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杜洛克母猪初情期日龄全基因组关联分析
被引量：
7
1
作者
袁晓龙
徐丹同
+5 位作者
曹浩男
熊浩铭
曾检华
陈子韬
张哲
李加琪
《广东农业科学》
CAS
2020年第5期87-92,共6页
【目的】母猪初情期日龄是重要的经济性状,直接影响母猪的繁殖利用年限,但调控母猪初情期启动的机制尚不清楚。【方法】基于全基因组芯片数据,对571头杜洛克母猪初情期日龄进行全基因组关联分析,筛选影响母猪初情期日龄的重要基因。【...
【目的】母猪初情期日龄是重要的经济性状,直接影响母猪的繁殖利用年限,但调控母猪初情期启动的机制尚不清楚。【方法】基于全基因组芯片数据,对571头杜洛克母猪初情期日龄进行全基因组关联分析,筛选影响母猪初情期日龄的重要基因。【结果】571头杜洛克母猪的初情期日龄符合正态分布,初情期日龄最早为173 d,最晚为291 d,平均为224 d;初情期越早的母猪表现出更高的窝产仔数和平均窝重;通过质控,共有30281 SNP位点被用于全基因组关联分析,在前10个潜在SNP位点附近,找到ABCC8、BCAR3、NELL2和NSF等基因,这些基因的主要功能富集在ATP binding、第二性征发育、激素分泌的调控方面。【结论】初步筛选了影响母猪初情期日龄的基因,但具体功能需要进一步研究确认。此研究不仅能为解析母猪初情期启动的遗传机制提供参考,还能为母猪初情期日龄的遗传改良提供一定的理论基础。
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关键词
杜洛克猪
初情期
全基因组关联分析(GWAS)
候选基因
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职称材料
miR-144、miR-21-3p、miR-142-5p及miR-27b-3p对心肌梗塞后血管再生的作用
被引量：
6
2
作者
袁晓龙
潘金春
+8 位作者
蒋瑶
龚宝勇
高洪彬
白国锋
谭伟江
梁十
李加琪
张豪
王希龙
《中国实验动物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期297-306,共10页
目的以五指山小型猪心肌梗塞模型为研究对象,筛选对心肌梗塞易感且可能调控血管生成素-2(ANGPT-2,促血管生长和形成的重要基因)表达的miRNAs。以人脐静脉内皮细胞(HUVECs)为细胞模型,探索候选miRNAs对人脐静脉内皮细胞的增殖、迁移及细...
目的以五指山小型猪心肌梗塞模型为研究对象,筛选对心肌梗塞易感且可能调控血管生成素-2(ANGPT-2,促血管生长和形成的重要基因)表达的miRNAs。以人脐静脉内皮细胞(HUVECs)为细胞模型,探索候选miRNAs对人脐静脉内皮细胞的增殖、迁移及细胞血管形成中的作用。方法通过小RNA测序和生物信息学软件预测靶标于ANGPT-2,并且在心肌梗塞组和对照组中差异表达的miRNAs,利用Edu法、Transwell法、体外实验法检测候选miRNAs对HUVECs的增殖、迁移和血管成腔的影响。结果miR-144、miR-21-3p、miR-142-5p及miR-27b-3p是潜在的靶标于ANGPT-2,并且在心肌梗塞和对照两组表达水平差异显著的miRNAs。miR-144不能直接影响HUVECs的增殖,但能抑制细胞的迁移及血管形成;miR-21-3p能抑制HUVECs增殖和迁移,但促进HUVECs血管形成;miR-142-5p和miR-27b-3p能抑制HUVECs增殖、迁移及成管;miR-142-5p和miR-27b-3p能显著抑制ANGPT-2的转录表达。结论心肌梗塞后,miR-142-5p和miR-27b-3p可能通过靶标于ANGPT-2的3’UTR并且抑制ANGPT-2的转录表达,抑制血管内皮细胞的增殖、迁移及血管形成,进而抑制血管再生。
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关键词
心机梗塞
血管再生
MIRNAS
ANGPT-2
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职称材料
题名
杜洛克母猪初情期日龄全基因组关联分析
被引量：
7
1
作者
袁晓龙
徐丹同
曹浩男
熊浩铭
曾检华
陈子韬
张哲
李加琪
机构
华南农业大学
动物
科学学院
/广东省
农业
动物
基因组学与分子育种
重点
实验室
/国家生猪种业工程技术研究中心
广东省实验动物重点实验室/广东省实验动物监测所
广东
壹号食品股份有限公司
出处
《广东农业科学》
CAS
2020年第5期87-92,共6页
基金
广东省重点领域研发计划项目(2018B020203003)
