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特殊缔合体系TFE水溶液分子动力学模拟
被引量：
5
1
作者
张荣
谭载友
+2 位作者
郑敦胜
罗三来
李浩然
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期428-432,共5页
三氟乙醇(TFE)水溶液是一类特殊的缔合体系.采用分子动力学模拟方法结合核磁共振化学位移研究了TFE水溶液体系全浓度范围的氢键网络,并对动力学模拟结果和核磁共振化学位移进行了比较.从径向分布函数(RDF)发现,TFE水溶液中存在着强氢键...
三氟乙醇(TFE)水溶液是一类特殊的缔合体系.采用分子动力学模拟方法结合核磁共振化学位移研究了TFE水溶液体系全浓度范围的氢键网络,并对动力学模拟结果和核磁共振化学位移进行了比较.从径向分布函数(RDF)发现,TFE水溶液中存在着强氢键,而体系中的C—H…O弱相互作用较为明显,也不能忽略.氢键网络分析发现TFE水溶液体系的氢键大致分为以下三个区域:在水富集区域,水分子倾向于自身缔合形成稳定的簇结构,随着TFE浓度的增加,水的有序结构受到破坏,水分子和TFE分子发生交叉缔合作用形成氢键;在TFE富集区域,水分子较少,TFE分子自身通过氢键形成多缔体结构.此外,分子动力学统计的平均氢键数的变化和文献报导的核磁共振化学位移变化趋势相同,实验和理论的结果吻合较好.
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关键词
TFE水溶液
分子动力学模拟
核磁共振化学位移
氢键网络
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职称材料
全原子分子动力学模拟研究丙氨酸二肽水溶液的结构和氢键作用
2
作者
张荣
吴文娟
《原子与分子物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期31-36,共6页
采用全原子分子动力学模拟研究了丙氨酸二肽分子在水溶液中的结构和氢键作用.径向分布函数和氢键统计用于分子动力学模拟的分析.从径向分布函数(RDF)发现不同类型的强氢键显示出不同的形成能力,而体系中的C-H…O弱相互作用较为明显,也...
采用全原子分子动力学模拟研究了丙氨酸二肽分子在水溶液中的结构和氢键作用.径向分布函数和氢键统计用于分子动力学模拟的分析.从径向分布函数(RDF)发现不同类型的强氢键显示出不同的形成能力,而体系中的C-H…O弱相互作用较为明显,也不能忽略.氢键统计分析的结果也证实了这一点.分子内距离、回转半径和骨架二面角用于表征丙氨酸二肽分子在水溶液中的构象变化.丙氨酸二肽分子在水溶液中的柔顺性较好,构象在折叠和伸展之间相互转换.
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关键词
全原子分子动力学模拟
丙氨酸二肽
水溶液
结构
氢键
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职称材料
基于酪氨酸端基的ACE三肽抑制剂定量构效关系研究
3
作者
曾威
黄国栋
+1 位作者
吴文娟
张荣
《原子与分子物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期463-470,共8页
固定酪氨酸为端基对ACE三肽抑制剂进行构效关系研究,采用多元线性回归方法,基于不同描述符建立模型,比较模型的可靠性和准确性.结果表明Z描述子建立的模型最好.定量构效关系研究表明ACE抑制三肽第二位氨基酸的电性参数是抑制活性的最大...
固定酪氨酸为端基对ACE三肽抑制剂进行构效关系研究,采用多元线性回归方法,基于不同描述符建立模型,比较模型的可靠性和准确性.结果表明Z描述子建立的模型最好.定量构效关系研究表明ACE抑制三肽第二位氨基酸的电性参数是抑制活性的最大影响因素.
