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基于生物信息学筛选肝脏缺血-再灌注损伤泛凋亡关键基因
被引量:
2
1
作者
朱丽容
郭乾
+7 位作者
杨洁
张秋雯
何贵柠
虞燕青
文宁
董建辉
李海滨
孙煦勇
《器官移植》
北大核心
2025年第1期106-113,共8页
目的探讨泛凋亡与肝脏缺血-再灌注损伤(HIRI)之间的关系,筛选HIRI的泛凋亡关键基因。方法通过基因表达综合数据库和GeneCards数据库获得泛凋亡相关差异表达基因(PDG)。通过基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)以及基因集富集...
目的探讨泛凋亡与肝脏缺血-再灌注损伤(HIRI)之间的关系,筛选HIRI的泛凋亡关键基因。方法通过基因表达综合数据库和GeneCards数据库获得泛凋亡相关差异表达基因(PDG)。通过基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)以及基因集富集分析(GSEA)探索PDG相关的生物学途径。构建蛋白质相互作用网络。筛选关键基因,评估关键基因的诊断价值,并在HIRI小鼠中进行验证。基于转录样本中不同细胞类型相对丰度算法进行免疫细胞浸润分析。结果经筛选共获得16个PDG。GO结果显示,PDG与细胞代谢密切相关;KEGG结果显示,PDG主要富集在细胞凋亡等细胞死亡途径以及肿瘤坏死因子信号通路等免疫相关信号通路;GSEA结果显示,关键基因主要富集在丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路等免疫相关信号通路。筛选出DFFB和TNFSF102个关键基因,其在诊断HIRI方面准确度高,曲线下面积分别为0.964、1.000。免疫浸润分析结果显示,对照组静息自然杀伤细胞、M2型巨噬细胞等浸润较多,HIRI组M0型巨噬细胞、中性粒细胞、初始细胞等浸润较多。实时荧光定量聚合酶链反应结果显示,与Sham组比较,HIRI组小鼠肝组织DFFB信使RNA相对表达量增加,TNFSF10信使RNA相对表达量降低。Cibersort分析结果显示,初始B细胞浸润丰度与DFFB表达呈正相关(r=0.70,P=0.035),M2型巨噬细胞浸润丰度与TNFSF10表达呈正相关(r=0.68,P=0.045)。结论泛凋亡相关基因DFFB和TNFSF10可能是HIRI潜在的生物标志物和治疗靶点。
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关键词
肝移植
缺血-再灌注损伤
泛凋亡
生物信息学
免疫微环境
治疗靶点
DFFB
TNFSF10
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职称材料
中国老年人骨质疏松症患病率的Meta分析
被引量:
91
2
作者
朱洁云
高敏
+4 位作者
宋秋韵
吉攀
李红园
钟枝梅
沈印
《中国全科医学》
CAS
北大核心
2022年第3期346-353,共8页
背景骨质疏松症(OP)的患病率高,且其患病率随着年龄的增长而逐渐增加,OP及其引起的骨折给患者家庭及社会造成沉重的经济负担,防治OP刻不容缓。了解我国OP的患病情况是开展OP防控工作的前提。目的通过Meta分析了解中国老年人OP的患病情...
背景骨质疏松症(OP)的患病率高,且其患病率随着年龄的增长而逐渐增加,OP及其引起的骨折给患者家庭及社会造成沉重的经济负担,防治OP刻不容缓。了解我国OP的患病情况是开展OP防控工作的前提。目的通过Meta分析了解中国老年人OP的患病情况。方法计算机检索PubMed、中国知网(CNKI)、万方数据知识服务平台和维普网(VIP)中关于中国老年人OP患病率相关的横断面研究,检索时限为2000-01-01至2021-03-20。提取数据并评价纳入研究的文献质量,采用Stata 12.0软件进行Meta分析。结果共纳入48篇横断面研究,包含68932例研究对象。Meta分析结果显示,中国≥60岁老年人OP患病率为37.7%〔95%CI(33.8%,41.7%)〕。亚组分析结果显示,2000—2009年中国≥60岁老年人OP患病率为39.6%〔95%CI(33.4%,45.9%)〕,2010—2020年为35.9%〔95%CI(31.1%,40.8%)〕;中国南方地区≥60岁老年人OP患病率为39.7%〔95%CI(34.0%,45.5%)〕,中国北方地区为35.7%〔95%CI(30.1%,41.2%)〕;中国男性≥60岁老年人OP患病率为27.3%〔95%CI(23.9%,30.7%)〕,中国女性为48.4%〔95%CI(42.7%,54.1%)〕;中国60~69岁老年人OP患病率为32.2%〔95%CI(28.6%,35.7%)〕,70~79岁老年人为41.9%〔95%CI(36.9%,46.9%)〕,≥80岁老年人为51.8%〔95%CI(43.9%,59.7%)〕。结论当前证据表明,中国老年人OP患病率为37.7%,且随着年龄的增长逐渐上升。
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关键词
骨质疏松
老年人
患病率
中国
META分析
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职称材料
单核细胞/高密度脂蛋白胆固醇比值诊断高血压并发无症状脑梗死的价值
被引量:
15
3
作者
梁明月
赵会民
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2019年第16期2645-2648,共4页
目的研究单核细胞/高密度脂蛋白胆固醇比值(monocyte/HDL-C ratio,MHR)与高血压并发无症状脑梗死(asymptomatic cerebral infarction,ACI)的影响,分析其应用于诊断的价值。方法回顾性分析2015年1月至2018年3月在广西医科大学第一附属医...
