-
题名具胁迫“记忆”特征的白木香离体根的miRNA分析
- 1
-
-
作者
庄婷婷
李佳欣
詹若挺
马新业
-
机构
广州中医药大学中药学院/岭南中药资源教育部重点实验室/国家中成药工程技术研究中心南药研发实验室
-
出处
《热带作物学报》
北大核心
2025年第4期820-830,共11页
-
基金
广东省乡村振兴战略专项-农业科技发展及资源环境保护管理项目-广东省现代南药产业技术体系创新团队项目(No.2023KJ148)。
-
文摘
本研究以白木香离体根为材料,在经过连续三代盐胁迫处理后,使用EASYspin Plus植物快速提取试剂盒提取样品的总RNA,利用HiSeq 2500高通量测序平台进行测序,旨在探讨miRNA在白木香三代离体根盐胁迫中发挥的作用及可能参与调控的代谢途径,为揭示白木香抵御盐胁迫机制的研究提供参考。取白木香三代盐胁迫的离体根为材料,通过使用高通量测序平台及生物信息学技术,获得第一代、第二代、第三代的miRNA表达谱,筛选三代离体根中的差异miRNA,对差异miRNA进行靶基因预测,之后进行靶基因分析,从而获得可能参与白木香次生代谢产物及响应盐胁迫相关的miRNA。结果显示:第一代样品中共检测出508个已知miRNA和764个新预测miRNA,第二代样品中共检测出444个已知miRNA和673个新预测miRNA,第三代样品中共检测出904个已知miRNA和1100个新预测miRNA。三代样品中共获得59个差异表达miRNA及275个靶基因,上调的miRNA靶基因主要参与类黄酮生物合成、谷胱甘肽代谢等信号通路,下调的miRNA靶基因则主要涉及苯丙烷类生物合成、植物激素信号传导、植物病原相互作用等信号通路。选取关键miRNA进行NR注释,结果发现,miR8020-x和novel-m0628-5p可能参与白木香离体根次生代谢产物合成;miR7494-y、miR477-y、miR5185-y、miR7757-y、miR408-z和novel-m0628-5p可能响应白木香离体根盐胁迫。本研究利用高通量测序得到白木香离体根盐胁迫的miRNA表达谱,并利用生物信息学分析得到可能参与白木香次生代谢产物及响应盐胁迫相关的miRNA,研究结果将有助于增强对白木香在盐胁迫条件下miRNA调控机制的认识,并为白木香次生代谢产物合成提供新的途径。
-
关键词
白木香
胁迫记忆
MIRNA
HiSeq
2500高通量测序
-
Keywords
Aquilaria sinensis
stress memory
miRNAs
HiSeq 2500 high-throughput sequencing
-
分类号
S567.19
[农业科学—中草药栽培]
-
