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基于基因组学分析嗜热链球菌KLDS SM的蛋白质水解系统和氨基酸合成途径被引量：6: 1; 作者李柏良丁秀云 +5 位作者靳妲刘飞蒙月月李娜赵莉霍贵成《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第18期120-126,共7页; 为从遗传水平上探究嗜热链球菌KLDS SM蛋白质水解和氨基酸合成的能力,首先基于Illumina Hiseq 2500与Pacbio RSII测序平台对嗜热链球菌KLDS SM进行全基因组测序并绘制基因组图谱;随后从胞外蛋白酶、转运系统、胞内肽酶以及氨基酸合成等... 展开更多; 关键词嗜热链球菌基因组生物信息分析蛋白质水解氨基酸合成; 在线阅读下载PDF 职称材料

嗜热链球菌KLDS3.1012胞外多糖合成途径的基因组学及表型特征分析被引量：4: 2; 作者李柏良赵莉 +4 位作者王成凤靳妲丁秀云刘飞霍贵成《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第6期136-142,共7页; 在分子水平上挖掘嗜热链球菌KLDS3.1012合成胞外多糖的途径并且通过表型特征进行验证。首先,基于Illumina HiSeq与Illumina MiSeq测序平台对菌株KLDS3.1012进行基因组测序并构建基因组图谱;随后,从糖代谢、糖核苷酸合成、胞外多糖基因... 展开更多; 关键词嗜热链球菌基因组测序生物信息分析糖代谢胞外多糖; 在线阅读下载PDF 职称材料

三七根部总RNA不同提取方法的比较被引量：1: 3; 作者郑锐东姚啟聪 +1 位作者廖鹏吴漫晔《贵州农业科学》 CAS 2015年第5期183-186,共4页; 为探明三七根部总RNA的最佳提取方法,获取高质量RNA,选取三七根部为材料,比较Trizol试剂法、CTAB法、改良Trizol法和试剂盒法提取三七根部总RNA的质量。结果表明:4种方法提取三七根部RNA效果不同,其中以改良Trizol法提取RNA的质量最高,... 展开更多; 关键词三七根部 RNA提取改良Trizol法; 在线阅读下载PDF 职称材料

灵武长枣贮藏过程中细胞壁成分及其相关酶活性的变化被引量：3: 4; 作者杨静慧邱雪 +1 位作者张海红郝慧慧《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期64-69,75,共7页; 为了解析贮藏过程中鲜食灵武长枣硬度变化的微观机理,该文利用原子力显微镜对长枣细胞壁多糖纳米结构的降解规律进行了研究,并对其降解酶活性、水分含量与果实硬度进行了相关分析。结果表明,前8 d为果实快速软化期,液泡水水分含量A_(23... 展开更多; 关键词灵武长枣硬度原子力显微镜细胞壁降解酶螯合性果胶; 在线阅读下载PDF 职称材料

重金属胁迫下白骨壤数字基因表达谱分析被引量：2: 5; 作者袁长春莫健新 +4 位作者袁柳娇余如凤刘倩钟军弟刘锴栋《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2017年第2期206-213,共8页; [目的]从转录组水平研究重金属污水胁迫处理下白骨壤的基因表达变化,以揭示白骨壤响应重金属污染胁迫的机制。[方法]采用基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术对重金属污水胁迫处理组和对照组白骨壤材料进行转录组测序分析。[结果]... 展开更多; 关键词白骨壤重金属胁迫数字基因表达谱(DEG) 差异表达基因机制; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于基因组学分析嗜热链球菌KLDS SM的蛋白质水解系统和氨基酸合成途径被引量：6: 1; 作者李柏良丁秀云靳妲刘飞蒙月月李娜赵莉霍贵成; 机构东北农业大学乳品科学教育部重点实验室广州基迪奥生物科技有限公司; 出处《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第18期120-126,共7页; 基金 "十三五"国家重点研发计划重点专项(2017YFD0400303) 国家自然科学基金青年科学基金项目(31401512); 文摘为从遗传水平上探究嗜热链球菌KLDS SM蛋白质水解和氨基酸合成的能力,首先基于Illumina Hiseq 2500与Pacbio RSII测序平台对嗜热链球菌KLDS SM进行全基因组测序并绘制基因组图谱;随后从胞外蛋白酶、转运系统、胞内肽酶以及氨基酸合成等方面所涉及的基因进行生物信息学分析;最后对15株已完成全基因组测序的嗜热链球菌的氨基酸合成能力进行比较基因组学研究。结果表明:菌株KLDS SM的基因组由一个1 856 787 bp环状染色体组成,GC含量为39.08%,含有1 732个蛋白质编码基因;菌株KLDS SM具有完整的蛋白水解系统和8种氨基酸的合成能力;15株嗜热链球菌在氨基酸合成方面上相对保守,仅在组氨酸合成途径存在较大的差异。