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诸氏鲻虾虎鱼多态性微卫星标记的开发及评价
被引量:
12
1
作者
蔡磊
陈小曲
+1 位作者
郑伟强
李建军
《中国实验动物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期57-62,共6页
目的开发诸氏鲻虾虎鱼(Mugilogobius chulae)多态性微卫星标记,为诸氏鲻虾虎鱼的遗传背景评价提供基础数据。方法采用磁珠富集法,以生物素标记的(AC)15为探针,构建了诸氏鲻虾虎鱼微卫星富集文库。经克隆、筛选、测序后,设计合成微卫星引...
目的开发诸氏鲻虾虎鱼(Mugilogobius chulae)多态性微卫星标记,为诸氏鲻虾虎鱼的遗传背景评价提供基础数据。方法采用磁珠富集法,以生物素标记的(AC)15为探针,构建了诸氏鲻虾虎鱼微卫星富集文库。经克隆、筛选、测序后,设计合成微卫星引物,利用野生群体对微卫星引物进行多态性筛选和评价。结果共获得74个含有微卫星重复单元的序列,根据微卫星序列共设计出33对微卫星引物。利用30个野生诸氏鲻虾虎鱼样本对33对引物的微卫星位点进行了评价,其中有12个位点表现出多态性,平均有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及多态信息含量(PIC)分别为2.9167、2.2311、0.4583、0.5633和0.4474。结论所筛选的微卫星标记将为诸氏鲻虾虎鱼遗传质量控制及监测提供实验依据。
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关键词
诸氏鲻虾虎鱼
多态性
微卫星标记
遗传多样性
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职称材料
禽脑脊髓炎病毒Luminex xTAG检测方法的建立
被引量:
1
2
作者
张孟迪
朱海波
+5 位作者
朱余军
伍妙梨
练月晓
黄碧洪
葛叶
丛锋
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2023年第10期54-58,共5页
为了建立一种灵敏快速检测禽脑脊髓炎病毒(AEV)的Luminex xTAG技术方法,本试验针对AEV高度保守的VP 1基因设计了1对特异性引物,在上游引物的5′端通过Spacer18间隔添加Tag序列,下游引物的5′端标记生物素,进行反转录-聚合酶链式反应(RT-...
为了建立一种灵敏快速检测禽脑脊髓炎病毒(AEV)的Luminex xTAG技术方法,本试验针对AEV高度保守的VP 1基因设计了1对特异性引物,在上游引物的5′端通过Spacer18间隔添加Tag序列,下游引物的5′端标记生物素,进行反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增,构建质粒标准品,通过优化反应体系建立Luminex xTAG检测方法。用所建立的Luminex xTAG方法进行特异性、敏感性和重复性试验,并与SYBR Green I实时荧光定量RT-PCR方法同时对45份脑组织临床样品进行检测。结果显示,所建立AEV Luminex xTAG检测方法与传染性法氏囊病毒、禽传染性贫血病病毒、新城疫病毒、禽流感病毒、传染性喉气管炎病毒、禽白血病病毒、马立克病毒和禽传染性支气管炎病毒无交叉反应;灵敏度可达1×10^(2)copies/μL;批内和批间重复性试验的变异系数均小于4.0%;对45份临床样品的Luminex xTAG检测结果与SYBR Green I实时荧光定量RT-PCR检测结果一致。结果表明,所建立的AEV Luminex xTAG检测方法特异性好、灵敏度高、重复性和稳定性好,可用于AEV的快速检测。
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关键词
禽脑脊髓炎病毒(AEV)
Luminex
xTAG
检测
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职称材料
题名
诸氏鲻虾虎鱼多态性微卫星标记的开发及评价
被引量:
12
1
作者
蔡磊
陈小曲
郑伟强
李建军
机构
广东省实验动物监测所、广东省实验动物重点实验室
出处
《中国实验动物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期57-62,共6页
基金
国家科技支撑计划项目(2013BAK11B02)
广东省中国科学院全面战略合作项目(2011B090300099)
+1 种基金
广东省科技计划项目(2012A020602008)
广东省科技计划项目(2011B010500021)
文摘
目的开发诸氏鲻虾虎鱼(Mugilogobius chulae)多态性微卫星标记,为诸氏鲻虾虎鱼的遗传背景评价提供基础数据。方法采用磁珠富集法,以生物素标记的(AC)15为探针,构建了诸氏鲻虾虎鱼微卫星富集文库。经克隆、筛选、测序后,设计合成微卫星引物,利用野生群体对微卫星引物进行多态性筛选和评价。结果共获得74个含有微卫星重复单元的序列,根据微卫星序列共设计出33对微卫星引物。利用30个野生诸氏鲻虾虎鱼样本对33对引物的微卫星位点进行了评价,其中有12个位点表现出多态性,平均有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及多态信息含量(PIC)分别为2.9167、2.2311、0.4583、0.5633和0.4474。结论所筛选的微卫星标记将为诸氏鲻虾虎鱼遗传质量控制及监测提供实验依据。
关键词
诸氏鲻虾虎鱼
多态性
微卫星标记
遗传多样性
Keywords
Mugilogobius chulae
Polymorphism
Microsatellites
Genetic diversity
分类号
Q95-33 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
禽脑脊髓炎病毒Luminex xTAG检测方法的建立
被引量:
1
2
作者
张孟迪
朱海波
朱余军
伍妙梨
练月晓
黄碧洪
葛叶
丛锋
机构
广东
海洋大学滨海农业学院
上海蛮蛮生物科技有限公司
广东省实验动物监测所、广东省实验动物重点实验室
出处
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2023年第10期54-58,共5页
基金
国家重点研发计划(2021YFF0703300)。
文摘
为了建立一种灵敏快速检测禽脑脊髓炎病毒(AEV)的Luminex xTAG技术方法,本试验针对AEV高度保守的VP 1基因设计了1对特异性引物,在上游引物的5′端通过Spacer18间隔添加Tag序列,下游引物的5′端标记生物素,进行反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增,构建质粒标准品,通过优化反应体系建立Luminex xTAG检测方法。用所建立的Luminex xTAG方法进行特异性、敏感性和重复性试验,并与SYBR Green I实时荧光定量RT-PCR方法同时对45份脑组织临床样品进行检测。结果显示,所建立AEV Luminex xTAG检测方法与传染性法氏囊病毒、禽传染性贫血病病毒、新城疫病毒、禽流感病毒、传染性喉气管炎病毒、禽白血病病毒、马立克病毒和禽传染性支气管炎病毒无交叉反应;灵敏度可达1×10^(2)copies/μL;批内和批间重复性试验的变异系数均小于4.0%;对45份临床样品的Luminex xTAG检测结果与SYBR Green I实时荧光定量RT-PCR检测结果一致。结果表明,所建立的AEV Luminex xTAG检测方法特异性好、灵敏度高、重复性和稳定性好,可用于AEV的快速检测。
关键词
禽脑脊髓炎病毒(AEV)
Luminex
xTAG
检测
Keywords
avian encephalomyelitis virus(AEV)
Luminex xTAG
detection
分类号
S855.3 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
诸氏鲻虾虎鱼多态性微卫星标记的开发及评价
蔡磊
陈小曲
郑伟强
李建军
《中国实验动物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
12
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
禽脑脊髓炎病毒Luminex xTAG检测方法的建立
张孟迪
朱海波
朱余军
伍妙梨
练月晓
黄碧洪
葛叶
丛锋
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2023
1
在线阅读
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职称材料
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