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微生物中抗耐药菌活性天然产物的研究进展 被引量:8
1
作者 褚福鑫 白志强 朱红惠 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1466-1482,共17页
近年来,细菌耐药性已成为全球性问题。微生物作为抗生素的重要来源,在发掘抗耐药菌新型抗生素的研究中承担了重要角色,许多微生物来源天然化合物展现了显著的抗耐药菌活性。本文主要综述了近十年发现的微生物源抗耐药菌天然化合物,并概... 近年来,细菌耐药性已成为全球性问题。微生物作为抗生素的重要来源,在发掘抗耐药菌新型抗生素的研究中承担了重要角色,许多微生物来源天然化合物展现了显著的抗耐药菌活性。本文主要综述了近十年发现的微生物源抗耐药菌天然化合物,并概括了抗耐药菌活性天然产物的筛选方法,以期对抗耐药菌新型抗生素的发现做铺垫。 展开更多
关键词 天然活性产物 耐药性 药物开发 抗生素筛选
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粘细菌的生物活性物质及其应用前景研究进展 被引量:3
2
作者 原红娟 谭志远 朱红惠 《生态科学》 CSCD 2015年第6期182-187,共6页
粘细菌是一类具有复杂的多细胞群体行为,属peoteobacteria的δ分支,能够产生丰富的生物活性物质,为第二类药源微生物新类群。由于粘细菌的捕食性,及产生的活性物质结构新、种类多、作用机制新颖多样,使得粘细菌作为重要的药源开发菌具... 粘细菌是一类具有复杂的多细胞群体行为,属peoteobacteria的δ分支,能够产生丰富的生物活性物质,为第二类药源微生物新类群。由于粘细菌的捕食性,及产生的活性物质结构新、种类多、作用机制新颖多样,使得粘细菌作为重要的药源开发菌具有潜在的应用前景。粘细菌的活性物质主要在抗肿瘤、抗病毒、抗寄生虫等药研的应用,特别是抗肿瘤活性甚至高于紫杉醇,为肿瘤患者带来福音;利用溶藻粘细菌可以缓解形成水华的有害藻类危害;农业上可开发除草剂、杀虫剂、粘细菌菌肥,有利于发展生态有机农业,生产无公害绿色产品;粘细菌做为纤维素生物燃料可以缓解燃料危机,促进可持续发展具有重大意义。 展开更多
关键词 粘细菌 生物活性物质 药源微生物 应用前景
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白肉灵芝菌丝体生物学特性的初步研究 被引量:22
3
作者 莫伟鹏 刘远超 +4 位作者 胡惠萍 黄龙花 梁晓薇 谢意珍 旦真次仁 《中国食用菌》 2017年第6期33-38,共6页
研究了不同培养条件对白肉灵芝(Ganoderma leucocontextum)菌丝体生长速度的影响。结果表明,白肉灵芝菌丝体培养的最适培养温度是25℃,最适pH是3.0,适宜的碳源是蔗糖和淀粉,适宜的氮源是酵母粉和牛肉膏,最佳碳氮源浓度组合是淀粉3%、蔗... 研究了不同培养条件对白肉灵芝(Ganoderma leucocontextum)菌丝体生长速度的影响。结果表明,白肉灵芝菌丝体培养的最适培养温度是25℃,最适pH是3.0,适宜的碳源是蔗糖和淀粉,适宜的氮源是酵母粉和牛肉膏,最佳碳氮源浓度组合是淀粉3%、蔗糖1.5%、酵母粉0.2%、牛肉膏0.2%。 展开更多
关键词 白肉灵芝 生物学特性 温度 pH 碳源 氮源
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一株深海真菌FS86的分离鉴定及其生物活性研究
4
作者 吴后吕 李浩华 +3 位作者 谭国慧 陈玉婵 刘运美 章卫民 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期195-200,共6页