本研究为该菌株氮代谢能力的挖掘提供了理论依据,并在将其开发为发酵剂方面上具有一定指导意义。; 关键词嗜热链球菌基因组生物信息分析蛋白质水解氨基酸合成; Keywords Streptococcus thermophilus genome bioinformatic analysis proteolysis amino acid biosynthesis; 分类号 R151.1 [医药卫生—营养与食品卫生学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名嗜热链球菌KLDS3.1012胞外多糖合成途径的基因组学及表型特征分析被引量：4: 2; 作者李柏良赵莉王成凤靳妲丁秀云刘飞霍贵成; 机构东北农业大学乳品科学教育部重点实验室广州基迪奥生物科技有限公司; 出处《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第6期136-142,共7页; 基金 "十三五"国家重点研发计划重点专项(2017YFD0400303) 国家自然科学基金青年科学基金项目(31401512); 文摘在分子水平上挖掘嗜热链球菌KLDS3.1012合成胞外多糖的途径并且通过表型特征进行验证。首先,基于Illumina HiSeq与Illumina MiSeq测序平台对菌株KLDS3.1012进行基因组测序并构建基因组图谱;随后,从糖代谢、糖核苷酸合成、胞外多糖基因簇等方面进行生物信息学分析;最后,利用API 50CH测定菌株KLDS3.1012的糖发酵情况及采用高效离子交换色谱法测定胞外多糖的单糖组成。生物信息学分析结果表明菌株KLDS3.1012具有半乳糖、葡萄糖、果糖、甘露糖、乳糖和蔗糖转运系统和4种糖核苷酸(UDP-葡萄糖、dTDP-鼠李糖、UDP-半乳糖和UDP-N-乙酰葡糖胺)合成的相关基因及1个胞外多糖合成基因簇。表型特征分析结果表明菌株KLDS3.1012可以利用以上6种碳源并能形成由鼠李糖、半乳糖和葡萄糖组成的胞外多糖。本研究为分析该菌株合成胞外多糖的遗传基础与胞外多糖结构的关系提供理论依据,并对将其开发为发酵剂具有一定指导意义。; 关键词嗜热链球菌基因组测序生物信息分析糖代谢胞外多糖; Keywords Streptococcus thermophilus genomic sequencing bioinformatic analysis glycometabolism exopolysaccharides; 分类号 TS252.1 [轻工技术与工程—农产品加工及贮藏工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名三七根部总RNA不同提取方法的比较被引量：1: 3; 作者郑锐东姚啟聪廖鹏吴漫晔; 机构揭阳职业技术学院实训中心广州基迪奥生物科技有限公司揭阳职业技术学院生物工程系; 出处《贵州农业科学》 CAS 2015年第5期183-186,共4页; 文摘为探明三七根部总RNA的最佳提取方法,获取高质量RNA,选取三七根部为材料,比较Trizol试剂法、CTAB法、改良Trizol法和试剂盒法提取三七根部总RNA的质量。结果表明:4种方法提取三七根部RNA效果不同,其中以改良Trizol法提取RNA的质量最高,其RNA的OD260/OD280为2.00,OD260/OD230为1.90,28S∶18S为1.9,RIN值为7.4,质量浓度为386μg/μL。而另外3种方法易出现样品降解、盐离子残留。结论:改良Trizol法适用于三七根部总RNA的提取。; 关键词三七根部 RNA提取改良Trizol法; Keywords Panax pseudoginseng root RNA extraction modified Trizol method; 分类号 S567.236 [农业科学—中草药栽培]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名灵武长枣贮藏过程中细胞壁成分及其相关酶活性的变化被引量：3: 4; 作者杨静慧邱雪张海红郝慧慧; 机构宁夏大学食品与葡萄酒学院广州基迪奥生物科技有限公司; 出处《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期64-69,75,共7页; 基金国家自然科学基金(31860422)。; 文摘为了解析贮藏过程中鲜食灵武长枣硬度变化的微观机理,该文利用原子力显微镜对长枣细胞壁多糖纳米结构的降解规律进行了研究,并对其降解酶活性、水分含量与果实硬度进行了相关分析。结果表明,前8 d为果实快速软化期,液泡水水分含量A_(23)与硬度同步降低(P<0.05)。多聚半乳糖醛酸酶、果胶甲酯酶、β-半乳糖苷酶(β-galactosidase,β-Gal)、纤维素酶等细胞壁降解酶均参与了长枣果实软化过程。