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关键词
酪氨酸
ACE三肽抑制剂
定量构效关系
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职称材料
题名
特殊缔合体系TFE水溶液分子动力学模拟
被引量：
5
1
作者
张荣
谭载友
郑敦胜
罗三来
李浩然
机构
广东
药学院
药
科学院
浙江大学
化学
系
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期428-432,共5页
基金
广东省自然科学基金博士科研启动基金(7301567)
广东药学院人才引进科研启动基金(2006YKX05)资助项目
文摘
三氟乙醇(TFE)水溶液是一类特殊的缔合体系.采用分子动力学模拟方法结合核磁共振化学位移研究了TFE水溶液体系全浓度范围的氢键网络,并对动力学模拟结果和核磁共振化学位移进行了比较.从径向分布函数(RDF)发现,TFE水溶液中存在着强氢键,而体系中的C—H…O弱相互作用较为明显,也不能忽略.氢键网络分析发现TFE水溶液体系的氢键大致分为以下三个区域:在水富集区域,水分子倾向于自身缔合形成稳定的簇结构,随着TFE浓度的增加,水的有序结构受到破坏,水分子和TFE分子发生交叉缔合作用形成氢键;在TFE富集区域,水分子较少,TFE分子自身通过氢键形成多缔体结构.此外,分子动力学统计的平均氢键数的变化和文献报导的核磁共振化学位移变化趋势相同,实验和理论的结果吻合较好.
关键词
TFE水溶液
分子动力学模拟
核磁共振化学位移
氢键网络
Keywords
TFE-water system
MD simulation
Chemical shifts in NMR
Hydrogen-bonding network
分类号
O641.1 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
全原子分子动力学模拟研究丙氨酸二肽水溶液的结构和氢键作用
2
作者
张荣
吴文娟
机构
广东药学院药科学院物理化学教研室
出处
《原子与分子物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期31-36,共6页
基金
国家自然科学基金(20903026)
广东省科技计划项目(2007B030702007)
广东省高等学校人才引进专项资金(2011)
文摘
采用全原子分子动力学模拟研究了丙氨酸二肽分子在水溶液中的结构和氢键作用.径向分布函数和氢键统计用于分子动力学模拟的分析.从径向分布函数(RDF)发现不同类型的强氢键显示出不同的形成能力,而体系中的C-H…O弱相互作用较为明显,也不能忽略.氢键统计分析的结果也证实了这一点.分子内距离、回转半径和骨架二面角用于表征丙氨酸二肽分子在水溶液中的构象变化.丙氨酸二肽分子在水溶液中的柔顺性较好,构象在折叠和伸展之间相互转换.
关键词
全原子分子动力学模拟
丙氨酸二肽
水溶液
结构
氢键
Keywords
All-atom MD simulation
alanine dipeptide
aqueous solution
structure
hydrogen bonds
分类号
O641 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
基于酪氨酸端基的ACE三肽抑制剂定量构效关系研究
3
作者
曾威
黄国栋
吴文娟
张荣
机构
广东药学院药科学院物理化学教研室
出处
《原子与分子物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期463-470,共8页
基金
国家自然科学基金(20903026)
广东省高等学校人才引进专项资金(2011)
广东省自然科学基金(S2011010002483)
文摘
固定酪氨酸为端基对ACE三肽抑制剂进行构效关系研究,采用多元线性回归方法,基于不同描述符建立模型,比较模型的可靠性和准确性.结果表明Z描述子建立的模型最好.定量构效关系研究表明ACE抑制三肽第二位氨基酸的电性参数是抑制活性的最大影响因素.
关键词
酪氨酸
ACE三肽抑制剂
定量构效关系
Keywords
tyrosine, ACE tripeptide inhibitor, quantitative structure-activity relationship
分类号
O641 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
特殊缔合体系TFE水溶液分子动力学模拟
张荣
谭载友
郑敦胜
罗三来
李浩然
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2008
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
全原子分子动力学模拟研究丙氨酸二肽水溶液的结构和氢键作用
张荣
吴文娟
《原子与分子物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
基于酪氨酸端基的ACE三肽抑制剂定量构效关系研究
曾威
黄国栋
吴文娟
张荣
《原子与分子物理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
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职称材料
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