采用平板涂布法从南海深海沉积物中分离出一株真菌FS86,根据培养特征、形态学特征和ITS序列分析,该菌株被鉴定为球孢枝孢(Cladosporium sphaerospermum)。生物活性测试结果表明,其发酵提取物对8种病原真菌和4种肿瘤细胞株都具有明显的... 采用平板涂布法从南海深海沉积物中分离出一株真菌FS86,根据培养特征、形态学特征和ITS序列分析,该菌株被鉴定为球孢枝孢(Cladosporium sphaerospermum)。生物活性测试结果表明,其发酵提取物对8种病原真菌和4种肿瘤细胞株都具有明显的抑制作用,其MIC值和IC50值分别为0.1-4 mg/m L和0.86-2.13μg/m L。 展开更多
关键词 深海真菌 球孢枝孢 分离 鉴定 抗真菌 细胞毒
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深海真菌Dichotomomyces cejpii胶霉毒素生物合成基因启动子的克隆和功能鉴定 被引量:2
5
作者 黄自磊 章卫民 +3 位作者 叶伟 李赛妮 李浩华 朱牧孜 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期144-150,共7页
利用染色体步移技术对深海真菌Dichotomomyces cejpii中胶霉毒素的生物合成基因Gli G、Gli I和Gli O启动子进行克隆,并将其核心区域导入p GL3-basic荧光素酶报告基因载体,通过荧光强度分析发现Gli G的启动子转录活性最强。进一步将Gli ... 利用染色体步移技术对深海真菌Dichotomomyces cejpii中胶霉毒素的生物合成基因Gli G、Gli I和Gli O启动子进行克隆,并将其核心区域导入p GL3-basic荧光素酶报告基因载体,通过荧光强度分析发现Gli G的启动子转录活性最强。进一步将Gli G启动子核心区域导入含潮霉素抗性标记的p AN7-1载体,以替换原有启动子pgpd A,并将重组质粒导入酿酒酵母,用潮霉素抗性平板进行筛选,发现Gli G启动子能在酿酒酵母中启动潮霉素抗性基因的表达。 展开更多
关键词 Dichotomomyces cejpii 胶霉毒素 启动子 克隆 鉴定 海洋真菌
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灵芝菌糠替代部分木屑栽培金针菇的研究 被引量:7
6
作者 李忠 曾振基 +2 位作者 宋斌 凌宏通 林敏 《中国食用菌》 2015年第1期26-28,43,共4页
研究采用灵芝菌糠替代部分木屑栽培金针菇其菌丝生长情况、农艺性状、生物学效率和经济效益等。结果表明,采用20%灵芝菌糠替代木屑栽培金针菇时其生物学效率最高且经济效益增长最多,可为灵芝菌糠的合理利用提供参考。
关键词 灵芝菌糠 金针菇 生物学效率 经济效益
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我国灵芝种质资源及生产技术研究进展 被引量:24
7
作者 李钦艳 钟莹莹 +3 位作者 陈逸湘 周卫雄 曾振基 宋斌 《中国食用菌》 2016年第1期8-12,20,共6页
灵芝是一种具有保健作用和药用价值的传统真菌,在中国具有悠久的利用和栽培历史,其市场产品名目繁多,2012年市场产值已超过25亿美元。然而,无论是从产品安全性还是产品质量方面来看,均迫切需要进一步深化灵芝产业的开发与应用研究。综... 灵芝是一种具有保健作用和药用价值的传统真菌,在中国具有悠久的利用和栽培历史,其市场产品名目繁多,2012年市场产值已超过25亿美元。然而,无论是从产品安全性还是产品质量方面来看,均迫切需要进一步深化灵芝产业的开发与应用研究。综述了灵芝的生产技术,包括我国灵芝种质资源、人工发酵与栽培技术的研究进展,并阐述了实施灵芝GAP生产的必要性。 展开更多
关键词 灵芝 菌种 栽培技术 发酵 GAP
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化妆品中耐热大肠菌群快速检测方法的研究 被引量:12
8
