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基于生物信息学方法探讨肠道菌群干预类风湿关节炎的机制及药物预测
1
作者 卜尔凡 张钏海 +3 位作者 于臻祎 伍嘉琪 刘良 潘胡丹 《中国免疫学杂志》 北大核心 2025年第3期522-528,共7页
目的:探究肠道菌群紊乱与类风湿关节炎(RA)的诊断及治疗应答的相关性,为精准靶向干预RA的进一步研究提供生物信息学依据。方法:从疾病数据库中分别下载并筛选整合肠道菌群紊乱疾病相关基因与RA基因,应用生物信息学方法对两种疾病的相关... 目的:探究肠道菌群紊乱与类风湿关节炎(RA)的诊断及治疗应答的相关性,为精准靶向干预RA的进一步研究提供生物信息学依据。方法:从疾病数据库中分别下载并筛选整合肠道菌群紊乱疾病相关基因与RA基因,应用生物信息学方法对两种疾病的相关性进行综合分析,通过STRING和Cytoscape及其插件分析PPI网络,筛选关键基因。将关键基因映射至CoremineMedicinal中得到相对应的化学药物及中药。结果:通过对疾病数据库的整合筛选,共获得525个肠道菌群紊乱与RA的共有基因,最终选取蛋白相互作用程度最强的基因为关键基因,分别为IL-6、IL-1β、TNF-α、IL-10、STAT3、STAT1、RE-LA。这些相关基因主要涉及负反馈调节、抗原刺激等生物过程,介导脂多糖受体结合、NF-κB受体结合等分子功能,主要富集在质膜区域;KEGG分析显示这些相关基因主要涉及IL-17通路、Toll样受体通路等经典信号通路。通过药物预测,发现了一些重组细胞因子及中药黄芪、黄芩、五味子、黄连等可能成为治疗RA的潜在药物来源。结论:生物信息学方法可预测肠道菌群干预RA发病,发现相关基因和信号通路,并预测可能通过靶向调控菌群治疗RA的中草药,为深入探讨靶向治疗RA提供了理论依据。 展开更多
关键词 生物信息学 类风湿关节炎 肠道菌群紊乱 药物预测 靶点蛋白
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开心散通过减轻前额叶皮质铁死亡缓解小鼠的阿霉素化疗性抑郁 被引量：3
2
作者 欧阳明子 崔佳琦 +5 位作者 王慧 梁正 皮大锦 陈利国 陈前军 吴迎朝 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1441-1449,共9页
目的明确中药复方开心散缓解乳腺癌阿霉素化疗性抑郁的疗效,并分析其药理机制。方法将40只雌性BALB/c小鼠通过原位注射4T1细胞建立乳腺癌小鼠模型,将小鼠随机分为对照组、模型组、开心散低剂量组和开心散高剂量组,10只/组。通过旷场试... 目的明确中药复方开心散缓解乳腺癌阿霉素化疗性抑郁的疗效,并分析其药理机制。方法将40只雌性BALB/c小鼠通过原位注射4T1细胞建立乳腺癌小鼠模型,将小鼠随机分为对照组、模型组、开心散低剂量组和开心散高剂量组,10只/组。通过旷场试验和高架十字迷宫实验行为学分析、抑郁相关因子血清学检测、转录组学分析、透射电镜病理分析和铁死亡相关因子检测分析阿霉素诱导的化疗性抑郁产生的病因以及开心散的作用机制。利用SH-SY5Y细胞系构建体外模型并使用铁死亡抑制剂Fer-1进行阳性对照,验证动物实验结果。结果开心散显著逆转阿霉素化疗所致的抑郁样行为(P<0.001)、逆转抑郁相关血清学的改变(P<0.05);转录组学结果显示,开心散缓解化疗性抑郁与调控前额叶皮质组织氧化应激、脂质代谢和铁离子结合等过程有关;病理学分析、铁死亡相关因子检测结果显示,开心散能减轻阿霉素化疗所致的前额叶皮质组织铁死亡(P<0.01)。体外实验结果也显示,开心散含药血清和铁死亡抑制剂均能逆转阿霉素诱导的神经细胞铁死亡(P<0.001)。结论开心散通过减轻乳腺癌阿霉素化疗所致的大脑前额叶皮质组织铁死亡,进而缓解化疗性抑郁。 展开更多
关键词 开心散 乳腺癌 化疗 抑郁 铁死亡
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不同衰弱评估工具在老年术前衰弱筛查中的应用效果比较研究 被引量：11
