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苦楝SRAP-PCR反应体系的建立及优化
被引量:
7
1
作者
陈丽君
刘明骞
+2 位作者
廖柏勇
邓小梅
陈晓阳
《华南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期104-108,共5页
【目的】应用SRAP技术对苦楝Melia azedarach遗传多样性、种质资源鉴定等开展研究,对苦楝SRAP-PCR体系中的模板DNA、dNTPs、Mg^2+、引物和TaqDNA聚合酶5个组分浓度进行优化,建立适合苦楝的SRAP-PCR反应体系.【方法】采用单因素试验...
【目的】应用SRAP技术对苦楝Melia azedarach遗传多样性、种质资源鉴定等开展研究,对苦楝SRAP-PCR体系中的模板DNA、dNTPs、Mg^2+、引物和TaqDNA聚合酶5个组分浓度进行优化,建立适合苦楝的SRAP-PCR反应体系.【方法】采用单因素试验对反应体系中的5个因素分别设置8个浓度梯度水平,确定浓度范围后进行L16(4^5)正交试验设计,并对结果进行打分,确定优化体系.【结果和结论】SRAP对苦楝DNA浓度的要求不高,有一个较宽的浓度适宜范围;dNTPs在0.1~0.2mmol·L^-1范围内,能扩增出条带基本相同的清晰谱带;Mg^2+为2.0mmol·L^-1左右时扩增条带较清晰且数量多;引物介于0.48~0.64μmol·L^-1均能扩增出带型基本保持一致且清晰的谱带;TaqDNA聚合酶在0.50~2.00U范围内可以得到清晰的带型.根据正交试验设计16个处理的得分,确定优化的反应体系为:模板DNA 30ng、dNTPs0.125mmol·L^-1、Mg^2+ 2.25mmol·L^-1、引物0.48μmol·L^-1、TaqDNA聚合酶0.75U,反应总体积25μL.
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关键词
苦楝
SRAP-PCR
体系优化
正交试验设计
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职称材料
澳大利亚12个剑豆种源生长节律及主要农艺性状的遗传变异分析
被引量:
2
2
作者
刘明骞
陈晓阳
+4 位作者
陈丽君
周玮
李俊成
惠文凯
丁美美
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第23期16-20,共5页
以从澳大利亚引进的12个剑豆种源为研究对象,对其生长规律和21个性状进行了调查,并采用方差分析和相关分析方法对剑豆种源的13个数量性状进行了分析。结果显示:不同种源间多数性状的差异显著;单株产量与株高、荚重、荚宽、荚厚、单株荚...
以从澳大利亚引进的12个剑豆种源为研究对象,对其生长规律和21个性状进行了调查,并采用方差分析和相关分析方法对剑豆种源的13个数量性状进行了分析。结果显示:不同种源间多数性状的差异显著;单株产量与株高、荚重、荚宽、荚厚、单株荚数、百粒重等性状呈显著正相关关系。通过聚类分析,可将12个剑豆种源分为4个大类,第1类:可以攀爬,分枝较多,结实量大,为晚熟型;第2类:植株不攀爬,为早熟型;第3类:植株善于攀爬且早熟;第4类:可攀爬且晚熟。
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关键词
剑豆
遗传变异
相关分析
聚类分析
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职称材料
题名
苦楝SRAP-PCR反应体系的建立及优化
被引量:
7
1
作者
陈丽君
刘明骞
廖柏勇
邓小梅
陈晓阳
机构
广东省森林植物种质创新与利用重点实验室/华南农业大学林学院
华南农业大学
教学科研基地管理中心
出处
《华南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期104-108,共5页
基金
广东省林业科技创新项目(2011KJCX002)
文摘
【目的】应用SRAP技术对苦楝Melia azedarach遗传多样性、种质资源鉴定等开展研究,对苦楝SRAP-PCR体系中的模板DNA、dNTPs、Mg^2+、引物和TaqDNA聚合酶5个组分浓度进行优化,建立适合苦楝的SRAP-PCR反应体系.【方法】采用单因素试验对反应体系中的5个因素分别设置8个浓度梯度水平,确定浓度范围后进行L16(4^5)正交试验设计,并对结果进行打分,确定优化体系.【结果和结论】SRAP对苦楝DNA浓度的要求不高,有一个较宽的浓度适宜范围;dNTPs在0.1~0.2mmol·L^-1范围内,能扩增出条带基本相同的清晰谱带;Mg^2+为2.0mmol·L^-1左右时扩增条带较清晰且数量多;引物介于0.48~0.64μmol·L^-1均能扩增出带型基本保持一致且清晰的谱带;TaqDNA聚合酶在0.50~2.00U范围内可以得到清晰的带型.根据正交试验设计16个处理的得分,确定优化的反应体系为:模板DNA 30ng、dNTPs0.125mmol·L^-1、Mg^2+ 2.25mmol·L^-1、引物0.48μmol·L^-1、TaqDNA聚合酶0.75U,反应总体积25μL.
关键词
苦楝
SRAP-PCR
体系优化
正交试验设计
Keywords
Melia azedarach
SRAP-PCR
optimization
orthogonal design
分类号
S792.33 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
澳大利亚12个剑豆种源生长节律及主要农艺性状的遗传变异分析
被引量:
2
2
作者
刘明骞
陈晓阳
陈丽君
周玮
李俊成
惠文凯
丁美美
机构
广东省森林植物种质创新与利用重点实验室/华南农业大学林学院
出处
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第23期16-20,共5页
基金
广州市科技计划项目(2010Z1-E241)
农业部"948"项目(2011-Z50)
文摘
以从澳大利亚引进的12个剑豆种源为研究对象,对其生长规律和21个性状进行了调查,并采用方差分析和相关分析方法对剑豆种源的13个数量性状进行了分析。结果显示:不同种源间多数性状的差异显著;单株产量与株高、荚重、荚宽、荚厚、单株荚数、百粒重等性状呈显著正相关关系。通过聚类分析,可将12个剑豆种源分为4个大类,第1类:可以攀爬,分枝较多,结实量大,为晚熟型;第2类:植株不攀爬,为早熟型;第3类:植株善于攀爬且早熟;第4类:可攀爬且晚熟。
关键词
剑豆
遗传变异
相关分析
聚类分析
Keywords
Cartavalia ensiformis
genetic variation
correlation analysis
cluster analysis
分类号
S643.2 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
苦楝SRAP-PCR反应体系的建立及优化
陈丽君
刘明骞
廖柏勇
邓小梅
陈晓阳
《华南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
澳大利亚12个剑豆种源生长节律及主要农艺性状的遗传变异分析
刘明骞
陈晓阳
陈丽君
周玮
李俊成
惠文凯
丁美美
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013
2
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职称材料
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