作者 文霞 李彩玲 +3 位作者 刘静霞 杨秀茳 张淑瑶 谢小保 《日用化学工业》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期410-414,共5页
研究化妆品中耐热大肠菌群快速检测方法。分别采用3M Petrifilm^TM大肠菌群测试片法和环介导等温扩增(Loopmediated isothermal amplification,LAMP)技术检测人工污染化妆品中耐热大肠菌群,并与传统平板检测法进行了比较。结果表明,3M P... 研究化妆品中耐热大肠菌群快速检测方法。分别采用3M Petrifilm^TM大肠菌群测试片法和环介导等温扩增(Loopmediated isothermal amplification,LAMP)技术检测人工污染化妆品中耐热大肠菌群,并与传统平板检测法进行了比较。结果表明,3M Petrifilm^TM大肠菌群测试片法与传统平板检测法比较结果无统计学差异,且操作步骤简便;LAMP技术特异性强,灵敏度可达到2.03 μg/L,且耗时短。3M Petrifilm^TM大肠菌群测试片法和LAMP技术均可用于化妆品中耐热大肠菌群的快速检测。 展开更多
关键词 化妆品 大肠菌群 测试片 环介导等温扩增技术
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山苍子油对白假丝酵母抗菌活性研究 被引量:10
9
作者 梁青 李文茹 +1 位作者 施庆珊 章卫民 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期205-210,共6页
研究山苍子油对白假丝酵母菌的抗菌活性,并阐明其可能的抗菌机制。通过水蒸馏法提取山苍子油,并利用气相色谱-质谱联用仪(GC/MS)分析其成分。通过琼脂平板稀释法测定山苍子油对白假丝酵母的最低抑菌浓度(MIC)和最低杀菌浓度(MFC),并研... 研究山苍子油对白假丝酵母菌的抗菌活性,并阐明其可能的抗菌机制。通过水蒸馏法提取山苍子油,并利用气相色谱-质谱联用仪(GC/MS)分析其成分。通过琼脂平板稀释法测定山苍子油对白假丝酵母的最低抑菌浓度(MIC)和最低杀菌浓度(MFC),并研究山苍子油对白假丝酵母的抗菌动力学;同时利用扫描电子显微镜(SEM)和透射电子显微镜(TEM)观察山苍子油对白假丝酵母细胞超微结构的影响。结果表明,自提山苍子油主成分为柠檬烯(26.51%),柠檬醛(11.94%)和马鞭烯醇(11.84%)。山苍子油对白假丝酵母菌的MIC和MFC均为1.25μL/m L;其抗菌动力学研究表明浓度低于其MIC时,山苍子油仅延长白假丝酵母的生长适应期,并不能彻底杀死细胞;SEM结果表示,山苍子易破坏正在出芽的细胞;TEM显示出山苍子破坏细胞壁,细胞膜,使细胞裂解。山苍子油具有优良的抗白假丝酵母活性,且白假丝酵母在芽痕处对山苍子油比较敏感,高浓度的精油(5.0μL/m L)对细胞产生不可逆破坏;山苍子油杀菌的靶标可能是细胞壁和细胞外膜,使细胞内大分子外泄,细胞器变形,最终导致细胞死亡。 展开更多
关键词 山苍子油 白假丝酵母 抗菌活性 抗菌动力学 扫描电镜 透射电镜
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深海真菌Penicillium herquei FS83次生代谢产物研究 被引量:5
10
作者 李浩华 潘清灵 +6 位作者 陈玉婵 李赛妮 谭国慧 叶伟 刘洪新 孙章华 章卫民 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期327-330,381,共5页
