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潮州地区人乳头瘤病毒52型E6多态性分析
被引量：
2
1
作者
罗招云
陈强
+4 位作者
杨立业
林敏
李文玉
詹小芬
陈默蕊
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期219-223,共5页
目的:明确潮州地区人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)52型E6编码区的基因多态性。方法:提取101例HPV 52单纯感染者宫颈脱落细胞DNA,通过特异性引物扩增HPV 52-E6编码区全序列,成功获得83份HPV 52-E6 PCR扩增阳性产物,进行测序及BL...
目的:明确潮州地区人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)52型E6编码区的基因多态性。方法:提取101例HPV 52单纯感染者宫颈脱落细胞DNA,通过特异性引物扩增HPV 52-E6编码区全序列,成功获得83份HPV 52-E6 PCR扩增阳性产物,进行测序及BLAST多态性分析。结果:成功获得76条HPV 52-E6基因全序列(447 bp)。该序列与参考株(GQ472848)的一致性为99%。在潮州地区发现11种E6编码区多态性,9种为同义突变,2种有义突变,引起所编码氨基酸改变。根据基因多态性分亚洲群和欧美群2群。亚洲群有7组,第1组,也是最为常见组(50/76)的编码序列与广州(EU924143)和香港(DQ057293)株编码完全匹配,该组称为潮州地方株;第2组(12/76)多态性与广州(EU924144)等报道的E6全序列完全匹配;第3组(仅1例)多态性与浙江大学报道(HM004117)的E6全序列完全匹配;其余4组多态性国际上尚未报道。欧美群有3组,第1组(5/76)多态性与美国(HQ537745)报道的E6全序列完全匹配;第2组(2例)多态性与美国(DQ057291)和德国(X74481)报道的E6全序列完全匹配;第3组(1例)多态性国际上尚未报道。结论:潮州地区HPV 52-E6编码区序列存在多态性,以中国东南部和东南亚国家报道E6编码区序列为主,少数与欧美报道E6全序列完全匹配。为基因疫苗的研制提供了科学依据。
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关键词
人乳头瘤病毒
52型
E6基因
序列分析
多态性
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职称材料
题名
潮州地区人乳头瘤病毒52型E6多态性分析
被引量：
2
1
作者
罗招云
陈强
杨立业
林敏
李文玉
詹小芬
陈默蕊
机构
广东省潮州市中心医院检验实验中心
出处
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期219-223,共5页
基金
广东省医学科研基金资助项目(编号:A2011760
B2008179)
文摘
目的:明确潮州地区人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)52型E6编码区的基因多态性。方法:提取101例HPV 52单纯感染者宫颈脱落细胞DNA,通过特异性引物扩增HPV 52-E6编码区全序列,成功获得83份HPV 52-E6 PCR扩增阳性产物,进行测序及BLAST多态性分析。结果:成功获得76条HPV 52-E6基因全序列(447 bp)。该序列与参考株(GQ472848)的一致性为99%。在潮州地区发现11种E6编码区多态性,9种为同义突变,2种有义突变,引起所编码氨基酸改变。根据基因多态性分亚洲群和欧美群2群。亚洲群有7组,第1组,也是最为常见组(50/76)的编码序列与广州(EU924143)和香港(DQ057293)株编码完全匹配,该组称为潮州地方株;第2组(12/76)多态性与广州(EU924144)等报道的E6全序列完全匹配;第3组(仅1例)多态性与浙江大学报道(HM004117)的E6全序列完全匹配;其余4组多态性国际上尚未报道。欧美群有3组,第1组(5/76)多态性与美国(HQ537745)报道的E6全序列完全匹配;第2组(2例)多态性与美国(DQ057291)和德国(X74481)报道的E6全序列完全匹配;第3组(1例)多态性国际上尚未报道。结论:潮州地区HPV 52-E6编码区序列存在多态性,以中国东南部和东南亚国家报道E6编码区序列为主,少数与欧美报道E6全序列完全匹配。为基因疫苗的研制提供了科学依据。
关键词
人乳头瘤病毒
52型
E6基因
序列分析
多态性
Keywords
human papillomavirus
52 subtype
E6 gene
sequence analysis
polymorphism
分类号
R694.13 [医药卫生—泌尿科学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
潮州地区人乳头瘤病毒52型E6多态性分析
罗招云
陈强
杨立业
林敏
李文玉
詹小芬
陈默蕊
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
2
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