其中β-Gal对果实硬度下降起促进作用,贡献率为0.2729。随着贮藏时间的延长,螯合性果胶中的长链结构和聚集体逐渐降解,短链(15.625、19.531、23.438、31.252 nm)出现的次数及频率均有所增加,其对硬度的贡献率为0.4780。该研究为灵武长枣贮藏保鲜技术的开发提供了理论支持。; 关键词灵武长枣硬度原子力显微镜细胞壁降解酶螯合性果胶; Keywords Lingwu long jujube hardness atomic force microscopy cell wall degrading enzyme CDTA-soluble pectin; 分类号 TS255.3 [轻工技术与工程—农产品加工及贮藏工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名重金属胁迫下白骨壤数字基因表达谱分析被引量：2: 5; 作者袁长春莫健新袁柳娇余如凤刘倩钟军弟刘锴栋; 机构岭南师范学院生命科学与技术学院广州基迪奥生物科技有限公司; 出处《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2017年第2期206-213,共8页; 基金广东省林业科技创新项目(2013KJCX011-03 2015KJCX025) +2 种基金岭南师范学院自然科学研究项目(LZL1507); 文摘 [目的]从转录组水平研究重金属污水胁迫处理下白骨壤的基因表达变化,以揭示白骨壤响应重金属污染胁迫的机制。[方法]采用基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术对重金属污水胁迫处理组和对照组白骨壤材料进行转录组测序分析。[结果]与对照组相比,重金属处理下白骨壤共有10 459个差异表达基因,其中,8 685个表达量上升,1 774个表达量下降。Me V聚类表明:大部分基因在重金属处理样本中的表达量受到极大的诱导。GO功能注释发现,差异表达基因主要定位于叶绿体以及细胞内各种膜结构,参与"细胞代谢"、"细胞组分的组合和生物合成"、"对刺激的响应"等过程。KEGG代谢通路分析显示,差异表达基因分布于126条Pathways,涉及"核糖体"、"光合作用"、"乙醛酸盐代谢"、"丙酮酸代谢"等途径。重金属胁迫还促进萜类、黄酮类化合物生物合成的关键酶基因(牻牛儿基焦磷酸合酶(0009238)、黄酮醇合成酶(0001833))的表达,进而促进白骨壤有效成分的积累;显著诱导细胞分裂素水解酶编码基因CKX7(0057124)、油菜素内脂信号转导组分基因BSK(0043741)等的表达,进而提高白骨壤对重金属胁迫的适应能力。此外,转录因子分析发现,b HLH、NAC、MYB-related和WRKY在重金属胁迫中发挥重要作用。实验选取8个与环境刺激响应密切相关的基因,通过qRT-PCR验证了它们在重金属污水胁迫处理下的表达差异,结果与数字基因表达谱分析的结果较一致,证实了差异表达基因数据的有效性。[结论]重金属处理影响了白骨壤大量的新陈代谢、光合作用、小分子酸合成、激素合成与信号转导及次生代谢产物合成相关基因的表达。; 关键词白骨壤重金属胁迫数字基因表达谱(DEG) 差异表达基因机制; Keywords Avicennia marina heavy metal stress digital gene expression profiling （DGE） differentially expressedgenes （DEGs） mechanism; 分类号 S718.46 [农业科学—林学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于基因组学分析嗜热链球菌KLDS SM的蛋白质水解系统和氨基酸合成途径	李柏良丁秀云靳妲刘飞蒙月月李娜赵莉霍贵成	《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心	2018	6	在线阅读下载PDF 职称材料
2	嗜热链球菌KLDS3.1012胞外多糖合成途径的基因组学及表型特征分析	李柏良赵莉王成凤靳妲丁秀云刘飞霍贵成	《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心	2019	4	在线阅读下载PDF 职称材料
3	三七根部总RNA不同提取方法的比较	郑锐东姚啟聪廖鹏吴漫晔	《贵州农业科学》 CAS	2015	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	灵武长枣贮藏过程中细胞壁成分及其相关酶活性的变化	杨静慧邱雪张海红郝慧慧	《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心	2022	3	在线阅读下载PDF 职称材料
5	重金属胁迫下白骨壤数字基因表达谱分析	袁长春莫健新袁柳娇余如凤刘倩钟军弟刘锴栋	《林业科学研究》 CSCD 北大核心	2017	2	在线阅读下载PDF 职称材料