利用正相硅胶柱、反相硅胶柱、凝胶柱、薄层层析以及高效液相色谱法等色谱技术从深海真菌Penicillium herquei FS83的液体发酵产物中分离得到5个化合物,通过波谱数据分析结合文献对照,分别鉴定为peniherin A(1)、sclerodin(2)、对羟基... 利用正相硅胶柱、反相硅胶柱、凝胶柱、薄层层析以及高效液相色谱法等色谱技术从深海真菌Penicillium herquei FS83的液体发酵产物中分离得到5个化合物,通过波谱数据分析结合文献对照,分别鉴定为peniherin A(1)、sclerodin(2)、对羟基苯乙酸甲酯(3)、对羟基苯乙酮(4)、(R)-甲羟戊酸内酯(5)。其中化合物1为新化合物,化合物2为首次从该属真菌中分离得到。生物活性实验显示,化合物1无明显细胞毒活性及抑菌活性。 展开更多
关键词 PENICILLIUM herquei 深海真菌 次生代谢产物 异香豆素
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响应面法优化超声辅助提取皱盖假芝脂溶性成分的研究 被引量:2
11
作者 黄纪国 韩园园 +1 位作者 谢意珍 潘鸿辉 《中国食用菌》 2015年第3期41-46,共6页
为了优化超声辅助提取皱盖假芝脂溶性成分的工艺。在单因素的实验基础上,采用响应面法进行实验设计,选取料液比、提取时间、提取温度、提取功率进行四因素三水平实验,最终得到超声辅助提取皱盖假芝脂溶性成分的最佳工艺条件为:料液比36.... 为了优化超声辅助提取皱盖假芝脂溶性成分的工艺。在单因素的实验基础上,采用响应面法进行实验设计,选取料液比、提取时间、提取温度、提取功率进行四因素三水平实验,最终得到超声辅助提取皱盖假芝脂溶性成分的最佳工艺条件为:料液比36.74 m L·g^(-1),提取时间47.31 min,提取温度90℃,提取功率82 W。在此条件下,提取率为8.4891%。因此超声辅助提取工艺简单且稳定,是可行的提取方案。 展开更多
关键词 皱盖假芝 脂溶性成分 超声辅助提取
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桑黄孔菌属的研究进展 被引量:13
12
作者 梁晓薇 刘远超 +3 位作者 黄龙花 谢意珍 贺凤 胡惠萍 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2017年第6期98-104,共7页
历来"桑黄"的种类混淆不清,直至近年来才被确定为桑树桑黄,与其亲缘性相近的物种也一同被划分入广义纤孔菌属的新分支—桑黄孔菌属。本文整理曾被当作"桑黄"的物种,阐述其正名和桑黄孔菌属确立的过程,对目前该属内... 历来"桑黄"的种类混淆不清,直至近年来才被确定为桑树桑黄,与其亲缘性相近的物种也一同被划分入广义纤孔菌属的新分支—桑黄孔菌属。本文整理曾被当作"桑黄"的物种,阐述其正名和桑黄孔菌属确立的过程,对目前该属内物种的生物活性和栽培研究进展进行综述,旨在为桑黄孔菌属真菌资源的研究开发提供参考。 展开更多
关键词 桑黄 纤孔菌属 生物活性 栽培研究
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垂枝红千层叶化学成分的研究 被引量:7
13
作者 黎灿 谭海波 +3 位作者 邱声祥 徐汉虹 刘洪新 杨晓云 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期954-958,共5页
本实验研究了垂枝红千层(Callistemon viminalis)叶化学成分及其杀虫活性。采用硅胶柱色谱、Sephadex LH-20柱色谱、反相C18柱色谱分离化合物,通过波谱技术分析确定所得化合物的结构。采用饲料载毒法对垂枝红千层中含量较高的化合物2、4... 本实验研究了垂枝红千层(Callistemon viminalis)叶化学成分及其杀虫活性。采用硅胶柱色谱、Sephadex LH-20柱色谱、反相C18柱色谱分离化合物,通过波谱技术分析确定所得化合物的结构。采用饲料载毒法对垂枝红千层中含量较高的化合物2、4、10进行了甜菜夜蛾的杀虫活性初筛。从垂枝红千层叶体积分数95%乙醇提取物的乙酸乙酯部分离得到13个化合物,分别鉴定为3,3',4'-三甲氧基鞣花酸(1)、槲皮素(2)、5,4'-二羟基-7-甲氧基-6,8-二甲基黄酮(3)、山奈酚(4)、5-羟基-7,4'-二甲氧基-6-甲基黄酮(5)、杜鹃素(6)、没食子酸甲酯(7)、原儿茶酸(8)、没食子酸(9)、2,6-二羟基-4-甲氧基异戊烯基间苯三酚(10)、vimifoliol(11)、丁二酸(12)及白桦酸(13)。化合物1~9、11、12均为首次从该植物中分离得到。杀虫活性研究表明间苯三酚类化合物10具有较强的杀甜菜夜蛾活性,其活性接近阳性对照药鱼藤酮,值得进一步深入的研究。 展开更多
