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35份甘蔗种质的遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
被引量:
10
1
作者
庞新华
檀小辉
+6 位作者
韦丽君
梁芳
张继
吕平
程琴
黄秋伟
周全光
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期1157-1164,共8页
【目的】利用SRAP分子标记分析35份甘蔗种质的遗传多样性,并构建其DNA指纹图谱,为甘蔗种质资源的分子鉴定提供技术支持。【方法】以凉蔗系列(26份)为主的35个甘蔗品种(系)为供试材料,利用SRAP分子标记的8条正向引物和14条反向引物随机组...
【目的】利用SRAP分子标记分析35份甘蔗种质的遗传多样性,并构建其DNA指纹图谱,为甘蔗种质资源的分子鉴定提供技术支持。【方法】以凉蔗系列(26份)为主的35个甘蔗品种(系)为供试材料,利用SRAP分子标记的8条正向引物和14条反向引物随机组成112对引物组合,从中筛选出核心引物对35份甘蔗材料进行遗传多样性分析,并利用POPGENE 1.32计算各材料间的Nei’s遗传相似系数,使用Ntsyspc 2.1 UPGMA方法进行聚类分析,并构建DNA指纹图谱。【结果】从112对引物组合中筛选出4对核心引物组合(Me3/Em8、Me4/Em8、Me5/Em8和Me6/Em2),利用其从35份甘蔗材料中共扩增出102条条带,平均每对引物的扩增条带数、多态性条带数和多态性比率分别为25.5条、21条和81.20%,各引物组合扩增的条带数为21~30条,多态性比率为61.90%~96.55%。根据Nei’s遗传相似系数,在遗传相似系数为0.751时,可将35份甘蔗材料分为五大类,26个凉蔗系列品种(系)(除凉蔗07-54外)均归在I类和II类,说明凉蔗系列的亲缘关系较近;桂糖73-167和农垦2号分别被单独归为一类,说明这两个品种(系)间及与其他品种(系)间的亲缘关系较远;I类中除凉蔗系列之外,还包括粤糖91-976和ROC16,说明这两个品种(系)有可能是I类中凉蔗系列的杂交亲本或存在血缘关系;II类中除凉蔗系列外,还包括B8、ROC22、ROC24和ROC10,说明这4个品种(系)的亲缘关系较近,ROC系列可能存在II类中凉蔗系列的亲本。利用这4对核心引物组合构建的DNA指纹图谱均可将35份甘蔗材料鉴别开。【结论】35份甘蔗材料的遗传多样性丰富,构建的DNA指纹图谱可用于甘蔗品种(系)鉴定。
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关键词
甘蔗
SRAP分子标记
遗传多样性
DNA指纹图谱
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职称材料
题名
35份甘蔗种质的遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
被引量:
10
1
作者
庞新华
檀小辉
韦丽君
梁芳
张继
吕平
程琴
黄秋伟
周全光
机构
广西农业科学院
广西
亚热带
作物
研究所
广西农业科学院广西亚热带作物研究所广西农垦甘蔗研究所
玉林师范
学院
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期1157-1164,共8页
基金
广西创新驱动发展专项(桂科AA17202042-5)
广西科学研究与技术开发计划项目(桂科攻1598006-1-1B)
广西亚热带作物研究所专项资金项目(桂热研201401)
文摘
【目的】利用SRAP分子标记分析35份甘蔗种质的遗传多样性,并构建其DNA指纹图谱,为甘蔗种质资源的分子鉴定提供技术支持。【方法】以凉蔗系列(26份)为主的35个甘蔗品种(系)为供试材料,利用SRAP分子标记的8条正向引物和14条反向引物随机组成112对引物组合,从中筛选出核心引物对35份甘蔗材料进行遗传多样性分析,并利用POPGENE 1.32计算各材料间的Nei’s遗传相似系数,使用Ntsyspc 2.1 UPGMA方法进行聚类分析,并构建DNA指纹图谱。【结果】从112对引物组合中筛选出4对核心引物组合(Me3/Em8、Me4/Em8、Me5/Em8和Me6/Em2),利用其从35份甘蔗材料中共扩增出102条条带,平均每对引物的扩增条带数、多态性条带数和多态性比率分别为25.5条、21条和81.20%,各引物组合扩增的条带数为21~30条,多态性比率为61.90%~96.55%。根据Nei’s遗传相似系数,在遗传相似系数为0.751时,可将35份甘蔗材料分为五大类,26个凉蔗系列品种(系)(除凉蔗07-54外)均归在I类和II类,说明凉蔗系列的亲缘关系较近;桂糖73-167和农垦2号分别被单独归为一类,说明这两个品种(系)间及与其他品种(系)间的亲缘关系较远;I类中除凉蔗系列之外,还包括粤糖91-976和ROC16,说明这两个品种(系)有可能是I类中凉蔗系列的杂交亲本或存在血缘关系;II类中除凉蔗系列外,还包括B8、ROC22、ROC24和ROC10,说明这4个品种(系)的亲缘关系较近,ROC系列可能存在II类中凉蔗系列的亲本。利用这4对核心引物组合构建的DNA指纹图谱均可将35份甘蔗材料鉴别开。【结论】35份甘蔗材料的遗传多样性丰富,构建的DNA指纹图谱可用于甘蔗品种(系)鉴定。
关键词
甘蔗
SRAP分子标记
遗传多样性
DNA指纹图谱
Keywords
sugarcane
SRAP molecular marker
genetic diversity
DNA fingerprint map
分类号
S566.102.4 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
35份甘蔗种质的遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
庞新华
檀小辉
韦丽君
梁芳
张继
吕平
程琴
黄秋伟
周全光
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
10
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