国家生猪现代农业产业技术体系项目(CARS-35)
+2 种基金
广东省普通高校青年创新人才项目(2018KQNCX019)
广东省自然科学基金面上项目(2019A1515010676)
国家自然科学基金(31902131)。
文摘
【目的】母猪初情期日龄是重要的经济性状,直接影响母猪的繁殖利用年限,但调控母猪初情期启动的机制尚不清楚。【方法】基于全基因组芯片数据,对571头杜洛克母猪初情期日龄进行全基因组关联分析,筛选影响母猪初情期日龄的重要基因。【结果】571头杜洛克母猪的初情期日龄符合正态分布,初情期日龄最早为173 d,最晚为291 d,平均为224 d;初情期越早的母猪表现出更高的窝产仔数和平均窝重;通过质控,共有30281 SNP位点被用于全基因组关联分析,在前10个潜在SNP位点附近,找到ABCC8、BCAR3、NELL2和NSF等基因,这些基因的主要功能富集在ATP binding、第二性征发育、激素分泌的调控方面。【结论】初步筛选了影响母猪初情期日龄的基因,但具体功能需要进一步研究确认。此研究不仅能为解析母猪初情期启动的遗传机制提供参考,还能为母猪初情期日龄的遗传改良提供一定的理论基础。
关键词
杜洛克猪
初情期
全基因组关联分析(GWAS)
候选基因
Keywords
Duroc sows
puberty
genome-wide association study(GWAS)
candidate genes
分类号
S813.1 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
miR-144、miR-21-3p、miR-142-5p及miR-27b-3p对心肌梗塞后血管再生的作用
被引量：
6
2
作者
袁晓龙
潘金春
蒋瑶
龚宝勇
高洪彬
白国锋
谭伟江
梁十
李加琪
张豪
王希龙
机构
广东省实验动物重点实验室/广东省实验动物监测所
广东省
农业
动物
基因组学与分子育种
重点
实验室
/华南农业大学
出处
《中国实验动物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期297-306,共10页
基金
国家自然科学基金(31572351)
广州市科技计划项目(201707010376)。
文摘
目的以五指山小型猪心肌梗塞模型为研究对象,筛选对心肌梗塞易感且可能调控血管生成素-2(ANGPT-2,促血管生长和形成的重要基因)表达的miRNAs。以人脐静脉内皮细胞(HUVECs)为细胞模型,探索候选miRNAs对人脐静脉内皮细胞的增殖、迁移及细胞血管形成中的作用。方法通过小RNA测序和生物信息学软件预测靶标于ANGPT-2,并且在心肌梗塞组和对照组中差异表达的miRNAs,利用Edu法、Transwell法、体外实验法检测候选miRNAs对HUVECs的增殖、迁移和血管成腔的影响。结果miR-144、miR-21-3p、miR-142-5p及miR-27b-3p是潜在的靶标于ANGPT-2,并且在心肌梗塞和对照两组表达水平差异显著的miRNAs。miR-144不能直接影响HUVECs的增殖,但能抑制细胞的迁移及血管形成;miR-21-3p能抑制HUVECs增殖和迁移,但促进HUVECs血管形成;miR-142-5p和miR-27b-3p能抑制HUVECs增殖、迁移及成管;miR-142-5p和miR-27b-3p能显著抑制ANGPT-2的转录表达。结论心肌梗塞后,miR-142-5p和miR-27b-3p可能通过靶标于ANGPT-2的3’UTR并且抑制ANGPT-2的转录表达,抑制血管内皮细胞的增殖、迁移及血管形成,进而抑制血管再生。
关键词
心机梗塞
血管再生
MIRNAS
ANGPT-2
Keywords
Myocardial infarction
angiogenesis
miRNAs
ANGPT-2
分类号
Q95-33 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杜洛克母猪初情期日龄全基因组关联分析
袁晓龙
徐丹同
曹浩男
熊浩铭
曾检华
陈子韬
张哲
李加琪
《广东农业科学》
CAS
2020
7
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职称材料
2
miR-144、miR-21-3p、miR-142-5p及miR-27b-3p对心肌梗塞后血管再生的作用
袁晓龙
潘金春
蒋瑶
龚宝勇
高洪彬
白国锋
谭伟江
梁十
李加琪
张豪
王希龙
《中国实验动物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
6
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