关键词 垂枝红千层 化学成分 结构鉴定 甜菜夜蛾
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Cladosperanol A,海洋真菌Cladosporium perangustum FS62中一个新的二聚萘满酮 被引量:1
14
作者 范震 孙章华 +2 位作者 陈玉婵 李浩华 章卫民 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期486-489,共4页
采用硅胶柱、凝胶柱、HPLC等色谱技术从海洋真菌Cladosporium perangustum FS62的发酵液提取物中分离得到了1个化合物(1),通过波谱数据分析(HR-ESI-MS、1D NMR、2D NMR、CD)确定该化合物为1个新的二聚萘满酮,结构为(4S,4'S)-4,8,8&#... 采用硅胶柱、凝胶柱、HPLC等色谱技术从海洋真菌Cladosporium perangustum FS62的发酵液提取物中分离得到了1个化合物(1),通过波谱数据分析(HR-ESI-MS、1D NMR、2D NMR、CD)确定该化合物为1个新的二聚萘满酮,结构为(4S,4'S)-4,8,8'-trihydroxy-2,3,2',3'-tetrahydro-[4',5-binaphthalene]-1,1'(4H,4'H)-dione,命名为cladosperanol A。 展开更多
关键词 cladosperanol A 二聚萘满酮 次级代谢产物 CLADOSPORIUM perangustum 海洋真菌
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4种农林废弃物代替木屑工厂化栽培白玉菇研究 被引量:8
15
作者 邹俊平 李挺 +6 位作者 宋斌 许喜佳 黄浩 郑永发 贝淑琴 韦曼华 梅亮添 《中国食用菌》 2017年第4期18-22,共5页
以4种农林废弃物(谷壳、互叶白千层树渣、金针菇菌糠、白玉菇菌糠)按不同的比例替代木屑栽培白玉菇,通过对白玉菇菌丝体的生长速度、子实体特性和生物学效率等进行评价,筛选出最佳的可替代木屑的白玉菇栽培原料。结果显示,在含有互叶白... 以4种农林废弃物(谷壳、互叶白千层树渣、金针菇菌糠、白玉菇菌糠)按不同的比例替代木屑栽培白玉菇,通过对白玉菇菌丝体的生长速度、子实体特性和生物学效率等进行评价,筛选出最佳的可替代木屑的白玉菇栽培原料。结果显示,在含有互叶白千层树渣的培养料中,白玉菇的菌丝体生长速度较快,白玉菇子实体朵形较好,菌盖直径、菌柄长度、单株平均鲜重和生物学效率均优于其他3种农林废弃物。当以互叶白千层树渣全部代替木屑时,白玉菇菌丝体的生长速度最快,29 d长满培养瓶,子实体菌柄长度、菌盖直径及单株平均鲜重达到最大值,分别为9.75 cm、2.78 cm和167.2 g。本研究结果表明互叶白千层树渣为木屑的最佳替代物,且当全部代替木屑时,白玉菇产量最高;谷壳和白玉菇菌糠次之,金针菇菌糠的效果最差。 展开更多
关键词 白玉菇 生物学效率 互叶白千层树渣 栽培技术
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食用菌菌糠生产有机肥研究 被引量:24
16
作者 曾振基 陈逸湘 +6 位作者 凌宏通 侯永康 周卫雄 林敏 陈东标 李钦艳 宋斌 《中国食用菌》 2015年第2期56-59,共4页
