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基于药物表达谱模式筛选结肠癌候选治疗药物
被引量：
3
1
作者
王纯忠
杨邵宇
+2 位作者
肖慧莲
刘丽娜
王桂平
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期212-217,共6页
目的:药物表达谱是发现药物新用途的重要模式,本项目探讨药物表达谱模式在结肠癌候选药物筛选中的应用价值。方法:首先,从Pub Med的GEO数据库中获取结肠癌表达谱数据集(No.GSE41258),从美国Memorial Sloan-Kettering癌症中心筛选出53对...
目的:药物表达谱是发现药物新用途的重要模式,本项目探讨药物表达谱模式在结肠癌候选药物筛选中的应用价值。方法:首先,从Pub Med的GEO数据库中获取结肠癌表达谱数据集(No.GSE41258),从美国Memorial Sloan-Kettering癌症中心筛选出53对配对的结肠癌与癌旁正常组织样本数据,采用RMAexpress软件进行质量分析;然后,采用Dchip软件建立结肠癌特征性表达谱;最后通过Connectivity Map(CMAP)进行结肠癌候选化合物的筛选和实验验证。结果:经芯片质量分析,选择36对配对样本进行后续分析;构建了一个由371个基因组成的结肠癌特征性表达谱,其中上调基因94个,下调基因277个;通过CMAP分析,筛选到vorinostat、tanespimycin(17-AAG)等10种候选药物,选择其中一种富集分数较高的药物17-AAG进行验证;后续实验证实17-AAG可有效抑制结肠癌SW480和HT29株细胞的增殖,其作用24和48 h时,SW480细胞的IC50分别为0.73和0.41μmol/L;而HT29细胞的IC50分别为0.72和0.50μmol/L。流式术分析显示,17-AAG可使结肠癌细胞阻滞于G1期。结论:本项目基于药物表达谱模式筛选到多种结肠癌候选药物,揭示药物表达谱模式在药物发现中具有重要意义。
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关键词
基因表达谱
结肠癌
CONNECTIVITY
Map
候选治疗药物
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题名
基于药物表达谱模式筛选结肠癌候选治疗药物
被引量：
3
1
作者
王纯忠
杨邵宇
肖慧莲
刘丽娜
王桂平
机构
广州
市第一人民医院普通外科
广州医科大学卫生职业技术学院系统生物与肿瘤研究中心
出处
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期212-217,共6页
基金
广东省中医药局建设中医药强省项目(No.20121001)~~
文摘
目的:药物表达谱是发现药物新用途的重要模式,本项目探讨药物表达谱模式在结肠癌候选药物筛选中的应用价值。方法:首先,从Pub Med的GEO数据库中获取结肠癌表达谱数据集(No.GSE41258),从美国Memorial Sloan-Kettering癌症中心筛选出53对配对的结肠癌与癌旁正常组织样本数据,采用RMAexpress软件进行质量分析;然后,采用Dchip软件建立结肠癌特征性表达谱;最后通过Connectivity Map(CMAP)进行结肠癌候选化合物的筛选和实验验证。结果:经芯片质量分析,选择36对配对样本进行后续分析;构建了一个由371个基因组成的结肠癌特征性表达谱,其中上调基因94个,下调基因277个;通过CMAP分析,筛选到vorinostat、tanespimycin(17-AAG)等10种候选药物,选择其中一种富集分数较高的药物17-AAG进行验证;后续实验证实17-AAG可有效抑制结肠癌SW480和HT29株细胞的增殖,其作用24和48 h时,SW480细胞的IC50分别为0.73和0.41μmol/L;而HT29细胞的IC50分别为0.72和0.50μmol/L。流式术分析显示,17-AAG可使结肠癌细胞阻滞于G1期。结论:本项目基于药物表达谱模式筛选到多种结肠癌候选药物,揭示药物表达谱模式在药物发现中具有重要意义。
关键词
基因表达谱
结肠癌
CONNECTIVITY
Map
候选治疗药物
Keywords
gene expression profiles
colon cancer
Connectivity Map（CAMP）
candidatetherapeutic drug
分类号
R735.3 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
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被引量
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1
基于药物表达谱模式筛选结肠癌候选治疗药物
王纯忠
杨邵宇
肖慧莲
刘丽娜
王桂平
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
3
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