3
作者 陈木欣 梁好 +5 位作者 赵怡迪 杨晓敏 方嘉敏 周春姣 傅秀珍 魏琳 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2024年第30期3790-3796,共7页
背景国际上衰弱评估工具种类繁多,针对老年围术期的衰弱评估工具的应用选择不一,哪种衰弱评估工具更适合我国围术期人群尚不清楚。目的比较FRAIL量表、临床衰弱量表(CFS)、围术期衰弱指数、5项改良衰弱指数(mFI-5)在老年手术患者中术前... 背景国际上衰弱评估工具种类繁多,针对老年围术期的衰弱评估工具的应用选择不一,哪种衰弱评估工具更适合我国围术期人群尚不清楚。目的比较FRAIL量表、临床衰弱量表(CFS)、围术期衰弱指数、5项改良衰弱指数(mFI-5)在老年手术患者中术前衰弱评估的应用效果,旨在为医护人员选择合适的衰弱评估工具提供参考。方法采用方便抽样法选取2023年2—5月于广东省中医院行择期手术的住院老年患者329例作为研究对象。采用11项改良衰弱指数(mFI-11)、FRAIL量表、CFS、mFI-5、围术期衰弱指数进行衰弱评估。应用Kappa检验评估5种衰弱评估工具之间的一致性;以mFI-11评估结果为参考,通过受试者工作特征(ROC)曲线和决策曲线(DCA)分析其余4种工具对老年术前衰弱发生率的诊断价值,计算ROC曲线下面积(AUC);根据约登指数(YI)最大原则确定各衰弱评估工具的最佳临界值,并分别计算在原始和最佳临界值时的评估性能指标。结果CFS与围术期衰弱指数对老年术前衰弱的评估一致性最高(Kappa=0.655,P<0.001),FRAIL量表与mFI-5及mFI-11对老年术前衰弱的评估一致性最低(Kappa=0.182、0.262)。ROC曲线分析结果显示,mFI-5、围术期衰弱指数、CFS及FRAIL量表筛查老年术前衰弱的AUC分别为0.920、0.888、0.823及0.799;mFI-5筛查老年术前衰弱的AUC大于FRAIL量表、CFS(Z=3.188、3.215,P=0.001);围术期衰弱指数筛查老年术前衰弱的AUC大于FRAIL量表(Z=2.561,P=0.001);在最佳临界值时,mFI-5筛查老年术前衰弱的灵敏度(91.18%)及特异度(84.41%)、围术期衰弱指数筛查老年术前衰弱的灵敏度(94.12%)及特异度(71.86%)等指标较高。DCA结果显示,在相关风险阈值范围内,mFI-5的净效益最高、围术期衰弱指数次之。结论mFI-5的筛查准确性最高,且在最佳临界值时具有较高的灵敏度和特异度,围术期衰弱指数的筛查准确性次之但综合预测性能相对较好,两者适用于老年手术患者的早期衰弱风险筛查。 展开更多
关键词 衰弱 术前衰弱 筛查 评估工具 老年人 评价研究
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益肺散结丸缓解小鼠癌因性骨骼肌萎缩的作用 被引量：3
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作者 吴迎朝 左谦 +6 位作者 罗薇 王慧 皮大锦 陈前军 陈利国 林丽珠 欧阳明子 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期1839-1849,共11页
目的研究益肺散结丸对荷瘤小鼠骨骼肌重量、强度、病理形态、糖原和脂质含量以及代谢强度的影响,以探究益肺散结丸治疗荷瘤小鼠骨骼肌萎缩的作用机制。方法将16只雌性ICR小鼠通过腹腔注射小鼠Lewis肺腺癌细胞建立荷瘤小鼠动物模型,随机... 目的研究益肺散结丸对荷瘤小鼠骨骼肌重量、强度、病理形态、糖原和脂质含量以及代谢强度的影响,以探究益肺散结丸治疗荷瘤小鼠骨骼肌萎缩的作用机制。方法将16只雌性ICR小鼠通过腹腔注射小鼠Lewis肺腺癌细胞建立荷瘤小鼠动物模型,随机分为模型组、益肺散结丸治疗组(4 g·kg^(-1)·d^(-1),共21 d),8只/组,并设正常组(n=8)。