研究食用菌菌糠规模化生产有机肥料的方法。利用当地食用菌菌糠、羊粪、烟草废料经微生物菌种发酵生产有机肥料,并进行田间试验。所获产品的有机质含量达到54%、全氮含量2.2%、全磷含量2.22%、全钾含量4.92%、总养分含量9.34%,其它指标... 研究食用菌菌糠规模化生产有机肥料的方法。利用当地食用菌菌糠、羊粪、烟草废料经微生物菌种发酵生产有机肥料,并进行田间试验。所获产品的有机质含量达到54%、全氮含量2.2%、全磷含量2.22%、全钾含量4.92%、总养分含量9.34%,其它指标包括p H值、大肠杆菌数、蛔虫卵死亡率以及汞、砷、镉、铅、铬含量等均符合我国有机肥料的行业标准;产品在金柚、蜜柚、脐橙、花生、番薯、苦瓜、油茶和茶叶等作物上试用,均有7%以上的增产效果。食用菌菌糠、羊粪、烟粉经微生物发酵后能生产出合格的有机肥料。 展开更多
关键词 食用菌菌糠 发酵 有机肥
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白木香果皮中的五个葫芦素类化合物及其细胞毒活性(英文) 被引量:3
17
作者 张兴 陶美华 +3 位作者 陈玉婵 高晓霞 谭毓治 章卫民 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期354-357,363,共5页
从白木香(Aquilaria sinensis)果皮中分离得到5个葫芦素类化合物,通过波谱数据分析分别鉴定为双氢葫芦素E(1)、endecaphyllacinsB(2)、2-O-β-D—glucopyranosylcucurbitacin I(3)、葫芦素E(4)、葫芦索I(5)。其中化合物1—... 从白木香(Aquilaria sinensis)果皮中分离得到5个葫芦素类化合物,通过波谱数据分析分别鉴定为双氢葫芦素E(1)、endecaphyllacinsB(2)、2-O-β-D—glucopyranosylcucurbitacin I(3)、葫芦素E(4)、葫芦索I(5)。其中化合物1—3为首次从沉香属植物中分离得到;化合物1—5具有细胞毒活性。 展开更多
关键词 白木香 果皮 化学成分 葫芦素 细胞毒活性
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斑玉蕈两个品种菌糠营养成分比较分析与评价 被引量:5
18
作者 李挺 宋斌 +3 位作者 林敏 许喜佳 黄浩 蒋鑫宇 《中国食用菌》 2016年第2期54-57,共4页
测定斑玉蕈(Hypsizygus marmoreus)两个品种(真姬菇和白玉菇)菌糠的主要营养成分,并进行初步评价。结果表明:真姬菇菌糠和白玉菇菌糠的蛋白质中总氨基酸含量分别为6.63%和4.09%,必需氨基酸含量分别占总氨基酸的44.56%和46.55%,氨基酸比... 测定斑玉蕈(Hypsizygus marmoreus)两个品种(真姬菇和白玉菇)菌糠的主要营养成分,并进行初步评价。结果表明:真姬菇菌糠和白玉菇菌糠的蛋白质中总氨基酸含量分别为6.63%和4.09%,必需氨基酸含量分别占总氨基酸的44.56%和46.55%,氨基酸比值系数分别为61.10和53.43。真姬菇菌糠的蛋白质营养价值高于白玉菇菌糠,磷、钾含量也高于白玉菇菌糠,但钙含量则低于白玉菇菌糠。两者的粗纤维含量均超过18%,均可直接用作粗饲料或动物饲料的来源。 展开更多
关键词 营养评价 饲料利用 菌糠 斑玉蕈
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白木香内生真菌Botryosphae riarhodina A13固体发酵产物的分离鉴定 被引量:9
19
作者 张瑶 陶美华 +2 位作者 陈玉婵 郁建平 章卫民 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期799-803,共5页