目的研究单核细胞/高密度脂蛋白胆固醇比值(monocyte/HDL-C ratio,MHR)与高血压并发无症状脑梗死(asymptomatic cerebral infarction,ACI)的影响,分析其应用于诊断的价值。方法回顾性分析2015年1月至2018年3月在广西医科大学第一附属医院高血压病区住院的349例高血压患者,根据头颅CT或MRI检查结果,分为高血压并发ACI组138例(ACI组),未并发ACI组211例(NACI组)。收集血常规、血脂、肾功能、颈动脉超声等检验检查结果,用Logistic回归分析高血压患者发生ACI的影响因素,并采用受试者工作特征(ROC)曲线评估高血压患者中各影响因素预测ACI的能力。结果两组患者的年龄、男性比例、高血压病程、颈动脉斑块比例、吸烟比例、饮酒比例、白细胞、中性粒细胞、单核细胞、MHR、血肌酐、总胆固醇及高密度脂蛋白胆固醇比较,差异有统计学意义(P<0.05)。Logistic回归分析结果显示,年龄增加、颈动脉斑块形成、MHR及血肌酐升高是高血压并发ACI的独立危险因素(P<0.05)。MHR、年龄、血肌酐及颈动脉斑块的ROC曲线下面积分别为0.76、0.69、0.65及0.655(P<0.001),其中MHR的预测价值最高,当分界值取10.29时,敏感度和特异度分别为70.3%和63.0%。结论MHR与高血压并发ACI密切相关,是高血压发生ACI的独立危险因素之一,可以作为风险筛查参考指标。
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关键词
单核细胞
高密度脂蛋白胆固醇
高血压
无症状脑梗死
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职称材料
题名
基于生物信息学筛选肝脏缺血-再灌注损伤泛凋亡关键基因
被引量:
2
1
作者
朱丽容
郭乾
杨洁
张秋雯
何贵柠
虞燕青
文宁
董建辉
李海滨
孙煦勇
机构
广西医科大学
基础
医学
院免疫学教研室
广西医科大学
第二
附属
医院
移植
医学
研究所、
广西
器官移植临床
医学
研究中心、
广西
器官捐献与移植研究重点实验室
广西医科大学第二附属医院全科医学科
广西医科大学
第二
附属
医院
临床
医学
研究中心
出处
《器官移植》
北大核心
2025年第1期106-113,共8页
基金
广西重点研发计划项目(桂科AB24010059)
广西自然科学基金区域高发疾病研究联合专项资助项目(2023GXNSFAA026142)。
文摘
目的探讨泛凋亡与肝脏缺血-再灌注损伤(HIRI)之间的关系,筛选HIRI的泛凋亡关键基因。方法通过基因表达综合数据库和GeneCards数据库获得泛凋亡相关差异表达基因(PDG)。通过基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)以及基因集富集分析(GSEA)探索PDG相关的生物学途径。构建蛋白质相互作用网络。筛选关键基因,评估关键基因的诊断价值,并在HIRI小鼠中进行验证。基于转录样本中不同细胞类型相对丰度算法进行免疫细胞浸润分析。结果经筛选共获得16个PDG。GO结果显示,PDG与细胞代谢密切相关;KEGG结果显示,PDG主要富集在细胞凋亡等细胞死亡途径以及肿瘤坏死因子信号通路等免疫相关信号通路;GSEA结果显示,关键基因主要富集在丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路等免疫相关信号通路。筛选出DFFB和TNFSF102个关键基因,其在诊断HIRI方面准确度高,曲线下面积分别为0.964、1.000。免疫浸润分析结果显示,对照组静息自然杀伤细胞、M2型巨噬细胞等浸润较多,HIRI组M0型巨噬细胞、中性粒细胞、初始细胞等浸润较多。实时荧光定量聚合酶链反应结果显示,与Sham组比较,HIRI组小鼠肝组织DFFB信使RNA相对表达量增加,TNFSF10信使RNA相对表达量降低。Cibersort分析结果显示,初始B细胞浸润丰度与DFFB表达呈正相关(r=0.70,P=0.035),M2型巨噬细胞浸润丰度与TNFSF10表达呈正相关(r=0.68,P=0.045)。结论泛凋亡相关基因DFFB和TNFSF10可能是HIRI潜在的生物标志物和治疗靶点。
关键词
肝移植
缺血-再灌注损伤
泛凋亡
生物信息学
免疫微环境
治疗靶点
DFFB
TNFSF10
Keywords
Liver transplantation
Ischemia-reperfusion injury
PANoptosis
Bioinformatics
Immune microenvironment
Therapeutic target
DFFB
TNFSF10
分类号
R617 [医药卫生—外科学]
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职称材料
题名
中国老年人骨质疏松症患病率的Meta分析
被引量:
91
2
作者
朱洁云
高敏
宋秋韵
吉攀
李红园
钟枝梅
沈印
机构
广西
壮族自治区人民
医院
国际医疗部
广西医科大学第二附属医院全科医学科
出处
《中国全科医学》
CAS
北大核心
2022年第3期346-353,共8页
文摘