记录小鼠体质量、腓肠肌重量,前肢握力试验测试肌肉强度,液质联用分析益肺散结丸入血成分,酶联免疫吸附测定血清血糖、血清胰岛素浓度和血清及腓肠肌炎症因子水平。苏木素-伊红染色和透射电子显微镜观察腓肠肌病理形态,转录组学测序分析腓肠肌病理过程中涉及的信号通路变化,过碘酸雪夫染色观察腓肠肌糖原含量,油红O染色观察腓肠肌脂质含量,腺苷三磷酸酶染色观察腓肠肌代谢强度,免疫组织化学染色观察腓肠肌炎症细胞浸润程度和P-AKT水平,试剂盒检测腓肠肌肌酸激酶、乳酸脱氢酶和肌红蛋白含量。结果益肺散结丸增加荷瘤小鼠的骨骼肌强度及腓肠肌重量(P<0.001),降低腓肠肌损伤标志物(P<0.01)。转录组学测序及入血成分显示,益肺散结丸改善荷瘤小鼠腓肠肌损伤的机制可能与炎症浸润、胰岛素抵抗和脂质代谢相关(P<0.05)。实验结果显示,益肺散结丸降低血清和腓肠肌炎症因子水平(P<0.05)及腓肠肌的促炎细胞浸润,增加腓肠肌胰岛素敏感性指标P-AKT水平,提高糖原和脂质含量以及代谢水平。结论益肺散结丸可能通过降低炎症性胰岛素抵抗缓解癌因性骨骼肌萎缩。 展开更多
关键词 益肺散结丸 炎症性胰岛素抵抗 癌因性骨骼肌萎缩
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DNA甲基化与类风湿关节炎发生、发展、诊断、治疗和预后关系的研究进展 被引量：5
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作者 邓海珊 卢琳琳 +1 位作者 刘中秋 周华(指导) 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期1752-1758,共7页
类风湿关节炎(RA)是一种常见的慢性自身免疫性疾病。脱氧核糖核酸(DNA)甲基化是一种重要的表观遗传修饰。本文对近年DNA甲基化与RA发生、发展、诊断、治疗和预后关系研究进行了综述,发现DNA甲基化与RA的发生和发展密切相关,有希望作为R... 类风湿关节炎(RA)是一种常见的慢性自身免疫性疾病。脱氧核糖核酸(DNA)甲基化是一种重要的表观遗传修饰。本文对近年DNA甲基化与RA发生、发展、诊断、治疗和预后关系研究进行了综述,发现DNA甲基化与RA的发生和发展密切相关,有希望作为RA诊断、治疗和预后的新靶点。其中,MAP3K5和LBH等甲基化基因参与RA发病阶段的调控,CYP2E1和DUSP22等甲基化基因调控RA的发展过程,SHROOM1等甲基化基因可用于RA的诊断,Foxp3和patched 1(PTCH1)等基因甲基化水平可用于评价RA的治疗效果。此外,给药前后的整体甲基化水平改变可用于RA的预后,有利于加深RA发病机制、疾病过程在表观遗传学上的认识。 展开更多
关键词 类风湿关节炎 DNA甲基化 抗炎
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基于类器官构建泛TKI提高ET+CDK4/6抑制剂治疗HR+/HER2-low乳腺癌疗效的筛选工具
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作者 吴迎朝 陈柳汕 +4 位作者 梁裕琪 陈洁婷 黄俊峰 左谦 陈前军 《实用医学杂志》 2025年第18期2786-2795,共10页
目的 探讨HR+/HER2-low乳腺癌ET+CDK4/6抑制剂治疗效果不佳的机制,并构建乳腺癌类器官模型工具以筛选泛TKI敏感的HR+/HER2-low乳腺癌患者。方法 转录组学分析HR+/HER2-0与HR+/HER2-low乳腺癌样本差异表达基因并进行富集分析。使用临床... 目的 探讨HR+/HER2-low乳腺癌ET+CDK4/6抑制剂治疗效果不佳的机制,并构建乳腺癌类器官模型工具以筛选泛TKI敏感的HR+/HER2-low乳腺癌患者。方法 转录组学分析HR+/HER2-0与HR+/HER2-low乳腺癌样本差异表达基因并进行富集分析。使用临床来源的乳腺癌组织构建肿瘤类器官模型,并通过Calcein-AM/PI细胞活死双染和EdU细胞增殖检测分析不同样本对治疗药物的敏感性。