运用硅胶柱、反相硅胶柱、凝胶柱、HPLC和薄层制备等色谱技术及重结晶从白木香内生真菌Botryosphaeria rhodina A13的固体发酵产物中分离纯化了10个化学成分,通过化合物波谱数据及理化性质鉴定它们的结构分别为豆甾-4-烯-3-酮(1)、豆... 运用硅胶柱、反相硅胶柱、凝胶柱、HPLC和薄层制备等色谱技术及重结晶从白木香内生真菌Botryosphaeria rhodina A13的固体发酵产物中分离纯化了10个化学成分,通过化合物波谱数据及理化性质鉴定它们的结构分别为豆甾-4-烯-3-酮(1)、豆甾-5-烯-3β-醇-7-酮(2)、豆甾-4-烯-3,6-二酮(3)、(22E,24S)-5α,6α-环氧基-24-甲基胆甾-8(14),22-二烯-3β,7α-二醇(4)、5,4'-二羟-7-甲氧基黄酮(5)、香草酸(6)、对甲氧基苯甲酸(7)、尿嘧啶(8)、2-甲氧基对苯二酚(9)、2-甲基-3,5-羟基色酮(10)。其中化合物1~10均为首次从该属真菌中分离得到,化合物4具有细胞毒活性。 展开更多
关键词 BOTRYOSPHAERIA rhodina 内生真菌 次级代谢产物 白木香 细胞毒活性
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基于差异基因网络特性探究乳腺癌他莫昔芬耐药的关键标志物 被引量:2
20
作者 马军 王雪庭 +2 位作者 陈梦杰 孟磊 王乐 《陕西科技大学学报》 CAS 2020年第5期67-74,共8页
他莫昔芬适用于绝经前或绝经后的患者,能有效降低雌激素受体阳性(estrogen receptor positive,ER+)患者的死亡率和复发率,目前仍然是乳腺癌内分泌治疗的基础用药,然而在临床应用中已经发现约半数患者出现原发或继发性他莫昔芬耐药.因此... 他莫昔芬适用于绝经前或绝经后的患者,能有效降低雌激素受体阳性(estrogen receptor positive,ER+)患者的死亡率和复发率,目前仍然是乳腺癌内分泌治疗的基础用药,然而在临床应用中已经发现约半数患者出现原发或继发性他莫昔芬耐药.因此,鉴定有效的他莫昔芬耐药关键基因将为TAM治疗ER+的乳腺癌患者提供重要的参考价值.本文首先联合Cancer Cell Line Encyclopedia(CCLE)数据库中的乳腺癌细胞系表达谱和STRING数据库中人类蛋白相互作用数据,得到了基于乳腺癌的蛋白互作(breast cancer-based PPI,B_PPI)网络.再通过walktrap算法对B_PPI网络中的基因进行聚类分析,产生不同大小的群落.同时,收集并分析GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中与他莫昔芬耐药相关的乳腺癌转录组数据,从而得到表达差异基因.再用reciprocal best-hit方法对群落与表达差异基因进行相似性分析找出与他莫昔芬耐药相关的群落.依据群落的功能特性和差异基因网络特性筛选耐药核心基因.最后选用核心基因STAT1和CDH1作为示例,探究基因表达情况与预后的关系.构建了包含7904个基因和213422个连接数的乳腺癌蛋白互作网络.经预后标记物验证发现CW4、CW5、CW13、CW21和CW33群落(共3863个基因)与他莫昔芬耐药相关,且CW5的显著性最高.功能分析发现CW5中基因参与丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路.选取前5个具有高节点度的表达差异基因STAT3、STAT1、CDH1、EGR1和PRKCA作为TAM耐药的核心基因,并通过他莫昔芬治疗后预后数据及文献证据验证核心基因表达与他莫昔芬耐药密切相关.耐药核心基因的表达情况与他莫昔芬治疗ER+乳腺癌患者的疗效关系密切.表达差异基因网络特性可以用于筛选乳腺癌他莫昔芬耐药的关键基因. 展开更多
关键词 蛋白与蛋白互作网络 乳腺癌 他莫昔芬耐药 预后标记物 差异基因
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