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3-O-C_(12)-HSL阻碍Mo-DCs成熟过程中lncRNA表达谱的变化
被引量：
3
1
作者
李有强
张云燕
+5 位作者
陈茶
徐建华
罗燕芬
肖倩
李沫
李启伟
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期117-121,共5页
目的:观察铜绿假单胞菌(Pseudomonas aerltginosa,PA)分泌的信号分子N-3-氧代十二烷酰-L-同型丝氨酸内酯(N-3-oxododecanoy1-L-homoserine lactone,3-O-C12-HSL)阻碍单核细胞来源的树突细胞(monocytes derived-dendritic cells,Mo-DCs)...
目的:观察铜绿假单胞菌(Pseudomonas aerltginosa,PA)分泌的信号分子N-3-氧代十二烷酰-L-同型丝氨酸内酯(N-3-oxododecanoy1-L-homoserine lactone,3-O-C12-HSL)阻碍单核细胞来源的树突细胞(monocytes derived-dendritic cells,Mo-DCs)成熟过程中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)表达谱的变化情况。方法:采用免疫磁珠法分选人外周血CD14+单核细胞,经重组人粒-单核细胞集落刺激因子和重组人白细胞介素-4诱导分化为Mo-DCs。不同因素处理Mo-DCs,实验组加入终浓度0.1μg/m L的LPS和终浓度为40μmol/L的3-O-C12-HSL,对照组加入相应体积的含0.1%DMSO的PBS,模型组加入终浓度0.1μg/m L的LPS。利用lnc RNA芯片技术检测对照组、模型组和实验组间lnc RNA表达谱的差异。对筛选数据进行分析处理,利用散点图分析2倍以上差异lnc RNA在各处理因素间的总体变异情况,利用聚类分析研究表达差异5倍以上lnc RNA的聚类情况。结果:与对照组和模型组相比较,实验组筛选出2倍以上表达差异的lnc RNA为1 386条,其中上调表达的548条,下调表达的838条。筛选出具有5倍以上表达差异的lnc RNA共153条,占2倍表达差异lnc RNA的11.04%,其中上调表达的22条,下调表达的131条。散点图发现2倍表达差异的lnc RNA总体分布呈集中趋势,存在特征性改变。聚类分析发现5倍表达差异的lnc RNA能根据处理因素进行有效的分层聚类。结合GO分析和m RNA通路分析,差异lnc RNA的相关基因可富集至PPAR信号通路、钙信号通路和NF-κB信号通路中。结论:3-O-C12-HSL作用于Mo-DCs后,lnc RNA表达谱发生了特征性变化,表达差异的lnc RNA可能参与了3-O-C12-HSL阻碍Mo-DCs成熟过程。
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关键词
N-3-氧代十二烷酰-L-同型丝氨酸内酯
单核细胞来源树突细胞
长链非编码RNA
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职称材料
血清LncRNA-ENST00000420480在铜绿假单胞菌感染中诊断价值
2
作者
李有强
张云燕
+4 位作者
刘杨
张轩
蔡雪莹
陈茶
罗燕芬
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2019年第21期3370-3373,共4页
目的探讨长链非编码RNAENST00000420480作为铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,PA)感染诊断标志物的临床价值。方法采用密度梯度离心法分离人外周血单个核细胞,免疫磁珠分选人CD14+单核细胞、hIL?4和hGM?CSF诱导分化为单核细胞衍生...
目的探讨长链非编码RNAENST00000420480作为铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,PA)感染诊断标志物的临床价值。方法采用密度梯度离心法分离人外周血单个核细胞,免疫磁珠分选人CD14+单核细胞、hIL?4和hGM?CSF诱导分化为单核细胞衍生树突细胞(monocytes derived dendritic cells,Mo?DCs),分PBS组、LPS组和LPS+3?O?C12?HSL组。实时荧光定量PCR检测lncRNA?ENST00000420480表达量。收集临床PA感染患者血清21例,体检表观健康人血清32例,提取血清RNA,逆转录获得cDNA,荧光定量PCR检测lncRNA?ENST00000420480表达量,受试者工作特征曲线评价血清中lncRNA?ENST00000420480对PA感染的诊断效能,计算约登指数(YI)明确PA感染诊断截点(cut?off)。结果与PBS组相比,LPS下调Mo?DCs中lncRNA?ENST00000420480表达水平。与LPS组相比,3?O?C12?HSL上调Mo?DCs中lncRNA?ENST00000420480表达水平。PA感染组血清中lncRNA?ENST00000420480相对表达量为(3.85±4.18),正常人组血清中lncRNA?ENST00000420480相对表达量为(1.30±1.06),差异有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线中AUC为0.708(P=0.01),YI为0.429,诊断截点值为4.13。结论lncRNA?ENST00000420480可作为PA感染的血清学标志物。
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关键词
N-3-氧代十二烷酰-L-同型丝氨酸内酯
单核细胞来源树突细胞
长链非编码RNA
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职称材料
题名
3-O-C_(12)-HSL阻碍Mo-DCs成熟过程中lncRNA表达谱的变化
被引量：
3
1
作者
李有强
张云燕
陈茶
徐建华
罗燕芬
肖倩
李沫
李启伟
机构
广州
中医药
大学
第二临床医学院检验医学部
广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心口腔科
出处
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期117-121,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(编号:81601736)