结果 转录组学富集分析结果显示,HR+/HER2-low乳腺癌的EGFR存在显著激活并具有酪氨酸激酶抑制剂耐药的特性。成功构建了乳腺癌类器官,通过药敏试验结果显示,部分HR+/HER2-low乳腺癌ET+CDK4/6抑制剂治疗效果较差,TKI可以恢复HR+/HER2-low乳腺癌ET+CDK4/6抑制剂治疗的敏感性(P<0.05)。结论 TKI可以逆转HR+/HER2-low乳腺癌对ET+CDK4/6抑制剂治疗的敏感性下降,乳腺癌类器官有望成为临床HR+/HER2-low乳腺癌药敏试验筛选工具。 展开更多
关键词 乳腺癌 HR+/HER2-low ET+CDK4/6抑制剂 类器官 酪氨酸激酶抑制剂
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基于P38/Erk/NF-κB信号通路探讨扶正和肤止痒方对银屑病炎症微环境的改善作用
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作者 廖怡静 刘炎杰 +7 位作者 卢月 唐斌 张骏鸿 喻靖傑 邓浩 韩凌 卢传坚 陈海明 《中成药》 2025年第8期2550-2558,共9页
目的探究扶正和肤止痒方对小鼠银屑病样皮损改善及免疫调节的作用。方法体内实验:将30只BALB/c小鼠随机分为空白组、模型组、地塞米松组(1.5 g/kg复方醋酸地塞米松乳膏)和扶正和肤止痒方(FZHFZY)低、高(2.5、5 g/kg)剂量组,每组6只。FZH... 目的探究扶正和肤止痒方对小鼠银屑病样皮损改善及免疫调节的作用。方法体内实验:将30只BALB/c小鼠随机分为空白组、模型组、地塞米松组(1.5 g/kg复方醋酸地塞米松乳膏)和扶正和肤止痒方(FZHFZY)低、高(2.5、5 g/kg)剂量组,每组6只。FZHFZY各剂量组涂抹相应剂量扶正和肤止痒方,空白组和模型组涂抹生理盐水,地塞米松组涂抹复方醋酸地塞米松乳膏,连续给药10 d。给药第4天开始,除空白组外各组小鼠涂抹咪喹莫特乳膏进行造模,连续7 d。PASI评分评估各组小鼠银屑病皮损面积和严重程度;苏木精-伊红(HE)染色观察皮损组织病理学变化;免疫组化(IHC)染色检测皮损组织F4/80水平;Western blot法检测皮损组织P38、p-P38、Erk、p-Erk、P65和p-P65表达;RT-qPCR法检测皮损组织TNF-α、IL-17、IL-23和IL-1βmRNA表达。体外实验:培养RAW264.7细胞,分为空白组、LPS组和FZHFZY 1200、600、300、150μg/mL组,Western blot法检测细胞P38、p-P38、Erk、p-Erk、P65和p-P65蛋白表达,RT-qPCR法检测细胞IL-6、TNF-α、IL-23、IL-8 mRNA表达。结果体内实验结果显示,与模型组比较,FZHFZY组小鼠PASI评分降低(P<0.01);皮损组织表皮增厚、角化不全等病变均得到改善,F4/80表达降低;皮损组织p-P38/P38、p-Erk/Erk、p-P65/P65蛋白表达比值降低(P<0.01);TNF-α、IL-17、IL-23和IL-1βmRNA表达降低(P<0.05,P<0.01)。体外实验结果显示,0~2400μg/mL FZHFZY对RAW264.7细胞无明显毒性(P>0.05)。与LPS组比较,FZHFZY 1200、600μg/mL组细胞p-P38/P38、p-Erk/Erk、p-P65/P65蛋白表达比值降低(P<0.05,P<0.01);TNF-α、IL-17、IL-23和IL-1βmRNA表达降低(P<0.01)。结论扶正和肤止痒方可能通过抑制P38/Erk/NF-κB信号通路减轻了咪喹莫特诱导的小鼠银屑病皮损和LPS刺激的RAW264.7细胞炎症反应。 展开更多
关键词 扶正和肤止痒方 银屑病 咪喹莫特乳膏 地塞米松 炎症反应 P38/Erk/NF-κB信号通路
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