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甘蔗蔗糖磷酸合成酶基因SPS Ⅳ电子克隆及生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
吴小斌
端木卜文
+2 位作者
齐永文
卢颖林
李奇伟
《甘蔗糖业》
2018年第4期1-9,共9页
蔗糖在植物生长发育过程中发挥重要作用,蔗糖磷酸合成酶(SPS)是蔗糖合成的关键酶之一。本研究以通过克隆获得的甘蔗SPS Ⅳ基因部分DNA序列为探针进行电子克隆,获得甘蔗SPS Ⅳ的编码区序列全长,并采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白的...
蔗糖在植物生长发育过程中发挥重要作用,蔗糖磷酸合成酶(SPS)是蔗糖合成的关键酶之一。本研究以通过克隆获得的甘蔗SPS Ⅳ基因部分DNA序列为探针进行电子克隆,获得甘蔗SPS Ⅳ的编码区序列全长,并采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白的氨基酸组成、理化性质、亚细胞定位及高级结构等方面进行预测分析。结果表明:Sc SPS Ⅳ基因编码区全长2943 bp,编码981个氨基酸,Sc SPS IV可能是不稳定的亲水性非分泌蛋白,主要表达于细胞质。遗传进化分析表明,该基因与高粱、玉米蔗糖磷酸合成酶基因同源性高。以上研究结果为Sc SPS Ⅳ基因下一步进行分子克隆、功能验证和应用提供基础。
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关键词
甘蔗
蔗糖磷酸合成酶
生物信息学
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职称材料
硝化抑制剂对酸性红壤硝化作用及氨氧化微生物丰度和群落结构的影响
被引量:
1
2
作者
黄琼
王庆
+4 位作者
吴启华
李爽
黄莹
陈迪文
江永
《甘蔗糖业》
2019年第2期18-26,共9页
以一种典型酸性红壤为研究对象,在微宇宙培养条件下,研究硝化抑制剂双氰胺(DCD)和乙炔对酸性土壤硝化过程以及氨氧化微生物丰度和群落结构的影响。结果表明:硫酸铵(铵态氮肥)施加刺激了土壤硝化过程,硝化抑制剂处理显著抑制了硝化作用并...
以一种典型酸性红壤为研究对象,在微宇宙培养条件下,研究硝化抑制剂双氰胺(DCD)和乙炔对酸性土壤硝化过程以及氨氧化微生物丰度和群落结构的影响。结果表明:硫酸铵(铵态氮肥)施加刺激了土壤硝化过程,硝化抑制剂处理显著抑制了硝化作用并且C_2H_2对硝化过程的抑制作用比DCD更强。研究还发现氨氧化细菌(Ammonia-Oxidizing Bacteria,AOB)的丰度与的浓度呈显著正相关关系,而氨氧化古菌(Ammonia-oxidizing Archaea,AOA)的丰度与的浓度呈显著负相关关系。末端限制性片段多态性(T-RFLP)分析和主坐标分析(PCo A)表明单施硫酸铵处理改变了AOB和AOA的群落结构。硝化抑制剂处理对AOA和AOB的群落结构没有显著影响。这些结果表明在高铵氮条件下AOB是土壤硝化过程的主要执行者,硝化抑制剂通过抑制AOB的丰度从而抑制硝化过程。
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关键词
酸性红壤
硝化作用
氨氧化细菌
氨氧化古菌
硝化抑制剂
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职称材料
题名
甘蔗蔗糖磷酸合成酶基因SPS Ⅳ电子克隆及生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
吴小斌
端木卜文
齐永文
卢颖林
李奇伟
机构
广东省
生物工程
研究所
(
广州
甘蔗
糖业
研究所
)
广东省
甘蔗
遗传
改良与
生物
炼制
重点
实验室
仲恺农业
工程
学院农业
与生物
学院
出处
《甘蔗糖业》
2018年第4期1-9,共9页
基金
国家糖料作物产业技术体系(CARS-170107)
广东省科技计划(2014B090907006
+4 种基金
2014B070705002
2015A020209026
2016A030313415
2016A030303018
2015A030313697)
文摘
蔗糖在植物生长发育过程中发挥重要作用,蔗糖磷酸合成酶(SPS)是蔗糖合成的关键酶之一。本研究以通过克隆获得的甘蔗SPS Ⅳ基因部分DNA序列为探针进行电子克隆,获得甘蔗SPS Ⅳ的编码区序列全长,并采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白的氨基酸组成、理化性质、亚细胞定位及高级结构等方面进行预测分析。结果表明:Sc SPS Ⅳ基因编码区全长2943 bp,编码981个氨基酸,Sc SPS IV可能是不稳定的亲水性非分泌蛋白,主要表达于细胞质。遗传进化分析表明,该基因与高粱、玉米蔗糖磷酸合成酶基因同源性高。以上研究结果为Sc SPS Ⅳ基因下一步进行分子克隆、功能验证和应用提供基础。
关键词
甘蔗
蔗糖磷酸合成酶
生物信息学
Keywords
Sugarcane
Sucrose phosphate synthase
Bioinformatic
分类号
S566.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
硝化抑制剂对酸性红壤硝化作用及氨氧化微生物丰度和群落结构的影响
被引量:
1
2
作者
黄琼
王庆
吴启华
李爽
黄莹
陈迪文
江永
机构
广东省
生物工程
研究所
(
广州
甘蔗
糖业
研究所
)
广东省
甘蔗
遗传
改良与
生物
炼制
重点
实验室
国家
糖业
质量监督检测中心
出处
《甘蔗糖业》
2019年第2期18-26,共9页
基金
广东省科学院实施创新驱动发展能力建设专项资金项目(2018GDASCX-0925)
国家自然科学青年基金项目(41807054)
文摘
以一种典型酸性红壤为研究对象,在微宇宙培养条件下,研究硝化抑制剂双氰胺(DCD)和乙炔对酸性土壤硝化过程以及氨氧化微生物丰度和群落结构的影响。结果表明:硫酸铵(铵态氮肥)施加刺激了土壤硝化过程,硝化抑制剂处理显著抑制了硝化作用并且C_2H_2对硝化过程的抑制作用比DCD更强。研究还发现氨氧化细菌(Ammonia-Oxidizing Bacteria,AOB)的丰度与的浓度呈显著正相关关系,而氨氧化古菌(Ammonia-oxidizing Archaea,AOA)的丰度与的浓度呈显著负相关关系。末端限制性片段多态性(T-RFLP)分析和主坐标分析(PCo A)表明单施硫酸铵处理改变了AOB和AOA的群落结构。硝化抑制剂处理对AOA和AOB的群落结构没有显著影响。这些结果表明在高铵氮条件下AOB是土壤硝化过程的主要执行者,硝化抑制剂通过抑制AOB的丰度从而抑制硝化过程。
关键词
酸性红壤
硝化作用
氨氧化细菌
氨氧化古菌
硝化抑制剂
Keywords
Acidic red soil
Nitrification process
AOB
AOA
Nitrification inhibitor
分类号
S566.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甘蔗蔗糖磷酸合成酶基因SPS Ⅳ电子克隆及生物信息学分析
吴小斌
端木卜文
齐永文
卢颖林
李奇伟
《甘蔗糖业》
2018
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
硝化抑制剂对酸性红壤硝化作用及氨氧化微生物丰度和群落结构的影响
黄琼
王庆
吴启华
李爽
黄莹
陈迪文
江永
《甘蔗糖业》
2019
1
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职称材料
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