、大塘、融水、柳州和来宾)的克氏原螯虾群体作为研究对象,利用8对微卫星引物对各克氏原...
【目的】了解当前广西克氏原螯虾(Procambarus clarkii)群体的遗传背景,为其人工养殖及种质资源保护提供参考依据。【方法】选取广西5个地区(南宁、大塘、融水、柳州和来宾)的克氏原螯虾群体作为研究对象,利用8对微卫星引物对各克氏原螯虾群体基因组DNA进行PCR检测,然后通过PopGene32和NTSYSpc 2.1等在线软件分析广西克氏原螯虾群体的遗传多样性。【结果】南宁(NN)、大塘(DT)、融水(RS)、柳州(LZ)和来宾(LB)5个克氏原螯虾群体的平均有效等位基因数(Ne)为2.5142~3.0574,平均期望杂合度(He)为0.5708~0.6489,平均多态信息含量(PIC)为0.4899~0.5843,存在中度至高度的遗传多样性,其中南宁群体和大塘群体的遗传多样性略低于融水群体、柳州群体和来宾群体。5个克氏原螯虾群体的平衡偏离指数(D)均为负值,且发生一定程度的Hardy-Weinberg平衡偏离,杂合子缺失现象普遍存在。5个克氏原螯虾群体间的基因流(Nm)为2.3898~6.0284,遗传分化指数(Fst)为0.0398~0.0947,表明各群体间存在广泛的基因交流,仅存在低度至中度的遗传分化;各克氏原螯虾群体间的遗传相似系数和遗传距离分别为0.6861~0.8583和0.1528~0.3768,其中,遗传距离趋势与Fst趋势一致,而遗传相似系数与Nm趋势一致,均表明柳州群体与来宾群体具有高度的相似性,遗传距离较近。UPGMA聚类分析结果也显示,南宁群体和大塘群体聚类为一支,而柳州群体先与来宾群体聚类再与融水群体聚类成另一支。【结论】广西不同地区克氏原螯虾群体具有一定的遗传多样性,但其杂合子缺失现象普遍存在,应通过适当引种及加强不同地区群体间的遗传交流,保护好克氏原螯虾的优良种质资源。
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关键词
克氏原螯虾
遗传多样性
微卫星位点
杂合子缺失
广西
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题名
广西不同地区克氏原螯虾群体遗传多样性微卫星分析
被引量：
14
1
作者
黄小芳
唐章生
刘俊丹
张宏燕
钟一治
卢智发
侯树鉴
王大鹏
陆专灵
机构
广西
水产科学
研
究院/
广西
水产遗传育种与健康养殖重点实验室
广西
大学动物科学
技术
学院/亚热带农业
生物
资源保护与利用国家重点实验室
广西南宁研乐上生物技术有限公司
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期437-444,共8页
基金
广西创新驱动发展专项(桂科AA17204094-6,桂科AA17204095-4)
广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室自主研究项目(18-A-04-07)。
文摘
【目的】了解当前广西克氏原螯虾(Procambarus clarkii)群体的遗传背景,为其人工养殖及种质资源保护提供参考依据。【方法】选取广西5个地区(南宁、大塘、融水、柳州和来宾)的克氏原螯虾群体作为研究对象,利用8对微卫星引物对各克氏原螯虾群体基因组DNA进行PCR检测,然后通过PopGene32和NTSYSpc 2.1等在线软件分析广西克氏原螯虾群体的遗传多样性。【结果】南宁(NN)、大塘(DT)、融水(RS)、柳州(LZ)和来宾(LB)5个克氏原螯虾群体的平均有效等位基因数(Ne)为2.5142~3.0574,平均期望杂合度(He)为0.5708~0.6489,平均多态信息含量(PIC)为0.4899~0.5843,存在中度至高度的遗传多样性,其中南宁群体和大塘群体的遗传多样性略低于融水群体、柳州群体和来宾群体。5个克氏原螯虾群体的平衡偏离指数(D)均为负值,且发生一定程度的Hardy-Weinberg平衡偏离,杂合子缺失现象普遍存在。5个克氏原螯虾群体间的基因流(Nm)为2.3898~6.0284,遗传分化指数(Fst)为0.0398~0.0947,表明各群体间存在广泛的基因交流,仅存在低度至中度的遗传分化;各克氏原螯虾群体间的遗传相似系数和遗传距离分别为0.6861~0.8583和0.1528~0.3768,其中,遗传距离趋势与Fst趋势一致,而遗传相似系数与Nm趋势一致,均表明柳州群体与来宾群体具有高度的相似性,遗传距离较近。UPGMA聚类分析结果也显示,南宁群体和大塘群体聚类为一支,而柳州群体先与来宾群体聚类再与融水群体聚类成另一支。【结论】广西不同地区克氏原螯虾群体具有一定的遗传多样性,但其杂合子缺失现象普遍存在,应通过适当引种及加强不同地区群体间的遗传交流,保护好克氏原螯虾的优良种质资源。
关键词
克氏原螯虾
遗传多样性
微卫星位点
杂合子缺失
广西
Keywords
Procambarus clarkia
genetic diversity
microsatellite loci
heterozygote deletion
Guangxi
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
广西不同地区克氏原螯虾群体遗传多样性微卫星分析
黄小芳
唐章生
刘俊丹
张宏燕
钟一治
卢智发
侯树鉴
王大鹏
陆专灵
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
14
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