广东省科技计划资助项目(编号:2013B021800241
+5 种基金
2014A020212267
2014A020212274)
广东省自然科学基金资助项目(编号:2015A030310291)
广东省医学科研基金资助项目(编号:B2014182)
广东省中医院转化医学专项(编号:YN2014ZHR201)
广州中医药大学优秀青年基金资助项目(编号:2013KT1478)
文摘
目的:观察铜绿假单胞菌(Pseudomonas aerltginosa,PA)分泌的信号分子N-3-氧代十二烷酰-L-同型丝氨酸内酯(N-3-oxododecanoy1-L-homoserine lactone,3-O-C12-HSL)阻碍单核细胞来源的树突细胞(monocytes derived-dendritic cells,Mo-DCs)成熟过程中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)表达谱的变化情况。方法:采用免疫磁珠法分选人外周血CD14+单核细胞,经重组人粒-单核细胞集落刺激因子和重组人白细胞介素-4诱导分化为Mo-DCs。不同因素处理Mo-DCs,实验组加入终浓度0.1μg/m L的LPS和终浓度为40μmol/L的3-O-C12-HSL,对照组加入相应体积的含0.1%DMSO的PBS,模型组加入终浓度0.1μg/m L的LPS。利用lnc RNA芯片技术检测对照组、模型组和实验组间lnc RNA表达谱的差异。对筛选数据进行分析处理,利用散点图分析2倍以上差异lnc RNA在各处理因素间的总体变异情况,利用聚类分析研究表达差异5倍以上lnc RNA的聚类情况。结果:与对照组和模型组相比较,实验组筛选出2倍以上表达差异的lnc RNA为1 386条,其中上调表达的548条,下调表达的838条。筛选出具有5倍以上表达差异的lnc RNA共153条,占2倍表达差异lnc RNA的11.04%,其中上调表达的22条,下调表达的131条。散点图发现2倍表达差异的lnc RNA总体分布呈集中趋势,存在特征性改变。聚类分析发现5倍表达差异的lnc RNA能根据处理因素进行有效的分层聚类。结合GO分析和m RNA通路分析,差异lnc RNA的相关基因可富集至PPAR信号通路、钙信号通路和NF-κB信号通路中。结论:3-O-C12-HSL作用于Mo-DCs后,lnc RNA表达谱发生了特征性变化,表达差异的lnc RNA可能参与了3-O-C12-HSL阻碍Mo-DCs成熟过程。
关键词
N-3-氧代十二烷酰-L-同型丝氨酸内酯
单核细胞来源树突细胞
长链非编码RNA
Keywords
long non coding RNA
N-3-oxododecanoyl-L-homoserine lactone
monocytes derived-dendritic cells
分类号
R737.14 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
血清LncRNA-ENST00000420480在铜绿假单胞菌感染中诊断价值
2
作者
李有强
张云燕
刘杨
张轩
蔡雪莹
陈茶
罗燕芬
机构
南方
医科大
学
附属
何贤纪念医院检验科
广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心口腔科
广州
中医药
大学
第二临床医学院
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2019年第21期3370-3373,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(编号：81601736)
广东省科技计划资助项目(编号：2013B021800241,2014A020212267)
文摘
目的探讨长链非编码RNAENST00000420480作为铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,PA)感染诊断标志物的临床价值。方法采用密度梯度离心法分离人外周血单个核细胞,免疫磁珠分选人CD14+单核细胞、hIL?4和hGM?CSF诱导分化为单核细胞衍生树突细胞(monocytes derived dendritic cells,Mo?DCs),分PBS组、LPS组和LPS+3?O?C12?HSL组。实时荧光定量PCR检测lncRNA?ENST00000420480表达量。收集临床PA感染患者血清21例,体检表观健康人血清32例,提取血清RNA,逆转录获得cDNA,荧光定量PCR检测lncRNA?ENST00000420480表达量,受试者工作特征曲线评价血清中lncRNA?ENST00000420480对PA感染的诊断效能,计算约登指数(YI)明确PA感染诊断截点(cut?off)。结果与PBS组相比,LPS下调Mo?DCs中lncRNA?ENST00000420480表达水平。与LPS组相比,3?O?C12?HSL上调Mo?DCs中lncRNA?ENST00000420480表达水平。PA感染组血清中lncRNA?ENST00000420480相对表达量为(3.85±4.18),正常人组血清中lncRNA?ENST00000420480相对表达量为(1.30±1.06),差异有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线中AUC为0.708(P=0.01),YI为0.429,诊断截点值为4.13。结论lncRNA?ENST00000420480可作为PA感染的血清学标志物。
关键词
N-3-氧代十二烷酰-L-同型丝氨酸内酯
单核细胞来源树突细胞
长链非编码RNA
Keywords
N-3-oxododecanoy1-L-homoserine lactone
monocytes derived-dendritic cells
long noncoding RNA
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
3-O-C_(12)-HSL阻碍Mo-DCs成熟过程中lncRNA表达谱的变化
李有强
张云燕
陈茶
徐建华
罗燕芬
肖倩
李沫
李启伟
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
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下载PDF
职称材料
2
血清LncRNA-ENST00000420480在铜绿假单胞菌感染中诊断价值
李有强
张云燕
刘杨
张轩
蔡雪莹
陈茶
罗燕芬
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2019
0
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