背景骨质疏松症(OP)的患病率高,且其患病率随着年龄的增长而逐渐增加,OP及其引起的骨折给患者家庭及社会造成沉重的经济负担,防治OP刻不容缓。了解我国OP的患病情况是开展OP防控工作的前提。目的通过Meta分析了解中国老年人OP的患病情况。方法计算机检索PubMed、中国知网(CNKI)、万方数据知识服务平台和维普网(VIP)中关于中国老年人OP患病率相关的横断面研究,检索时限为2000-01-01至2021-03-20。提取数据并评价纳入研究的文献质量,采用Stata 12.0软件进行Meta分析。结果共纳入48篇横断面研究,包含68932例研究对象。Meta分析结果显示,中国≥60岁老年人OP患病率为37.7%〔95%CI(33.8%,41.7%)〕。亚组分析结果显示,2000—2009年中国≥60岁老年人OP患病率为39.6%〔95%CI(33.4%,45.9%)〕,2010—2020年为35.9%〔95%CI(31.1%,40.8%)〕;中国南方地区≥60岁老年人OP患病率为39.7%〔95%CI(34.0%,45.5%)〕,中国北方地区为35.7%〔95%CI(30.1%,41.2%)〕;中国男性≥60岁老年人OP患病率为27.3%〔95%CI(23.9%,30.7%)〕,中国女性为48.4%〔95%CI(42.7%,54.1%)〕;中国60~69岁老年人OP患病率为32.2%〔95%CI(28.6%,35.7%)〕,70~79岁老年人为41.9%〔95%CI(36.9%,46.9%)〕,≥80岁老年人为51.8%〔95%CI(43.9%,59.7%)〕。结论当前证据表明,中国老年人OP患病率为37.7%,且随着年龄的增长逐渐上升。
关键词
骨质疏松
老年人
患病率
中国
META分析
Keywords
Osteoporosis
Aged
Prevalence
China
Meta-analysis
分类号
R681 [医药卫生—骨科学]
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职称材料
题名
单核细胞/高密度脂蛋白胆固醇比值诊断高血压并发无症状脑梗死的价值
被引量:
15
3
作者
梁明月
赵会民
机构
广西医科大学第二附属医院全科医学科
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2019年第16期2645-2648,共4页
文摘
目的研究单核细胞/高密度脂蛋白胆固醇比值(monocyte/HDL-C ratio,MHR)与高血压并发无症状脑梗死(asymptomatic cerebral infarction,ACI)的影响,分析其应用于诊断的价值。方法回顾性分析2015年1月至2018年3月在广西医科大学第一附属医院高血压病区住院的349例高血压患者,根据头颅CT或MRI检查结果,分为高血压并发ACI组138例(ACI组),未并发ACI组211例(NACI组)。收集血常规、血脂、肾功能、颈动脉超声等检验检查结果,用Logistic回归分析高血压患者发生ACI的影响因素,并采用受试者工作特征(ROC)曲线评估高血压患者中各影响因素预测ACI的能力。结果两组患者的年龄、男性比例、高血压病程、颈动脉斑块比例、吸烟比例、饮酒比例、白细胞、中性粒细胞、单核细胞、MHR、血肌酐、总胆固醇及高密度脂蛋白胆固醇比较,差异有统计学意义(P<0.05)。Logistic回归分析结果显示,年龄增加、颈动脉斑块形成、MHR及血肌酐升高是高血压并发ACI的独立危险因素(P<0.05)。MHR、年龄、血肌酐及颈动脉斑块的ROC曲线下面积分别为0.76、0.69、0.65及0.655(P<0.001),其中MHR的预测价值最高,当分界值取10.29时,敏感度和特异度分别为70.3%和63.0%。结论MHR与高血压并发ACI密切相关,是高血压发生ACI的独立危险因素之一,可以作为风险筛查参考指标。
关键词
单核细胞
高密度脂蛋白胆固醇
高血压
无症状脑梗死
Keywords
monocyte
HDL-C
hypertension
asymptomatic cerebral infarction
分类号
R544.1 [医药卫生—心血管疾病]
R743.3 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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1
基于生物信息学筛选肝脏缺血-再灌注损伤泛凋亡关键基因
朱丽容
郭乾
杨洁
张秋雯
何贵柠
虞燕青
文宁
董建辉
李海滨
孙煦勇
《器官移植》
北大核心
2025
2
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职称材料
2
中国老年人骨质疏松症患病率的Meta分析
朱洁云
高敏
宋秋韵
吉攀
李红园
钟枝梅
沈印
《中国全科医学》
CAS
北大核心
2022
91
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3
单核细胞/高密度脂蛋白胆固醇比值诊断高血压并发无症状脑梗死的价值
梁明月
赵会民
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2019
15
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