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光倒刺鲃(Spinibarbus hollandi)基因组Survey及线粒体基因组研究
1
作者
赖洁
叶树政
+6 位作者
黄文炜
李斯迅
邓彬华
韩崇
龚剑
桂林
李强
《海洋与湖沼》
北大核心
2025年第2期423-432,共10页
光倒刺鲃(Spinibarbus hollandi)是我国南部重要经济鱼类,为了解其基因组特征及线粒体基因组结构,首次采用二代高通量测序技术对珠江和赣江水系光倒刺鲃基因组进行Survey分析,并在此基础上提取出两者的线粒体基因组。结果显示珠江和赣...
光倒刺鲃(Spinibarbus hollandi)是我国南部重要经济鱼类,为了解其基因组特征及线粒体基因组结构,首次采用二代高通量测序技术对珠江和赣江水系光倒刺鲃基因组进行Survey分析,并在此基础上提取出两者的线粒体基因组。结果显示珠江和赣江水系光倒刺鲃基因组大小分别为1769.91 Mb和1846.46 Mb,均为简单杂合型基因组。珠江和赣江水系光倒刺鲃线粒体基因组长度分别为16543 bp和16546 bp,除16S rRNA、tRNA-Leu(UUA)和D-loop区外,两水系其他线粒体基因长度一致。光倒刺鲃线粒体蛋白编码基因中出现不完整的密码子T/TA。tRNA中除tRNA-Ser(GCT)外,其他均能折叠形成正常二级结构。利用线粒体基因组序列计算各水系个体间的遗传距离,使用邻接法和贝叶斯法构建系统进化树,结果表明赣江和桐江水系光倒刺鲃亲缘关系最近,台湾水系光倒刺鲃与大陆水系的亲缘关系较远,台湾种群光倒刺鲃可能是有效种。该研究旨在为研究光倒刺鲃群体遗传学和分子系统学提供基础信息,为今后其种质鉴定、保护和开发利用提供科学依据。
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关键词
光倒刺鲃
基因组Survey
线粒体基因组
系统发育
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题名
光倒刺鲃(Spinibarbus hollandi)基因组Survey及线粒体基因组研究
1
作者
赖洁
叶树政
黄文炜
李斯迅
邓彬华
韩崇
龚剑
桂林
李强
机构
广州大学
生命
科学
学院
广州大学环境科学与工程学院、珠江三角洲水质安全与保护教育部重点实验室
出处
《海洋与湖沼》
北大核心
2025年第2期423-432,共10页
基金
广州市科技计划项目,201804010486号
国家自然科学基金资助项目,42077321号
2024年度广东省大学生创新创业项目,S202411078013号。
文摘
光倒刺鲃(Spinibarbus hollandi)是我国南部重要经济鱼类,为了解其基因组特征及线粒体基因组结构,首次采用二代高通量测序技术对珠江和赣江水系光倒刺鲃基因组进行Survey分析,并在此基础上提取出两者的线粒体基因组。结果显示珠江和赣江水系光倒刺鲃基因组大小分别为1769.91 Mb和1846.46 Mb,均为简单杂合型基因组。珠江和赣江水系光倒刺鲃线粒体基因组长度分别为16543 bp和16546 bp,除16S rRNA、tRNA-Leu(UUA)和D-loop区外,两水系其他线粒体基因长度一致。光倒刺鲃线粒体蛋白编码基因中出现不完整的密码子T/TA。tRNA中除tRNA-Ser(GCT)外,其他均能折叠形成正常二级结构。利用线粒体基因组序列计算各水系个体间的遗传距离,使用邻接法和贝叶斯法构建系统进化树,结果表明赣江和桐江水系光倒刺鲃亲缘关系最近,台湾水系光倒刺鲃与大陆水系的亲缘关系较远,台湾种群光倒刺鲃可能是有效种。该研究旨在为研究光倒刺鲃群体遗传学和分子系统学提供基础信息,为今后其种质鉴定、保护和开发利用提供科学依据。
关键词
光倒刺鲃
基因组Survey
线粒体基因组
系统发育
Keywords
Spinibarbus hollandi
genome Survey
mitochondrial genome
phylogenetic relationships
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
S964.5 [农业科学—水产养殖]
Q953.3 [生物学—动物学]
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作者
出处
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1
光倒刺鲃(Spinibarbus hollandi)基因组Survey及线粒体基因组研究
赖洁
叶树政
黄文炜
李斯迅
邓彬华
韩崇
龚剑
桂林
李强
《海洋与湖沼》
北大核心
2025
0
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